MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 17216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011833	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	219681390
2	NC_011833	GTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681390
3	NC_011833	AGC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681390
4	NC_011833	TCA	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
5	NC_011833	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681390
6	NC_011833	CTCA	2	8	299	306	25 %	25 %	0 %	50 %	219681390
7	NC_011833	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
8	NC_011833	GGT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681390
9	NC_011833	ATG	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681390
10	NC_011833	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681390
11	NC_011833	CTA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
12	NC_011833	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
13	NC_011833	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
14	NC_011833	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681390
15	NC_011833	TGT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681390
16	NC_011833	GT	3	6	606	611	0 %	50 %	50 %	0 %	219681390
17	NC_011833	AATT	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	219681390
18	NC_011833	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681390
19	NC_011833	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	219681390
20	NC_011833	AGG	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219681390
21	NC_011833	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681390
22	NC_011833	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219681390
23	NC_011833	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681390
24	NC_011833	T	6	6	873	878	0 %	100 %	0 %	0 %	219681390
25	NC_011833	CAT	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
26	NC_011833	CA	3	6	928	933	50 %	0 %	0 %	50 %	219681390
27	NC_011833	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
28	NC_011833	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681390
29	NC_011833	AT	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	219681390
30	NC_011833	T	6	6	997	1002	0 %	100 %	0 %	0 %	219681390
31	NC_011833	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681390
32	NC_011833	T	7	7	1234	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	219681390
33	NC_011833	ATTA	2	8	1276	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	219681390
34	NC_011833	T	6	6	1292	1297	0 %	100 %	0 %	0 %	219681390
35	NC_011833	ACT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
36	NC_011833	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681390
37	NC_011833	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681390
38	NC_011833	GCA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219681390
39	NC_011833	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681390
40	NC_011833	ACT	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
41	NC_011833	CTTT	2	8	1505	1512	0 %	75 %	0 %	25 %	219681390
42	NC_011833	AGA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681390
43	NC_011833	A	9	9	1636	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
44	NC_011833	A	7	7	1681	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
45	NC_011833	TA	3	6	1689	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	219681390
46	NC_011833	TTAA	2	8	1703	1710	50 %	50 %	0 %	0 %	219681390
47	NC_011833	ATT	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681390
48	NC_011833	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681390
49	NC_011833	AGA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681390
50	NC_011833	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
51	NC_011833	ATC	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681390
52	NC_011833	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681390
53	NC_011833	GTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681390
54	NC_011833	A	6	6	1958	1963	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
55	NC_011833	GCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681390
56	NC_011833	TTA	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681390
57	NC_011833	A	7	7	2053	2059	100 %	0 %	0 %	0 %	219681390
58	NC_011833	AT	3	6	2310	2315	50 %	50 %	0 %	0 %	219681391
59	NC_011833	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681391
60	NC_011833	AGAT	2	8	2339	2346	50 %	25 %	25 %	0 %	219681391
61	NC_011833	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681391
62	NC_011833	TCT	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681391
63	NC_011833	ATT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681391
64	NC_011833	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
65	NC_011833	T	9	9	2442	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
66	NC_011833	T	6	6	2456	2461	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
67	NC_011833	A	8	8	2472	2479	100 %	0 %	0 %	0 %	219681391
68	NC_011833	TATT	2	8	2603	2610	25 %	75 %	0 %	0 %	219681391
69	NC_011833	T	7	7	2615	2621	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
70	NC_011833	GATT	2	8	2646	2653	25 %	50 %	25 %	0 %	219681391
71	NC_011833	ATTT	2	8	2661	2668	25 %	75 %	0 %	0 %	219681391
72	NC_011833	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681391
73	NC_011833	ATATTA	2	12	2717	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	219681391
74	NC_011833	T	8	8	2752	2759	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
75	NC_011833	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	219681391
76	NC_011833	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681391
77	NC_011833	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	219681391
78	NC_011833	TGC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219681391
79	NC_011833	TGG	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681391
80	NC_011833	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	219681391
81	NC_011833	TAA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681391
82	NC_011833	TTTTAT	2	12	3039	3050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	219681391
83	NC_011833	TA	3	6	3166	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	219681392
84	NC_011833	TGG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219681392
85	NC_011833	GGAATT	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681392
86	NC_011833	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681392
87	NC_011833	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	219681392
88	NC_011833	TA	3	6	3353	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	219681392
89	NC_011833	AT	3	6	3565	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	219681393
90	NC_011833	CCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219681393
91	NC_011833	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681393
92	NC_011833	A	7	7	3637	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	219681393
93	NC_011833	TA	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	219681393
94	NC_011833	A	9	9	3669	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	219681393
95	NC_011833	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681393
96	NC_011833	CAAA	2	8	3700	3707	75 %	0 %	0 %	25 %	219681393
97	NC_011833	AGA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681393
98	NC_011833	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681393
99	NC_011833	A	7	7	3791	3797	100 %	0 %	0 %	0 %	219681393
100	NC_011833	AGT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681393
101	NC_011833	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	219681393
102	NC_011833	A	8	8	3905	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	219681393
103	NC_011833	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681393
104	NC_011833	GTT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681393
105	NC_011833	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681393
106	NC_011833	AAT	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681394
107	NC_011833	AT	3	6	4070	4075	50 %	50 %	0 %	0 %	219681394
108	NC_011833	TTA	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681394
109	NC_011833	A	6	6	4105	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	219681394
110	NC_011833	T	6	6	4119	4124	0 %	100 %	0 %	0 %	219681394
111	NC_011833	TGA	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681394
112	NC_011833	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	219681394
113	NC_011833	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681394
114	NC_011833	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681394
115	NC_011833	AT	3	6	4241	4246	50 %	50 %	0 %	0 %	219681394
116	NC_011833	ATA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681394
117	NC_011833	CAT	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681394
118	NC_011833	TTC	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219681394
119	NC_011833	A	8	8	4383	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	219681394
120	NC_011833	TA	4	8	4398	4405	50 %	50 %	0 %	0 %	219681394
121	NC_011833	AAT	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681394
122	NC_011833	ATC	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219681394
123	NC_011833	AT	3	6	4526	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	219681395
124	NC_011833	ATTA	2	8	4559	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	219681395
125	NC_011833	AAGA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	25 %	0 %	219681395
126	NC_011833	AATC	2	8	4596	4603	50 %	25 %	0 %	25 %	219681395
127	NC_011833	TAT	2	6	4619	4624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681395
128	NC_011833	TAT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681395
129	NC_011833	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219681395
130	NC_011833	T	6	6	4835	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	219681395
131	NC_011833	AGT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681395
132	NC_011833	ATG	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219681395
133	NC_011833	T	7	7	4904	4910	0 %	100 %	0 %	0 %	219681395
134	NC_011833	AATT	2	8	5023	5030	50 %	50 %	0 %	0 %	219681395
135	NC_011833	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681395
136	NC_011833	ATT	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219681395
137	NC_011833	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219681395
138	NC_011833	A	6	6	5157	5162	100 %	0 %	0 %	0 %	219681395
139	NC_011833	AGA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219681395
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400	NC_011833	T	6	6	15042	15047	0 %	100 %	0 %	0 %	219681403
401	NC_011833	TTTCT	2	10	15053	15062	0 %	80 %	0 %	20 %	219681403
402	NC_011833	GGCA	2	8	15068	15075	25 %	0 %	50 %	25 %	219681403
403	NC_011833	TAAA	2	8	15095	15102	75 %	25 %	0 %	0 %	219681403
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