MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-4

Total Repeats: 404

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011785	T	8	8	174	181	0 %	100 %	0 %	0 %	218906786
2	NC_011785	T	7	7	186	192	0 %	100 %	0 %	0 %	218906786
3	NC_011785	A	8	8	213	220	100 %	0 %	0 %	0 %	218906786
4	NC_011785	AATC	2	8	230	237	50 %	25 %	0 %	25 %	218906786
5	NC_011785	ATTC	2	8	245	252	25 %	50 %	0 %	25 %	218906786
6	NC_011785	A	6	6	341	346	100 %	0 %	0 %	0 %	218906786
7	NC_011785	AT	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	218906786
8	NC_011785	AAC	2	6	402	407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
9	NC_011785	CTAT	2	8	489	496	25 %	50 %	0 %	25 %	218906786
10	NC_011785	ATTA	2	8	510	517	50 %	50 %	0 %	0 %	218906786
11	NC_011785	A	6	6	524	529	100 %	0 %	0 %	0 %	218906786
12	NC_011785	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
13	NC_011785	AAC	2	6	556	561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906786
14	NC_011785	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
15	NC_011785	A	6	6	632	637	100 %	0 %	0 %	0 %	218906786
16	NC_011785	CTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906786
17	NC_011785	AT	3	6	689	694	50 %	50 %	0 %	0 %	218906786
18	NC_011785	TCAA	2	8	718	725	50 %	25 %	0 %	25 %	218906786
19	NC_011785	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906786
20	NC_011785	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906786
21	NC_011785	CTA	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906786
22	NC_011785	T	7	7	794	800	0 %	100 %	0 %	0 %	218906786
23	NC_011785	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	218906786
24	NC_011785	T	6	6	921	926	0 %	100 %	0 %	0 %	218906786
25	NC_011785	ATT	2	6	1052	1057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
26	NC_011785	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
27	NC_011785	TTA	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
28	NC_011785	AAT	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906795
29	NC_011785	A	6	6	1138	1143	100 %	0 %	0 %	0 %	218906795
30	NC_011785	TTA	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906795
31	NC_011785	A	7	7	1341	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	218906795
32	NC_011785	AGA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906795
33	NC_011785	TA	3	6	1383	1388	50 %	50 %	0 %	0 %	218906795
34	NC_011785	G	7	7	1410	1416	0 %	0 %	100 %	0 %	218906795
35	NC_011785	AATC	2	8	1443	1450	50 %	25 %	0 %	25 %	218906795
36	NC_011785	ATC	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
37	NC_011785	TC	3	6	1470	1475	0 %	50 %	0 %	50 %	218906795
38	NC_011785	AT	3	6	1499	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	218906795
39	NC_011785	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	218906795
40	NC_011785	TAG	3	9	1538	1546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906795
41	NC_011785	TAC	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906795
42	NC_011785	A	6	6	1615	1620	100 %	0 %	0 %	0 %	218906795
43	NC_011785	A	7	7	2244	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	218906798
44	NC_011785	TAA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
45	NC_011785	AC	3	6	2303	2308	50 %	0 %	0 %	50 %	218906798
46	NC_011785	ACA	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
47	NC_011785	A	6	6	2331	2336	100 %	0 %	0 %	0 %	218906798
48	NC_011785	TAG	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906798
49	NC_011785	ACA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
50	NC_011785	TTA	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906798
51	NC_011785	AAC	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906798
52	NC_011785	TAA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906798
53	NC_011785	A	7	7	2501	2507	100 %	0 %	0 %	0 %	218906798
54	NC_011785	TAC	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
55	NC_011785	CAAT	2	8	2528	2535	50 %	25 %	0 %	25 %	218906798
56	NC_011785	ACT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906798
57	NC_011785	ACA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
58	NC_011785	AAC	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
59	NC_011785	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906780
60	NC_011785	CAA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906780
61	NC_011785	AAACA	2	10	3183	3192	80 %	0 %	0 %	20 %	218906780
62	NC_011785	A	6	6	3209	3214	100 %	0 %	0 %	0 %	218906780
63	NC_011785	A	9	9	3243	3251	100 %	0 %	0 %	0 %	218906780
64	NC_011785	A	6	6	3324	3329	100 %	0 %	0 %	0 %	218906780
65	NC_011785	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906780
66	NC_011785	TTAA	2	8	3660	3667	50 %	50 %	0 %	0 %	218906782
67	NC_011785	ATA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906782
68	NC_011785	T	8	8	4042	4049	0 %	100 %	0 %	0 %	218906790
69	NC_011785	AAAT	2	8	4085	4092	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
70	NC_011785	TAA	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
71	NC_011785	AGA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
72	NC_011785	ATT	2	6	4168	4173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906790
73	NC_011785	CAAAA	2	10	4174	4183	80 %	0 %	0 %	20 %	218906790
74	NC_011785	A	6	6	4180	4185	100 %	0 %	0 %	0 %	218906790
75	NC_011785	AGA	2	6	4197	4202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
76	NC_011785	AGA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
77	NC_011785	A	9	9	4212	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	218906790
78	NC_011785	ATA	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
79	NC_011785	AAAT	2	8	4280	4287	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
80	NC_011785	TATAT	2	10	4306	4315	40 %	60 %	0 %	0 %	218906790
81	NC_011785	AAAT	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	218906790
82	NC_011785	ACA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
83	NC_011785	A	6	6	4486	4491	100 %	0 %	0 %	0 %	218906790
84	NC_011785	TAAAA	2	10	4527	4536	80 %	20 %	0 %	0 %	218906790
85	NC_011785	AT	3	6	4554	4559	50 %	50 %	0 %	0 %	218906790
86	NC_011785	TAA	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
87	NC_011785	ATC	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
88	NC_011785	AGA	2	6	4617	4622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906790
89	NC_011785	CGCAAT	2	12	4632	4643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218906790
90	NC_011785	ATC	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906790
91	NC_011785	CAA	2	6	4728	4733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906790
92	NC_011785	AAT	2	6	4738	4743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906790
93	NC_011785	GAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
94	NC_011785	A	6	6	4756	4761	100 %	0 %	0 %	0 %	218906790
95	NC_011785	A	7	7	4767	4773	100 %	0 %	0 %	0 %	218906790
96	NC_011785	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218906790
97	NC_011785	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218906790
98	NC_011785	TTAA	2	8	4807	4814	50 %	50 %	0 %	0 %	218906790
99	NC_011785	ATT	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906792
100	NC_011785	TAA	2	6	5166	5171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
101	NC_011785	TAA	2	6	5254	5259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906792
102	NC_011785	AAAAG	2	10	5274	5283	80 %	0 %	20 %	0 %	218906792
103	NC_011785	AT	3	6	6624	6629	50 %	50 %	0 %	0 %	218906797
104	NC_011785	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906797
105	NC_011785	AGA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906797
106	NC_011785	A	6	6	6765	6770	100 %	0 %	0 %	0 %	218906797
107	NC_011785	AAAT	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	218906797
108	NC_011785	A	7	7	6797	6803	100 %	0 %	0 %	0 %	218906797
109	NC_011785	AGA	3	9	8857	8865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
110	NC_011785	A	6	6	8873	8878	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
111	NC_011785	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
112	NC_011785	GAA	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
113	NC_011785	A	6	6	8900	8905	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
114	NC_011785	CAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
115	NC_011785	GAA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
116	NC_011785	A	6	6	8927	8932	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
117	NC_011785	CAA	2	6	8933	8938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
118	NC_011785	GAA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
119	NC_011785	GAAG	2	8	8947	8954	50 %	0 %	50 %	0 %	218906794
120	NC_011785	ACA	2	6	8965	8970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
121	NC_011785	A	6	6	8974	8979	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
122	NC_011785	A	6	6	8998	9003	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
123	NC_011785	AGA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
124	NC_011785	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906794
125	NC_011785	ATAA	2	8	9233	9240	75 %	25 %	0 %	0 %	218906794
126	NC_011785	GGA	2	6	9284	9289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218906794
127	NC_011785	A	6	6	9323	9328	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
128	NC_011785	TA	4	8	9393	9400	50 %	50 %	0 %	0 %	218906794
129	NC_011785	A	7	7	9424	9430	100 %	0 %	0 %	0 %	218906794
130	NC_011785	TTA	2	6	9434	9439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218906794
131	NC_011785	TAA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218906794
132	NC_011785	CAA	2	6	9512	9517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906794
133	NC_011785	AGA	2	6	9538	9543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218906794
134	NC_011785	ACT	2	6	9863	9868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218906789
135	NC_011785	TA	3	6	9906	9911	50 %	50 %	0 %	0 %	218906789
136	NC_011785	CT	3	6	9912	9917	0 %	50 %	0 %	50 %	218906789
137	NC_011785	CTG	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218906789
138	NC_011785	ATTG	2	8	9989	9996	25 %	50 %	25 %	0 %	218906789
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140	NC_011785	ACA	2	6	11885	11890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218906784
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.