MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp25

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011783	TTAT	2	8	348	355	25 %	75 %	0 %	0 %	219405374
2	NC_011783	A	6	6	359	364	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
3	NC_011783	TAT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
4	NC_011783	AAT	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
5	NC_011783	AGA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219405374
6	NC_011783	TCT	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
7	NC_011783	T	9	9	426	434	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
8	NC_011783	TAA	2	6	506	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
9	NC_011783	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
10	NC_011783	TTTTCT	2	12	523	534	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219405374
11	NC_011783	TCT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
12	NC_011783	TTA	2	6	571	576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
13	NC_011783	AAGTA	2	10	607	616	60 %	20 %	20 %	0 %	219405374
14	NC_011783	T	6	6	664	669	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
15	NC_011783	TTTCTT	2	12	701	712	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	219405374
16	NC_011783	CAA	2	6	764	769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219405374
17	NC_011783	TCT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
18	NC_011783	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
19	NC_011783	AAT	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
20	NC_011783	T	6	6	825	830	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
21	NC_011783	TCA	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405374
22	NC_011783	TA	4	8	861	868	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
23	NC_011783	CA	3	6	876	881	50 %	0 %	0 %	50 %	219405374
24	NC_011783	TTGC	2	8	931	938	0 %	50 %	25 %	25 %	219405374
25	NC_011783	TATC	2	8	1010	1017	25 %	50 %	0 %	25 %	219405374
26	NC_011783	CTTT	2	8	1033	1040	0 %	75 %	0 %	25 %	219405374
27	NC_011783	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
28	NC_011783	TGA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
29	NC_011783	TAT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
30	NC_011783	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
31	NC_011783	T	6	6	1170	1175	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
32	NC_011783	AT	3	6	1183	1188	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
33	NC_011783	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
34	NC_011783	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
35	NC_011783	TAT	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
36	NC_011783	CTT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
37	NC_011783	AATTC	2	10	1309	1318	40 %	40 %	0 %	20 %	219405374
38	NC_011783	ACT	2	6	1380	1385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405374
39	NC_011783	T	7	7	1484	1490	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
40	NC_011783	AT	3	6	1532	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
41	NC_011783	ATTC	2	8	1562	1569	25 %	50 %	0 %	25 %	219405374
42	NC_011783	TTA	2	6	1613	1618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
43	NC_011783	TAAAT	2	10	1623	1632	60 %	40 %	0 %	0 %	219405374
44	NC_011783	CCA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219405374
45	NC_011783	ATT	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
46	NC_011783	T	7	7	1723	1729	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
47	NC_011783	GAT	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
48	NC_011783	A	7	7	1838	1844	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
49	NC_011783	GGA	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219405374
50	NC_011783	CTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
51	NC_011783	AATTC	2	10	1921	1930	40 %	40 %	0 %	20 %	219405374
52	NC_011783	A	6	6	1938	1943	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
53	NC_011783	TAG	2	6	1948	1953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
54	NC_011783	T	6	6	1970	1975	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
55	NC_011783	T	6	6	1979	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
56	NC_011783	TTAA	2	8	2098	2105	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
57	NC_011783	ATT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
58	NC_011783	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
59	NC_011783	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
60	NC_011783	TAG	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
61	NC_011783	T	6	6	2213	2218	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
62	NC_011783	TCT	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
63	NC_011783	T	7	7	2258	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
64	NC_011783	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
65	NC_011783	ATG	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
66	NC_011783	GTG	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219405374
67	NC_011783	CTT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
68	NC_011783	CAT	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405374
69	NC_011783	AAT	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
70	NC_011783	TTC	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
71	NC_011783	T	7	7	2568	2574	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
72	NC_011783	A	6	6	2638	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
73	NC_011783	GCT	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219405374
74	NC_011783	TGA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405374
75	NC_011783	AGTCA	2	10	2736	2745	40 %	20 %	20 %	20 %	219405374
76	NC_011783	TTTC	2	8	2769	2776	0 %	75 %	0 %	25 %	219405374
77	NC_011783	CTT	2	6	2855	2860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
78	NC_011783	AAT	2	6	2889	2894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
79	NC_011783	T	7	7	3010	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
80	NC_011783	TTC	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
81	NC_011783	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
82	NC_011783	TCT	2	6	3100	3105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
83	NC_011783	TTA	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
84	NC_011783	T	7	7	3182	3188	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
85	NC_011783	T	6	6	3202	3207	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
86	NC_011783	TCA	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405374
87	NC_011783	A	8	8	3221	3228	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
88	NC_011783	AGA	2	6	3243	3248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219405374
89	NC_011783	TCT	2	6	3265	3270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
90	NC_011783	AT	3	6	3301	3306	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
91	NC_011783	A	6	6	3312	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
92	NC_011783	TAAAA	2	10	3324	3333	80 %	20 %	0 %	0 %	219405374
93	NC_011783	TTC	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
94	NC_011783	GCTA	2	8	3354	3361	25 %	25 %	25 %	25 %	219405374
95	NC_011783	AT	4	8	3408	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
96	NC_011783	T	6	6	3415	3420	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
97	NC_011783	GTC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219405374
98	NC_011783	TC	3	6	3450	3455	0 %	50 %	0 %	50 %	219405374
99	NC_011783	T	6	6	3476	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
100	NC_011783	ATTAC	2	10	3526	3535	40 %	40 %	0 %	20 %	219405374
101	NC_011783	TCTT	2	8	3549	3556	0 %	75 %	0 %	25 %	219405374
102	NC_011783	AAAC	2	8	3578	3585	75 %	0 %	0 %	25 %	219405374
103	NC_011783	TTC	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
104	NC_011783	TTC	2	6	3612	3617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
105	NC_011783	AT	3	6	3640	3645	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
106	NC_011783	T	6	6	3647	3652	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
107	NC_011783	TA	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
108	NC_011783	TCT	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
109	NC_011783	ATT	2	6	3849	3854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
110	NC_011783	T	8	8	3853	3860	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
111	NC_011783	CTT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
112	NC_011783	TAT	2	6	3875	3880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
113	NC_011783	CTTTGT	2	12	3890	3901	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	219405374
114	NC_011783	ACTCC	2	10	3932	3941	20 %	20 %	0 %	60 %	219405374
115	NC_011783	TGT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219405374
116	NC_011783	AAT	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405374
117	NC_011783	TTC	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405374
118	NC_011783	AT	3	6	3992	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
119	NC_011783	ATC	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405374
120	NC_011783	A	6	6	4046	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
121	NC_011783	T	6	6	4057	4062	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
122	NC_011783	A	6	6	4071	4076	100 %	0 %	0 %	0 %	219405374
123	NC_011783	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
124	NC_011783	T	6	6	4102	4107	0 %	100 %	0 %	0 %	219405374
125	NC_011783	AT	3	6	4139	4144	50 %	50 %	0 %	0 %	219405374
126	NC_011783	ATT	2	6	4149	4154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405374
127	NC_011783	ATT	2	6	4490	4495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405382
128	NC_011783	TCT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405382
129	NC_011783	GAT	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219405382
130	NC_011783	ATC	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219405382
131	NC_011783	ACAAA	2	10	4551	4560	80 %	0 %	0 %	20 %	219405382
132	NC_011783	TATT	2	8	4563	4570	25 %	75 %	0 %	0 %	219405382
133	NC_011783	CAAAT	2	10	4755	4764	60 %	20 %	0 %	20 %	219405376
134	NC_011783	ATT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219405376
135	NC_011783	CTT	2	6	6617	6622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219405385
136	NC_011783	TTG	2	6	6670	6675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219405385
137	NC_011783	ATA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219405385
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139	NC_011783	AT	4	8	6934	6941	50 %	50 %	0 %	0 %	219405387
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.