MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_3

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011776	ATAG	2	8	160	167	50 %	25 %	25 %	0 %	218848182
2	NC_011776	TAA	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848182
3	NC_011776	A	7	7	178	184	100 %	0 %	0 %	0 %	218848182
4	NC_011776	CAA	2	6	224	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218848182
5	NC_011776	A	6	6	263	268	100 %	0 %	0 %	0 %	218848182
6	NC_011776	CATAT	2	10	501	510	40 %	40 %	0 %	20 %	218848184
7	NC_011776	GTT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848184
8	NC_011776	CTTCC	2	10	563	572	0 %	40 %	0 %	60 %	218848184
9	NC_011776	T	6	6	627	632	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
10	NC_011776	TTG	2	6	636	641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848184
11	NC_011776	TGTA	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	218848184
12	NC_011776	TC	5	10	720	729	0 %	50 %	0 %	50 %	218848184
13	NC_011776	TGA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218848184
14	NC_011776	T	6	6	795	800	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
15	NC_011776	CCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218848184
16	NC_011776	T	6	6	872	877	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
17	NC_011776	TTCG	2	8	891	898	0 %	50 %	25 %	25 %	218848184
18	NC_011776	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848184
19	NC_011776	T	6	6	954	959	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
20	NC_011776	T	7	7	971	977	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
21	NC_011776	TTGATT	2	12	994	1005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218848184
22	NC_011776	CTTTTT	2	12	1038	1049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218848184
23	NC_011776	TC	3	6	1083	1088	0 %	50 %	0 %	50 %	218848184
24	NC_011776	TCTTTT	2	12	1093	1104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218848184
25	NC_011776	CATC	2	8	1118	1125	25 %	25 %	0 %	50 %	218848184
26	NC_011776	T	7	7	1129	1135	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
27	NC_011776	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
28	NC_011776	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	218848184
29	NC_011776	TGG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218848184
30	NC_011776	GTT	2	6	1319	1324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848184
31	NC_011776	T	6	6	1323	1328	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
32	NC_011776	ACA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218848184
33	NC_011776	GTT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848184
34	NC_011776	T	7	7	1408	1414	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
35	NC_011776	T	6	6	1448	1453	0 %	100 %	0 %	0 %	218848184
36	NC_011776	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	218848184
37	NC_011776	GTT	2	6	1466	1471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218848184
38	NC_011776	GTAAC	2	10	1502	1511	40 %	20 %	20 %	20 %	218848184
39	NC_011776	TCAT	2	8	1573	1580	25 %	50 %	0 %	25 %	218848184
40	NC_011776	CTT	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218848184
41	NC_011776	C	6	6	1744	1749	0 %	0 %	0 %	100 %	218848184
42	NC_011776	GA	3	6	1778	1783	50 %	0 %	50 %	0 %	218848184
43	NC_011776	AAT	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848184
44	NC_011776	A	7	7	1876	1882	100 %	0 %	0 %	0 %	218848184
45	NC_011776	GAAT	2	8	2182	2189	50 %	25 %	25 %	0 %	218848180
46	NC_011776	ATA	2	6	2205	2210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848180
47	NC_011776	T	6	6	2278	2283	0 %	100 %	0 %	0 %	218848180
48	NC_011776	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	218848180
49	NC_011776	TA	3	6	2319	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	218848180
50	NC_011776	ACT	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218848180
51	NC_011776	ACA	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218848180
52	NC_011776	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218848183
53	NC_011776	TAA	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218848183
54	NC_011776	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	218848183
55	NC_011776	TA	3	6	2529	2534	50 %	50 %	0 %	0 %	218848183
56	NC_011776	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	218848183
57	NC_011776	GCTG	2	8	2584	2591	0 %	25 %	50 %	25 %	218848183
58	NC_011776	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	218848181
59	NC_011776	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	218848181
60	NC_011776	TAC	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218848181
61	NC_011776	A	8	8	2852	2859	100 %	0 %	0 %	0 %	218848181
62	NC_011776	A	6	6	2862	2867	100 %	0 %	0 %	0 %	218848181
63	NC_011776	AT	3	6	2870	2875	50 %	50 %	0 %	0 %	218848181

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.