MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_12

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011654	T	6	6	225	230	0 %	100 %	0 %	0 %	217316528
2	NC_011654	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
3	NC_011654	GTT	3	9	303	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
4	NC_011654	TACT	2	8	344	351	25 %	50 %	0 %	25 %	217316528
5	NC_011654	TCT	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
6	NC_011654	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
7	NC_011654	AT	3	6	507	512	50 %	50 %	0 %	0 %	217316528
8	NC_011654	ACT	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316528
9	NC_011654	GAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
10	NC_011654	AATG	2	8	684	691	50 %	25 %	25 %	0 %	217316528
11	NC_011654	TTG	2	6	731	736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
12	NC_011654	ATG	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
13	NC_011654	CAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316528
14	NC_011654	A	7	7	835	841	100 %	0 %	0 %	0 %	217316528
15	NC_011654	T	6	6	894	899	0 %	100 %	0 %	0 %	217316528
16	NC_011654	AAAAAG	2	12	937	948	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
17	NC_011654	GAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
18	NC_011654	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
19	NC_011654	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
20	NC_011654	TAT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
21	NC_011654	AAAAAG	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
22	NC_011654	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
23	NC_011654	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
24	NC_011654	A	6	6	1132	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	217316528
25	NC_011654	AGA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
26	NC_011654	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
27	NC_011654	AAAAGA	2	12	1227	1238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
28	NC_011654	TG	3	6	1466	1471	0 %	50 %	50 %	0 %	217316519
29	NC_011654	GGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217316519
30	NC_011654	TGAT	2	8	1503	1510	25 %	50 %	25 %	0 %	217316519
31	NC_011654	AGA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
32	NC_011654	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
33	NC_011654	TAA	3	9	1609	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
34	NC_011654	TAT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
35	NC_011654	TA	3	6	1634	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	217316519
36	NC_011654	A	7	7	1653	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
37	NC_011654	AGAT	2	8	1662	1669	50 %	25 %	25 %	0 %	217316519
38	NC_011654	A	7	7	1741	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
39	NC_011654	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
40	NC_011654	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
41	NC_011654	TAT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
42	NC_011654	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
43	NC_011654	GAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
44	NC_011654	GA	3	6	1970	1975	50 %	0 %	50 %	0 %	217316519
45	NC_011654	A	7	7	1980	1986	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
46	NC_011654	AATT	2	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	217316519
47	NC_011654	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
48	NC_011654	A	6	6	2212	2217	100 %	0 %	0 %	0 %	217316530
49	NC_011654	AT	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	217316530
50	NC_011654	AAGA	2	8	2266	2273	75 %	0 %	25 %	0 %	217316530
51	NC_011654	TCA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316530
52	NC_011654	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316530
53	NC_011654	ATA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316530
54	NC_011654	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316518
55	NC_011654	A	6	6	2515	2520	100 %	0 %	0 %	0 %	217316518
56	NC_011654	AG	3	6	2574	2579	50 %	0 %	50 %	0 %	217316518
57	NC_011654	A	6	6	2591	2596	100 %	0 %	0 %	0 %	217316518
58	NC_011654	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316518
59	NC_011654	TGA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316518
60	NC_011654	ATTG	2	8	2715	2722	25 %	50 %	25 %	0 %	217316518
61	NC_011654	TAA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316518
62	NC_011654	CTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316526
63	NC_011654	AG	3	6	3394	3399	50 %	0 %	50 %	0 %	217316526
64	NC_011654	TTG	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316526
65	NC_011654	A	6	6	3475	3480	100 %	0 %	0 %	0 %	217316526
66	NC_011654	GAT	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316526
67	NC_011654	ATG	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316522
68	NC_011654	GCG	3	9	3631	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217316522
69	NC_011654	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316522
70	NC_011654	AATT	2	8	3703	3710	50 %	50 %	0 %	0 %	217316522
71	NC_011654	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316520
72	NC_011654	GTT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
73	NC_011654	TTGG	2	8	3867	3874	0 %	50 %	50 %	0 %	217316520
74	NC_011654	ATTT	2	8	3916	3923	25 %	75 %	0 %	0 %	217316520
75	NC_011654	TGT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
76	NC_011654	AT	3	6	3984	3989	50 %	50 %	0 %	0 %	217316520
77	NC_011654	A	7	7	4012	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	217316520
78	NC_011654	ATG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
79	NC_011654	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316524
80	NC_011654	TAA	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
81	NC_011654	A	6	6	4376	4381	100 %	0 %	0 %	0 %	217316524
82	NC_011654	TAAAA	2	10	4399	4408	80 %	20 %	0 %	0 %	217316524
83	NC_011654	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
84	NC_011654	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
85	NC_011654	TAA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
86	NC_011654	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217316524
87	NC_011654	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
88	NC_011654	GTA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
89	NC_011654	ATG	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
90	NC_011654	A	6	6	4687	4692	100 %	0 %	0 %	0 %	217316524
91	NC_011654	ATA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
92	NC_011654	GAAA	2	8	4729	4736	75 %	0 %	25 %	0 %	217316524
93	NC_011654	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
94	NC_011654	ACG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217316524
95	NC_011654	TGT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316524
96	NC_011654	TGATT	2	10	4855	4864	20 %	60 %	20 %	0 %	217316524
97	NC_011654	AAG	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
98	NC_011654	AGA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
99	NC_011654	GAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
100	NC_011654	CAAG	2	8	5307	5314	50 %	0 %	25 %	25 %	217316524
101	NC_011654	GA	4	8	5363	5370	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
102	NC_011654	GA	3	6	5383	5388	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
103	NC_011654	GA	3	6	5419	5424	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
104	NC_011654	GTAT	2	8	5446	5453	25 %	50 %	25 %	0 %	217316516
105	NC_011654	ATT	2	6	5498	5503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316516
106	NC_011654	TA	5	10	5514	5523	50 %	50 %	0 %	0 %	217316516
107	NC_011654	TGT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316516
108	NC_011654	CTA	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316516
109	NC_011654	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	217316523
110	NC_011654	TGA	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
111	NC_011654	TATG	2	8	6810	6817	25 %	50 %	25 %	0 %	217316523
112	NC_011654	GTA	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
113	NC_011654	GAT	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
114	NC_011654	TTA	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
115	NC_011654	A	6	6	7043	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	217316523
116	NC_011654	TTG	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316523
117	NC_011654	TTA	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
118	NC_011654	AAT	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316523
119	NC_011654	TAA	2	6	7174	7179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316525
120	NC_011654	TAG	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316525
121	NC_011654	A	6	6	7221	7226	100 %	0 %	0 %	0 %	217316525
122	NC_011654	AGAGA	2	10	7240	7249	60 %	0 %	40 %	0 %	217316525
123	NC_011654	AACC	2	8	7272	7279	50 %	0 %	0 %	50 %	217316525
124	NC_011654	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316525
125	NC_011654	AGA	2	6	7373	7378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
126	NC_011654	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
127	NC_011654	GAA	2	6	7398	7403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
128	NC_011654	CAA	2	6	7473	7478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
129	NC_011654	TTA	2	6	7494	7499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316514
130	NC_011654	ATG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
131	NC_011654	AATT	2	8	7579	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	217316514
132	NC_011654	GA	3	6	7697	7702	50 %	0 %	50 %	0 %	217316514
133	NC_011654	CAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
134	NC_011654	ATGT	2	8	7736	7743	25 %	50 %	25 %	0 %	217316514
135	NC_011654	TTTG	2	8	7792	7799	0 %	75 %	25 %	0 %	217316529
136	NC_011654	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
137	NC_011654	TCT	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316529
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.