MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl42

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011254	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
2	NC_011254	TTG	2	6	835	840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288731
3	NC_011254	TCT	2	6	872	877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
4	NC_011254	CCT	2	6	906	911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288731
5	NC_011254	ATT	2	6	944	949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288731
6	NC_011254	TGC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
7	NC_011254	AGC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
8	NC_011254	T	6	6	1087	1092	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
9	NC_011254	CAT	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
10	NC_011254	TCTT	2	8	1127	1134	0 %	75 %	0 %	25 %	203288731
11	NC_011254	AGC	3	9	1135	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
12	NC_011254	CAG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
13	NC_011254	CAG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
14	NC_011254	AT	3	6	1221	1226	50 %	50 %	0 %	0 %	203288731
15	NC_011254	TGC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288731
16	NC_011254	CAG	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
17	NC_011254	T	6	6	1324	1329	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
18	NC_011254	GTAGCA	2	12	1349	1360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288731
19	NC_011254	ACA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288731
20	NC_011254	CAG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
21	NC_011254	AGC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
22	NC_011254	CAG	3	9	1458	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
23	NC_011254	GCA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288731
24	NC_011254	ATC	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
25	NC_011254	CTT	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288731
26	NC_011254	CTTC	2	8	1623	1630	0 %	50 %	0 %	50 %	203288731
27	NC_011254	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288731
28	NC_011254	CAT	3	9	1813	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
29	NC_011254	CAT	4	12	1825	1836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
30	NC_011254	ACT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288731
31	NC_011254	T	6	6	1867	1872	0 %	100 %	0 %	0 %	203288731
32	NC_011254	ATTC	2	8	1879	1886	25 %	50 %	0 %	25 %	203288731
33	NC_011254	ATT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
34	NC_011254	ACT	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
35	NC_011254	CTT	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
36	NC_011254	CTT	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
37	NC_011254	AT	3	6	3564	3569	50 %	50 %	0 %	0 %	203288732
38	NC_011254	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
39	NC_011254	AGC	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
40	NC_011254	ACC	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
41	NC_011254	TCGC	2	8	3666	3673	0 %	25 %	25 %	50 %	203288732
42	NC_011254	CAC	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
43	NC_011254	CTT	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
44	NC_011254	AT	3	6	3777	3782	50 %	50 %	0 %	0 %	203288732
45	NC_011254	CTC	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288732
46	NC_011254	TGC	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288732
47	NC_011254	CTTT	2	8	3828	3835	0 %	75 %	0 %	25 %	203288732
48	NC_011254	CAT	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
49	NC_011254	CAG	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288732
50	NC_011254	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288732
51	NC_011254	TCTCCA	2	12	3890	3901	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288732
52	NC_011254	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
53	NC_011254	CTA	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288732
54	NC_011254	TAT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
55	NC_011254	TTCTT	2	10	4184	4193	0 %	80 %	0 %	20 %	203288732
56	NC_011254	CAA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288732
57	NC_011254	TTA	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288732
58	NC_011254	CTT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
59	NC_011254	CTT	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288732
60	NC_011254	TCCT	2	8	4396	4403	0 %	50 %	0 %	50 %	203288732
61	NC_011254	ACCATC	2	12	4433	4444	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203288732
62	NC_011254	ACC	3	9	4445	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288732
63	NC_011254	T	8	8	4458	4465	0 %	100 %	0 %	0 %	203288732
64	NC_011254	ATTT	2	8	5595	5602	25 %	75 %	0 %	0 %	203288733
65	NC_011254	CTT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
66	NC_011254	TTA	2	6	5691	5696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
67	NC_011254	ATTA	2	8	5717	5724	50 %	50 %	0 %	0 %	203288733
68	NC_011254	TTA	2	6	5748	5753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
69	NC_011254	GCC	2	6	5769	5774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288733
70	NC_011254	AGC	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
71	NC_011254	CAGTAG	2	12	5896	5907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203288733
72	NC_011254	CAT	3	9	5920	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
73	NC_011254	AGC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
74	NC_011254	ATT	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
75	NC_011254	ATCA	2	8	5975	5982	50 %	25 %	0 %	25 %	203288733
76	NC_011254	TCA	2	6	6009	6014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
77	NC_011254	TAG	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288733
78	NC_011254	AAT	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
79	NC_011254	CTT	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
80	NC_011254	AAT	2	6	6164	6169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
81	NC_011254	GCA	3	9	6201	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
82	NC_011254	CAG	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288733
83	NC_011254	TCACT	2	10	6295	6304	20 %	40 %	0 %	40 %	203288733
84	NC_011254	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
85	NC_011254	ATTTA	2	10	6377	6386	40 %	60 %	0 %	0 %	203288733
86	NC_011254	TCT	2	6	6415	6420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288733
87	NC_011254	TTA	2	6	6538	6543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288733
88	NC_011254	A	6	6	6552	6557	100 %	0 %	0 %	0 %	203288733
89	NC_011254	CTC	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288733
90	NC_011254	CAT	2	6	6614	6619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
91	NC_011254	CAT	4	12	6623	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288733
92	NC_011254	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288733
93	NC_011254	T	6	6	6665	6670	0 %	100 %	0 %	0 %	203288733
94	NC_011254	ATTC	2	8	6677	6684	25 %	50 %	0 %	25 %	203288733
95	NC_011254	CAT	3	9	8166	8174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
96	NC_011254	ACT	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
97	NC_011254	TAA	2	6	8236	8241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
98	NC_011254	TAA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
99	NC_011254	TTG	2	6	8310	8315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
100	NC_011254	ATC	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
101	NC_011254	ATT	2	6	8438	8443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
102	NC_011254	TTTTGA	2	12	8483	8494	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203288734
103	NC_011254	ATA	2	6	8506	8511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
104	NC_011254	TAT	2	6	8547	8552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
105	NC_011254	CCA	2	6	8555	8560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288734
106	NC_011254	CTA	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
107	NC_011254	AAT	2	6	8614	8619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
108	NC_011254	CAT	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288734
109	NC_011254	TAG	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288734
110	NC_011254	TCT	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288734
111	NC_011254	TGT	2	6	8755	8760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
112	NC_011254	TTA	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288734
113	NC_011254	AAT	2	6	8811	8816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
114	NC_011254	GAT	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288734
115	NC_011254	ATA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288734
116	NC_011254	CTT	2	6	8883	8888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288734
117	NC_011254	GTT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288734
118	NC_011254	ATAA	2	8	8926	8933	75 %	25 %	0 %	0 %	203288734
119	NC_011254	CAG	2	6	8934	8939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288734
120	NC_011254	CAC	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288734
121	NC_011254	AATT	2	8	8991	8998	50 %	50 %	0 %	0 %	203288734
122	NC_011254	TTTAA	2	10	9482	9491	40 %	60 %	0 %	0 %	203288735
123	NC_011254	ATA	2	6	9502	9507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288735
124	NC_011254	T	7	7	9516	9522	0 %	100 %	0 %	0 %	203288735
125	NC_011254	ATT	3	9	9562	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
126	NC_011254	TC	3	6	9602	9607	0 %	50 %	0 %	50 %	203288735
127	NC_011254	CT	3	6	9623	9628	0 %	50 %	0 %	50 %	203288735
128	NC_011254	TAC	2	6	9741	9746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288735
129	NC_011254	ATT	2	6	9784	9789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
130	NC_011254	TTC	2	6	9796	9801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288735
131	NC_011254	TTC	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288735
132	NC_011254	ATT	2	6	9832	9837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288735
133	NC_011254	TACA	2	8	9870	9877	50 %	25 %	0 %	25 %	203288735
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135	NC_011254	ATC	2	6	9952	9957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288735
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250	NC_011254	T	6	6	18412	18417	0 %	100 %	0 %	0 %	203288741
251	NC_011254	GTA	2	6	18472	18477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288741
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257	NC_011254	T	8	8	18683	18690	0 %	100 %	0 %	0 %	203288741
258	NC_011254	ATTT	2	8	18698	18705	25 %	75 %	0 %	0 %	203288741
259	NC_011254	AT	3	6	20322	20327	50 %	50 %	0 %	0 %	203288742
260	NC_011254	ACA	2	6	20334	20339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288742
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262	NC_011254	GTT	2	6	20378	20383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288742
263	NC_011254	ATT	2	6	20399	20404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288742
264	NC_011254	TAA	3	9	20448	20456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288742
265	NC_011254	TTA	2	6	20457	20462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288742
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269	NC_011254	ATC	2	6	20705	20710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288742
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271	NC_011254	T	6	6	22494	22499	0 %	100 %	0 %	0 %	203288743
272	NC_011254	T	6	6	22501	22506	0 %	100 %	0 %	0 %	203288743
273	NC_011254	TTC	2	6	22526	22531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288743
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280	NC_011254	TAT	2	6	22706	22711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288743
281	NC_011254	ATT	2	6	22724	22729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288743
282	NC_011254	TA	4	8	22753	22760	50 %	50 %	0 %	0 %	203288743
283	NC_011254	AATT	2	8	22771	22778	50 %	50 %	0 %	0 %	203288743
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286	NC_011254	T	6	6	22850	22855	0 %	100 %	0 %	0 %	203288743
287	NC_011254	AATTTA	2	12	22920	22931	50 %	50 %	0 %	0 %	203288743
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304	NC_011254	ATT	2	6	25131	25136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288744
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382	NC_011254	TGCTGG	3	18	32310	32327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	203288747
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389	NC_011254	TAA	3	9	32511	32519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288747
390	NC_011254	TGC	4	12	32529	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288747
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392	NC_011254	TGA	2	6	32619	32624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
393	NC_011254	TGT	2	6	32658	32663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288747
394	NC_011254	TAA	3	9	32667	32675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288747
395	NC_011254	TGCTAA	2	12	32679	32690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288747
396	NC_011254	AGG	2	6	32715	32720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288747
397	NC_011254	TGT	2	6	32796	32801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288747
398	NC_011254	AAG	2	6	32856	32861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288747
399	NC_011254	TGA	2	6	32868	32873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288747
400	NC_011254	AATTAA	2	12	32898	32909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288747
401	NC_011254	ATC	2	6	32928	32933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288747
402	NC_011254	TGG	2	6	32949	32954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288747
403	NC_011254	AAAT	2	8	32958	32965	75 %	25 %	0 %	0 %	203288747
404	NC_011254	AG	3	6	33624	33629	50 %	0 %	50 %	0 %	203288748
405	NC_011254	AG	4	8	33634	33641	50 %	0 %	50 %	0 %	203288748
406	NC_011254	AG	3	6	33657	33662	50 %	0 %	50 %	0 %	203288748
407	NC_011254	AAT	2	6	33685	33690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288748
408	NC_011254	TGA	2	6	33693	33698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288748
409	NC_011254	AGGA	2	8	33735	33742	50 %	0 %	50 %	0 %	203288748
410	NC_011254	AGGA	2	8	33794	33801	50 %	0 %	50 %	0 %	203288748
411	NC_011254	A	6	6	33834	33839	100 %	0 %	0 %	0 %	203288748
412	NC_011254	TTG	2	6	33909	33914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288748
413	NC_011254	A	8	8	33925	33932	100 %	0 %	0 %	0 %	203288748
414	NC_011254	CTG	2	6	33948	33953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288748
415	NC_011254	TAA	2	6	33961	33966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288748
416	NC_011254	CTAAGA	2	12	34086	34097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288748
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419	NC_011254	ATA	2	6	34191	34196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288748
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422	NC_011254	TAA	2	6	34267	34272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288748
423	NC_011254	CTT	2	6	34308	34313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288748
424	NC_011254	A	8	8	35440	35447	100 %	0 %	0 %	0 %	203288749
425	NC_011254	TGG	3	9	35451	35459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288749
426	NC_011254	TGATGG	2	12	35460	35471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288749
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428	NC_011254	AATA	2	8	35513	35520	75 %	25 %	0 %	0 %	203288749
429	NC_011254	AAG	2	6	35618	35623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288749
430	NC_011254	AAG	2	6	35645	35650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288749
431	NC_011254	TAA	2	6	35686	35691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288749
432	NC_011254	TTG	2	6	35694	35699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288749
433	NC_011254	GAAG	2	8	35707	35714	50 %	0 %	50 %	0 %	203288749
434	NC_011254	GATAA	2	10	35777	35786	60 %	20 %	20 %	0 %	203288749
435	NC_011254	TAG	2	6	35895	35900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288749
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439	NC_011254	TGC	2	6	36046	36051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288749
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442	NC_011254	GCA	2	6	36089	36094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288749
443	NC_011254	AGG	2	6	36103	36108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288749
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