MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl41

Total Repeats: 644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011251	TAA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
2	NC_011251	T	6	6	38	43	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
3	NC_011251	TCC	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
4	NC_011251	AATTT	2	10	136	145	40 %	60 %	0 %	0 %	203288702
5	NC_011251	TTC	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
6	NC_011251	CAA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
7	NC_011251	TTTTA	2	10	227	236	20 %	80 %	0 %	0 %	203288702
8	NC_011251	CT	3	6	244	249	0 %	50 %	0 %	50 %	203288702
9	NC_011251	CTA	3	9	268	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
10	NC_011251	TAT	2	6	316	321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
11	NC_011251	T	6	6	332	337	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
12	NC_011251	TTCT	2	8	361	368	0 %	75 %	0 %	25 %	203288702
13	NC_011251	AGA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288702
14	NC_011251	AAT	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
15	NC_011251	TAT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
16	NC_011251	CAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
17	NC_011251	TAT	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
18	NC_011251	TCC	2	6	495	500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288702
19	NC_011251	CAT	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
20	NC_011251	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
21	NC_011251	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
22	NC_011251	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
23	NC_011251	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288702
24	NC_011251	TCA	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288702
25	NC_011251	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
26	NC_011251	ACA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
27	NC_011251	ATT	2	6	692	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
28	NC_011251	ACA	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288702
29	NC_011251	A	6	6	711	716	100 %	0 %	0 %	0 %	203288702
30	NC_011251	TAT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288702
31	NC_011251	AAT	2	6	741	746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
32	NC_011251	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288702
33	NC_011251	TAAA	2	8	790	797	75 %	25 %	0 %	0 %	203288702
34	NC_011251	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	203288702
35	NC_011251	ATTA	2	8	2398	2405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288703
36	NC_011251	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288703
37	NC_011251	TC	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
38	NC_011251	TTAT	2	8	2451	2458	25 %	75 %	0 %	0 %	203288703
39	NC_011251	CTTA	2	8	2516	2523	25 %	50 %	0 %	25 %	203288703
40	NC_011251	CTA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
41	NC_011251	GCT	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
42	NC_011251	TCTT	2	8	2643	2650	0 %	75 %	0 %	25 %	203288703
43	NC_011251	T	6	6	2669	2674	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
44	NC_011251	AGCAAT	2	12	2690	2701	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288703
45	NC_011251	GCA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
46	NC_011251	TGC	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288703
47	NC_011251	TAT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
48	NC_011251	AT	3	6	2782	2787	50 %	50 %	0 %	0 %	203288703
49	NC_011251	ACTG	2	8	2795	2802	25 %	25 %	25 %	25 %	203288703
50	NC_011251	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288703
51	NC_011251	TCA	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
52	NC_011251	CTT	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
53	NC_011251	T	8	8	2885	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
54	NC_011251	ATT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
55	NC_011251	CTT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
56	NC_011251	TC	3	6	2929	2934	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
57	NC_011251	AGC	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288703
58	NC_011251	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
59	NC_011251	TACCT	2	10	3113	3122	20 %	40 %	0 %	40 %	203288703
60	NC_011251	TC	4	8	3169	3176	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
61	NC_011251	CTTC	2	8	3178	3185	0 %	50 %	0 %	50 %	203288703
62	NC_011251	CCA	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288703
63	NC_011251	CAT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
64	NC_011251	CAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288703
65	NC_011251	TAT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288703
66	NC_011251	T	6	6	3413	3418	0 %	100 %	0 %	0 %	203288703
67	NC_011251	TTC	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288703
68	NC_011251	ATTA	2	8	3649	3656	50 %	50 %	0 %	0 %	203288704
69	NC_011251	TC	3	6	3688	3693	0 %	50 %	0 %	50 %	203288704
70	NC_011251	TTAT	2	8	3702	3709	25 %	75 %	0 %	0 %	203288704
71	NC_011251	CTA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
72	NC_011251	ATA	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288704
73	NC_011251	ATC	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
74	NC_011251	CTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288704
75	NC_011251	T	7	7	3890	3896	0 %	100 %	0 %	0 %	203288704
76	NC_011251	TTC	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288704
77	NC_011251	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	203288704
78	NC_011251	CTG	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288704
79	NC_011251	TAG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288704
80	NC_011251	AT	3	6	4030	4035	50 %	50 %	0 %	0 %	203288704
81	NC_011251	GCC	2	6	4074	4079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	203288704
82	NC_011251	TC	3	6	4136	4141	0 %	50 %	0 %	50 %	203288704
83	NC_011251	CTTT	2	8	4176	4183	0 %	75 %	0 %	25 %	203288704
84	NC_011251	CAA	2	6	4195	4200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288704
85	NC_011251	CAG	2	6	4243	4248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288704
86	NC_011251	TAA	2	6	4351	4356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288704
87	NC_011251	CTC	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288704
88	NC_011251	AAC	2	6	4364	4369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288704
89	NC_011251	TAG	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288704
90	NC_011251	TTC	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288704
91	NC_011251	CAT	3	9	4628	4636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288704
92	NC_011251	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	203288705
93	NC_011251	TTCA	2	8	4990	4997	25 %	50 %	0 %	25 %	203288705
94	NC_011251	CTG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288705
95	NC_011251	TCTT	2	8	5156	5163	0 %	75 %	0 %	25 %	203288705
96	NC_011251	CTT	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
97	NC_011251	AGCAAT	2	12	5206	5217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203288705
98	NC_011251	AT	3	6	5298	5303	50 %	50 %	0 %	0 %	203288705
99	NC_011251	TCT	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
100	NC_011251	ATC	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
101	NC_011251	TAG	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288705
102	NC_011251	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
103	NC_011251	TTA	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288705
104	NC_011251	AGC	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288705
105	NC_011251	CAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288705
106	NC_011251	CTT	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288705
107	NC_011251	TAA	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
108	NC_011251	GCA	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288705
109	NC_011251	ATT	2	6	5665	5670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288705
110	NC_011251	TTG	2	6	5697	5702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288705
111	NC_011251	CAT	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
112	NC_011251	CAT	4	12	5902	5913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288705
113	NC_011251	AAT	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288705
114	NC_011251	T	6	6	5944	5949	0 %	100 %	0 %	0 %	203288705
115	NC_011251	ATTC	2	8	5956	5963	25 %	50 %	0 %	25 %	203288705
116	NC_011251	AT	3	6	8754	8759	50 %	50 %	0 %	0 %	203288706
117	NC_011251	TAA	2	6	8785	8790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
118	NC_011251	CTGT	2	8	8799	8806	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
119	NC_011251	TAT	2	6	8824	8829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288706
120	NC_011251	TAA	2	6	8854	8859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
121	NC_011251	TTTA	2	8	8860	8867	25 %	75 %	0 %	0 %	203288706
122	NC_011251	TACTCC	2	12	8875	8886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288706
123	NC_011251	TGC	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288706
124	NC_011251	TCC	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288706
125	NC_011251	TGCTAA	2	12	8968	8979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288706
126	NC_011251	CTG	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288706
127	NC_011251	TTG	2	6	9009	9014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288706
128	NC_011251	CAA	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288706
129	NC_011251	CTC	3	9	9183	9191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288706
130	NC_011251	TGT	2	6	9196	9201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288706
131	NC_011251	CCT	2	6	9215	9220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288706
132	NC_011251	T	6	6	9265	9270	0 %	100 %	0 %	0 %	203288706
133	NC_011251	TCT	2	6	9320	9325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288706
134	NC_011251	CTG	2	6	9348	9353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288706
135	NC_011251	TAC	2	6	9379	9384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288706
136	NC_011251	TAA	2	6	9396	9401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288706
137	NC_011251	AAG	2	6	9411	9416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288706
138	NC_011251	CTT	2	6	9424	9429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288706
139	NC_011251	TTGC	2	8	9450	9457	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
140	NC_011251	TTC	2	6	9478	9483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288706
141	NC_011251	TGCT	2	8	9501	9508	0 %	50 %	25 %	25 %	203288706
142	NC_011251	AT	3	6	9570	9575	50 %	50 %	0 %	0 %	203288706
143	NC_011251	T	8	8	9579	9586	0 %	100 %	0 %	0 %	203288706
144	NC_011251	TTA	2	6	9621	9626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288706
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150	NC_011251	TAA	2	6	10278	10283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288707
151	NC_011251	TAA	2	6	10301	10306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288707
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153	NC_011251	TTA	2	6	10459	10464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288707
154	NC_011251	TAA	2	6	10496	10501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288707
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159	NC_011251	ATT	2	6	10731	10736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288707
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265	NC_011251	CTT	2	6	17718	17723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288713
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398	NC_011251	AGC	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288719
399	NC_011251	A	6	6	26995	27000	100 %	0 %	0 %	0 %	203288719
400	NC_011251	TAA	2	6	27013	27018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288719
401	NC_011251	TGG	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288719
402	NC_011251	CTTT	2	8	28268	28275	0 %	75 %	0 %	25 %	203288720
403	NC_011251	TTC	2	6	28285	28290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288720
404	NC_011251	T	7	7	28296	28302	0 %	100 %	0 %	0 %	203288720
405	NC_011251	TTAT	2	8	28328	28335	25 %	75 %	0 %	0 %	203288720
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409	NC_011251	ACC	2	6	28411	28416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288720
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411	NC_011251	TA	3	6	28486	28491	50 %	50 %	0 %	0 %	203288720
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416	NC_011251	CT	3	6	28579	28584	0 %	50 %	0 %	50 %	203288720
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430	NC_011251	AAT	2	6	29267	29272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288721
431	NC_011251	GTA	2	6	29310	29315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288721
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433	NC_011251	AGG	2	6	29452	29457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288721
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