MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010816	TTC	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438864
2	NC_010816	AAG	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438864
3	NC_010816	CGG	2	6	114	119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438864
4	NC_010816	GAC	2	6	154	159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438864
5	NC_010816	GCA	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438864
6	NC_010816	TGT	2	6	249	254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438864
7	NC_010816	ATC	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438865
8	NC_010816	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438865
9	NC_010816	CGT	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
10	NC_010816	AAG	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438865
11	NC_010816	CGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438865
12	NC_010816	CAC	3	9	786	794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438865
13	NC_010816	TGCT	2	8	803	810	0 %	50 %	25 %	25 %	189438865
14	NC_010816	GAA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438865
15	NC_010816	TCG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
16	NC_010816	GCC	2	6	922	927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
17	NC_010816	GCT	2	6	955	960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
18	NC_010816	CCA	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438865
19	NC_010816	CCG	2	6	974	979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
20	NC_010816	ACA	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438865
21	NC_010816	GAC	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438865
22	NC_010816	CTG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
23	NC_010816	CAG	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438865
24	NC_010816	GCT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
25	NC_010816	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438865
26	NC_010816	AAC	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438865
27	NC_010816	TGC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
28	NC_010816	CGA	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438865
29	NC_010816	AAG	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438865
30	NC_010816	ACC	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438865
31	NC_010816	GCTG	2	8	1632	1639	0 %	25 %	50 %	25 %	189438865
32	NC_010816	GCG	2	6	1640	1645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438865
33	NC_010816	TCA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438865
34	NC_010816	GCC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
35	NC_010816	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
36	NC_010816	GTGGC	2	10	1763	1772	0 %	20 %	60 %	20 %	189438865
37	NC_010816	GCT	2	6	1783	1788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
38	NC_010816	GCC	2	6	1846	1851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
39	NC_010816	TCA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438865
40	NC_010816	CCTG	2	8	1941	1948	0 %	25 %	25 %	50 %	189438865
41	NC_010816	CGC	2	6	1965	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
42	NC_010816	CTG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
43	NC_010816	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
44	NC_010816	GACC	2	8	2007	2014	25 %	0 %	25 %	50 %	189438865
45	NC_010816	CGCTC	2	10	2029	2038	0 %	20 %	20 %	60 %	189438865
46	NC_010816	CGC	2	6	2046	2051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
47	NC_010816	ACC	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438865
48	NC_010816	CGT	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
49	NC_010816	CAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438865
50	NC_010816	CTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438865
51	NC_010816	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438865
52	NC_010816	AGCG	2	8	2312	2319	25 %	0 %	50 %	25 %	189438866
53	NC_010816	TGGA	2	8	2321	2328	25 %	25 %	50 %	0 %	189438866
54	NC_010816	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438866
55	NC_010816	GCC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438866
56	NC_010816	GCC	2	6	2446	2451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438866
57	NC_010816	GCCT	2	8	2456	2463	0 %	25 %	25 %	50 %	189438866
58	NC_010816	GAT	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438866
59	NC_010816	CAG	3	9	2810	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438867
60	NC_010816	GCG	2	6	2827	2832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438867
61	NC_010816	CTG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438867
62	NC_010816	GGC	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438867
63	NC_010816	TGG	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438867
64	NC_010816	TCG	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438867
65	NC_010816	CAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438867
66	NC_010816	CCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438867
67	NC_010816	CGGCAA	2	12	3184	3195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438867
68	NC_010816	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	189438867
69	NC_010816	ATC	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438867
70	NC_010816	TGG	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438867
71	NC_010816	TCA	3	9	3292	3300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438867
72	NC_010816	TGG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438867
73	NC_010816	AAG	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438867
74	NC_010816	AGA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438867
75	NC_010816	TTG	3	9	3437	3445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438868
76	NC_010816	CGA	3	9	3447	3455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438868
77	NC_010816	CTG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438868
78	NC_010816	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438868
79	NC_010816	TGC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438868
80	NC_010816	GAC	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438868
81	NC_010816	CAAGA	2	10	3682	3691	60 %	0 %	20 %	20 %	189438868
82	NC_010816	CGG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438868
83	NC_010816	ATT	2	6	3811	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438868
84	NC_010816	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438868
85	NC_010816	GCT	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438868
86	NC_010816	GCG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438868
87	NC_010816	TCG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438868
88	NC_010816	CGA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438868
89	NC_010816	GGC	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438868
90	NC_010816	GAA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438868
91	NC_010816	CGC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
92	NC_010816	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438869
93	NC_010816	AGC	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438869
94	NC_010816	TGG	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438869
95	NC_010816	TGC	2	6	4373	4378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438869
96	NC_010816	CG	3	6	4411	4416	0 %	0 %	50 %	50 %	189438869
97	NC_010816	AAC	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438869
98	NC_010816	TGC	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438869
99	NC_010816	TGG	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438869
100	NC_010816	CAA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189438869
101	NC_010816	CTG	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438869
102	NC_010816	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	189438869
103	NC_010816	CAAAGA	2	12	4563	4574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189438869
104	NC_010816	GTATC	2	10	4622	4631	20 %	40 %	20 %	20 %	189438869
105	NC_010816	CCTA	2	8	4645	4652	25 %	25 %	0 %	50 %	189438869
106	NC_010816	ATC	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438869
107	NC_010816	TGCCAA	2	12	4815	4826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189438869
108	NC_010816	GCC	2	6	4831	4836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
109	NC_010816	CCGTG	2	10	4899	4908	0 %	20 %	40 %	40 %	189438869
110	NC_010816	AC	3	6	4952	4957	50 %	0 %	0 %	50 %	189438869
111	NC_010816	GTG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438869
112	NC_010816	CGG	2	6	5001	5006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438869
113	NC_010816	ATC	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438869
114	NC_010816	CGC	2	6	5042	5047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
115	NC_010816	CCG	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
116	NC_010816	TTCC	2	8	5105	5112	0 %	50 %	0 %	50 %	189438869
117	NC_010816	CT	3	6	5136	5141	0 %	50 %	0 %	50 %	189438869
118	NC_010816	GCC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
119	NC_010816	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438869
120	NC_010816	ACC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438869
121	NC_010816	GCCA	2	8	5236	5243	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
122	NC_010816	GCC	2	6	5263	5268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
123	NC_010816	CCAG	2	8	5360	5367	25 %	0 %	25 %	50 %	189438869
124	NC_010816	TTG	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189438869
125	NC_010816	CTG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438869
126	NC_010816	TCG	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438869
127	NC_010816	CGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438869
128	NC_010816	CGC	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
129	NC_010816	GC	3	6	5542	5547	0 %	0 %	50 %	50 %	189438869
130	NC_010816	CCG	2	6	5561	5566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
131	NC_010816	GGT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438869
132	NC_010816	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	189438869
133	NC_010816	GCG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438869
134	NC_010816	GCC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
135	NC_010816	GTG	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438869
136	NC_010816	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438869
137	NC_010816	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189438869
138	NC_010816	CTT	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438869
139	NC_010816	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438870
140	NC_010816	CAC	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438870
141	NC_010816	GTG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438870
142	NC_010816	CGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438870
143	NC_010816	CCCG	2	8	6458	6465	0 %	0 %	25 %	75 %	189438870
144	NC_010816	GCC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438870
145	NC_010816	TCA	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438870
146	NC_010816	CGGC	2	8	6518	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	189438870
147	NC_010816	CTG	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438870
148	NC_010816	TGC	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438870
149	NC_010816	CTGAT	2	10	6621	6630	20 %	40 %	20 %	20 %	189438870
150	NC_010816	ACC	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438871
151	NC_010816	CG	4	8	6680	6687	0 %	0 %	50 %	50 %	189438871
152	NC_010816	TGC	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438871
153	NC_010816	CGA	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438871
154	NC_010816	CGC	2	6	6779	6784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438871
155	NC_010816	ACG	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438871
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157	NC_010816	GCC	2	6	6899	6904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438871
158	NC_010816	ACG	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438871
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161	NC_010816	CCG	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438871
162	NC_010816	TTC	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438871
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165	NC_010816	AGCCA	2	10	7315	7324	40 %	0 %	20 %	40 %	189438871
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167	NC_010816	GTG	2	6	7371	7376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438871
168	NC_010816	TGA	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438871
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170	NC_010816	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189438871
171	NC_010816	TGA	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438871
172	NC_010816	CGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438871
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175	NC_010816	GAT	3	9	7689	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438871
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183	NC_010816	CGGCG	2	10	8162	8171	0 %	0 %	60 %	40 %	189438872
184	NC_010816	GACC	2	8	8174	8181	25 %	0 %	25 %	50 %	189438872
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191	NC_010816	GCG	2	6	8346	8351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438872
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200	NC_010816	TCG	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438872
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203	NC_010816	CTG	2	6	9143	9148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438873
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258	NC_010816	CCG	2	6	11625	11630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438873
259	NC_010816	AGT	2	6	11652	11657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189438873
260	NC_010816	ATT	2	6	11832	11837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189438874
261	NC_010816	CAG	2	6	11839	11844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438874
262	NC_010816	CGGC	2	8	11888	11895	0 %	0 %	50 %	50 %	189438874
263	NC_010816	GC	3	6	11894	11899	0 %	0 %	50 %	50 %	189438874
264	NC_010816	AGC	2	6	11916	11921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189438874
265	NC_010816	TCG	2	6	12053	12058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438874
266	NC_010816	TTC	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189438874
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269	NC_010816	CAT	2	6	12112	12117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189438874
270	NC_010816	ATTGCC	2	12	12118	12129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189438874
271	NC_010816	GCC	2	6	12293	12298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438874
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274	NC_010816	CCG	2	6	12336	12341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189438874
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278	NC_010816	CAACT	2	10	12487	12496	40 %	20 %	0 %	40 %	189438874
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281	NC_010816	CCA	2	6	12588	12593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189438874
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288	NC_010816	CG	3	6	12799	12804	0 %	0 %	50 %	50 %	189438874
289	NC_010816	TCG	2	6	12815	12820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438874
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374	NC_010816	GCTCG	2	10	17948	17957	0 %	20 %	40 %	40 %	189438878
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382	NC_010816	CG	3	6	18400	18405	0 %	0 %	50 %	50 %	189438878
383	NC_010816	GGC	3	9	18422	18430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438878
384	NC_010816	ACAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	189438878
385	NC_010816	CGGT	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	189438878
386	NC_010816	TGG	2	6	18535	18540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189438878
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388	NC_010816	AG	3	6	18742	18747	50 %	0 %	50 %	0 %	189438878
389	NC_010816	GCG	2	6	18788	18793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189438878
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391	NC_010816	ACGCTG	2	12	18886	18897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189438878
392	NC_010816	TGC	2	6	18905	18910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189438878
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