MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_010816	CGG	2	6	2325834	2325839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440812
45502	NC_010816	GC	3	6	2325864	2325869	0 %	0 %	50 %	50 %	189440812
45503	NC_010816	CGCCCA	2	12	2325885	2325896	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	189440812
45504	NC_010816	CGG	2	6	2325934	2325939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440812
45505	NC_010816	TGG	2	6	2325950	2325955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440812
45506	NC_010816	GAGC	2	8	2325973	2325980	25 %	0 %	50 %	25 %	189440812
45507	NC_010816	CGC	2	6	2325997	2326002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440812
45508	NC_010816	TAC	2	6	2326220	2326225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440813
45509	NC_010816	GGC	2	6	2326315	2326320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440813
45510	NC_010816	GGC	2	6	2326479	2326484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440814
45511	NC_010816	CCT	2	6	2326491	2326496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440814
45512	NC_010816	TGC	2	6	2326554	2326559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45513	NC_010816	CAC	2	6	2326631	2326636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440814
45514	NC_010816	AGC	3	9	2326649	2326657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45515	NC_010816	ACTC	2	8	2326684	2326691	25 %	25 %	0 %	50 %	189440814
45516	NC_010816	TCG	2	6	2326757	2326762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45517	NC_010816	GAT	2	6	2326885	2326890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440814
45518	NC_010816	CCA	2	6	2326902	2326907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440814
45519	NC_010816	TGCG	2	8	2326959	2326966	0 %	25 %	50 %	25 %	189440814
45520	NC_010816	TGGG	2	8	2326982	2326989	0 %	25 %	75 %	0 %	189440814
45521	NC_010816	TGG	2	6	2326997	2327002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440814
45522	NC_010816	TCG	2	6	2327030	2327035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45523	NC_010816	CGC	2	6	2327199	2327204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440814
45524	NC_010816	GTT	2	6	2327245	2327250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440814
45525	NC_010816	GCA	3	9	2327289	2327297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45526	NC_010816	GCG	2	6	2327312	2327317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440814
45527	NC_010816	GAT	2	6	2327419	2327424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440814
45528	NC_010816	GTC	2	6	2327437	2327442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440814
45529	NC_010816	GAT	2	6	2327485	2327490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440814
45530	NC_010816	CCAC	2	8	2327532	2327539	25 %	0 %	0 %	75 %	189440814
45531	NC_010816	CCATG	2	10	2327622	2327631	20 %	20 %	20 %	40 %	189440814
45532	NC_010816	ATG	2	6	2327639	2327644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440814
45533	NC_010816	GCG	2	6	2328218	2328223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440815
45534	NC_010816	GGA	2	6	2328264	2328269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440815
45535	NC_010816	ACT	2	6	2328281	2328286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440815
45536	NC_010816	GAC	2	6	2328295	2328300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45537	NC_010816	TTC	2	6	2328361	2328366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440815
45538	NC_010816	CTG	2	6	2328409	2328414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45539	NC_010816	CCG	2	6	2328506	2328511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440815
45540	NC_010816	ACG	2	6	2328584	2328589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45541	NC_010816	AGC	2	6	2328725	2328730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45542	NC_010816	GGCCT	2	10	2328742	2328751	0 %	20 %	40 %	40 %	189440815
45543	NC_010816	TGC	2	6	2328767	2328772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45544	NC_010816	ACC	2	6	2328853	2328858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440815
45545	NC_010816	GAC	2	6	2328889	2328894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45546	NC_010816	TCT	2	6	2328905	2328910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440815
45547	NC_010816	ACC	3	9	2328913	2328921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440815
45548	NC_010816	CCA	2	6	2328935	2328940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440815
45549	NC_010816	CCGA	2	8	2328988	2328995	25 %	0 %	25 %	50 %	189440815
45550	NC_010816	AAG	2	6	2329012	2329017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440815
45551	NC_010816	CTG	2	6	2329036	2329041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45552	NC_010816	GCC	2	6	2329112	2329117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440815
45553	NC_010816	CTA	2	6	2329119	2329124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440815
45554	NC_010816	GCCCG	2	10	2329176	2329185	0 %	0 %	40 %	60 %	189440815
45555	NC_010816	CCG	2	6	2329205	2329210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440815
45556	NC_010816	CGA	2	6	2329317	2329322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45557	NC_010816	GC	3	6	2329404	2329409	0 %	0 %	50 %	50 %	189440815
45558	NC_010816	CGCT	2	8	2329421	2329428	0 %	25 %	25 %	50 %	189440815
45559	NC_010816	CG	3	6	2329447	2329452	0 %	0 %	50 %	50 %	189440815
45560	NC_010816	CTG	2	6	2329494	2329499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45561	NC_010816	TCC	2	6	2329534	2329539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440815
45562	NC_010816	CTG	2	6	2329573	2329578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45563	NC_010816	CAG	2	6	2329588	2329593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45564	NC_010816	CG	4	8	2329650	2329657	0 %	0 %	50 %	50 %	189440815
45565	NC_010816	GTGA	2	8	2329708	2329715	25 %	25 %	50 %	0 %	189440815
45566	NC_010816	TC	3	6	2329750	2329755	0 %	50 %	0 %	50 %	189440815
45567	NC_010816	CG	3	6	2329787	2329792	0 %	0 %	50 %	50 %	189440815
45568	NC_010816	CAACAT	2	12	2329803	2329814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189440815
45569	NC_010816	CCGT	2	8	2329818	2329825	0 %	25 %	25 %	50 %	189440815
45570	NC_010816	GAC	2	6	2329855	2329860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
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45572	NC_010816	AGC	2	6	2329976	2329981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45573	NC_010816	CTG	2	6	2330038	2330043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45574	NC_010816	AGA	2	6	2330126	2330131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440815
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45581	NC_010816	GC	3	6	2330373	2330378	0 %	0 %	50 %	50 %	189440815
45582	NC_010816	CTG	2	6	2330416	2330421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45583	NC_010816	CGC	2	6	2330431	2330436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440815
45584	NC_010816	GCC	2	6	2330446	2330451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440815
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45587	NC_010816	CGA	2	6	2330757	2330762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45588	NC_010816	TGG	2	6	2330771	2330776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440815
45589	NC_010816	GTT	2	6	2330800	2330805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440815
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45592	NC_010816	ACG	2	6	2330906	2330911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
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45598	NC_010816	ACG	2	6	2331383	2331388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440815
45599	NC_010816	CCT	2	6	2331440	2331445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440815
45600	NC_010816	AAG	2	6	2331455	2331460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440815
45601	NC_010816	GTT	2	6	2331481	2331486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440815
45602	NC_010816	TGATGC	2	12	2331493	2331504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189440815
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45604	NC_010816	GCCA	2	8	2331803	2331810	25 %	0 %	25 %	50 %	189440816
45605	NC_010816	AT	3	6	2331905	2331910	50 %	50 %	0 %	0 %	189440816
45606	NC_010816	TTCC	2	8	2331935	2331942	0 %	50 %	0 %	50 %	189440816
45607	NC_010816	TGA	2	6	2332043	2332048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440816
45608	NC_010816	TTG	2	6	2332069	2332074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440816
45609	NC_010816	CTG	2	6	2332110	2332115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440816
45610	NC_010816	CATT	2	8	2332139	2332146	25 %	50 %	0 %	25 %	189440816
45611	NC_010816	TCA	2	6	2332297	2332302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440816
45612	NC_010816	TCA	2	6	2332307	2332312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440816
45613	NC_010816	GAT	2	6	2332414	2332419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440817
45614	NC_010816	GCGTC	2	10	2332467	2332476	0 %	20 %	40 %	40 %	189440817
45615	NC_010816	CG	3	6	2332559	2332564	0 %	0 %	50 %	50 %	189440817
45616	NC_010816	CGG	2	6	2332570	2332575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440817
45617	NC_010816	TGT	2	6	2332601	2332606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440817
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45619	NC_010816	GTC	2	6	2332641	2332646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440817
45620	NC_010816	AGGT	2	8	2332651	2332658	25 %	25 %	50 %	0 %	189440817
45621	NC_010816	CCCT	2	8	2332675	2332682	0 %	25 %	0 %	75 %	189440817
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45731	NC_010816	AAAAG	2	10	2338082	2338091	80 %	0 %	20 %	0 %	189440821
45732	NC_010816	CTG	2	6	2338162	2338167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440821
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45762	NC_010816	A	6	6	2339465	2339470	100 %	0 %	0 %	0 %	189440822
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45961	NC_010816	CGA	2	6	2349952	2349957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440829
45962	NC_010816	GTC	2	6	2349971	2349976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440829
45963	NC_010816	AAC	2	6	2349981	2349986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440829
45964	NC_010816	GCT	2	6	2350087	2350092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440829
45965	NC_010816	CGG	2	6	2350168	2350173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440829
45966	NC_010816	GTA	2	6	2350244	2350249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440829
45967	NC_010816	ATG	2	6	2350290	2350295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440829
45968	NC_010816	TCG	2	6	2350305	2350310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440829
45969	NC_010816	GCC	2	6	2350319	2350324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440829
45970	NC_010816	TCG	2	6	2350377	2350382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440829
45971	NC_010816	TCT	2	6	2350387	2350392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440829
45972	NC_010816	CGG	2	6	2350489	2350494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440829
45973	NC_010816	CGT	2	6	2350516	2350521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440829
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45976	NC_010816	GCC	2	6	2350702	2350707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440830
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45978	NC_010816	GTC	2	6	2350755	2350760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440830
45979	NC_010816	CGC	2	6	2350835	2350840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440830
45980	NC_010816	CGC	2	6	2350853	2350858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440830
45981	NC_010816	GC	3	6	2350862	2350867	0 %	0 %	50 %	50 %	189440830
45982	NC_010816	TCA	2	6	2350886	2350891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440830
45983	NC_010816	GGC	3	9	2350917	2350925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440830
45984	NC_010816	CGGC	2	8	2350928	2350935	0 %	0 %	50 %	50 %	189440830
45985	NC_010816	CTC	2	6	2350956	2350961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440830
45986	NC_010816	GGTC	2	8	2351021	2351028	0 %	25 %	50 %	25 %	189440830
45987	NC_010816	GCC	2	6	2351049	2351054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440830
45988	NC_010816	GC	3	6	2351066	2351071	0 %	0 %	50 %	50 %	189440830
45989	NC_010816	CGCA	2	8	2351082	2351089	25 %	0 %	25 %	50 %	189440830
45990	NC_010816	CACGGC	2	12	2351157	2351168	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189440830
45991	NC_010816	ACGC	2	8	2351211	2351218	25 %	0 %	25 %	50 %	189440830
45992	NC_010816	ATC	2	6	2351248	2351253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440830
45993	NC_010816	ACT	2	6	2351302	2351307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440830
45994	NC_010816	CCAG	2	8	2351326	2351333	25 %	0 %	25 %	50 %	189440830
45995	NC_010816	CCG	2	6	2351336	2351341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440830
45996	NC_010816	CAC	2	6	2351364	2351369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440830
45997	NC_010816	GGC	2	6	2351412	2351417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440830
45998	NC_010816	CGG	2	6	2351452	2351457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440830
45999	NC_010816	CGGC	2	8	2351459	2351466	0 %	0 %	50 %	50 %	189440830
46000	NC_010816	AGC	2	6	2351560	2351565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440830

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