MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_010816	GCC	2	6	2299526	2299531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440793
45003	NC_010816	CAA	2	6	2299565	2299570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440793
45004	NC_010816	CCA	2	6	2299574	2299579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440793
45005	NC_010816	GC	3	6	2299612	2299617	0 %	0 %	50 %	50 %	189440793
45006	NC_010816	CCA	3	9	2299651	2299659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440793
45007	NC_010816	ACG	2	6	2299678	2299683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440793
45008	NC_010816	CAA	2	6	2299712	2299717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440793
45009	NC_010816	CCG	2	6	2299735	2299740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440793
45010	NC_010816	AAG	2	6	2299755	2299760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440793
45011	NC_010816	TCA	2	6	2299828	2299833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440793
45012	NC_010816	GTG	2	6	2299860	2299865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440793
45013	NC_010816	GTG	2	6	2299885	2299890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440793
45014	NC_010816	CCG	2	6	2299915	2299920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440793
45015	NC_010816	CGG	2	6	2299931	2299936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440793
45016	NC_010816	CTC	2	6	2300135	2300140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440793
45017	NC_010816	GAAG	2	8	2300156	2300163	50 %	0 %	50 %	0 %	189440793
45018	NC_010816	CGC	2	6	2300183	2300188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440793
45019	NC_010816	GTG	2	6	2300205	2300210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440793
45020	NC_010816	TCA	2	6	2300230	2300235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440793
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45022	NC_010816	ACG	2	6	2300296	2300301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440793
45023	NC_010816	TGC	2	6	2300305	2300310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440793
45024	NC_010816	GC	3	6	2300309	2300314	0 %	0 %	50 %	50 %	189440793
45025	NC_010816	GCT	2	6	2300321	2300326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440793
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45028	NC_010816	CCGC	2	8	2300392	2300399	0 %	0 %	25 %	75 %	189440793
45029	NC_010816	TGG	2	6	2300434	2300439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440793
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45032	NC_010816	ACC	2	6	2300622	2300627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440793
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45035	NC_010816	AAG	3	9	2300739	2300747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440793
45036	NC_010816	TACAAG	2	12	2300775	2300786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189440793
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45039	NC_010816	CG	3	6	2300848	2300853	0 %	0 %	50 %	50 %	189440793
45040	NC_010816	GCT	2	6	2300891	2300896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440793
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45042	NC_010816	CAA	2	6	2301032	2301037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440793
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45045	NC_010816	GAG	2	6	2301075	2301080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440793
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45052	NC_010816	GCTC	2	8	2301457	2301464	0 %	25 %	25 %	50 %	189440793
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45099	NC_010816	CGG	2	6	2303992	2303997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440794
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45103	NC_010816	GCT	2	6	2304379	2304384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440794
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45105	NC_010816	GAT	2	6	2304446	2304451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440794
45106	NC_010816	GGA	2	6	2304463	2304468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440794
45107	NC_010816	CGC	2	6	2304492	2304497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440794
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45110	NC_010816	ACGT	2	8	2304660	2304667	25 %	25 %	25 %	25 %	189440794
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45112	NC_010816	CT	3	6	2304745	2304750	0 %	50 %	0 %	50 %	189440794
45113	NC_010816	AGGCCA	2	12	2304822	2304833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440794
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45115	NC_010816	TGTTT	2	10	2305028	2305037	0 %	80 %	20 %	0 %	189440795
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45228	NC_010816	CA	3	6	2311482	2311487	50 %	0 %	0 %	50 %	189440801
45229	NC_010816	GCCGA	2	10	2311655	2311664	20 %	0 %	40 %	40 %	189440802
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45231	NC_010816	GGC	2	6	2311709	2311714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440802
45232	NC_010816	GC	4	8	2311740	2311747	0 %	0 %	50 %	50 %	189440802
45233	NC_010816	GTA	2	6	2311768	2311773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440802
45234	NC_010816	GCA	2	6	2311812	2311817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440802
45235	NC_010816	TG	3	6	2311829	2311834	0 %	50 %	50 %	0 %	189440802
45236	NC_010816	CAG	2	6	2311888	2311893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440802
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45238	NC_010816	CAG	2	6	2311990	2311995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440802
45239	NC_010816	GTTCTT	2	12	2311999	2312010	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189440802
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45243	NC_010816	GGC	2	6	2312107	2312112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440802
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45259	NC_010816	CCT	2	6	2312893	2312898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440803
45260	NC_010816	CTG	2	6	2312946	2312951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440803
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45334	NC_010816	CAGGGG	2	12	2316475	2316486	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	189440806
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45338	NC_010816	GCG	2	6	2316655	2316660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440806
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45342	NC_010816	GCA	2	6	2316900	2316905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440806
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45345	NC_010816	GCG	2	6	2317009	2317014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440806
45346	NC_010816	ATCGGT	2	12	2317015	2317026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189440806
45347	NC_010816	CGTC	2	8	2317311	2317318	0 %	25 %	25 %	50 %	189440807
45348	NC_010816	CGG	2	6	2317357	2317362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440807
45349	NC_010816	GACC	2	8	2317468	2317475	25 %	0 %	25 %	50 %	189440807
45350	NC_010816	GAC	2	6	2317478	2317483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440807
45351	NC_010816	GCCG	2	8	2317507	2317514	0 %	0 %	50 %	50 %	189440807
45352	NC_010816	GAG	2	6	2317574	2317579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440807
45353	NC_010816	CGG	2	6	2317642	2317647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440807
45354	NC_010816	GCT	2	6	2317650	2317655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440807
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45356	NC_010816	CGC	2	6	2317756	2317761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440807
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45358	NC_010816	CG	3	6	2317809	2317814	0 %	0 %	50 %	50 %	189440807
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45363	NC_010816	CGA	2	6	2317951	2317956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440807
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45373	NC_010816	CGT	2	6	2318647	2318652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440807
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45450	NC_010816	TCCAT	2	10	2322795	2322804	20 %	40 %	0 %	40 %	189440810
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45454	NC_010816	CGA	2	6	2322995	2323000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440810
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45457	NC_010816	GTC	2	6	2323065	2323070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45458	NC_010816	TCG	2	6	2323108	2323113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45459	NC_010816	GCC	2	6	2323116	2323121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440810
45460	NC_010816	CTG	2	6	2323194	2323199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45461	NC_010816	TCA	2	6	2323216	2323221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440810
45462	NC_010816	CAG	2	6	2323242	2323247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45463	NC_010816	TGA	2	6	2323258	2323263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440810
45464	NC_010816	CGA	2	6	2323427	2323432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45465	NC_010816	CTG	2	6	2323539	2323544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45466	NC_010816	TGC	2	6	2323600	2323605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45467	NC_010816	AGA	2	6	2323636	2323641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440810
45468	NC_010816	TCG	2	6	2323648	2323653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45469	NC_010816	ACC	2	6	2323674	2323679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440810
45470	NC_010816	TCA	2	6	2323690	2323695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440810
45471	NC_010816	ACG	2	6	2323732	2323737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45472	NC_010816	AAG	2	6	2323758	2323763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440810
45473	NC_010816	TGC	2	6	2323792	2323797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45474	NC_010816	ACA	2	6	2323831	2323836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440810
45475	NC_010816	TGA	2	6	2323862	2323867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440810
45476	NC_010816	CG	3	6	2323883	2323888	0 %	0 %	50 %	50 %	189440810
45477	NC_010816	TGC	2	6	2323918	2323923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440810
45478	NC_010816	ACA	2	6	2323933	2323938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440810
45479	NC_010816	CGC	2	6	2324003	2324008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440810
45480	NC_010816	CCGC	2	8	2324019	2324026	0 %	0 %	25 %	75 %	189440810
45481	NC_010816	TGA	2	6	2324101	2324106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440810
45482	NC_010816	CAT	2	6	2324189	2324194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440810
45483	NC_010816	GCT	2	6	2324782	2324787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440811
45484	NC_010816	TGTC	2	8	2324805	2324812	0 %	50 %	25 %	25 %	189440811
45485	NC_010816	CAT	2	6	2324833	2324838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440811
45486	NC_010816	AGC	2	6	2324850	2324855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440811
45487	NC_010816	GCTAC	2	10	2324859	2324868	20 %	20 %	20 %	40 %	189440811
45488	NC_010816	GAA	2	6	2324930	2324935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440811
45489	NC_010816	CGT	2	6	2325009	2325014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440811
45490	NC_010816	CGA	2	6	2325025	2325030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440811
45491	NC_010816	CCGT	2	8	2325077	2325084	0 %	25 %	25 %	50 %	189440811
45492	NC_010816	CT	3	6	2325086	2325091	0 %	50 %	0 %	50 %	189440811
45493	NC_010816	ACG	2	6	2325238	2325243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440811
45494	NC_010816	CGG	2	6	2325256	2325261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440811
45495	NC_010816	GGA	2	6	2325409	2325414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440811
45496	NC_010816	ATC	2	6	2325426	2325431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440811
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45498	NC_010816	CCA	2	6	2325690	2325695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440811
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45500	NC_010816	AAG	2	6	2325733	2325738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440811

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