MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_010816	GCC	2	6	2246674	2246679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440753
44002	NC_010816	GTG	2	6	2246698	2246703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440753
44003	NC_010816	CTC	3	9	2246715	2246723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440753
44004	NC_010816	CGA	2	6	2246727	2246732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440753
44005	NC_010816	AGA	2	6	2246756	2246761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440753
44006	NC_010816	GCT	2	6	2246781	2246786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440753
44007	NC_010816	TAC	3	9	2246797	2246805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440753
44008	NC_010816	TGGC	2	8	2246810	2246817	0 %	25 %	50 %	25 %	189440753
44009	NC_010816	CAT	2	6	2246823	2246828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440753
44010	NC_010816	ACA	2	6	2246918	2246923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440753
44011	NC_010816	CTA	2	6	2246928	2246933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440753
44012	NC_010816	CAC	2	6	2246934	2246939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440753
44013	NC_010816	ACT	2	6	2246942	2246947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440753
44014	NC_010816	CCG	2	6	2246948	2246953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440753
44015	NC_010816	ACA	2	6	2246957	2246962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440753
44016	NC_010816	TCA	2	6	2246984	2246989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440753
44017	NC_010816	AAC	2	6	2247007	2247012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440753
44018	NC_010816	GCCGA	2	10	2247013	2247022	20 %	0 %	40 %	40 %	189440753
44019	NC_010816	CGC	2	6	2247030	2247035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440753
44020	NC_010816	ACA	2	6	2247230	2247235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440753
44021	NC_010816	GATCA	2	10	2247503	2247512	40 %	20 %	20 %	20 %	189440754
44022	NC_010816	TCA	2	6	2247519	2247524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44023	NC_010816	TGG	2	6	2247567	2247572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440754
44024	NC_010816	CAT	2	6	2247598	2247603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44025	NC_010816	TCA	2	6	2247633	2247638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44026	NC_010816	TGCTCA	2	12	2247654	2247665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189440754
44027	NC_010816	TCG	2	6	2247750	2247755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440754
44028	NC_010816	GCC	2	6	2247761	2247766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440754
44029	NC_010816	CGCCAT	2	12	2247814	2247825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440754
44030	NC_010816	TGC	2	6	2247831	2247836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440754
44031	NC_010816	CAAGCT	2	12	2247919	2247930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189440754
44032	NC_010816	CTG	2	6	2247944	2247949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440754
44033	NC_010816	TCA	2	6	2247969	2247974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44034	NC_010816	TGG	2	6	2247975	2247980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440754
44035	NC_010816	CAGG	2	8	2248006	2248013	25 %	0 %	50 %	25 %	189440754
44036	NC_010816	GC	3	6	2248024	2248029	0 %	0 %	50 %	50 %	189440754
44037	NC_010816	AGG	2	6	2248044	2248049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440754
44038	NC_010816	CCG	2	6	2248050	2248055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440754
44039	NC_010816	CCA	2	6	2248080	2248085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440754
44040	NC_010816	GCC	2	6	2248145	2248150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440754
44041	NC_010816	ATG	2	6	2248169	2248174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440754
44042	NC_010816	TCG	2	6	2248200	2248205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440754
44043	NC_010816	CCG	2	6	2248206	2248211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440754
44044	NC_010816	CGG	2	6	2248216	2248221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440754
44045	NC_010816	GGT	2	6	2248250	2248255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440754
44046	NC_010816	CGG	2	6	2248308	2248313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440754
44047	NC_010816	CAT	2	6	2248315	2248320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44048	NC_010816	ATC	2	6	2248361	2248366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440754
44049	NC_010816	TGC	2	6	2248368	2248373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440754
44050	NC_010816	GAA	2	6	2248430	2248435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440755
44051	NC_010816	CCA	2	6	2248447	2248452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440755
44052	NC_010816	CGC	2	6	2248487	2248492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440755
44053	NC_010816	CAT	2	6	2248550	2248555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440755
44054	NC_010816	CAT	3	9	2248574	2248582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440755
44055	NC_010816	ACC	2	6	2248584	2248589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440755
44056	NC_010816	TGC	2	6	2248635	2248640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44057	NC_010816	CGC	2	6	2248694	2248699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440755
44058	NC_010816	CCGC	2	8	2248720	2248727	0 %	0 %	25 %	75 %	189440755
44059	NC_010816	CAC	2	6	2248736	2248741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440755
44060	NC_010816	CGG	2	6	2248748	2248753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440755
44061	NC_010816	GTG	2	6	2248755	2248760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440755
44062	NC_010816	CCTGC	2	10	2248791	2248800	0 %	20 %	20 %	60 %	189440755
44063	NC_010816	CAT	2	6	2248823	2248828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440755
44064	NC_010816	ATC	2	6	2248848	2248853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440755
44065	NC_010816	ATC	2	6	2248860	2248865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440755
44066	NC_010816	CGG	2	6	2248883	2248888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440755
44067	NC_010816	GCC	2	6	2248908	2248913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440755
44068	NC_010816	CGT	2	6	2248955	2248960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44069	NC_010816	TGG	2	6	2248972	2248977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440755
44070	NC_010816	CGA	3	9	2249042	2249050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44071	NC_010816	CGC	2	6	2249054	2249059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440755
44072	NC_010816	TTC	2	6	2249118	2249123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440755
44073	NC_010816	CGG	2	6	2249135	2249140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440755
44074	NC_010816	GCTC	2	8	2249161	2249168	0 %	25 %	25 %	50 %	189440755
44075	NC_010816	CCA	2	6	2249173	2249178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440755
44076	NC_010816	TGG	2	6	2249215	2249220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440755
44077	NC_010816	CGG	2	6	2249225	2249230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440755
44078	NC_010816	GCT	2	6	2249288	2249293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44079	NC_010816	GC	3	6	2249294	2249299	0 %	0 %	50 %	50 %	189440755
44080	NC_010816	GGT	2	6	2249330	2249335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440755
44081	NC_010816	CCGC	2	8	2249357	2249364	0 %	0 %	25 %	75 %	189440755
44082	NC_010816	GCC	2	6	2249430	2249435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440755
44083	NC_010816	AGC	2	6	2249467	2249472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44084	NC_010816	CGA	2	6	2249483	2249488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440755
44085	NC_010816	AGG	2	6	2249500	2249505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440755
44086	NC_010816	GGT	2	6	2249567	2249572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440756
44087	NC_010816	CAA	2	6	2249605	2249610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440756
44088	NC_010816	CTG	2	6	2249669	2249674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44089	NC_010816	CTGG	2	8	2249707	2249714	0 %	25 %	50 %	25 %	189440756
44090	NC_010816	AAG	2	6	2249735	2249740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440756
44091	NC_010816	CGTG	2	8	2249752	2249759	0 %	25 %	50 %	25 %	189440756
44092	NC_010816	AGC	2	6	2249799	2249804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44093	NC_010816	GAG	2	6	2249813	2249818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440756
44094	NC_010816	TCG	2	6	2249826	2249831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44095	NC_010816	CTG	2	6	2249930	2249935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44096	NC_010816	CCA	2	6	2249961	2249966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440756
44097	NC_010816	GGC	2	6	2249971	2249976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440756
44098	NC_010816	CAG	2	6	2249993	2249998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44099	NC_010816	CTG	3	9	2250041	2250049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44100	NC_010816	CGA	2	6	2250052	2250057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44101	NC_010816	GCCG	2	8	2250058	2250065	0 %	0 %	50 %	50 %	189440756
44102	NC_010816	CTG	2	6	2250095	2250100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440756
44103	NC_010816	ACATG	2	10	2250154	2250163	40 %	20 %	20 %	20 %	189440756
44104	NC_010816	TGA	2	6	2250171	2250176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440756
44105	NC_010816	GGA	2	6	2250235	2250240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440756
44106	NC_010816	CAA	2	6	2250247	2250252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440756
44107	NC_010816	ACA	2	6	2250285	2250290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440756
44108	NC_010816	CCA	3	9	2250312	2250320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440756
44109	NC_010816	GC	3	6	2250365	2250370	0 %	0 %	50 %	50 %	189440756
44110	NC_010816	ACG	2	6	2250446	2250451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440757
44111	NC_010816	ACC	3	9	2250493	2250501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440757
44112	NC_010816	TGCC	2	8	2250524	2250531	0 %	25 %	25 %	50 %	189440757
44113	NC_010816	GCA	2	6	2250539	2250544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440757
44114	NC_010816	ATG	2	6	2250551	2250556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440757
44115	NC_010816	GCC	2	6	2250623	2250628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440757
44116	NC_010816	CCAGT	2	10	2250690	2250699	20 %	20 %	20 %	40 %	189440757
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44123	NC_010816	GCT	2	6	2250873	2250878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440757
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44126	NC_010816	CTG	2	6	2251033	2251038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440757
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44143	NC_010816	GGC	2	6	2251695	2251700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440758
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44146	NC_010816	CGCT	2	8	2251816	2251823	0 %	25 %	25 %	50 %	189440758
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44229	NC_010816	ATG	2	6	2255802	2255807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440762
44230	NC_010816	CGG	2	6	2255878	2255883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440762
44231	NC_010816	CGA	2	6	2255884	2255889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440762
44232	NC_010816	TCG	2	6	2255892	2255897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440762
44233	NC_010816	TCA	2	6	2255958	2255963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440762
44234	NC_010816	GGCCGA	2	12	2256061	2256072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189440762
44235	NC_010816	TGC	2	6	2256093	2256098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440762
44236	NC_010816	GCT	2	6	2256124	2256129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440762
44237	NC_010816	AAG	2	6	2256155	2256160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440762
44238	NC_010816	CGCC	2	8	2256238	2256245	0 %	0 %	25 %	75 %	189440762
44239	NC_010816	CCGC	2	8	2256271	2256278	0 %	0 %	25 %	75 %	189440762
44240	NC_010816	CAT	2	6	2256310	2256315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440762
44241	NC_010816	CTA	2	6	2256337	2256342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440762
44242	NC_010816	GCCCCC	2	12	2256359	2256370	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	189440762
44243	NC_010816	CGC	2	6	2256400	2256405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440762
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44245	NC_010816	AGT	2	6	2256435	2256440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440762
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44248	NC_010816	TCA	2	6	2256729	2256734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440763
44249	NC_010816	TGC	2	6	2256795	2256800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440763
44250	NC_010816	TTGTC	2	10	2256879	2256888	0 %	60 %	20 %	20 %	189440763
44251	NC_010816	CTT	2	6	2256895	2256900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440763
44252	NC_010816	GCC	2	6	2256907	2256912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440763
44253	NC_010816	TCA	2	6	2257014	2257019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440763
44254	NC_010816	CTG	2	6	2257097	2257102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440763
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44256	NC_010816	CGAC	2	8	2257318	2257325	25 %	0 %	25 %	50 %	189440763
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44258	NC_010816	GCTC	2	8	2257422	2257429	0 %	25 %	25 %	50 %	189440763
44259	NC_010816	CGTG	2	8	2257435	2257442	0 %	25 %	50 %	25 %	189440763
44260	NC_010816	GGC	2	6	2257463	2257468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440763
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44262	NC_010816	TGCGC	2	10	2257575	2257584	0 %	20 %	40 %	40 %	189440763
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44267	NC_010816	CGA	2	6	2257873	2257878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440763
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44282	NC_010816	GT	3	6	2258840	2258845	0 %	50 %	50 %	0 %	189440764
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44303	NC_010816	CTC	2	6	2260094	2260099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440764
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44324	NC_010816	ATG	2	6	2261069	2261074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440764
44325	NC_010816	ATTT	2	8	2261075	2261082	25 %	75 %	0 %	0 %	189440764
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44327	NC_010816	GTTG	2	8	2261178	2261185	0 %	50 %	50 %	0 %	189440764
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44330	NC_010816	GTT	2	6	2261299	2261304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440764
44331	NC_010816	TGC	2	6	2261352	2261357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440764
44332	NC_010816	TGT	2	6	2261388	2261393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440764
44333	NC_010816	TCGTA	2	10	2261469	2261478	20 %	40 %	20 %	20 %	189440764
44334	NC_010816	TCG	2	6	2261509	2261514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440764
44335	NC_010816	TGC	2	6	2262128	2262133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440765
44336	NC_010816	AGC	2	6	2262159	2262164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440765
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44338	NC_010816	ATT	2	6	2262209	2262214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440765
44339	NC_010816	GAT	2	6	2262226	2262231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440765
44340	NC_010816	TA	3	6	2262242	2262247	50 %	50 %	0 %	0 %	189440765
44341	NC_010816	CTG	2	6	2262274	2262279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440765
44342	NC_010816	ATG	2	6	2262281	2262286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440765
44343	NC_010816	AAG	2	6	2262313	2262318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440765
44344	NC_010816	CAA	2	6	2262340	2262345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440765
44345	NC_010816	GCA	2	6	2262393	2262398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440765
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44350	NC_010816	ATC	2	6	2262709	2262714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440766
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44360	NC_010816	CGG	2	6	2265744	2265749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440767
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44365	NC_010816	CAT	2	6	2266149	2266154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440768
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44370	NC_010816	CTG	2	6	2266297	2266302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440768
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