MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_010816	CAG	2	6	2221199	2221204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440728
43502	NC_010816	CAT	2	6	2221237	2221242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440728
43503	NC_010816	GGGCC	2	10	2221264	2221273	0 %	0 %	60 %	40 %	189440728
43504	NC_010816	TGC	2	6	2221281	2221286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440728
43505	NC_010816	CGC	2	6	2221309	2221314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440728
43506	NC_010816	GAT	2	6	2221442	2221447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440728
43507	NC_010816	CGC	2	6	2221465	2221470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440728
43508	NC_010816	GAA	2	6	2221520	2221525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440728
43509	NC_010816	TAT	2	6	2221550	2221555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440729
43510	NC_010816	CGA	2	6	2221604	2221609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440729
43511	NC_010816	GCC	2	6	2221671	2221676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440729
43512	NC_010816	CAT	2	6	2221700	2221705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440729
43513	NC_010816	GGCG	2	8	2221728	2221735	0 %	0 %	75 %	25 %	189440729
43514	NC_010816	AGGA	2	8	2221792	2221799	50 %	0 %	50 %	0 %	189440729
43515	NC_010816	CGC	2	6	2221821	2221826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440729
43516	NC_010816	CGCC	2	8	2221877	2221884	0 %	0 %	25 %	75 %	189440729
43517	NC_010816	CAT	2	6	2221946	2221951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440729
43518	NC_010816	ACT	3	9	2222906	2222914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440730
43519	NC_010816	AT	3	6	2223011	2223016	50 %	50 %	0 %	0 %	189440730
43520	NC_010816	TGC	2	6	2223063	2223068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440730
43521	NC_010816	TGG	2	6	2223080	2223085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440730
43522	NC_010816	TGA	2	6	2223277	2223282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440730
43523	NC_010816	GTC	2	6	2223333	2223338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440730
43524	NC_010816	CAT	2	6	2223352	2223357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440730
43525	NC_010816	TGG	2	6	2223361	2223366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440730
43526	NC_010816	GCC	2	6	2223392	2223397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440730
43527	NC_010816	CGG	2	6	2223418	2223423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440730
43528	NC_010816	ATCGC	2	10	2223435	2223444	20 %	20 %	20 %	40 %	189440730
43529	NC_010816	TGA	2	6	2223502	2223507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440730
43530	NC_010816	CG	3	6	2223637	2223642	0 %	0 %	50 %	50 %	189440730
43531	NC_010816	AAG	2	6	2223671	2223676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440730
43532	NC_010816	GCT	2	6	2223706	2223711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440731
43533	NC_010816	CGG	2	6	2223720	2223725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440731
43534	NC_010816	CA	3	6	2223768	2223773	50 %	0 %	0 %	50 %	189440731
43535	NC_010816	GCC	2	6	2223816	2223821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440731
43536	NC_010816	GCC	2	6	2223846	2223851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440731
43537	NC_010816	ATG	2	6	2223867	2223872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440731
43538	NC_010816	CAG	2	6	2223878	2223883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440731
43539	NC_010816	CGGC	2	8	2223926	2223933	0 %	0 %	50 %	50 %	189440731
43540	NC_010816	TGCC	2	8	2223955	2223962	0 %	25 %	25 %	50 %	189440731
43541	NC_010816	CAT	2	6	2223998	2224003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440731
43542	NC_010816	GTG	2	6	2224081	2224086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440732
43543	NC_010816	ATG	2	6	2224120	2224125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440732
43544	NC_010816	GGT	2	6	2224146	2224151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440732
43545	NC_010816	TGC	2	6	2224166	2224171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440732
43546	NC_010816	ATC	2	6	2224213	2224218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440732
43547	NC_010816	ATC	2	6	2224252	2224257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440732
43548	NC_010816	TGA	2	6	2224262	2224267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440732
43549	NC_010816	GAAG	2	8	2224621	2224628	50 %	0 %	50 %	0 %	189440733
43550	NC_010816	TAC	2	6	2224643	2224648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440733
43551	NC_010816	AAG	2	6	2224673	2224678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440733
43552	NC_010816	TGG	2	6	2224709	2224714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440733
43553	NC_010816	CGGCAC	2	12	2224747	2224758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189440733
43554	NC_010816	TAC	2	6	2224772	2224777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440733
43555	NC_010816	CCGAT	2	10	2224785	2224794	20 %	20 %	20 %	40 %	189440733
43556	NC_010816	GTC	2	6	2224931	2224936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440733
43557	NC_010816	GAG	2	6	2224946	2224951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440733
43558	NC_010816	GCT	2	6	2224975	2224980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440733
43559	NC_010816	CCT	2	6	2224989	2224994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440733
43560	NC_010816	GCC	2	6	2225027	2225032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440733
43561	NC_010816	CTACGC	2	12	2225053	2225064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440733
43562	NC_010816	CGG	2	6	2225065	2225070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440733
43563	NC_010816	AAG	2	6	2225078	2225083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440733
43564	NC_010816	GGC	2	6	2225132	2225137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440733
43565	NC_010816	GACC	2	8	2225182	2225189	25 %	0 %	25 %	50 %	189440733
43566	NC_010816	TTC	2	6	2225201	2225206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440733
43567	NC_010816	CCGAAG	2	12	2225264	2225275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440733
43568	NC_010816	GCC	2	6	2225306	2225311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440733
43569	NC_010816	CTGA	2	8	2225342	2225349	25 %	25 %	25 %	25 %	189440733
43570	NC_010816	GGCC	2	8	2225389	2225396	0 %	0 %	50 %	50 %	189440733
43571	NC_010816	CGAC	2	8	2225502	2225509	25 %	0 %	25 %	50 %	189440733
43572	NC_010816	GGT	2	6	2225570	2225575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440733
43573	NC_010816	CCT	2	6	2225604	2225609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440733
43574	NC_010816	GAG	2	6	2225615	2225620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440733
43575	NC_010816	CGC	2	6	2225659	2225664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440733
43576	NC_010816	CTG	2	6	2225669	2225674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440733
43577	NC_010816	CGA	2	6	2225764	2225769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440733
43578	NC_010816	CGC	2	6	2225833	2225838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440733
43579	NC_010816	CAA	2	6	2225878	2225883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440733
43580	NC_010816	CAT	2	6	2225887	2225892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440733
43581	NC_010816	GC	3	6	2226324	2226329	0 %	0 %	50 %	50 %	189440734
43582	NC_010816	AGG	2	6	2226340	2226345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440734
43583	NC_010816	TGG	2	6	2226370	2226375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440734
43584	NC_010816	GGC	2	6	2226381	2226386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440734
43585	NC_010816	ATC	2	6	2226453	2226458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440734
43586	NC_010816	CGG	2	6	2226554	2226559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440734
43587	NC_010816	GTG	2	6	2226684	2226689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440734
43588	NC_010816	CAC	2	6	2226692	2226697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440734
43589	NC_010816	CGT	2	6	2226772	2226777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440734
43590	NC_010816	TGA	2	6	2226820	2226825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440734
43591	NC_010816	CCG	2	6	2226832	2226837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440734
43592	NC_010816	GAC	2	6	2226906	2226911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440734
43593	NC_010816	CGA	2	6	2226920	2226925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440734
43594	NC_010816	GCTC	2	8	2226999	2227006	0 %	25 %	25 %	50 %	189440734
43595	NC_010816	CAATG	2	10	2227007	2227016	40 %	20 %	20 %	20 %	189440734
43596	NC_010816	CG	3	6	2227051	2227056	0 %	0 %	50 %	50 %	189440734
43597	NC_010816	TGG	2	6	2227258	2227263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440734
43598	NC_010816	TTCT	2	8	2227321	2227328	0 %	75 %	0 %	25 %	189440734
43599	NC_010816	CGA	2	6	2227343	2227348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440734
43600	NC_010816	CT	3	6	2227355	2227360	0 %	50 %	0 %	50 %	189440734
43601	NC_010816	CGG	2	6	2227391	2227396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440734
43602	NC_010816	GCC	2	6	2227495	2227500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440735
43603	NC_010816	CAC	2	6	2227514	2227519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440735
43604	NC_010816	AGAA	2	8	2227529	2227536	75 %	0 %	25 %	0 %	189440735
43605	NC_010816	GGC	2	6	2227595	2227600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440735
43606	NC_010816	TGGC	2	8	2227613	2227620	0 %	25 %	50 %	25 %	189440735
43607	NC_010816	CGG	2	6	2227651	2227656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440735
43608	NC_010816	TCG	2	6	2227665	2227670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440735
43609	NC_010816	GCC	2	6	2227719	2227724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440735
43610	NC_010816	CTGC	2	8	2227752	2227759	0 %	25 %	25 %	50 %	189440735
43611	NC_010816	GTG	2	6	2227827	2227832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440735
43612	NC_010816	TGA	2	6	2227846	2227851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440735
43613	NC_010816	GCC	2	6	2227887	2227892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440735
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43615	NC_010816	TCCGG	2	10	2227932	2227941	0 %	20 %	40 %	40 %	189440735
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43730	NC_010816	GCG	2	6	2233406	2233411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440740
43731	NC_010816	CGAGC	2	10	2233521	2233530	20 %	0 %	40 %	40 %	189440740
43732	NC_010816	GGCC	2	8	2233545	2233552	0 %	0 %	50 %	50 %	189440740
43733	NC_010816	ACC	2	6	2233568	2233573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440740
43734	NC_010816	TCA	2	6	2233592	2233597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440740
43735	NC_010816	CGT	2	6	2233661	2233666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440740
43736	NC_010816	TGA	2	6	2233695	2233700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440740
43737	NC_010816	ACCTAC	2	12	2233741	2233752	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	189440740
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43740	NC_010816	GAT	2	6	2233819	2233824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440740
43741	NC_010816	TCG	2	6	2233865	2233870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440740
43742	NC_010816	TGG	2	6	2233874	2233879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440740
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43759	NC_010816	CGG	2	6	2234802	2234807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440741
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43837	NC_010816	GAG	2	6	2238404	2238409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440744
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43839	NC_010816	TGC	2	6	2238463	2238468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440744
43840	NC_010816	GC	3	6	2238467	2238472	0 %	0 %	50 %	50 %	189440744
43841	NC_010816	GCTCG	2	10	2238480	2238489	0 %	20 %	40 %	40 %	189440744
43842	NC_010816	GGC	2	6	2238499	2238504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440744
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43962	NC_010816	TCG	2	6	2244700	2244705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440751
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