MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_010816	CGGC	2	8	2196830	2196837	0 %	0 %	50 %	50 %	189440706
43002	NC_010816	CAT	2	6	2196840	2196845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43003	NC_010816	GCC	2	6	2196882	2196887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440706
43004	NC_010816	GTC	2	6	2196952	2196957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43005	NC_010816	GACCAT	2	12	2196972	2196983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189440706
43006	NC_010816	ATG	2	6	2197006	2197011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440706
43007	NC_010816	CCA	2	6	2197025	2197030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440706
43008	NC_010816	TGC	2	6	2197088	2197093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43009	NC_010816	ATC	2	6	2197183	2197188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43010	NC_010816	CTC	2	6	2197195	2197200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440706
43011	NC_010816	TCA	2	6	2197217	2197222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43012	NC_010816	ATG	2	6	2197225	2197230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440706
43013	NC_010816	CCA	2	6	2197259	2197264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440706
43014	NC_010816	CGTT	2	8	2197319	2197326	0 %	50 %	25 %	25 %	189440706
43015	NC_010816	ATC	2	6	2197327	2197332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43016	NC_010816	GCG	2	6	2197399	2197404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440706
43017	NC_010816	ACC	2	6	2197405	2197410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440706
43018	NC_010816	TCG	2	6	2197412	2197417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43019	NC_010816	TGC	2	6	2197481	2197486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43020	NC_010816	GTCC	2	8	2197583	2197590	0 %	25 %	25 %	50 %	189440706
43021	NC_010816	ATC	2	6	2197726	2197731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43022	NC_010816	GTC	2	6	2197762	2197767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43023	NC_010816	CGT	2	6	2197803	2197808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43024	NC_010816	GCGT	2	8	2197865	2197872	0 %	25 %	50 %	25 %	189440706
43025	NC_010816	CAT	2	6	2197914	2197919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440706
43026	NC_010816	GTC	2	6	2197921	2197926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43027	NC_010816	TGC	2	6	2197934	2197939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43028	NC_010816	GGGCAT	2	12	2198031	2198042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189440706
43029	NC_010816	CCT	2	6	2198075	2198080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440706
43030	NC_010816	CTT	2	6	2198154	2198159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440706
43031	NC_010816	CTG	2	6	2198185	2198190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43032	NC_010816	TGC	2	6	2198195	2198200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43033	NC_010816	TGC	2	6	2198225	2198230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440706
43034	NC_010816	GGC	2	6	2198245	2198250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440706
43035	NC_010816	TGGC	2	8	2198254	2198261	0 %	25 %	50 %	25 %	189440706
43036	NC_010816	ATT	2	6	2198263	2198268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440706
43037	NC_010816	GATG	2	8	2198331	2198338	25 %	25 %	50 %	0 %	189440706
43038	NC_010816	ACTCG	2	10	2198364	2198373	20 %	20 %	20 %	40 %	189440706
43039	NC_010816	CGG	2	6	2198462	2198467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440707
43040	NC_010816	ATCGC	2	10	2198476	2198485	20 %	20 %	20 %	40 %	189440707
43041	NC_010816	TCA	2	6	2198499	2198504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440707
43042	NC_010816	ACC	2	6	2198516	2198521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440707
43043	NC_010816	GCC	2	6	2198546	2198551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43044	NC_010816	TTG	2	6	2198576	2198581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440707
43045	NC_010816	GGC	2	6	2198636	2198641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440707
43046	NC_010816	CGC	2	6	2198776	2198781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43047	NC_010816	CGC	2	6	2198842	2198847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43048	NC_010816	TGC	2	6	2198949	2198954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440707
43049	NC_010816	ACG	2	6	2199072	2199077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440707
43050	NC_010816	GGC	2	6	2199122	2199127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440707
43051	NC_010816	TCA	2	6	2199167	2199172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440707
43052	NC_010816	GCC	2	6	2199189	2199194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43053	NC_010816	CCG	2	6	2199201	2199206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43054	NC_010816	GCCG	2	8	2199217	2199224	0 %	0 %	50 %	50 %	189440707
43055	NC_010816	TGA	2	6	2199229	2199234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440707
43056	NC_010816	GAG	2	6	2199446	2199451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440707
43057	NC_010816	GGC	2	6	2199500	2199505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440707
43058	NC_010816	ACGC	2	8	2199607	2199614	25 %	0 %	25 %	50 %	189440707
43059	NC_010816	GGC	2	6	2199616	2199621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440707
43060	NC_010816	CAA	2	6	2199626	2199631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440707
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43062	NC_010816	TGC	2	6	2199655	2199660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440707
43063	NC_010816	TGG	2	6	2199690	2199695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440707
43064	NC_010816	GAT	2	6	2199719	2199724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440707
43065	NC_010816	CTG	2	6	2199737	2199742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440707
43066	NC_010816	GTG	2	6	2199827	2199832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440707
43067	NC_010816	CAA	2	6	2199835	2199840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440707
43068	NC_010816	GCC	2	6	2199854	2199859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440707
43069	NC_010816	TCA	2	6	2199882	2199887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440707
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43073	NC_010816	GGCG	2	8	2200150	2200157	0 %	0 %	75 %	25 %	189440708
43074	NC_010816	GCGT	2	8	2200208	2200215	0 %	25 %	50 %	25 %	189440708
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43086	NC_010816	TCG	2	6	2200849	2200854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440708
43087	NC_010816	TGA	2	6	2200928	2200933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440708
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43089	NC_010816	GCC	2	6	2201035	2201040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440708
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43098	NC_010816	AC	3	6	2201476	2201481	50 %	0 %	0 %	50 %	189440709
43099	NC_010816	CGT	2	6	2201510	2201515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440709
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43102	NC_010816	TCGAT	2	10	2201661	2201670	20 %	40 %	20 %	20 %	189440709
43103	NC_010816	CCGT	2	8	2201684	2201691	0 %	25 %	25 %	50 %	189440709
43104	NC_010816	AAT	2	6	2201740	2201745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189440710
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43115	NC_010816	CTA	2	6	2202102	2202107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440710
43116	NC_010816	TCA	2	6	2202230	2202235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440710
43117	NC_010816	TCT	2	6	2202236	2202241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440710
43118	NC_010816	TGG	2	6	2202253	2202258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440710
43119	NC_010816	TGA	2	6	2202260	2202265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440710
43120	NC_010816	GCG	2	6	2202275	2202280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440710
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43122	NC_010816	GAA	2	6	2202309	2202314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440710
43123	NC_010816	CAC	2	6	2202345	2202350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440710
43124	NC_010816	GAG	2	6	2202397	2202402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440710
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43126	NC_010816	CG	3	6	2202458	2202463	0 %	0 %	50 %	50 %	189440710
43127	NC_010816	TGC	2	6	2202467	2202472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440710
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43131	NC_010816	CGA	2	6	2202654	2202659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440710
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43133	NC_010816	GCT	2	6	2202735	2202740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440710
43134	NC_010816	TCA	3	9	2202776	2202784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440710
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43139	NC_010816	GCC	3	9	2203168	2203176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440710
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43142	NC_010816	GCT	2	6	2203287	2203292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440710
43143	NC_010816	CCG	2	6	2203325	2203330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440710
43144	NC_010816	CGACC	2	10	2203347	2203356	20 %	0 %	20 %	60 %	189440710
43145	NC_010816	CGA	2	6	2203458	2203463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440710
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43154	NC_010816	GCC	2	6	2203743	2203748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440710
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43173	NC_010816	CGG	2	6	2204668	2204673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440713
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43204	NC_010816	CGC	2	6	2206076	2206081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440714
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43213	NC_010816	CAAG	2	8	2206482	2206489	50 %	0 %	25 %	25 %	189440714
43214	NC_010816	GTCGGA	2	12	2206497	2206508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189440714
43215	NC_010816	ATT	2	6	2206528	2206533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440714
43216	NC_010816	CGC	2	6	2206628	2206633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440714
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43218	NC_010816	GCA	2	6	2206730	2206735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440714
43219	NC_010816	GACCTT	2	12	2206762	2206773	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189440714
43220	NC_010816	CGA	2	6	2206797	2206802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440714
43221	NC_010816	GCA	2	6	2206811	2206816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440714
43222	NC_010816	GCG	2	6	2206892	2206897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440714
43223	NC_010816	CCTT	2	8	2206907	2206914	0 %	50 %	0 %	50 %	189440714
43224	NC_010816	TGG	2	6	2207179	2207184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440715
43225	NC_010816	CCT	2	6	2207234	2207239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440715
43226	NC_010816	AAG	2	6	2207365	2207370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440715
43227	NC_010816	TCA	2	6	2207384	2207389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440715
43228	NC_010816	GGCG	2	8	2207439	2207446	0 %	0 %	75 %	25 %	189440715
43229	NC_010816	TGA	2	6	2207480	2207485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440715
43230	NC_010816	GTG	2	6	2207548	2207553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440715
43231	NC_010816	ATC	2	6	2207569	2207574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440715
43232	NC_010816	CCG	2	6	2207605	2207610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440715
43233	NC_010816	GCC	2	6	2207732	2207737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440716
43234	NC_010816	GCG	2	6	2207792	2207797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440716
43235	NC_010816	GATATC	2	12	2207833	2207844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189440716
43236	NC_010816	ACC	2	6	2207850	2207855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440716
43237	NC_010816	CGGCG	2	10	2207910	2207919	0 %	0 %	60 %	40 %	189440716
43238	NC_010816	CAT	2	6	2207932	2207937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440716
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43241	NC_010816	ATCGG	2	10	2208206	2208215	20 %	20 %	40 %	20 %	189440716
43242	NC_010816	CCT	2	6	2208228	2208233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440716
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43250	NC_010816	GTC	3	9	2209032	2209040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440717
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43257	NC_010816	CAC	2	6	2209244	2209249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440717
43258	NC_010816	CTG	2	6	2209272	2209277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440717
43259	NC_010816	TTG	2	6	2209384	2209389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440717
43260	NC_010816	CGC	2	6	2209454	2209459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440717
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43263	NC_010816	GCCG	2	8	2209641	2209648	0 %	0 %	50 %	50 %	189440717
43264	NC_010816	GAATCT	2	12	2209649	2209660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189440717
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43339	NC_010816	AT	3	6	2213826	2213831	50 %	50 %	0 %	0 %	189440720
43340	NC_010816	TGCC	2	8	2213845	2213852	0 %	25 %	25 %	50 %	189440720
43341	NC_010816	TGG	2	6	2214001	2214006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440720
43342	NC_010816	CGGCCA	2	12	2214016	2214027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189440720
43343	NC_010816	TGC	2	6	2214064	2214069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440720
43344	NC_010816	TGA	2	6	2214082	2214087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440720
43345	NC_010816	GCA	2	6	2214088	2214093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440720
43346	NC_010816	GAT	2	6	2214155	2214160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440720
43347	NC_010816	CG	3	6	2214201	2214206	0 %	0 %	50 %	50 %	189440720
43348	NC_010816	TCG	2	6	2214303	2214308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440720
43349	NC_010816	TTG	2	6	2214460	2214465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440720
43350	NC_010816	AAG	2	6	2214734	2214739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440721
43351	NC_010816	TCG	2	6	2214741	2214746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43352	NC_010816	GTG	2	6	2214749	2214754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440721
43353	NC_010816	TGG	2	6	2214790	2214795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440721
43354	NC_010816	CAA	2	6	2214901	2214906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440721
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43356	NC_010816	CAG	2	6	2214974	2214979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43357	NC_010816	CAA	2	6	2215003	2215008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440721
43358	NC_010816	TCG	2	6	2215020	2215025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43359	NC_010816	CCG	2	6	2215059	2215064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440721
43360	NC_010816	ACT	2	6	2215137	2215142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440721
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43363	NC_010816	CTG	2	6	2215304	2215309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43364	NC_010816	AGA	2	6	2215398	2215403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440721
43365	NC_010816	TGA	2	6	2215410	2215415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440721
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43368	NC_010816	GCTG	2	8	2215678	2215685	0 %	25 %	50 %	25 %	189440721
43369	NC_010816	GTC	2	6	2215703	2215708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440721
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43372	NC_010816	GCT	2	6	2215783	2215788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43373	NC_010816	CGA	2	6	2215861	2215866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440721
43374	NC_010816	AGT	2	6	2215875	2215880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440721
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43376	NC_010816	CGGTC	2	10	2216030	2216039	0 %	20 %	40 %	40 %	189440722
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43378	NC_010816	TGA	2	6	2216125	2216130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440722
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43380	NC_010816	TCAT	2	8	2216242	2216249	25 %	50 %	0 %	25 %	189440722
43381	NC_010816	GAA	2	6	2216357	2216362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440722
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43402	NC_010816	CATCCT	2	12	2217278	2217289	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189440722
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43413	NC_010816	TCG	2	6	2217642	2217647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440723
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43446	NC_010816	GTAT	2	8	2218884	2218891	25 %	50 %	25 %	0 %	189440724
43447	NC_010816	TCTGGC	2	12	2218917	2218928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440724
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43452	NC_010816	GCA	2	6	2219094	2219099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440724
43453	NC_010816	GCTT	2	8	2219345	2219352	0 %	50 %	25 %	25 %	189440725
43454	NC_010816	CCT	2	6	2219373	2219378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440725
43455	NC_010816	CTG	2	6	2219385	2219390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440725
43456	NC_010816	AACGA	2	10	2219482	2219491	60 %	0 %	20 %	20 %	189440725
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43459	NC_010816	ACGCTC	2	12	2219638	2219649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440725
43460	NC_010816	CCG	2	6	2219670	2219675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440725
43461	NC_010816	GGGC	2	8	2219718	2219725	0 %	0 %	75 %	25 %	189440725
43462	NC_010816	GCA	2	6	2219796	2219801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440725
43463	NC_010816	TGAA	2	8	2219815	2219822	50 %	25 %	25 %	0 %	189440725
43464	NC_010816	CGG	2	6	2219870	2219875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440726
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43467	NC_010816	GGA	2	6	2219987	2219992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440726
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43482	NC_010816	TG	3	6	2220433	2220438	0 %	50 %	50 %	0 %	189440727
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43487	NC_010816	CCTCG	2	10	2220547	2220556	0 %	20 %	20 %	60 %	189440727
43488	NC_010816	CGC	2	6	2220578	2220583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440727
43489	NC_010816	CCG	2	6	2220584	2220589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440727
43490	NC_010816	ACC	2	6	2220691	2220696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440728
43491	NC_010816	ACG	2	6	2220720	2220725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440728
43492	NC_010816	GCCA	2	8	2220736	2220743	25 %	0 %	25 %	50 %	189440728
43493	NC_010816	TCA	2	6	2220805	2220810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440728
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