MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_010816	ATGA	2	8	2144502	2144509	50 %	25 %	25 %	0 %	189440657
42003	NC_010816	CAG	2	6	2145269	2145274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440658
42004	NC_010816	TCC	2	6	2145276	2145281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440658
42005	NC_010816	GCCG	2	8	2145333	2145340	0 %	0 %	50 %	50 %	189440658
42006	NC_010816	CGG	2	6	2145350	2145355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440658
42007	NC_010816	CCAT	2	8	2145393	2145400	25 %	25 %	0 %	50 %	189440658
42008	NC_010816	GTAT	2	8	2145519	2145526	25 %	50 %	25 %	0 %	189440658
42009	NC_010816	GCTC	2	8	2145533	2145540	0 %	25 %	25 %	50 %	189440658
42010	NC_010816	TAA	2	6	2145551	2145556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189440658
42011	NC_010816	TG	3	6	2145583	2145588	0 %	50 %	50 %	0 %	189440658
42012	NC_010816	TTTA	2	8	2145603	2145610	25 %	75 %	0 %	0 %	189440658
42013	NC_010816	TGC	2	6	2145619	2145624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440658
42014	NC_010816	GTCA	2	8	2145627	2145634	25 %	25 %	25 %	25 %	189440658
42015	NC_010816	TGT	2	6	2145657	2145662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440658
42016	NC_010816	AAT	2	6	2145738	2145743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189440658
42017	NC_010816	GCT	2	6	2145744	2145749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440658
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42051	NC_010816	CG	3	6	2147923	2147928	0 %	0 %	50 %	50 %	189440661
42052	NC_010816	TCC	2	6	2147966	2147971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440661
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42092	NC_010816	CG	4	8	2149966	2149973	0 %	0 %	50 %	50 %	189440662
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42101	NC_010816	T	7	7	2150221	2150227	0 %	100 %	0 %	0 %	189440662
42102	NC_010816	CGG	2	6	2150311	2150316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440663
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42112	NC_010816	GGA	2	6	2150603	2150608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440663
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42114	NC_010816	GC	4	8	2150726	2150733	0 %	0 %	50 %	50 %	189440663
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42116	NC_010816	GCG	2	6	2150838	2150843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440663
42117	NC_010816	CG	3	6	2150862	2150867	0 %	0 %	50 %	50 %	189440663
42118	NC_010816	TCG	2	6	2150944	2150949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440663
42119	NC_010816	CGTC	2	8	2150999	2151006	0 %	25 %	25 %	50 %	189440663
42120	NC_010816	CGCC	2	8	2151018	2151025	0 %	0 %	25 %	75 %	189440664
42121	NC_010816	TCG	2	6	2151087	2151092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440664
42122	NC_010816	CCGCC	2	10	2151154	2151163	0 %	0 %	20 %	80 %	189440664
42123	NC_010816	GTCT	2	8	2151258	2151265	0 %	50 %	25 %	25 %	189440664
42124	NC_010816	TTG	2	6	2151342	2151347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440664
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42127	NC_010816	CGA	2	6	2151434	2151439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440664
42128	NC_010816	GACCTC	2	12	2151446	2151457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440664
42129	NC_010816	GC	3	6	2151460	2151465	0 %	0 %	50 %	50 %	189440664
42130	NC_010816	GCC	2	6	2151565	2151570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440664
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42132	NC_010816	TCC	2	6	2151642	2151647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440664
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42134	NC_010816	CGG	2	6	2151910	2151915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440664
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42143	NC_010816	CG	4	8	2152346	2152353	0 %	0 %	50 %	50 %	189440664
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42219	NC_010816	CGA	2	6	2155999	2156004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440668
42220	NC_010816	CGA	2	6	2156042	2156047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440668
42221	NC_010816	CGG	2	6	2156062	2156067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440668
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42225	NC_010816	ATG	2	6	2156247	2156252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440668
42226	NC_010816	AC	3	6	2156333	2156338	50 %	0 %	0 %	50 %	189440668
42227	NC_010816	GAT	2	6	2156447	2156452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440669
42228	NC_010816	GCG	2	6	2156511	2156516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440669
42229	NC_010816	CCG	2	6	2156593	2156598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440669
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42231	NC_010816	TCA	2	6	2156755	2156760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440669
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42448	NC_010816	CCAGC	2	10	2165809	2165818	20 %	0 %	20 %	60 %	189440679
42449	NC_010816	CGC	2	6	2165921	2165926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440680
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42451	NC_010816	CAG	2	6	2165973	2165978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440680
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42454	NC_010816	GAA	2	6	2166141	2166146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440680
42455	NC_010816	CAC	2	6	2166246	2166251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440680
42456	NC_010816	ACC	2	6	2166259	2166264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440680
42457	NC_010816	ACA	2	6	2166278	2166283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440680
42458	NC_010816	CAG	2	6	2166297	2166302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440680
42459	NC_010816	AAC	2	6	2166307	2166312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440680
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42461	NC_010816	CGCC	2	8	2166380	2166387	0 %	0 %	25 %	75 %	189440680
42462	NC_010816	CGAGT	2	10	2166553	2166562	20 %	20 %	40 %	20 %	189440680
42463	NC_010816	GC	3	6	2166564	2166569	0 %	0 %	50 %	50 %	189440680
42464	NC_010816	CAC	2	6	2166597	2166602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440680
42465	NC_010816	ACA	2	6	2166686	2166691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440680
42466	NC_010816	CCG	4	12	2166715	2166726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440680
42467	NC_010816	TCC	2	6	2166754	2166759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440680
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42469	NC_010816	GAT	2	6	2166820	2166825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440681
42470	NC_010816	ACC	3	9	2166889	2166897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440681
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42473	NC_010816	CAA	2	6	2166976	2166981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440681
42474	NC_010816	AATC	2	8	2167444	2167451	50 %	25 %	0 %	25 %	189440682
42475	NC_010816	TCT	2	6	2167465	2167470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440682
42476	NC_010816	AAG	2	6	2167482	2167487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440682
42477	NC_010816	TGA	2	6	2168233	2168238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440683
42478	NC_010816	GCA	2	6	2168244	2168249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440683
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42481	NC_010816	CTT	2	6	2168387	2168392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440683
42482	NC_010816	AATG	2	8	2168455	2168462	50 %	25 %	25 %	0 %	189440683
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42485	NC_010816	TCG	2	6	2168595	2168600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440683
42486	NC_010816	AAT	2	6	2168641	2168646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189440683
42487	NC_010816	CAG	2	6	2169162	2169167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440684
42488	NC_010816	ACC	2	6	2169198	2169203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440684
42489	NC_010816	GAG	2	6	2169231	2169236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440684
42490	NC_010816	CGA	2	6	2169266	2169271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440684
42491	NC_010816	CG	3	6	2169284	2169289	0 %	0 %	50 %	50 %	189440684
42492	NC_010816	GGCC	2	8	2169323	2169330	0 %	0 %	50 %	50 %	189440684
42493	NC_010816	CGG	2	6	2169409	2169414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440684
42494	NC_010816	GAG	2	6	2169438	2169443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440684
42495	NC_010816	GAG	2	6	2169450	2169455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440684
42496	NC_010816	CGA	2	6	2169500	2169505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440684
42497	NC_010816	CAGC	2	8	2169509	2169516	25 %	0 %	25 %	50 %	189440684
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42499	NC_010816	CGA	2	6	2169584	2169589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440684
42500	NC_010816	TGG	2	6	2169691	2169696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440684

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