MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_010816	CCG	2	6	2118697	2118702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440633
41502	NC_010816	CTA	2	6	2118707	2118712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440633
41503	NC_010816	GGC	2	6	2118732	2118737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440633
41504	NC_010816	ACA	2	6	2118754	2118759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440633
41505	NC_010816	TTC	2	6	2118783	2118788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440633
41506	NC_010816	CCA	2	6	2118802	2118807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440633
41507	NC_010816	TGG	2	6	2118889	2118894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440633
41508	NC_010816	GTG	2	6	2118909	2118914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440633
41509	NC_010816	AT	3	6	2118958	2118963	50 %	50 %	0 %	0 %	189440633
41510	NC_010816	ACG	2	6	2118964	2118969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440633
41511	NC_010816	CAAG	2	8	2118979	2118986	50 %	0 %	25 %	25 %	189440633
41512	NC_010816	TGA	2	6	2119045	2119050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440634
41513	NC_010816	ACC	2	6	2119118	2119123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440634
41514	NC_010816	TGC	2	6	2119170	2119175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440634
41515	NC_010816	GAT	2	6	2119187	2119192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440634
41516	NC_010816	TGC	2	6	2119206	2119211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440634
41517	NC_010816	AACC	2	8	2119290	2119297	50 %	0 %	0 %	50 %	189440634
41518	NC_010816	GGAG	2	8	2119336	2119343	25 %	0 %	75 %	0 %	189440634
41519	NC_010816	TGG	2	6	2119345	2119350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440634
41520	NC_010816	GAT	2	6	2119367	2119372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440634
41521	NC_010816	GCA	2	6	2119385	2119390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440634
41522	NC_010816	CCG	2	6	2119425	2119430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440634
41523	NC_010816	G	6	6	2119448	2119453	0 %	0 %	100 %	0 %	189440634
41524	NC_010816	GC	3	6	2119539	2119544	0 %	0 %	50 %	50 %	189440634
41525	NC_010816	CGGAT	2	10	2119614	2119623	20 %	20 %	40 %	20 %	189440634
41526	NC_010816	GTT	2	6	2119630	2119635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440634
41527	NC_010816	TAT	2	6	2119663	2119668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440634
41528	NC_010816	AAG	2	6	2119733	2119738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440634
41529	NC_010816	CGGCG	2	10	2119849	2119858	0 %	0 %	60 %	40 %	189440635
41530	NC_010816	AGCG	2	8	2119862	2119869	25 %	0 %	50 %	25 %	189440635
41531	NC_010816	GAT	2	6	2119922	2119927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440635
41532	NC_010816	AC	3	6	2119939	2119944	50 %	0 %	0 %	50 %	189440635
41533	NC_010816	ACC	2	6	2119983	2119988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440635
41534	NC_010816	TAC	2	6	2120089	2120094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440635
41535	NC_010816	TTCA	2	8	2120136	2120143	25 %	50 %	0 %	25 %	189440635
41536	NC_010816	TGC	2	6	2120251	2120256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440635
41537	NC_010816	TGC	2	6	2120305	2120310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440635
41538	NC_010816	GCG	2	6	2120320	2120325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440635
41539	NC_010816	GC	3	6	2120494	2120499	0 %	0 %	50 %	50 %	189440635
41540	NC_010816	ATC	2	6	2120673	2120678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440635
41541	NC_010816	CAA	2	6	2120687	2120692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440635
41542	NC_010816	CCG	2	6	2120830	2120835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440635
41543	NC_010816	GATG	2	8	2120847	2120854	25 %	25 %	50 %	0 %	189440635
41544	NC_010816	CGC	2	6	2120897	2120902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440635
41545	NC_010816	TCG	2	6	2120926	2120931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440635
41546	NC_010816	GCTC	2	8	2120932	2120939	0 %	25 %	25 %	50 %	189440635
41547	NC_010816	TGG	2	6	2120959	2120964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440635
41548	NC_010816	GGC	2	6	2120987	2120992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440635
41549	NC_010816	CATG	2	8	2121074	2121081	25 %	25 %	25 %	25 %	189440635
41550	NC_010816	GCC	2	6	2121102	2121107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440635
41551	NC_010816	TGT	2	6	2121181	2121186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440635
41552	NC_010816	GTT	2	6	2121242	2121247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440635
41553	NC_010816	GCGT	2	8	2121349	2121356	0 %	25 %	50 %	25 %	189440635
41554	NC_010816	GTT	2	6	2121422	2121427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440635
41555	NC_010816	GTC	2	6	2121541	2121546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440636
41556	NC_010816	CCG	2	6	2121585	2121590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440636
41557	NC_010816	TG	3	6	2121599	2121604	0 %	50 %	50 %	0 %	189440636
41558	NC_010816	CAA	2	6	2121605	2121610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440636
41559	NC_010816	TTGCG	2	10	2121627	2121636	0 %	40 %	40 %	20 %	189440636
41560	NC_010816	GGCT	2	8	2121637	2121644	0 %	25 %	50 %	25 %	189440636
41561	NC_010816	GCG	2	6	2121645	2121650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440636
41562	NC_010816	CGCT	2	8	2121651	2121658	0 %	25 %	25 %	50 %	189440636
41563	NC_010816	ATC	2	6	2121660	2121665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440636
41564	NC_010816	CGC	2	6	2121709	2121714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440636
41565	NC_010816	GT	3	6	2121745	2121750	0 %	50 %	50 %	0 %	189440636
41566	NC_010816	GGT	3	9	2121755	2121763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440636
41567	NC_010816	GC	3	6	2121768	2121773	0 %	0 %	50 %	50 %	189440636
41568	NC_010816	TCGCC	2	10	2121775	2121784	0 %	20 %	20 %	60 %	189440636
41569	NC_010816	CTG	2	6	2121827	2121832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440636
41570	NC_010816	CG	3	6	2121857	2121862	0 %	0 %	50 %	50 %	189440636
41571	NC_010816	AG	3	6	2121869	2121874	50 %	0 %	50 %	0 %	189440636
41572	NC_010816	TTC	2	6	2121897	2121902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440636
41573	NC_010816	CGGTG	2	10	2121914	2121923	0 %	20 %	60 %	20 %	189440636
41574	NC_010816	CAT	2	6	2121929	2121934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440636
41575	NC_010816	TGG	2	6	2122050	2122055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440636
41576	NC_010816	CG	3	6	2122082	2122087	0 %	0 %	50 %	50 %	189440636
41577	NC_010816	TTG	2	6	2122098	2122103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440636
41578	NC_010816	TCA	3	9	2122152	2122160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440636
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41582	NC_010816	CAC	2	6	2122589	2122594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440637
41583	NC_010816	TGGA	2	8	2122647	2122654	25 %	25 %	50 %	0 %	189440637
41584	NC_010816	CGC	2	6	2122675	2122680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440637
41585	NC_010816	AACG	2	8	2122686	2122693	50 %	0 %	25 %	25 %	189440637
41586	NC_010816	TCG	2	6	2122761	2122766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440637
41587	NC_010816	TGG	2	6	2122834	2122839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440637
41588	NC_010816	CGG	2	6	2122840	2122845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440637
41589	NC_010816	GCG	2	6	2122879	2122884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440637
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41591	NC_010816	GC	3	6	2122974	2122979	0 %	0 %	50 %	50 %	189440637
41592	NC_010816	GTC	2	6	2123013	2123018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440637
41593	NC_010816	CGC	2	6	2123042	2123047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440637
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41600	NC_010816	ATC	2	6	2123409	2123414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440637
41601	NC_010816	CG	3	6	2123438	2123443	0 %	0 %	50 %	50 %	189440637
41602	NC_010816	GC	3	6	2123599	2123604	0 %	0 %	50 %	50 %	189440637
41603	NC_010816	GCC	2	6	2123652	2123657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440637
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41605	NC_010816	CCGCAT	2	12	2123761	2123772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440637
41606	NC_010816	TC	3	6	2123777	2123782	0 %	50 %	0 %	50 %	189440637
41607	NC_010816	TCC	2	6	2123892	2123897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440637
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41611	NC_010816	CGGT	2	8	2124087	2124094	0 %	25 %	50 %	25 %	189440637
41612	NC_010816	TGA	2	6	2124129	2124134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440637
41613	NC_010816	CG	3	6	2124167	2124172	0 %	0 %	50 %	50 %	189440637
41614	NC_010816	GTG	2	6	2124198	2124203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440637
41615	NC_010816	GGT	2	6	2124224	2124229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440637
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41732	NC_010816	GTC	2	6	2130474	2130479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440642
41733	NC_010816	GAT	2	6	2130486	2130491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440642
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41844	NC_010816	TAT	2	6	2136454	2136459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440648
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41846	NC_010816	GAA	3	9	2136586	2136594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440648
41847	NC_010816	TCCACC	2	12	2136608	2136619	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189440648
41848	NC_010816	TGA	2	6	2136625	2136630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440648
41849	NC_010816	GAAG	2	8	2136691	2136698	50 %	0 %	50 %	0 %	189440648
41850	NC_010816	CTG	2	6	2136699	2136704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440648
41851	NC_010816	GCG	3	9	2136707	2136715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440648
41852	NC_010816	TGA	2	6	2136730	2136735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440648
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41854	NC_010816	GCT	3	9	2136755	2136763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440648
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41953	NC_010816	GCA	3	9	2141531	2141539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440654
41954	NC_010816	ACC	2	6	2141614	2141619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440654
41955	NC_010816	GAT	2	6	2141664	2141669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440654
41956	NC_010816	GCG	2	6	2141672	2141677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440654
41957	NC_010816	GCT	2	6	2141678	2141683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440654
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41960	NC_010816	TCCT	2	8	2141792	2141799	0 %	50 %	0 %	50 %	189440655
41961	NC_010816	CTG	2	6	2141801	2141806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440655
41962	NC_010816	CATGG	2	10	2141822	2141831	20 %	20 %	40 %	20 %	189440655
41963	NC_010816	CGG	2	6	2141854	2141859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440655
41964	NC_010816	CGA	2	6	2141893	2141898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440655
41965	NC_010816	ATC	2	6	2141916	2141921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440655
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41968	NC_010816	TCGC	2	8	2141999	2142006	0 %	25 %	25 %	50 %	189440655
41969	NC_010816	GC	3	6	2142097	2142102	0 %	0 %	50 %	50 %	189440655
41970	NC_010816	GCCC	2	8	2142109	2142116	0 %	0 %	25 %	75 %	189440655
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41976	NC_010816	GTTGGT	2	12	2142554	2142565	0 %	50 %	50 %	0 %	189440655
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41978	NC_010816	TTG	2	6	2143027	2143032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440656
41979	NC_010816	GGC	2	6	2143049	2143054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440656
41980	NC_010816	CGT	2	6	2143281	2143286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440657
41981	NC_010816	CGC	2	6	2143317	2143322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440657
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41983	NC_010816	GGA	2	6	2143570	2143575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440657
41984	NC_010816	CGC	2	6	2143716	2143721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440657
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41988	NC_010816	CCG	2	6	2143811	2143816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440657
41989	NC_010816	AG	3	6	2143871	2143876	50 %	0 %	50 %	0 %	189440657
41990	NC_010816	AGT	2	6	2143948	2143953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440657
41991	NC_010816	TCG	2	6	2143965	2143970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440657
41992	NC_010816	GCG	2	6	2143983	2143988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440657
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41996	NC_010816	ACC	2	6	2144243	2144248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440657
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41999	NC_010816	TCG	2	6	2144424	2144429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440657
42000	NC_010816	TCA	2	6	2144448	2144453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440657

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