MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41003	NC_010816	CGGG	2	8	2093186	2093193	0 %	0 %	75 %	25 %	189440616
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41006	NC_010816	CAC	2	6	2093328	2093333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440616
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41009	NC_010816	TGC	3	9	2093524	2093532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440616
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41011	NC_010816	CT	4	8	2093657	2093664	0 %	50 %	0 %	50 %	189440616
41012	NC_010816	ATG	2	6	2093784	2093789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440616
41013	NC_010816	ATC	3	9	2093793	2093801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440616
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41017	NC_010816	CG	3	6	2093952	2093957	0 %	0 %	50 %	50 %	189440616
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41115	NC_010816	TGA	2	6	2099812	2099817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440619
41116	NC_010816	CCG	2	6	2099890	2099895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440619
41117	NC_010816	CGTGCT	2	12	2099897	2099908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440619
41118	NC_010816	CATC	2	8	2100005	2100012	25 %	25 %	0 %	50 %	189440619
41119	NC_010816	CCG	2	6	2100020	2100025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440619
41120	NC_010816	GCTG	2	8	2100034	2100041	0 %	25 %	50 %	25 %	189440619
41121	NC_010816	CGGC	2	8	2100055	2100062	0 %	0 %	50 %	50 %	189440619
41122	NC_010816	GGCT	2	8	2100084	2100091	0 %	25 %	50 %	25 %	189440619
41123	NC_010816	TGC	2	6	2100103	2100108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440619
41124	NC_010816	GTT	2	6	2100248	2100253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440619
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41126	NC_010816	CCA	2	6	2100277	2100282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440619
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41128	NC_010816	GCCG	2	8	2100438	2100445	0 %	0 %	50 %	50 %	189440619
41129	NC_010816	CG	3	6	2100489	2100494	0 %	0 %	50 %	50 %	189440619
41130	NC_010816	CGT	2	6	2100512	2100517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440619
41131	NC_010816	GAC	2	6	2100524	2100529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440619
41132	NC_010816	GGC	2	6	2100615	2100620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440619
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41134	NC_010816	CGG	2	6	2100709	2100714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440619
41135	NC_010816	CGG	2	6	2100751	2100756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440619
41136	NC_010816	TGG	3	9	2100772	2100780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440619
41137	NC_010816	GGT	2	6	2100785	2100790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440619
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41144	NC_010816	CGT	2	6	2100955	2100960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440620
41145	NC_010816	GGC	2	6	2100971	2100976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440620
41146	NC_010816	CGG	2	6	2100979	2100984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440620
41147	NC_010816	CGA	2	6	2101042	2101047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440620
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41151	NC_010816	GCG	2	6	2101249	2101254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440620
41152	NC_010816	TACC	2	8	2101267	2101274	25 %	25 %	0 %	50 %	189440620
41153	NC_010816	GCT	2	6	2101276	2101281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440620
41154	NC_010816	TATACG	2	12	2101439	2101450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189440620
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41162	NC_010816	GAT	2	6	2101889	2101894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
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41167	NC_010816	GAT	2	6	2102109	2102114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440621
41168	NC_010816	CAG	2	6	2102124	2102129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440621
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41183	NC_010816	CGG	2	6	2102755	2102760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440621
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41185	NC_010816	GCG	3	9	2102847	2102855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440621
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41187	NC_010816	CGATGA	2	12	2102870	2102881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189440621
41188	NC_010816	CAC	3	9	2102892	2102900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440621
41189	NC_010816	GCG	2	6	2102911	2102916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440621
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41200	NC_010816	GTC	2	6	2103542	2103547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440622
41201	NC_010816	AAG	2	6	2103548	2103553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440622
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41211	NC_010816	GAGCAC	2	12	2104076	2104087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440622
41212	NC_010816	CTG	2	6	2104088	2104093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440622
41213	NC_010816	CAT	2	6	2104138	2104143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440622
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41215	NC_010816	CGC	2	6	2104174	2104179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440622
41216	NC_010816	CACCTC	2	12	2104234	2104245	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	189440622
41217	NC_010816	GGC	2	6	2104301	2104306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440622
41218	NC_010816	CCA	2	6	2104341	2104346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440622
41219	NC_010816	CAT	2	6	2104363	2104368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440622
41220	NC_010816	ACC	2	6	2104374	2104379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440622
41221	NC_010816	GC	3	6	2104417	2104422	0 %	0 %	50 %	50 %	189440622
41222	NC_010816	GGC	2	6	2104430	2104435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440622
41223	NC_010816	CAA	2	6	2105470	2105475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440624
41224	NC_010816	GCT	2	6	2105486	2105491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440624
41225	NC_010816	AGC	2	6	2105503	2105508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440624
41226	NC_010816	GCG	2	6	2105532	2105537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440624
41227	NC_010816	CCA	2	6	2105691	2105696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440624
41228	NC_010816	GCC	2	6	2105711	2105716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
41229	NC_010816	AAG	2	6	2105726	2105731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440624
41230	NC_010816	GCC	2	6	2105840	2105845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
41231	NC_010816	ACTT	2	8	2105936	2105943	25 %	50 %	0 %	25 %	189440624
41232	NC_010816	CGC	2	6	2105950	2105955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
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41234	NC_010816	CAT	2	6	2106043	2106048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440624
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41236	NC_010816	ATG	4	12	2106071	2106082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440624
41237	NC_010816	CAG	2	6	2106185	2106190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440624
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41241	NC_010816	GCC	2	6	2106281	2106286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440624
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41263	NC_010816	GCC	2	6	2107473	2107478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440625
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41268	NC_010816	ACA	2	6	2107561	2107566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440625
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41332	NC_010816	CGTGGG	2	12	2110719	2110730	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189440627
41333	NC_010816	CGAGC	2	10	2110731	2110740	20 %	0 %	40 %	40 %	189440627
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41343	NC_010816	CG	3	6	2111038	2111043	0 %	0 %	50 %	50 %	189440627
41344	NC_010816	CGG	2	6	2111046	2111051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440627
41345	NC_010816	CGG	2	6	2111120	2111125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440627
41346	NC_010816	CTG	2	6	2111137	2111142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440627
41347	NC_010816	CAA	2	6	2111256	2111261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440627
41348	NC_010816	AGA	2	6	2111276	2111281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440627
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41350	NC_010816	CAT	2	6	2111383	2111388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440628
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41353	NC_010816	TCC	2	6	2111523	2111528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440628
41354	NC_010816	CAC	2	6	2111638	2111643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440628
41355	NC_010816	GGC	2	6	2111672	2111677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440628
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41367	NC_010816	GCA	2	6	2112231	2112236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440628
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41369	NC_010816	CTG	2	6	2112257	2112262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440628
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41374	NC_010816	CTTGAC	2	12	2112579	2112590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189440629
41375	NC_010816	ACGCA	2	10	2112593	2112602	40 %	0 %	20 %	40 %	189440629
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41382	NC_010816	CAT	2	6	2112833	2112838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440629
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41411	NC_010816	TCG	2	6	2113822	2113827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440629
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41421	NC_010816	ACA	2	6	2114425	2114430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440630
41422	NC_010816	TGC	2	6	2114449	2114454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440630
41423	NC_010816	TGA	2	6	2114461	2114466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440630
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41432	NC_010816	CTG	2	6	2114694	2114699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440630
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41440	NC_010816	CA	3	6	2115201	2115206	50 %	0 %	0 %	50 %	189440631
41441	NC_010816	CGG	2	6	2115217	2115222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440631
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41444	NC_010816	CCT	2	6	2115364	2115369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440631
41445	NC_010816	CTC	2	6	2115395	2115400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440631
41446	NC_010816	GCC	2	6	2115428	2115433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440631
41447	NC_010816	CGC	2	6	2115443	2115448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440631
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41449	NC_010816	AAATC	2	10	2115535	2115544	60 %	20 %	0 %	20 %	189440631
41450	NC_010816	GCG	2	6	2115610	2115615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440631
41451	NC_010816	CCG	2	6	2115687	2115692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440631
41452	NC_010816	CGC	2	6	2115700	2115705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440631
41453	NC_010816	GCACAT	2	12	2115709	2115720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189440631
41454	NC_010816	ACC	2	6	2115729	2115734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440631
41455	NC_010816	ATC	2	6	2115753	2115758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440631
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41457	NC_010816	CGA	2	6	2115790	2115795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440631
41458	NC_010816	CCG	2	6	2115986	2115991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440632
41459	NC_010816	CGC	2	6	2116134	2116139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440632
41460	NC_010816	CAG	2	6	2116180	2116185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41461	NC_010816	CG	3	6	2116208	2116213	0 %	0 %	50 %	50 %	189440632
41462	NC_010816	ACC	2	6	2116226	2116231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440632
41463	NC_010816	TCC	2	6	2116253	2116258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440632
41464	NC_010816	CGG	2	6	2116263	2116268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440632
41465	NC_010816	GGT	2	6	2116372	2116377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440632
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41469	NC_010816	CTC	2	6	2116456	2116461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440632
41470	NC_010816	GCA	2	6	2116500	2116505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41471	NC_010816	CCA	2	6	2116530	2116535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440632
41472	NC_010816	CGA	2	6	2116542	2116547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41473	NC_010816	TCA	2	6	2116548	2116553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440632
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41475	NC_010816	GAG	2	6	2116578	2116583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440632
41476	NC_010816	CCCA	2	8	2116590	2116597	25 %	0 %	0 %	75 %	189440632
41477	NC_010816	CCCAT	2	10	2116626	2116635	20 %	20 %	0 %	60 %	189440632
41478	NC_010816	GCC	2	6	2116651	2116656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440632
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41480	NC_010816	GCC	2	6	2116714	2116719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440632
41481	NC_010816	CAG	2	6	2116729	2116734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41482	NC_010816	ACG	2	6	2116814	2116819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41483	NC_010816	TCG	2	6	2116877	2116882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41484	NC_010816	GCG	2	6	2116917	2116922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440632
41485	NC_010816	AGCCGC	2	12	2116945	2116956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189440632
41486	NC_010816	GGCA	2	8	2116969	2116976	25 %	0 %	50 %	25 %	189440632
41487	NC_010816	GAT	2	6	2117002	2117007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440632
41488	NC_010816	GC	3	6	2117140	2117145	0 %	0 %	50 %	50 %	189440632
41489	NC_010816	GCA	2	6	2117148	2117153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440632
41490	NC_010816	CGG	2	6	2118067	2118072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440633
41491	NC_010816	TGG	2	6	2118220	2118225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440633
41492	NC_010816	TCA	2	6	2118226	2118231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440633
41493	NC_010816	GGT	2	6	2118258	2118263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440633
41494	NC_010816	GC	3	6	2118295	2118300	0 %	0 %	50 %	50 %	189440633
41495	NC_010816	TAC	2	6	2118336	2118341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440633
41496	NC_010816	TGT	2	6	2118371	2118376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440633
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41500	NC_010816	CGGT	2	8	2118616	2118623	0 %	25 %	50 %	25 %	189440633

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