MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_010816	GTC	2	6	2044330	2044335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40003	NC_010816	TCG	2	6	2044351	2044356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40004	NC_010816	CTG	2	6	2044366	2044371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40005	NC_010816	CAT	2	6	2044449	2044454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440561
40006	NC_010816	TGC	2	6	2044481	2044486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40007	NC_010816	CGT	2	6	2044541	2044546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40008	NC_010816	TTGC	2	8	2044597	2044604	0 %	50 %	25 %	25 %	189440561
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40011	NC_010816	TCTG	2	8	2044775	2044782	0 %	50 %	25 %	25 %	189440561
40012	NC_010816	CT	3	6	2044849	2044854	0 %	50 %	0 %	50 %	189440561
40013	NC_010816	ACC	2	6	2044880	2044885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440561
40014	NC_010816	TGC	2	6	2044896	2044901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40015	NC_010816	CGG	3	9	2044980	2044988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440561
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40017	NC_010816	CTG	2	6	2045029	2045034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40018	NC_010816	TCG	2	6	2045036	2045041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
40019	NC_010816	TGG	2	6	2045110	2045115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440561
40020	NC_010816	GCT	2	6	2045117	2045122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440561
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40116	NC_010816	TCA	2	6	2050492	2050497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40117	NC_010816	GCT	2	6	2050647	2050652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440566
40118	NC_010816	CCA	2	6	2050675	2050680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440566
40119	NC_010816	GCC	2	6	2050686	2050691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440566
40120	NC_010816	CGA	3	9	2050709	2050717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440566
40121	NC_010816	GCTC	2	8	2050736	2050743	0 %	25 %	25 %	50 %	189440566
40122	NC_010816	ACA	2	6	2050768	2050773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440566
40123	NC_010816	CCG	2	6	2050828	2050833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440566
40124	NC_010816	CAA	2	6	2050844	2050849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440566
40125	NC_010816	CGTG	2	8	2050859	2050866	0 %	25 %	50 %	25 %	189440566
40126	NC_010816	CAT	2	6	2050895	2050900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40127	NC_010816	TCC	2	6	2050914	2050919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440566
40128	NC_010816	CGG	2	6	2050922	2050927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440566
40129	NC_010816	CGG	2	6	2050985	2050990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440566
40130	NC_010816	GGA	2	6	2051050	2051055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440566
40131	NC_010816	ACA	3	9	2051056	2051064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440566
40132	NC_010816	AGC	2	6	2051176	2051181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440566
40133	NC_010816	ATC	2	6	2051199	2051204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40134	NC_010816	GC	3	6	2051213	2051218	0 %	0 %	50 %	50 %	189440566
40135	NC_010816	CAT	2	6	2051243	2051248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40136	NC_010816	GAT	2	6	2051300	2051305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440566
40137	NC_010816	GAG	2	6	2051310	2051315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440566
40138	NC_010816	ATC	2	6	2051331	2051336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40139	NC_010816	GGC	3	9	2051343	2051351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440566
40140	NC_010816	GATG	2	8	2051357	2051364	25 %	25 %	50 %	0 %	189440566
40141	NC_010816	GCT	2	6	2051381	2051386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440566
40142	NC_010816	TTC	2	6	2051430	2051435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440566
40143	NC_010816	GC	3	6	2051447	2051452	0 %	0 %	50 %	50 %	189440566
40144	NC_010816	CGC	2	6	2051464	2051469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440566
40145	NC_010816	AAG	2	6	2051475	2051480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440566
40146	NC_010816	CCT	2	6	2051503	2051508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440566
40147	NC_010816	CCGT	2	8	2051598	2051605	0 %	25 %	25 %	50 %	189440566
40148	NC_010816	CGC	2	6	2051834	2051839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440566
40149	NC_010816	GGCAT	2	10	2051850	2051859	20 %	20 %	40 %	20 %	189440566
40150	NC_010816	CTG	2	6	2051949	2051954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440566
40151	NC_010816	GAG	2	6	2051988	2051993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440566
40152	NC_010816	ACA	2	6	2052013	2052018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440566
40153	NC_010816	ACA	2	6	2052133	2052138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440566
40154	NC_010816	ACT	2	6	2052184	2052189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
40155	NC_010816	GC	3	6	2052218	2052223	0 %	0 %	50 %	50 %	189440566
40156	NC_010816	TAC	2	6	2052300	2052305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440566
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40158	NC_010816	CGC	2	6	2052569	2052574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440567
40159	NC_010816	CAC	2	6	2052626	2052631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440567
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40161	NC_010816	GCAAC	2	10	2052664	2052673	40 %	0 %	20 %	40 %	189440567
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40163	NC_010816	ACGGC	2	10	2052727	2052736	20 %	0 %	40 %	40 %	189440567
40164	NC_010816	AGC	2	6	2052741	2052746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440567
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40169	NC_010816	TGC	2	6	2052995	2053000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440567
40170	NC_010816	TGC	2	6	2053033	2053038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440567
40171	NC_010816	ACG	2	6	2053042	2053047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440567
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40173	NC_010816	TCCT	2	8	2053110	2053117	0 %	50 %	0 %	50 %	189440567
40174	NC_010816	TA	4	8	2053154	2053161	50 %	50 %	0 %	0 %	189440567
40175	NC_010816	CGATGA	2	12	2053210	2053221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189440567
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40178	NC_010816	CCG	2	6	2053356	2053361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440567
40179	NC_010816	AGCC	2	8	2053369	2053376	25 %	0 %	25 %	50 %	189440567
40180	NC_010816	GCA	2	6	2053384	2053389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440567
40181	NC_010816	GGTT	2	8	2053410	2053417	0 %	50 %	50 %	0 %	189440567
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40183	NC_010816	AAGA	2	8	2053494	2053501	75 %	0 %	25 %	0 %	189440567
40184	NC_010816	CG	3	6	2053581	2053586	0 %	0 %	50 %	50 %	189440567
40185	NC_010816	GAA	2	6	2053892	2053897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440568
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40189	NC_010816	GAA	2	6	2053961	2053966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440568
40190	NC_010816	TCT	2	6	2053969	2053974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440568
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40193	NC_010816	CTG	2	6	2054170	2054175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440569
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40201	NC_010816	TCG	2	6	2054396	2054401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440569
40202	NC_010816	CGA	2	6	2054412	2054417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440569
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40207	NC_010816	CGT	2	6	2054688	2054693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440569
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40214	NC_010816	CCA	2	6	2054969	2054974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440570
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40217	NC_010816	CGG	2	6	2055075	2055080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440570
40218	NC_010816	ACT	2	6	2055107	2055112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440570
40219	NC_010816	AAG	2	6	2055127	2055132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440570
40220	NC_010816	GTG	2	6	2055193	2055198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440570
40221	NC_010816	CCA	2	6	2055221	2055226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440570
40222	NC_010816	CGC	2	6	2055237	2055242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440570
40223	NC_010816	CAC	2	6	2055270	2055275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440570
40224	NC_010816	ACA	2	6	2055293	2055298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440570
40225	NC_010816	TCG	2	6	2055347	2055352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440570
40226	NC_010816	ACG	2	6	2055368	2055373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440570
40227	NC_010816	AGG	2	6	2055446	2055451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440570
40228	NC_010816	ACG	2	6	2055487	2055492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440571
40229	NC_010816	CGT	2	6	2055506	2055511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440571
40230	NC_010816	CGC	2	6	2055527	2055532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440571
40231	NC_010816	GTG	2	6	2055558	2055563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440571
40232	NC_010816	TCAAGG	2	12	2055613	2055624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189440571
40233	NC_010816	AAG	2	6	2055657	2055662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440571
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40235	NC_010816	CGA	2	6	2055817	2055822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440572
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40346	NC_010816	AAG	2	6	2059815	2059820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440580
40347	NC_010816	TAC	2	6	2059846	2059851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440581
40348	NC_010816	GTC	3	9	2059967	2059975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440581
40349	NC_010816	AAG	2	6	2060078	2060083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440581
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40351	NC_010816	CTG	2	6	2060174	2060179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440581
40352	NC_010816	CCA	2	6	2060224	2060229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440581
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40354	NC_010816	TCGA	2	8	2060300	2060307	25 %	25 %	25 %	25 %	189440581
40355	NC_010816	CCA	2	6	2060343	2060348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440581
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40358	NC_010816	GGC	2	6	2060438	2060443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440582
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40364	NC_010816	CTG	2	6	2061020	2061025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440583
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40370	NC_010816	CAT	2	6	2061315	2061320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440584
40371	NC_010816	TCG	2	6	2061371	2061376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440584
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40374	NC_010816	GCC	2	6	2061538	2061543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440584
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40461	NC_010816	CCA	2	6	2064746	2064751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440589
40462	NC_010816	TGA	2	6	2064770	2064775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440589
40463	NC_010816	CTG	2	6	2064805	2064810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440589
40464	NC_010816	CAC	2	6	2064879	2064884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440589
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40472	NC_010816	GTG	2	6	2065496	2065501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440590
40473	NC_010816	GCC	2	6	2065511	2065516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440590
40474	NC_010816	TGC	2	6	2065524	2065529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440590
40475	NC_010816	GAA	2	6	2065540	2065545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440590
40476	NC_010816	GC	3	6	2065546	2065551	0 %	0 %	50 %	50 %	189440590
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40478	NC_010816	CCGCT	2	10	2065623	2065632	0 %	20 %	20 %	60 %	189440590
40479	NC_010816	TCG	2	6	2065662	2065667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440590
40480	NC_010816	CGA	2	6	2065690	2065695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440590
40481	NC_010816	ATC	2	6	2065709	2065714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440590
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40483	NC_010816	TCGTG	2	10	2066058	2066067	0 %	40 %	40 %	20 %	189440591
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40485	NC_010816	AGC	2	6	2066245	2066250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440592
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40487	NC_010816	CGT	2	6	2066620	2066625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440593
40488	NC_010816	TCG	2	6	2066643	2066648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440593
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40491	NC_010816	AGT	2	6	2066783	2066788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440593
40492	NC_010816	AAGC	2	8	2066887	2066894	50 %	0 %	25 %	25 %	189440594
40493	NC_010816	CGT	2	6	2066908	2066913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440594
40494	NC_010816	TCCG	2	8	2066991	2066998	0 %	25 %	25 %	50 %	189440594
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