MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010816	GGC	2	6	191393	191398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439013
3502	NC_010816	GTG	2	6	191416	191421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439013
3503	NC_010816	CAG	2	6	191484	191489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439013
3504	NC_010816	CTG	2	6	191525	191530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439013
3505	NC_010816	CGCA	2	8	191575	191582	25 %	0 %	25 %	50 %	189439013
3506	NC_010816	TGC	2	6	191625	191630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439013
3507	NC_010816	CAT	2	6	191653	191658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439014
3508	NC_010816	GCA	2	6	191817	191822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439014
3509	NC_010816	GCGT	2	8	191937	191944	0 %	25 %	50 %	25 %	189439014
3510	NC_010816	TGAG	2	8	192053	192060	25 %	25 %	50 %	0 %	189439015
3511	NC_010816	CAT	2	6	192063	192068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439015
3512	NC_010816	TGC	2	6	192132	192137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3513	NC_010816	GAG	2	6	192223	192228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439015
3514	NC_010816	GC	3	6	192312	192317	0 %	0 %	50 %	50 %	189439015
3515	NC_010816	GCGCC	2	10	192336	192345	0 %	0 %	40 %	60 %	189439015
3516	NC_010816	GCC	2	6	192355	192360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3517	NC_010816	CGG	2	6	192456	192461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439015
3518	NC_010816	TCA	2	6	192485	192490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439015
3519	NC_010816	GCC	2	6	192511	192516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3520	NC_010816	CGCC	2	8	192545	192552	0 %	0 %	25 %	75 %	189439015
3521	NC_010816	CGG	2	6	192633	192638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439015
3522	NC_010816	CAT	2	6	192819	192824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439015
3523	NC_010816	CGA	2	6	192828	192833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3524	NC_010816	CTG	2	6	192850	192855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3525	NC_010816	GCC	2	6	192856	192861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3526	NC_010816	CGC	2	6	193074	193079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3527	NC_010816	GTC	2	6	193117	193122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3528	NC_010816	TGC	2	6	193208	193213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3529	NC_010816	CGG	2	6	193218	193223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439015
3530	NC_010816	CCGC	2	8	193226	193233	0 %	0 %	25 %	75 %	189439015
3531	NC_010816	CGC	2	6	193236	193241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3532	NC_010816	ACG	2	6	193289	193294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439015
3533	NC_010816	CGC	2	6	193314	193319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439015
3534	NC_010816	GCCC	2	8	193353	193360	0 %	0 %	25 %	75 %	189439015
3535	NC_010816	GTGC	2	8	193368	193375	0 %	25 %	50 %	25 %	189439015
3536	NC_010816	GAAG	2	8	193428	193435	50 %	0 %	50 %	0 %	189439015
3537	NC_010816	GAG	2	6	193494	193499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439016
3538	NC_010816	CCGGCC	2	12	193563	193574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3539	NC_010816	TGGACG	2	12	193702	193713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189439016
3540	NC_010816	CCGCA	2	10	193781	193790	20 %	0 %	20 %	60 %	189439016
3541	NC_010816	CCGAC	2	10	193798	193807	20 %	0 %	20 %	60 %	189439016
3542	NC_010816	TGC	2	6	193936	193941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439016
3543	NC_010816	AAC	2	6	193953	193958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439016
3544	NC_010816	GGA	2	6	193982	193987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439016
3545	NC_010816	CGC	2	6	194003	194008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3546	NC_010816	CGA	2	6	194066	194071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439016
3547	NC_010816	ACC	2	6	194128	194133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439016
3548	NC_010816	GCCTTC	2	12	194166	194177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189439016
3549	NC_010816	CAT	2	6	194216	194221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439016
3550	NC_010816	TGCG	2	8	194226	194233	0 %	25 %	50 %	25 %	189439016
3551	NC_010816	CGTA	2	8	194237	194244	25 %	25 %	25 %	25 %	189439016
3552	NC_010816	ACC	2	6	194251	194256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439016
3553	NC_010816	CCG	2	6	194260	194265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3554	NC_010816	GCC	2	6	194274	194279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3555	NC_010816	GCC	2	6	194286	194291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3556	NC_010816	AC	3	6	194297	194302	50 %	0 %	0 %	50 %	189439016
3557	NC_010816	CGA	2	6	194303	194308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439016
3558	NC_010816	CCG	2	6	194353	194358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439016
3559	NC_010816	CTG	2	6	194424	194429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439016
3560	NC_010816	CGG	2	6	194432	194437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439016
3561	NC_010816	CGA	2	6	194465	194470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439016
3562	NC_010816	GCG	2	6	194482	194487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439016
3563	NC_010816	CGGAC	2	10	194504	194513	20 %	0 %	40 %	40 %	189439016
3564	NC_010816	CGA	2	6	194540	194545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439016
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3569	NC_010816	ATG	2	6	194809	194814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439017
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3575	NC_010816	CGG	2	6	195081	195086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439017
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3577	NC_010816	GCCG	2	8	195169	195176	0 %	0 %	50 %	50 %	189439017
3578	NC_010816	CAC	2	6	195184	195189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439017
3579	NC_010816	TGCGC	2	10	195222	195231	0 %	20 %	40 %	40 %	189439017
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3581	NC_010816	CGA	2	6	195332	195337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439018
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3585	NC_010816	CTCG	2	8	195572	195579	0 %	25 %	25 %	50 %	189439018
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3591	NC_010816	CGC	2	6	195883	195888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439018
3592	NC_010816	CGC	2	6	195907	195912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439018
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3594	NC_010816	GTG	2	6	195978	195983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439018
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3602	NC_010816	CTG	2	6	196438	196443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439019
3603	NC_010816	GTG	2	6	196453	196458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439019
3604	NC_010816	ATGGG	2	10	196465	196474	20 %	20 %	60 %	0 %	189439019
3605	NC_010816	GCC	2	6	196486	196491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439019
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3983	NC_010816	ACG	2	6	215085	215090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439034
3984	NC_010816	CGG	3	9	215096	215104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439034
3985	NC_010816	TCG	2	6	215152	215157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439034
3986	NC_010816	AGC	2	6	215158	215163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439034
3987	NC_010816	GGGC	2	8	215197	215204	0 %	0 %	75 %	25 %	189439034
3988	NC_010816	CCAG	2	8	215236	215243	25 %	0 %	25 %	50 %	189439034
3989	NC_010816	CAGC	2	8	215304	215311	25 %	0 %	25 %	50 %	189439034
3990	NC_010816	AGC	2	6	215350	215355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439034
3991	NC_010816	CG	3	6	215361	215366	0 %	0 %	50 %	50 %	189439034
3992	NC_010816	CGCCTG	2	12	215493	215504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189439034
3993	NC_010816	AGC	2	6	215562	215567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439034
3994	NC_010816	ACGC	2	8	215574	215581	25 %	0 %	25 %	50 %	189439034
3995	NC_010816	GCG	2	6	215584	215589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439034
3996	NC_010816	CCG	2	6	215657	215662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439034
3997	NC_010816	AGG	2	6	215723	215728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439034
3998	NC_010816	CAA	2	6	215771	215776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439034
3999	NC_010816	CAG	2	6	215817	215822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439034
4000	NC_010816	GGC	2	6	215826	215831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439034

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