MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_010816	GCA	2	6	1856786	1856791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440421
36502	NC_010816	CCA	2	6	1856821	1856826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440421
36503	NC_010816	GCG	2	6	1856842	1856847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36504	NC_010816	CAGC	2	8	1856854	1856861	25 %	0 %	25 %	50 %	189440421
36505	NC_010816	GAA	2	6	1856981	1856986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440421
36506	NC_010816	CTAAGG	2	12	1856995	1857006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189440421
36507	NC_010816	GGC	2	6	1857033	1857038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36508	NC_010816	CGG	2	6	1857056	1857061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36509	NC_010816	TGT	2	6	1857064	1857069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440421
36510	NC_010816	GTG	2	6	1857075	1857080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440421
36511	NC_010816	CAG	2	6	1857186	1857191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440421
36512	NC_010816	CAG	2	6	1857239	1857244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440421
36513	NC_010816	CA	3	6	1857251	1857256	50 %	0 %	0 %	50 %	189440421
36514	NC_010816	GGT	2	6	1857281	1857286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440421
36515	NC_010816	CGG	2	6	1857340	1857345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36516	NC_010816	CGG	2	6	1857389	1857394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36517	NC_010816	CGG	2	6	1857401	1857406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440421
36518	NC_010816	ACG	2	6	1857412	1857417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440421
36519	NC_010816	TCC	2	6	1857432	1857437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440421
36520	NC_010816	CGGC	2	8	1857445	1857452	0 %	0 %	50 %	50 %	189440421
36521	NC_010816	TGA	2	6	1857525	1857530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440421
36522	NC_010816	CG	3	6	1857567	1857572	0 %	0 %	50 %	50 %	189440422
36523	NC_010816	CTG	2	6	1857587	1857592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36524	NC_010816	GTG	2	6	1857596	1857601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440422
36525	NC_010816	CAA	2	6	1857634	1857639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440422
36526	NC_010816	CCGG	2	8	1857772	1857779	0 %	0 %	50 %	50 %	189440422
36527	NC_010816	GCTCTG	2	12	1857810	1857821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36528	NC_010816	GGC	2	6	1857833	1857838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440422
36529	NC_010816	CG	3	6	1857877	1857882	0 %	0 %	50 %	50 %	189440422
36530	NC_010816	CTA	3	9	1857883	1857891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440422
36531	NC_010816	CTG	2	6	1857923	1857928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36532	NC_010816	GATC	2	8	1857964	1857971	25 %	25 %	25 %	25 %	189440422
36533	NC_010816	GGC	2	6	1857983	1857988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440422
36534	NC_010816	GTT	2	6	1858003	1858008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440422
36535	NC_010816	GAT	2	6	1858096	1858101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440422
36536	NC_010816	GCC	3	9	1858145	1858153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440422
36537	NC_010816	AT	3	6	1858170	1858175	50 %	50 %	0 %	0 %	189440422
36538	NC_010816	CTG	2	6	1858229	1858234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36539	NC_010816	CTA	2	6	1858237	1858242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440422
36540	NC_010816	CCG	2	6	1858271	1858276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440422
36541	NC_010816	CG	3	6	1858279	1858284	0 %	0 %	50 %	50 %	189440422
36542	NC_010816	CGGCG	2	10	1858289	1858298	0 %	0 %	60 %	40 %	189440422
36543	NC_010816	CCTGG	2	10	1858321	1858330	0 %	20 %	40 %	40 %	189440422
36544	NC_010816	CGCCA	2	10	1858336	1858345	20 %	0 %	20 %	60 %	189440422
36545	NC_010816	CAG	2	6	1858361	1858366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36546	NC_010816	CACGGT	2	12	1858381	1858392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36547	NC_010816	TGG	2	6	1858404	1858409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440422
36548	NC_010816	TTC	2	6	1858427	1858432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440422
36549	NC_010816	ACG	2	6	1858437	1858442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36550	NC_010816	CTGG	3	12	1858480	1858491	0 %	25 %	50 %	25 %	189440422
36551	NC_010816	ATTT	2	8	1858505	1858512	25 %	75 %	0 %	0 %	189440422
36552	NC_010816	CGC	2	6	1858521	1858526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440422
36553	NC_010816	CGA	2	6	1858563	1858568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36554	NC_010816	GGC	2	6	1858621	1858626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440422
36555	NC_010816	GTG	2	6	1858655	1858660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440422
36556	NC_010816	CTG	2	6	1858679	1858684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440422
36557	NC_010816	CAG	3	9	1858746	1858754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440423
36558	NC_010816	GC	3	6	1858790	1858795	0 %	0 %	50 %	50 %	189440423
36559	NC_010816	GC	3	6	1858831	1858836	0 %	0 %	50 %	50 %	189440423
36560	NC_010816	CAG	2	6	1858857	1858862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440423
36561	NC_010816	GTCGA	2	10	1858978	1858987	20 %	20 %	40 %	20 %	189440423
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36567	NC_010816	TTC	2	6	1859710	1859715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440425
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36574	NC_010816	GCA	2	6	1860957	1860962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440427
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36576	NC_010816	GAC	2	6	1861008	1861013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440427
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36585	NC_010816	GCA	2	6	1861623	1861628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440427
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36589	NC_010816	TCA	2	6	1861792	1861797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440427
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36595	NC_010816	AC	3	6	1862190	1862195	50 %	0 %	0 %	50 %	189440427
36596	NC_010816	ATG	2	6	1862227	1862232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440427
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36599	NC_010816	CAA	2	6	1862440	1862445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440427
36600	NC_010816	GCA	2	6	1862535	1862540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440427
36601	NC_010816	GGC	2	6	1862772	1862777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440427
36602	NC_010816	CTT	2	6	1862930	1862935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440427
36603	NC_010816	TTG	2	6	1864029	1864034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440428
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36605	NC_010816	AGA	2	6	1864119	1864124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440428
36606	NC_010816	CGA	2	6	1864225	1864230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440428
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36610	NC_010816	GTT	3	9	1864397	1864405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440428
36611	NC_010816	CG	3	6	1864444	1864449	0 %	0 %	50 %	50 %	189440428
36612	NC_010816	CG	3	6	1864487	1864492	0 %	0 %	50 %	50 %	189440428
36613	NC_010816	ATG	2	6	1864503	1864508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440428
36614	NC_010816	GC	3	6	1864519	1864524	0 %	0 %	50 %	50 %	189440428
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36616	NC_010816	GGCG	2	8	1864661	1864668	0 %	0 %	75 %	25 %	189440428
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36732	NC_010816	CAT	2	6	1871202	1871207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440433
36733	NC_010816	AGC	2	6	1871230	1871235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440433
36734	NC_010816	GCAG	2	8	1871243	1871250	25 %	0 %	50 %	25 %	189440433
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36736	NC_010816	TGC	2	6	1871502	1871507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440434
36737	NC_010816	TGA	2	6	1871529	1871534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440434
36738	NC_010816	GAT	2	6	1871551	1871556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440434
36739	NC_010816	ATC	2	6	1871626	1871631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440434
36740	NC_010816	AG	3	6	1871635	1871640	50 %	0 %	50 %	0 %	189440434
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36742	NC_010816	TCCGT	2	10	1871757	1871766	0 %	40 %	20 %	40 %	189440434
36743	NC_010816	TTC	2	6	1872057	1872062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440434
36744	NC_010816	GAT	2	6	1872100	1872105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440434
36745	NC_010816	TTCT	2	8	1872129	1872136	0 %	75 %	0 %	25 %	189440434
36746	NC_010816	CAGC	2	8	1872175	1872182	25 %	0 %	25 %	50 %	189440434
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36758	NC_010816	AT	4	8	1873053	1873060	50 %	50 %	0 %	0 %	189440434
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36762	NC_010816	TCACG	2	10	1873283	1873292	20 %	20 %	20 %	40 %	189440434
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36840	NC_010816	CTG	2	6	1877228	1877233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440438
36841	NC_010816	TTCT	2	8	1877243	1877250	0 %	75 %	0 %	25 %	189440438
36842	NC_010816	CGC	2	6	1877305	1877310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440438
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36948	NC_010816	CAT	3	9	1883909	1883917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440442
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36951	NC_010816	AGTC	2	8	1884027	1884034	25 %	25 %	25 %	25 %	189440442
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36954	NC_010816	CGATT	2	10	1884155	1884164	20 %	40 %	20 %	20 %	189440442
36955	NC_010816	TCG	2	6	1884172	1884177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440442
36956	NC_010816	CGA	2	6	1884290	1884295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440442
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36958	NC_010816	CAT	2	6	1884409	1884414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440442
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36960	NC_010816	CGC	2	6	1884613	1884618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440443
36961	NC_010816	ACGG	2	8	1884645	1884652	25 %	0 %	50 %	25 %	189440443
36962	NC_010816	CGACGG	2	12	1884731	1884742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189440443
36963	NC_010816	GGCC	2	8	1884827	1884834	0 %	0 %	50 %	50 %	189440443
36964	NC_010816	CGA	2	6	1884905	1884910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36965	NC_010816	GTG	2	6	1884966	1884971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440443
36966	NC_010816	ACG	2	6	1885042	1885047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36967	NC_010816	CG	3	6	1885087	1885092	0 %	0 %	50 %	50 %	189440443
36968	NC_010816	GAC	2	6	1885143	1885148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36969	NC_010816	CAC	2	6	1885214	1885219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440443
36970	NC_010816	TCG	2	6	1885263	1885268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36971	NC_010816	GCT	2	6	1885277	1885282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36972	NC_010816	TCA	2	6	1885294	1885299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440443
36973	NC_010816	CGA	2	6	1885340	1885345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440443
36974	NC_010816	GTGC	2	8	1885493	1885500	0 %	25 %	50 %	25 %	189440444
36975	NC_010816	TCA	2	6	1885508	1885513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440444
36976	NC_010816	CCA	2	6	1885514	1885519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440444
36977	NC_010816	TGA	2	6	1885523	1885528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440444
36978	NC_010816	GAT	2	6	1885632	1885637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440444
36979	NC_010816	GCCG	2	8	1885661	1885668	0 %	0 %	50 %	50 %	189440445
36980	NC_010816	AGCC	2	8	1885766	1885773	25 %	0 %	25 %	50 %	189440445
36981	NC_010816	CGGT	2	8	1885926	1885933	0 %	25 %	50 %	25 %	189440445
36982	NC_010816	GC	3	6	1885957	1885962	0 %	0 %	50 %	50 %	189440445
36983	NC_010816	CACGCC	2	12	1886030	1886041	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	189440445
36984	NC_010816	GCG	2	6	1886050	1886055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440445
36985	NC_010816	GCGCG	2	10	1886062	1886071	0 %	0 %	60 %	40 %	189440445
36986	NC_010816	CTC	2	6	1886072	1886077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440445
36987	NC_010816	GCA	2	6	1886104	1886109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440445
36988	NC_010816	CAA	2	6	1886140	1886145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440445
36989	NC_010816	CG	3	6	1886237	1886242	0 %	0 %	50 %	50 %	189440445
36990	NC_010816	CAA	2	6	1886288	1886293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440445
36991	NC_010816	CGAG	2	8	1886328	1886335	25 %	0 %	50 %	25 %	189440445
36992	NC_010816	GGC	2	6	1886339	1886344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440445
36993	NC_010816	GCC	2	6	1886397	1886402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440445
36994	NC_010816	GAT	3	9	1886427	1886435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440445
36995	NC_010816	TGC	2	6	1886505	1886510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440445
36996	NC_010816	GCAGA	2	10	1886773	1886782	40 %	0 %	40 %	20 %	189440446
36997	NC_010816	GC	3	6	1886833	1886838	0 %	0 %	50 %	50 %	189440446
36998	NC_010816	CG	3	6	1886893	1886898	0 %	0 %	50 %	50 %	189440446
36999	NC_010816	CGA	2	6	1886916	1886921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440446
37000	NC_010816	GC	3	6	1886957	1886962	0 %	0 %	50 %	50 %	189440446

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