MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_010816	TAC	2	6	1748034	1748039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440357
34503	NC_010816	AGC	2	6	1748059	1748064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34504	NC_010816	GCCA	2	8	1748321	1748328	25 %	0 %	25 %	50 %	189440357
34505	NC_010816	CAC	2	6	1748360	1748365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440357
34506	NC_010816	TGA	2	6	1748390	1748395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440357
34507	NC_010816	GCC	2	6	1748430	1748435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440357
34508	NC_010816	GAA	2	6	1748445	1748450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440357
34509	NC_010816	CAC	2	6	1748456	1748461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440357
34510	NC_010816	CCG	2	6	1748610	1748615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440357
34511	NC_010816	CGC	2	6	1748630	1748635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440357
34512	NC_010816	TCG	2	6	1748636	1748641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34513	NC_010816	GCA	2	6	1748649	1748654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34514	NC_010816	GGA	2	6	1748720	1748725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440357
34515	NC_010816	TTTGA	2	10	1748727	1748736	20 %	60 %	20 %	0 %	189440357
34516	NC_010816	ATT	2	6	1748779	1748784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440357
34517	NC_010816	TGC	2	6	1748951	1748956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34518	NC_010816	GTGG	2	8	1748975	1748982	0 %	25 %	75 %	0 %	189440357
34519	NC_010816	GCT	2	6	1749038	1749043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34520	NC_010816	TCC	2	6	1749179	1749184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440357
34521	NC_010816	GCT	2	6	1749186	1749191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440357
34522	NC_010816	CGC	2	6	1749483	1749488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440358
34523	NC_010816	AAC	2	6	1749500	1749505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440358
34524	NC_010816	CCA	2	6	1749519	1749524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440358
34525	NC_010816	GTG	2	6	1749606	1749611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440358
34526	NC_010816	ACGC	2	8	1749654	1749661	25 %	0 %	25 %	50 %	189440358
34527	NC_010816	CGC	2	6	1749673	1749678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440358
34528	NC_010816	AAC	2	6	1749679	1749684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440358
34529	NC_010816	TGA	2	6	1749774	1749779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440358
34530	NC_010816	AT	3	6	1749846	1749851	50 %	50 %	0 %	0 %	189440358
34531	NC_010816	CA	3	6	1749891	1749896	50 %	0 %	0 %	50 %	189440358
34532	NC_010816	GCA	2	6	1749901	1749906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34533	NC_010816	CAA	2	6	1750020	1750025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440358
34534	NC_010816	GGA	2	6	1750029	1750034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440358
34535	NC_010816	CCAAG	2	10	1750038	1750047	40 %	0 %	20 %	40 %	189440358
34536	NC_010816	GCT	2	6	1750173	1750178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34537	NC_010816	ACC	2	6	1750288	1750293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440358
34538	NC_010816	AAC	2	6	1750331	1750336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440358
34539	NC_010816	TGA	2	6	1750482	1750487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440358
34540	NC_010816	ACG	2	6	1750497	1750502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34541	NC_010816	CGG	2	6	1750506	1750511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440358
34542	NC_010816	GCATGG	2	12	1750526	1750537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189440358
34543	NC_010816	GGA	2	6	1750542	1750547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440358
34544	NC_010816	GTA	2	6	1750580	1750585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440358
34545	NC_010816	CGA	2	6	1750587	1750592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34546	NC_010816	CTG	2	6	1750654	1750659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34547	NC_010816	GCG	2	6	1750745	1750750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440358
34548	NC_010816	TGA	2	6	1750839	1750844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440358
34549	NC_010816	TCG	2	6	1750946	1750951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34550	NC_010816	ATT	2	6	1750978	1750983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440358
34551	NC_010816	CAT	2	6	1751007	1751012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440358
34552	NC_010816	CGA	2	6	1751027	1751032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440358
34553	NC_010816	ATG	2	6	1751230	1751235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440359
34554	NC_010816	ACT	2	6	1751236	1751241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440359
34555	NC_010816	AAT	2	6	1751253	1751258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189440359
34556	NC_010816	GTG	2	6	1751298	1751303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440359
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34558	NC_010816	GAC	2	6	1751461	1751466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440359
34559	NC_010816	CGA	2	6	1751520	1751525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440359
34560	NC_010816	GCT	2	6	1751535	1751540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440359
34561	NC_010816	TTG	2	6	1751582	1751587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189440359
34562	NC_010816	GAC	2	6	1751638	1751643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440359
34563	NC_010816	TGG	2	6	1751662	1751667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440359
34564	NC_010816	CAC	2	6	1751685	1751690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440359
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34568	NC_010816	TGG	2	6	1751863	1751868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440359
34569	NC_010816	TCA	2	6	1751903	1751908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440359
34570	NC_010816	GAG	2	6	1751989	1751994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440359
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34574	NC_010816	CGA	2	6	1752354	1752359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440359
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34581	NC_010816	CG	3	6	1752600	1752605	0 %	0 %	50 %	50 %	189440359
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34588	NC_010816	CCG	2	6	1752935	1752940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440359
34589	NC_010816	GCCGA	2	10	1752949	1752958	20 %	0 %	40 %	40 %	189440359
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34597	NC_010816	AAGG	2	8	1753742	1753749	50 %	0 %	50 %	0 %	189440360
34598	NC_010816	GCC	2	6	1753762	1753767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440360
34599	NC_010816	CGA	2	6	1753771	1753776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440360
34600	NC_010816	GGT	3	9	1753862	1753870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440360
34601	NC_010816	GT	3	6	1753983	1753988	0 %	50 %	50 %	0 %	189440360
34602	NC_010816	CCG	2	6	1754013	1754018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440360
34603	NC_010816	GTCACC	2	12	1754087	1754098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189440360
34604	NC_010816	TGG	2	6	1754148	1754153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440360
34605	NC_010816	GGC	2	6	1754158	1754163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440360
34606	NC_010816	GCTG	2	8	1754176	1754183	0 %	25 %	50 %	25 %	189440360
34607	NC_010816	CGC	3	9	1754218	1754226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440360
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34609	NC_010816	CGG	2	6	1754260	1754265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440360
34610	NC_010816	CAT	2	6	1754326	1754331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440360
34611	NC_010816	AGC	2	6	1754397	1754402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440360
34612	NC_010816	GC	3	6	1754401	1754406	0 %	0 %	50 %	50 %	189440360
34613	NC_010816	TC	3	6	1754468	1754473	0 %	50 %	0 %	50 %	189440360
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34960	NC_010816	ACA	2	6	1778846	1778851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440373
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