MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_010816	TCGG	2	8	1720818	1720825	0 %	25 %	50 %	25 %	189440337
34003	NC_010816	CGA	2	6	1720826	1720831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440337
34004	NC_010816	GGC	2	6	1720848	1720853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440337
34005	NC_010816	CCG	2	6	1720909	1720914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440337
34006	NC_010816	CGA	2	6	1721051	1721056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440337
34007	NC_010816	GCC	2	6	1721103	1721108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440337
34008	NC_010816	TCG	2	6	1721203	1721208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440337
34009	NC_010816	GAT	2	6	1721450	1721455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440338
34010	NC_010816	AACG	2	8	1721488	1721495	50 %	0 %	25 %	25 %	189440338
34011	NC_010816	GC	3	6	1721518	1721523	0 %	0 %	50 %	50 %	189440338
34012	NC_010816	CGA	2	6	1721569	1721574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34013	NC_010816	GAA	2	6	1721621	1721626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440338
34014	NC_010816	CCCG	2	8	1721674	1721681	0 %	0 %	25 %	75 %	189440338
34015	NC_010816	GAA	2	6	1721692	1721697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440338
34016	NC_010816	CTG	2	6	1721732	1721737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34017	NC_010816	TAT	2	6	1721749	1721754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189440338
34018	NC_010816	GGC	2	6	1721807	1721812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440338
34019	NC_010816	TGC	2	6	1721817	1721822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34020	NC_010816	ATC	2	6	1721840	1721845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440338
34021	NC_010816	AAG	2	6	1721883	1721888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440338
34022	NC_010816	GGC	2	6	1721899	1721904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440338
34023	NC_010816	TGC	2	6	1721946	1721951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34024	NC_010816	CCG	2	6	1721979	1721984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
34025	NC_010816	CAT	2	6	1722001	1722006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440338
34026	NC_010816	AAG	2	6	1722113	1722118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440338
34027	NC_010816	AC	3	6	1722123	1722128	50 %	0 %	0 %	50 %	189440338
34028	NC_010816	GTG	2	6	1722353	1722358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440338
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34030	NC_010816	ACG	2	6	1722390	1722395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34031	NC_010816	TGAT	2	8	1722405	1722412	25 %	50 %	25 %	0 %	189440338
34032	NC_010816	GCTG	2	8	1722433	1722440	0 %	25 %	50 %	25 %	189440338
34033	NC_010816	GCC	2	6	1722443	1722448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
34034	NC_010816	GCC	2	6	1722464	1722469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
34035	NC_010816	GTG	2	6	1722479	1722484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440338
34036	NC_010816	CGG	2	6	1722697	1722702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440338
34037	NC_010816	GTC	2	6	1722746	1722751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34038	NC_010816	ACG	2	6	1722780	1722785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34039	NC_010816	GAG	2	6	1722797	1722802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189440338
34040	NC_010816	CGCA	2	8	1722856	1722863	25 %	0 %	25 %	50 %	189440338
34041	NC_010816	CG	3	6	1722897	1722902	0 %	0 %	50 %	50 %	189440338
34042	NC_010816	CAT	2	6	1722943	1722948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440338
34043	NC_010816	GC	3	6	1722996	1723001	0 %	0 %	50 %	50 %	189440338
34044	NC_010816	GTGG	2	8	1723037	1723044	0 %	25 %	75 %	0 %	189440338
34045	NC_010816	TC	3	6	1723102	1723107	0 %	50 %	0 %	50 %	189440338
34046	NC_010816	CCG	2	6	1723280	1723285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
34047	NC_010816	TGA	2	6	1723341	1723346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440338
34048	NC_010816	ACC	2	6	1723356	1723361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440338
34049	NC_010816	CCG	2	6	1723368	1723373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
34050	NC_010816	CAT	2	6	1723396	1723401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440338
34051	NC_010816	CG	4	8	1723495	1723502	0 %	0 %	50 %	50 %	189440338
34052	NC_010816	TCG	2	6	1723527	1723532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34053	NC_010816	GAT	2	6	1723666	1723671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440338
34054	NC_010816	GAC	2	6	1723679	1723684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34055	NC_010816	CCA	2	6	1723692	1723697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189440338
34056	NC_010816	GCC	2	6	1723703	1723708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440338
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34058	NC_010816	CTG	2	6	1723760	1723765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34059	NC_010816	GGTGT	2	10	1723802	1723811	0 %	40 %	60 %	0 %	189440338
34060	NC_010816	GCT	2	6	1723864	1723869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34061	NC_010816	CA	3	6	1723873	1723878	50 %	0 %	0 %	50 %	189440338
34062	NC_010816	CTG	2	6	1723895	1723900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34063	NC_010816	CGA	2	6	1723945	1723950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440338
34064	NC_010816	CAT	2	6	1724014	1724019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440338
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34066	NC_010816	CGG	2	6	1724077	1724082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440338
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34082	NC_010816	TCA	2	6	1724902	1724907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440339
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34089	NC_010816	GC	3	6	1725271	1725276	0 %	0 %	50 %	50 %	189440339
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34098	NC_010816	CAG	2	6	1725562	1725567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440339
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34100	NC_010816	TG	3	6	1725612	1725617	0 %	50 %	50 %	0 %	189440339
34101	NC_010816	GCA	2	6	1725621	1725626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440339
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34105	NC_010816	GAA	2	6	1726570	1726575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189440340
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34233	NC_010816	GAC	2	6	1733260	1733265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440345
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34263	NC_010816	CG	3	6	1734861	1734866	0 %	0 %	50 %	50 %	189440346
34264	NC_010816	GTCA	2	8	1734903	1734910	25 %	25 %	25 %	25 %	189440346
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34347	NC_010816	GTC	2	6	1739027	1739032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440349
34348	NC_010816	AGT	2	6	1739058	1739063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440349
34349	NC_010816	GTC	2	6	1739184	1739189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440350
34350	NC_010816	GC	3	6	1739223	1739228	0 %	0 %	50 %	50 %	189440350
34351	NC_010816	CG	3	6	1739246	1739251	0 %	0 %	50 %	50 %	189440350
34352	NC_010816	GTA	2	6	1739379	1739384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440350
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34450	NC_010816	ATC	2	6	1745961	1745966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440355
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34452	NC_010816	CAT	2	6	1745975	1745980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440355
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34454	NC_010816	GGTC	2	8	1746035	1746042	0 %	25 %	50 %	25 %	189440355
34455	NC_010816	CG	3	6	1746073	1746078	0 %	0 %	50 %	50 %	189440355
34456	NC_010816	CCTGGA	2	12	1746106	1746117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189440355
34457	NC_010816	GCT	2	6	1746146	1746151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440355
34458	NC_010816	GC	3	6	1746152	1746157	0 %	0 %	50 %	50 %	189440355
34459	NC_010816	TG	3	6	1746255	1746260	0 %	50 %	50 %	0 %	189440355
34460	NC_010816	TGCTCT	2	12	1746262	1746273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189440355
34461	NC_010816	CGG	2	6	1746281	1746286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440355
34462	NC_010816	GCA	2	6	1746309	1746314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440355
34463	NC_010816	TGG	2	6	1746333	1746338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440355
34464	NC_010816	TGACCA	2	12	1746394	1746405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189440355
34465	NC_010816	GTG	2	6	1746432	1746437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440355
34466	NC_010816	GGC	2	6	1746453	1746458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189440355
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34468	NC_010816	CAG	2	6	1746513	1746518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440355
34469	NC_010816	TTGGC	2	10	1746523	1746532	0 %	40 %	40 %	20 %	189440355
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34473	NC_010816	GCA	2	6	1746622	1746627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440356
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34475	NC_010816	GCT	3	9	1746817	1746825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440356
34476	NC_010816	GTG	2	6	1746863	1746868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440356
34477	NC_010816	TCT	2	6	1746870	1746875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189440356
34478	NC_010816	GCTC	2	8	1746876	1746883	0 %	25 %	25 %	50 %	189440356
34479	NC_010816	GCTCA	2	10	1746899	1746908	20 %	20 %	20 %	40 %	189440356
34480	NC_010816	TCG	2	6	1746945	1746950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189440356
34481	NC_010816	TAC	2	6	1746989	1746994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440356
34482	NC_010816	TG	3	6	1747075	1747080	0 %	50 %	50 %	0 %	189440356
34483	NC_010816	TGATC	2	10	1747111	1747120	20 %	40 %	20 %	20 %	189440356
34484	NC_010816	CATC	2	8	1747128	1747135	25 %	25 %	0 %	50 %	189440356
34485	NC_010816	CGTTC	2	10	1747158	1747167	0 %	40 %	20 %	40 %	189440356
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34489	NC_010816	GTG	2	6	1747331	1747336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440356
34490	NC_010816	TCA	2	6	1747359	1747364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189440356
34491	NC_010816	CGA	2	6	1747371	1747376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189440356
34492	NC_010816	TCC	2	6	1747392	1747397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189440356
34493	NC_010816	CAA	2	6	1747556	1747561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189440357
34494	NC_010816	TGG	2	6	1747566	1747571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189440357
34495	NC_010816	GATC	2	8	1747652	1747659	25 %	25 %	25 %	25 %	189440357
34496	NC_010816	CGC	2	6	1747720	1747725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189440357
34497	NC_010816	ATG	2	6	1747741	1747746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189440357
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