MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_010816	GCCA	2	8	869386	869393	25 %	0 %	25 %	50 %	189439621
17003	NC_010816	TGG	2	6	869486	869491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439621
17004	NC_010816	ACA	2	6	869553	869558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439621
17005	NC_010816	GGA	2	6	869668	869673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439622
17006	NC_010816	GGCA	2	8	869701	869708	25 %	0 %	50 %	25 %	189439622
17007	NC_010816	TCC	2	6	869807	869812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439622
17008	NC_010816	TGC	2	6	869872	869877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17009	NC_010816	CAT	2	6	869922	869927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439622
17010	NC_010816	GC	3	6	869933	869938	0 %	0 %	50 %	50 %	189439622
17011	NC_010816	GC	3	6	869953	869958	0 %	0 %	50 %	50 %	189439622
17012	NC_010816	CAG	2	6	870180	870185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17013	NC_010816	CGGCAG	2	12	870328	870339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	189439622
17014	NC_010816	CCAT	2	8	870368	870375	25 %	25 %	0 %	50 %	189439622
17015	NC_010816	CAC	2	6	870388	870393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439622
17016	NC_010816	TGC	2	6	870440	870445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17017	NC_010816	CGG	2	6	870456	870461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439622
17018	NC_010816	GGT	2	6	870565	870570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439622
17019	NC_010816	TGG	2	6	870576	870581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439622
17020	NC_010816	GCT	2	6	870600	870605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17021	NC_010816	GCC	2	6	870671	870676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439622
17022	NC_010816	CAT	2	6	870696	870701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439622
17023	NC_010816	ATG	2	6	870708	870713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439622
17024	NC_010816	CGGTGC	2	12	870726	870737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189439622
17025	NC_010816	GCA	2	6	870750	870755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17026	NC_010816	TGAT	2	8	870782	870789	25 %	50 %	25 %	0 %	189439622
17027	NC_010816	TCG	2	6	870818	870823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17028	NC_010816	CGC	2	6	870910	870915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439622
17029	NC_010816	GC	3	6	870919	870924	0 %	0 %	50 %	50 %	189439622
17030	NC_010816	TG	3	6	870926	870931	0 %	50 %	50 %	0 %	189439622
17031	NC_010816	ACG	2	6	871109	871114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439622
17032	NC_010816	TTG	2	6	871187	871192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439622
17033	NC_010816	CTC	2	6	871203	871208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439623
17034	NC_010816	GTC	2	6	871223	871228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17035	NC_010816	CGC	2	6	871257	871262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439623
17036	NC_010816	TGC	2	6	871318	871323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17037	NC_010816	CTG	2	6	871338	871343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17038	NC_010816	GCT	2	6	871350	871355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17039	NC_010816	TAG	2	6	871372	871377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439623
17040	NC_010816	GCG	2	6	871420	871425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439623
17041	NC_010816	GCC	2	6	871494	871499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439623
17042	NC_010816	GC	3	6	871508	871513	0 %	0 %	50 %	50 %	189439623
17043	NC_010816	TCG	2	6	871534	871539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17044	NC_010816	CAG	2	6	871548	871553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17045	NC_010816	GTT	2	6	871574	871579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439623
17046	NC_010816	CAT	2	6	871589	871594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439623
17047	NC_010816	CAG	2	6	871605	871610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17048	NC_010816	GC	3	6	871611	871616	0 %	0 %	50 %	50 %	189439623
17049	NC_010816	CGC	2	6	871646	871651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439623
17050	NC_010816	GAT	2	6	871715	871720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439623
17051	NC_010816	GGT	2	6	871743	871748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439623
17052	NC_010816	GCA	2	6	871830	871835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17053	NC_010816	AGCA	2	8	871848	871855	50 %	0 %	25 %	25 %	189439623
17054	NC_010816	CGA	2	6	871958	871963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17055	NC_010816	AC	3	6	871965	871970	50 %	0 %	0 %	50 %	189439623
17056	NC_010816	ATC	3	9	871990	871998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439623
17057	NC_010816	GC	3	6	872078	872083	0 %	0 %	50 %	50 %	189439623
17058	NC_010816	ACC	2	6	872098	872103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439623
17059	NC_010816	GCA	2	6	872135	872140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17060	NC_010816	AGCAAG	2	12	872148	872159	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189439623
17061	NC_010816	TGA	2	6	872165	872170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439623
17062	NC_010816	GGC	2	6	872379	872384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439623
17063	NC_010816	GC	3	6	872410	872415	0 %	0 %	50 %	50 %	189439623
17064	NC_010816	ACG	2	6	872449	872454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17065	NC_010816	CAG	2	6	872466	872471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17066	NC_010816	CCA	2	6	872486	872491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439623
17067	NC_010816	GCG	2	6	872509	872514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439623
17068	NC_010816	CACGG	2	10	872574	872583	20 %	0 %	40 %	40 %	189439623
17069	NC_010816	CGGC	2	8	872600	872607	0 %	0 %	50 %	50 %	189439623
17070	NC_010816	CAG	2	6	872682	872687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
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17072	NC_010816	CGCC	2	8	872726	872733	0 %	0 %	25 %	75 %	189439623
17073	NC_010816	GCG	2	6	872759	872764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439623
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17076	NC_010816	CAG	2	6	872838	872843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
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17082	NC_010816	AGC	2	6	873100	873105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439623
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17085	NC_010816	CTG	2	6	873159	873164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439623
17086	NC_010816	GCG	2	6	873196	873201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439623
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17089	NC_010816	GGCA	2	8	873271	873278	25 %	0 %	50 %	25 %	189439623
17090	NC_010816	CTT	2	6	873303	873308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439623
17091	NC_010816	CAT	2	6	873315	873320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439623
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17100	NC_010816	GCC	2	6	873680	873685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439623
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17102	NC_010816	GTG	2	6	873738	873743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439623
17103	NC_010816	CATA	2	8	873749	873756	50 %	25 %	0 %	25 %	189439623
17104	NC_010816	CAT	2	6	873761	873766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439623
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17113	NC_010816	CGCT	2	8	874376	874383	0 %	25 %	25 %	50 %	189439624
17114	NC_010816	TCA	2	6	874409	874414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439624
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17116	NC_010816	C	6	6	874490	874495	0 %	0 %	0 %	100 %	189439624
17117	NC_010816	GAA	2	6	874504	874509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439624
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17475	NC_010816	T	6	6	892979	892984	0 %	100 %	0 %	0 %	189439640
17476	NC_010816	CCA	2	6	892990	892995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439640
17477	NC_010816	GGCCAC	2	12	893030	893041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189439640
17478	NC_010816	GGC	2	6	893090	893095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439640
17479	NC_010816	GCCG	2	8	893189	893196	0 %	0 %	50 %	50 %	189439640
17480	NC_010816	GCG	2	6	893199	893204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439640
17481	NC_010816	GTG	2	6	893322	893327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439640
17482	NC_010816	TCG	2	6	893415	893420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439640
17483	NC_010816	GC	3	6	893431	893436	0 %	0 %	50 %	50 %	189439640
17484	NC_010816	GGC	2	6	893453	893458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439640
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17491	NC_010816	GTGCG	2	10	893846	893855	0 %	20 %	60 %	20 %	189439640
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17493	NC_010816	GGC	2	6	893954	893959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439640
17494	NC_010816	TCG	2	6	893961	893966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439640
17495	NC_010816	TCC	2	6	893976	893981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439640
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17498	NC_010816	CG	4	8	894146	894153	0 %	0 %	50 %	50 %	189439640
17499	NC_010816	CAT	2	6	894217	894222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439640
17500	NC_010816	GGC	3	9	894323	894331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439640

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