MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010816	CGG	2	6	668623	668628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439447
13002	NC_010816	CCG	3	9	668660	668668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439447
13003	NC_010816	ATG	2	6	668693	668698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439447
13004	NC_010816	GGC	2	6	668725	668730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439447
13005	NC_010816	TGT	2	6	668790	668795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439447
13006	NC_010816	GTT	2	6	669068	669073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439448
13007	NC_010816	TCAA	2	8	669084	669091	50 %	25 %	0 %	25 %	189439448
13008	NC_010816	TTC	2	6	669101	669106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439448
13009	NC_010816	ACG	2	6	669171	669176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439448
13010	NC_010816	CGC	2	6	669229	669234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439448
13011	NC_010816	CGC	2	6	669251	669256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439448
13012	NC_010816	CAT	2	6	669268	669273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439448
13013	NC_010816	CAGCCG	2	12	669286	669297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189439448
13014	NC_010816	TCA	2	6	669300	669305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439448
13015	NC_010816	CGC	2	6	669308	669313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439448
13016	NC_010816	CG	3	6	669365	669370	0 %	0 %	50 %	50 %	189439448
13017	NC_010816	CTG	2	6	669428	669433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439448
13018	NC_010816	CGT	2	6	669496	669501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439448
13019	NC_010816	AGA	2	6	669524	669529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439448
13020	NC_010816	CAT	2	6	669547	669552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439448
13021	NC_010816	TGA	2	6	669580	669585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439448
13022	NC_010816	TCA	2	6	669612	669617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439448
13023	NC_010816	GCA	2	6	669673	669678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439448
13024	NC_010816	TGT	2	6	669703	669708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439448
13025	NC_010816	AGC	2	6	669768	669773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439448
13026	NC_010816	GCC	2	6	669806	669811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439448
13027	NC_010816	CCA	2	6	669829	669834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439448
13028	NC_010816	AGC	2	6	670216	670221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13029	NC_010816	TCG	2	6	670222	670227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13030	NC_010816	GCC	2	6	670254	670259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439449
13031	NC_010816	TGA	2	6	670310	670315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439449
13032	NC_010816	GGC	2	6	670317	670322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439449
13033	NC_010816	AGC	2	6	670372	670377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13034	NC_010816	CGT	2	6	670406	670411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13035	NC_010816	GCA	2	6	670424	670429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13036	NC_010816	CAT	2	6	670515	670520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439449
13037	NC_010816	AGGT	2	8	670543	670550	25 %	25 %	50 %	0 %	189439449
13038	NC_010816	TGG	2	6	670553	670558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439449
13039	NC_010816	GGC	2	6	670623	670628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439449
13040	NC_010816	GCC	2	6	670635	670640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439449
13041	NC_010816	GCC	2	6	670659	670664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439449
13042	NC_010816	CGC	2	6	670715	670720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439449
13043	NC_010816	AGT	2	6	670757	670762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439449
13044	NC_010816	GC	3	6	670777	670782	0 %	0 %	50 %	50 %	189439449
13045	NC_010816	CGG	2	6	670840	670845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439449
13046	NC_010816	GTC	2	6	670899	670904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13047	NC_010816	CAGG	2	8	670916	670923	25 %	0 %	50 %	25 %	189439449
13048	NC_010816	GCA	2	6	671042	671047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439449
13049	NC_010816	CGG	2	6	671092	671097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439449
13050	NC_010816	TGT	2	6	671138	671143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439449
13051	NC_010816	GTG	2	6	671265	671270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439449
13052	NC_010816	AGC	3	9	671532	671540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
13053	NC_010816	AGC	3	9	671553	671561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
13054	NC_010816	GCG	2	6	671569	671574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439450
13055	NC_010816	AAC	2	6	671661	671666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439450
13056	NC_010816	TCT	2	6	671720	671725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439450
13057	NC_010816	CAGG	2	8	671726	671733	25 %	0 %	50 %	25 %	189439450
13058	NC_010816	CGA	2	6	671771	671776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
13059	NC_010816	CAG	2	6	671783	671788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
13060	NC_010816	TCT	2	6	671834	671839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439450
13061	NC_010816	GAT	2	6	671874	671879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439450
13062	NC_010816	TTC	2	6	671893	671898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439450
13063	NC_010816	GAC	2	6	671910	671915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
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13065	NC_010816	CGC	2	6	672020	672025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439450
13066	NC_010816	TGG	2	6	672035	672040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439450
13067	NC_010816	TTG	2	6	672049	672054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439450
13068	NC_010816	GAC	2	6	672065	672070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439450
13069	NC_010816	TGG	2	6	672119	672124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439450
13070	NC_010816	GAC	2	6	672571	672576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439451
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13083	NC_010816	CTG	2	6	672927	672932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439451
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13085	NC_010816	CGA	2	6	673074	673079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439451
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13088	NC_010816	GGC	2	6	673173	673178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439451
13089	NC_010816	CGT	2	6	673203	673208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439451
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13091	NC_010816	TGC	2	6	673301	673306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439451
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13094	NC_010816	TTCA	2	8	673408	673415	25 %	50 %	0 %	25 %	189439451
13095	NC_010816	GCGGA	2	10	673418	673427	20 %	0 %	60 %	20 %	189439451
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13100	NC_010816	ACG	2	6	673874	673879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
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13102	NC_010816	CGA	2	6	673968	673973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
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13104	NC_010816	CTC	2	6	674029	674034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439452
13105	NC_010816	CAG	2	6	674056	674061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
13106	NC_010816	GCCTGA	2	12	674168	674179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439452
13107	NC_010816	TTCC	2	8	674265	674272	0 %	50 %	0 %	50 %	189439452
13108	NC_010816	CAG	2	6	674283	674288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
13109	NC_010816	CGG	2	6	674289	674294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439452
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13112	NC_010816	CGA	2	6	674391	674396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
13113	NC_010816	GAC	2	6	674485	674490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
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13117	NC_010816	GAC	2	6	674611	674616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439452
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13231	NC_010816	TCG	2	6	679437	679442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439456
13232	NC_010816	CTC	2	6	679499	679504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439456
13233	NC_010816	CTGAT	2	10	679506	679515	20 %	40 %	20 %	20 %	189439456
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13236	NC_010816	TCG	2	6	679677	679682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439456
13237	NC_010816	TGG	2	6	679741	679746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439456
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13239	NC_010816	CGG	2	6	679804	679809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439456
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13351	NC_010816	GC	3	6	684191	684196	0 %	0 %	50 %	50 %	189439461
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13354	NC_010816	CAC	2	6	684292	684297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439461
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13459	NC_010816	GACGTG	2	12	690613	690624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189439467
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13464	NC_010816	CGA	2	6	690784	690789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439468
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13466	NC_010816	CAC	2	6	690809	690814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439468
13467	NC_010816	TCG	3	9	690870	690878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439468
13468	NC_010816	GAT	2	6	690911	690916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439468
13469	NC_010816	TTTCGA	2	12	690925	690936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189439468
13470	NC_010816	CCCA	2	8	691038	691045	25 %	0 %	0 %	75 %	189439468
13471	NC_010816	GC	3	6	691054	691059	0 %	0 %	50 %	50 %	189439468
13472	NC_010816	GC	3	6	691072	691077	0 %	0 %	50 %	50 %	189439468
13473	NC_010816	GGT	2	6	691108	691113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439468
13474	NC_010816	ACC	2	6	691119	691124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439468
13475	NC_010816	CGC	2	6	691195	691200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439468
13476	NC_010816	ATGCGG	2	12	691215	691226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189439468
13477	NC_010816	CGC	2	6	691234	691239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439468
13478	NC_010816	ACG	2	6	691248	691253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439468
13479	NC_010816	GGT	2	6	691291	691296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439468
13480	NC_010816	GAAC	2	8	691330	691337	50 %	0 %	25 %	25 %	189439468
13481	NC_010816	GTG	2	6	691338	691343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439468
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13483	NC_010816	CGT	2	6	691402	691407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439468
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13496	NC_010816	GGTA	2	8	692148	692155	25 %	25 %	50 %	0 %	189439469
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