MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010816	ACC	2	6	641905	641910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439425
12502	NC_010816	GCC	3	9	642030	642038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439425
12503	NC_010816	GCT	2	6	642041	642046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439425
12504	NC_010816	AG	3	6	642073	642078	50 %	0 %	50 %	0 %	189439425
12505	NC_010816	TAA	2	6	642086	642091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439425
12506	NC_010816	GCA	2	6	642107	642112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439425
12507	NC_010816	GAT	2	6	642159	642164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439425
12508	NC_010816	CAT	2	6	642176	642181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439425
12509	NC_010816	CAGC	2	8	642230	642237	25 %	0 %	25 %	50 %	189439425
12510	NC_010816	CGA	2	6	642257	642262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439425
12511	NC_010816	GCA	2	6	642286	642291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439425
12512	NC_010816	CCA	2	6	642403	642408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439425
12513	NC_010816	GCG	2	6	642416	642421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439425
12514	NC_010816	GCCGT	2	10	642588	642597	0 %	20 %	40 %	40 %	189439426
12515	NC_010816	TGA	2	6	642682	642687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439426
12516	NC_010816	GAA	2	6	642725	642730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439426
12517	NC_010816	CAG	2	6	642839	642844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439426
12518	NC_010816	CCG	2	6	642867	642872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439426
12519	NC_010816	CTG	2	6	642923	642928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439426
12520	NC_010816	ACGGCC	2	12	642956	642967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189439426
12521	NC_010816	TCAG	2	8	643149	643156	25 %	25 %	25 %	25 %	189439427
12522	NC_010816	ATC	3	9	643249	643257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439427
12523	NC_010816	GC	3	6	643349	643354	0 %	0 %	50 %	50 %	189439427
12524	NC_010816	TCG	2	6	643358	643363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12525	NC_010816	CCG	2	6	643418	643423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439427
12526	NC_010816	TCG	2	6	643448	643453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12527	NC_010816	CCA	2	6	643458	643463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439427
12528	NC_010816	CAT	2	6	643471	643476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439427
12529	NC_010816	GAG	2	6	643631	643636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439427
12530	NC_010816	CGGCG	2	10	643671	643680	0 %	0 %	60 %	40 %	189439427
12531	NC_010816	CGG	2	6	643694	643699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439427
12532	NC_010816	TCG	2	6	643727	643732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12533	NC_010816	GCG	2	6	643787	643792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439427
12534	NC_010816	GCG	2	6	643807	643812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439427
12535	NC_010816	AGGT	2	8	643841	643848	25 %	25 %	50 %	0 %	189439427
12536	NC_010816	TGG	2	6	643850	643855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439427
12537	NC_010816	CCGC	2	8	643856	643863	0 %	0 %	25 %	75 %	189439427
12538	NC_010816	GCGT	2	8	643867	643874	0 %	25 %	50 %	25 %	189439427
12539	NC_010816	TTG	2	6	643910	643915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439427
12540	NC_010816	AGT	2	6	643938	643943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439427
12541	NC_010816	GCC	2	6	644023	644028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439427
12542	NC_010816	CCT	2	6	644031	644036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439427
12543	NC_010816	GGT	2	6	644190	644195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439427
12544	NC_010816	GTA	3	9	644203	644211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439427
12545	NC_010816	CACG	2	8	644271	644278	25 %	0 %	25 %	50 %	189439427
12546	NC_010816	GC	3	6	644287	644292	0 %	0 %	50 %	50 %	189439427
12547	NC_010816	TCGT	2	8	644323	644330	0 %	50 %	25 %	25 %	189439427
12548	NC_010816	ACGA	2	8	644337	644344	50 %	0 %	25 %	25 %	189439427
12549	NC_010816	CCG	2	6	644358	644363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439427
12550	NC_010816	CGG	2	6	644616	644621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439427
12551	NC_010816	ATC	2	6	644639	644644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439427
12552	NC_010816	TGA	2	6	644661	644666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439427
12553	NC_010816	CGT	2	6	644668	644673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12554	NC_010816	GTC	2	6	644680	644685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12555	NC_010816	CATA	2	8	644795	644802	50 %	25 %	0 %	25 %	189439427
12556	NC_010816	TGC	2	6	644844	644849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12557	NC_010816	GCT	2	6	644877	644882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12558	NC_010816	CGCGAA	2	12	644905	644916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439427
12559	NC_010816	GC	3	6	644925	644930	0 %	0 %	50 %	50 %	189439427
12560	NC_010816	CG	3	6	644979	644984	0 %	0 %	50 %	50 %	189439427
12561	NC_010816	GTTC	2	8	645002	645009	0 %	50 %	25 %	25 %	189439427
12562	NC_010816	CTT	2	6	645217	645222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439428
12563	NC_010816	GCC	3	9	645244	645252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439428
12564	NC_010816	GCTG	2	8	645286	645293	0 %	25 %	50 %	25 %	189439428
12565	NC_010816	GCA	2	6	645336	645341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439428
12566	NC_010816	ATA	2	6	645361	645366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439428
12567	NC_010816	CAT	2	6	645409	645414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439428
12568	NC_010816	GCC	2	6	645451	645456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439428
12569	NC_010816	GGAT	2	8	645508	645515	25 %	25 %	50 %	0 %	189439428
12570	NC_010816	TCG	2	6	645581	645586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439428
12571	NC_010816	TTC	2	6	645662	645667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439428
12572	NC_010816	CCTTGG	2	12	645744	645755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439428
12573	NC_010816	CGG	2	6	645831	645836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439428
12574	NC_010816	TCT	2	6	645858	645863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439428
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12578	NC_010816	TGC	2	6	646190	646195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439428
12579	NC_010816	CTT	2	6	646243	646248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439428
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12581	NC_010816	GTC	2	6	646351	646356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439428
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12585	NC_010816	GCTGGC	2	12	646441	646452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189439428
12586	NC_010816	TTG	2	6	646457	646462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439428
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12588	NC_010816	GCC	2	6	646612	646617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439428
12589	NC_010816	GCC	2	6	646666	646671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439428
12590	NC_010816	GTG	2	6	646682	646687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439428
12591	NC_010816	AGC	2	6	646793	646798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439428
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12593	NC_010816	GT	3	6	646842	646847	0 %	50 %	50 %	0 %	189439428
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12599	NC_010816	CGGC	2	8	647336	647343	0 %	0 %	50 %	50 %	189439429
12600	NC_010816	GAC	2	6	647403	647408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439429
12601	NC_010816	GTGAC	2	10	647419	647428	20 %	20 %	40 %	20 %	189439429
12602	NC_010816	CGG	2	6	647453	647458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439429
12603	NC_010816	GTCG	2	8	647520	647527	0 %	25 %	50 %	25 %	189439429
12604	NC_010816	GGA	2	6	647556	647561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439429
12605	NC_010816	TCT	2	6	647564	647569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439429
12606	NC_010816	TGT	2	6	647600	647605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439429
12607	NC_010816	GCA	2	6	647639	647644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439429
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12611	NC_010816	CCA	2	6	647870	647875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439429
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12619	NC_010816	CGA	2	6	648125	648130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439429
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12856	NC_010816	CTG	2	6	661130	661135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439440
12857	NC_010816	TCG	2	6	661161	661166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439440
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12965	NC_010816	GACT	2	8	666529	666536	25 %	25 %	25 %	25 %	189439445
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12969	NC_010816	GC	3	6	666752	666757	0 %	0 %	50 %	50 %	189439445
12970	NC_010816	GCGGG	2	10	666782	666791	0 %	0 %	80 %	20 %	189439445
12971	NC_010816	GCA	2	6	666854	666859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439445
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