MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010816	CGG	2	6	510937	510942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439290
10002	NC_010816	CGA	2	6	511012	511017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439290
10003	NC_010816	ACC	2	6	511022	511027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439290
10004	NC_010816	GCT	2	6	511054	511059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439290
10005	NC_010816	TGC	2	6	511065	511070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439290
10006	NC_010816	TGG	2	6	511077	511082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439290
10007	NC_010816	GTCATC	2	12	511097	511108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189439290
10008	NC_010816	AGG	2	6	511131	511136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439290
10009	NC_010816	GATC	2	8	511147	511154	25 %	25 %	25 %	25 %	189439290
10010	NC_010816	GCG	2	6	511167	511172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439290
10011	NC_010816	GGC	2	6	511178	511183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439290
10012	NC_010816	GT	3	6	511599	511604	0 %	50 %	50 %	0 %	189439291
10013	NC_010816	GGCAA	2	10	511643	511652	40 %	0 %	40 %	20 %	189439291
10014	NC_010816	ATT	2	6	511677	511682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189439291
10015	NC_010816	CTG	2	6	511697	511702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10016	NC_010816	CGCA	2	8	511709	511716	25 %	0 %	25 %	50 %	189439291
10017	NC_010816	CGCA	2	8	511732	511739	25 %	0 %	25 %	50 %	189439291
10018	NC_010816	GTC	2	6	511754	511759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10019	NC_010816	CGA	2	6	511837	511842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10020	NC_010816	CG	3	6	511887	511892	0 %	0 %	50 %	50 %	189439291
10021	NC_010816	CGG	2	6	511916	511921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439291
10022	NC_010816	TGC	2	6	511983	511988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10023	NC_010816	CAC	2	6	512011	512016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439291
10024	NC_010816	TGA	2	6	512148	512153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439291
10025	NC_010816	GAC	2	6	512157	512162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10026	NC_010816	GCC	2	6	512234	512239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10027	NC_010816	GTG	2	6	512273	512278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439291
10028	NC_010816	CGT	2	6	512290	512295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10029	NC_010816	CGA	2	6	512338	512343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10030	NC_010816	GC	3	6	512374	512379	0 %	0 %	50 %	50 %	189439291
10031	NC_010816	CGC	2	6	512479	512484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10032	NC_010816	CCA	2	6	512520	512525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439291
10033	NC_010816	ACC	2	6	512618	512623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439291
10034	NC_010816	GC	3	6	512626	512631	0 %	0 %	50 %	50 %	189439291
10035	NC_010816	CTG	2	6	512636	512641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10036	NC_010816	CG	3	6	512661	512666	0 %	0 %	50 %	50 %	189439291
10037	NC_010816	ATC	2	6	512669	512674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439291
10038	NC_010816	CCG	2	6	512692	512697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10039	NC_010816	GGCT	2	8	512711	512718	0 %	25 %	50 %	25 %	189439291
10040	NC_010816	AAG	2	6	512771	512776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439291
10041	NC_010816	GCCA	2	8	512804	512811	25 %	0 %	25 %	50 %	189439291
10042	NC_010816	GCA	2	6	512823	512828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10043	NC_010816	GCAC	2	8	512855	512862	25 %	0 %	25 %	50 %	189439291
10044	NC_010816	GTG	2	6	512949	512954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439291
10045	NC_010816	TGG	2	6	512973	512978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439291
10046	NC_010816	GAT	2	6	513056	513061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439291
10047	NC_010816	CGC	2	6	513089	513094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10048	NC_010816	GCC	2	6	513161	513166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10049	NC_010816	GGC	2	6	513187	513192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439291
10050	NC_010816	CCCG	2	8	513298	513305	0 %	0 %	25 %	75 %	189439291
10051	NC_010816	CAG	2	6	513314	513319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10052	NC_010816	TGG	3	9	513357	513365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439291
10053	NC_010816	GGC	2	6	513371	513376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439291
10054	NC_010816	GCC	3	9	513392	513400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439291
10055	NC_010816	ACG	2	6	513426	513431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10056	NC_010816	GAC	3	9	513479	513487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10057	NC_010816	ATC	2	6	513494	513499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439291
10058	NC_010816	CTG	2	6	513527	513532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10059	NC_010816	CGA	2	6	513544	513549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10060	NC_010816	ACC	2	6	513573	513578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439291
10061	NC_010816	CAG	2	6	513581	513586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10062	NC_010816	GC	3	6	513609	513614	0 %	0 %	50 %	50 %	189439291
10063	NC_010816	CGA	2	6	513616	513621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10064	NC_010816	GCT	2	6	513655	513660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439291
10065	NC_010816	ATC	2	6	513894	513899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439292
10066	NC_010816	CGA	2	6	513979	513984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10067	NC_010816	GAC	2	6	514016	514021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10068	NC_010816	GCCTGA	2	12	514062	514073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439292
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10070	NC_010816	GAT	2	6	514181	514186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439292
10071	NC_010816	ACA	2	6	514224	514229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189439292
10072	NC_010816	ACACC	2	10	514285	514294	40 %	0 %	0 %	60 %	189439292
10073	NC_010816	ATC	2	6	514319	514324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439292
10074	NC_010816	TGC	2	6	514361	514366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439292
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10076	NC_010816	TCG	3	9	514389	514397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10077	NC_010816	A	6	6	514414	514419	100 %	0 %	0 %	0 %	189439292
10078	NC_010816	CGA	2	6	514489	514494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10079	NC_010816	TCA	2	6	514533	514538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439292
10080	NC_010816	CTG	2	6	514613	514618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10081	NC_010816	CCA	2	6	514644	514649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439292
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10083	NC_010816	CGG	2	6	514690	514695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439292
10084	NC_010816	GAA	2	6	514697	514702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439292
10085	NC_010816	TGC	2	6	514704	514709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10086	NC_010816	TGA	2	6	514737	514742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439292
10087	NC_010816	GAC	2	6	514757	514762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10088	NC_010816	ACC	3	9	514796	514804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439292
10089	NC_010816	GAC	2	6	514808	514813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439292
10090	NC_010816	GAG	2	6	514844	514849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439292
10091	NC_010816	GGC	2	6	514893	514898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439293
10092	NC_010816	TGC	2	6	514979	514984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439293
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10101	NC_010816	GCC	2	6	515288	515293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439293
10102	NC_010816	GCA	2	6	515304	515309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439293
10103	NC_010816	CTG	2	6	515350	515355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439293
10104	NC_010816	CCA	2	6	515409	515414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439293
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10106	NC_010816	CAC	2	6	515457	515462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439293
10107	NC_010816	GGT	2	6	515731	515736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439293
10108	NC_010816	CGGT	2	8	515743	515750	0 %	25 %	50 %	25 %	189439293
10109	NC_010816	CGC	2	6	515773	515778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439293
10110	NC_010816	GA	3	6	515814	515819	50 %	0 %	50 %	0 %	189439293
10111	NC_010816	GGC	2	6	516139	516144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439294
10112	NC_010816	ATAC	2	8	516164	516171	50 %	25 %	0 %	25 %	189439294
10113	NC_010816	GAA	2	6	516216	516221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439294
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10116	NC_010816	AGC	2	6	516368	516373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439294
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10118	NC_010816	GCC	2	6	516517	516522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439294
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10474	NC_010816	AAAG	2	8	531968	531975	75 %	0 %	25 %	0 %	189439307
10475	NC_010816	TTC	2	6	531978	531983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439307
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10477	NC_010816	CAG	2	6	532062	532067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439308
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10486	NC_010816	CGCGG	2	10	532380	532389	0 %	0 %	60 %	40 %	189439308
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10499	NC_010816	TCG	2	6	533290	533295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439309
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