MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A chromosome

Total Repeats: 46524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010816	TGA	2	6	342941	342946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439137
6502	NC_010816	TTC	2	6	342958	342963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439137
6503	NC_010816	CGG	2	6	342965	342970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439137
6504	NC_010816	TGA	2	6	342998	343003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439137
6505	NC_010816	CG	3	6	343007	343012	0 %	0 %	50 %	50 %	189439137
6506	NC_010816	TGAA	2	8	343093	343100	50 %	25 %	25 %	0 %	189439137
6507	NC_010816	GCG	2	6	343160	343165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439138
6508	NC_010816	GC	4	8	343221	343228	0 %	0 %	50 %	50 %	189439138
6509	NC_010816	AGC	2	6	343234	343239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439138
6510	NC_010816	TTG	2	6	343261	343266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439138
6511	NC_010816	AGCGC	2	10	343286	343295	20 %	0 %	40 %	40 %	189439138
6512	NC_010816	AAT	2	6	343313	343318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189439138
6513	NC_010816	GC	3	6	343361	343366	0 %	0 %	50 %	50 %	189439138
6514	NC_010816	GAG	2	6	343369	343374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439138
6515	NC_010816	GCA	2	6	343454	343459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439138
6516	NC_010816	CGA	2	6	343476	343481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439138
6517	NC_010816	CGT	2	6	343505	343510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439138
6518	NC_010816	GAT	2	6	343608	343613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439138
6519	NC_010816	ATG	2	6	343644	343649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439138
6520	NC_010816	TCG	3	9	343681	343689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439138
6521	NC_010816	CCA	2	6	343862	343867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439138
6522	NC_010816	ATGA	2	8	344000	344007	50 %	25 %	25 %	0 %	189439139
6523	NC_010816	ATG	2	6	344012	344017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439139
6524	NC_010816	GC	3	6	344029	344034	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6525	NC_010816	TCCATA	2	12	344091	344102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439139
6526	NC_010816	CAATGA	2	12	344194	344205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189439139
6527	NC_010816	GGC	2	6	344327	344332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439139
6528	NC_010816	AAG	2	6	344354	344359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439139
6529	NC_010816	CAGGTC	2	12	344459	344470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189439139
6530	NC_010816	CGC	2	6	344506	344511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6531	NC_010816	GTGG	2	8	344533	344540	0 %	25 %	75 %	0 %	189439139
6532	NC_010816	CAC	2	6	344587	344592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439139
6533	NC_010816	CCG	2	6	344611	344616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6534	NC_010816	TGA	2	6	344632	344637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439139
6535	NC_010816	TG	3	6	344648	344653	0 %	50 %	50 %	0 %	189439139
6536	NC_010816	AGG	2	6	344667	344672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439139
6537	NC_010816	TTCG	2	8	344698	344705	0 %	50 %	25 %	25 %	189439139
6538	NC_010816	CGAT	2	8	344719	344726	25 %	25 %	25 %	25 %	189439139
6539	NC_010816	GC	3	6	344746	344751	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6540	NC_010816	CGC	2	6	344793	344798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6541	NC_010816	GCC	2	6	344804	344809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6542	NC_010816	CGA	2	6	344815	344820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439139
6543	NC_010816	CGC	2	6	344827	344832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6544	NC_010816	CAT	2	6	344851	344856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439139
6545	NC_010816	GC	3	6	344902	344907	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6546	NC_010816	CGC	2	6	344962	344967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6547	NC_010816	CAT	2	6	344995	345000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439139
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6550	NC_010816	GC	3	6	345062	345067	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6551	NC_010816	CGTTCA	2	12	345078	345089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189439139
6552	NC_010816	GCCG	2	8	345112	345119	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6553	NC_010816	CG	3	6	345138	345143	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6554	NC_010816	GTG	2	6	345146	345151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439139
6555	NC_010816	TGG	2	6	345171	345176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189439139
6556	NC_010816	TGA	2	6	345237	345242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439139
6557	NC_010816	AAG	2	6	345260	345265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189439139
6558	NC_010816	GACACC	2	12	345266	345277	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189439139
6559	NC_010816	CA	3	6	345379	345384	50 %	0 %	0 %	50 %	189439139
6560	NC_010816	GCCG	2	8	345386	345393	0 %	0 %	50 %	50 %	189439139
6561	NC_010816	GCC	2	6	345422	345427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439139
6562	NC_010816	GTC	2	6	345477	345482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439140
6563	NC_010816	TCG	2	6	345487	345492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439140
6564	NC_010816	CATCGC	2	12	345524	345535	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	189439140
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6567	NC_010816	CAT	2	6	345671	345676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439140
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6569	NC_010816	GC	3	6	345720	345725	0 %	0 %	50 %	50 %	189439140
6570	NC_010816	TCG	2	6	345769	345774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439140
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6573	NC_010816	GC	3	6	345927	345932	0 %	0 %	50 %	50 %	189439140
6574	NC_010816	CGC	2	6	345951	345956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439140
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6576	NC_010816	CATCG	2	10	346080	346089	20 %	20 %	20 %	40 %	189439140
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6588	NC_010816	GTA	2	6	346547	346552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439141
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6592	NC_010816	ACGGA	2	10	346713	346722	40 %	0 %	40 %	20 %	189439141
6593	NC_010816	TCA	2	6	346738	346743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439141
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6604	NC_010816	TCC	2	6	347461	347466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439142
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6620	NC_010816	GTC	2	6	348043	348048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439142
6621	NC_010816	TGA	2	6	348065	348070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189439142
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6624	NC_010816	CGC	2	6	348117	348122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439142
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6651	NC_010816	CTG	2	6	349429	349434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189439142
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6738	NC_010816	ACTC	2	8	353318	353325	25 %	25 %	0 %	50 %	189439147
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6980	NC_010816	TG	4	8	365649	365656	0 %	50 %	50 %	0 %	189439157
6981	NC_010816	ACC	2	6	365720	365725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189439157
6982	NC_010816	ATC	2	6	365763	365768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189439157
6983	NC_010816	TGT	2	6	365791	365796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189439157
6984	NC_010816	GATC	2	8	366062	366069	25 %	25 %	25 %	25 %	189439158
6985	NC_010816	TCT	2	6	366131	366136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189439158
6986	NC_010816	CCG	2	6	366165	366170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189439158
6987	NC_010816	CAGA	2	8	366180	366187	50 %	0 %	25 %	25 %	189439158
6988	NC_010816	CGA	2	6	366264	366269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439158
6989	NC_010816	CGGC	2	8	366310	366317	0 %	0 %	50 %	50 %	189439158
6990	NC_010816	GCCTG	2	10	366336	366345	0 %	20 %	40 %	40 %	189439158
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6992	NC_010816	CAG	2	6	366367	366372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189439158
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6998	NC_010816	CCT	2	6	366860	366865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189439158
6999	NC_010816	GGA	2	6	366871	366876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189439158
7000	NC_010816	GGC	2	6	366877	366882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	189439158

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