MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella avium 197N chromosome

Total Repeats: 74910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010645	TCA	2	6	200376	200381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476708
4002	NC_010645	CGG	2	6	200514	200519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476708
4003	NC_010645	GGC	2	6	200526	200531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476708
4004	NC_010645	CG	3	6	200586	200591	0 %	0 %	50 %	50 %	187476708
4005	NC_010645	TTG	2	6	200606	200611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187476708
4006	NC_010645	GTTTT	2	10	200687	200696	0 %	80 %	20 %	0 %	187476708
4007	NC_010645	GCA	2	6	200766	200771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476708
4008	NC_010645	GCCG	2	8	200782	200789	0 %	0 %	50 %	50 %	187476708
4009	NC_010645	CG	3	6	200792	200797	0 %	0 %	50 %	50 %	187476708
4010	NC_010645	GC	3	6	200842	200847	0 %	0 %	50 %	50 %	187476708
4011	NC_010645	AGTC	2	8	200856	200863	25 %	25 %	25 %	25 %	187476708
4012	NC_010645	GGCG	2	8	201186	201193	0 %	0 %	75 %	25 %	187476709
4013	NC_010645	GTC	2	6	201257	201262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4014	NC_010645	GGCCA	2	10	201295	201304	20 %	0 %	40 %	40 %	187476709
4015	NC_010645	CAG	2	6	201313	201318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4016	NC_010645	TGCAA	2	10	201347	201356	40 %	20 %	20 %	20 %	187476709
4017	NC_010645	GCA	2	6	201390	201395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4018	NC_010645	CG	3	6	201413	201418	0 %	0 %	50 %	50 %	187476709
4019	NC_010645	CAT	2	6	201444	201449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476709
4020	NC_010645	CCTT	2	8	201457	201464	0 %	50 %	0 %	50 %	187476709
4021	NC_010645	GCG	2	6	201617	201622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476709
4022	NC_010645	GCT	2	6	201651	201656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4023	NC_010645	CTT	2	6	201678	201683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187476709
4024	NC_010645	TCG	2	6	201686	201691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4025	NC_010645	GAT	2	6	201694	201699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476709
4026	NC_010645	GCC	2	6	201735	201740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476709
4027	NC_010645	AGC	2	6	201764	201769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4028	NC_010645	TGGT	2	8	201832	201839	0 %	50 %	50 %	0 %	187476709
4029	NC_010645	GCCG	2	8	201843	201850	0 %	0 %	50 %	50 %	187476709
4030	NC_010645	GCC	2	6	201857	201862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476709
4031	NC_010645	GCC	2	6	201880	201885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476709
4032	NC_010645	GAC	2	6	201886	201891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4033	NC_010645	CGC	2	6	201975	201980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476709
4034	NC_010645	GCCGG	2	10	202029	202038	0 %	0 %	60 %	40 %	187476709
4035	NC_010645	GGC	2	6	202060	202065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476709
4036	NC_010645	GC	3	6	202078	202083	0 %	0 %	50 %	50 %	187476709
4037	NC_010645	GTC	2	6	202138	202143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476709
4038	NC_010645	CATGC	2	10	202192	202201	20 %	20 %	20 %	40 %	187476709
4039	NC_010645	ATGA	2	8	202219	202226	50 %	25 %	25 %	0 %	187476709
4040	NC_010645	TGG	2	6	202470	202475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476710
4041	NC_010645	GCC	2	6	202481	202486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476710
4042	NC_010645	GC	3	6	202509	202514	0 %	0 %	50 %	50 %	187476710
4043	NC_010645	GTG	2	6	202553	202558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476710
4044	NC_010645	CAC	2	6	202564	202569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476710
4045	NC_010645	GCG	2	6	202652	202657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476710
4046	NC_010645	CAA	2	6	202672	202677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476710
4047	NC_010645	GCA	2	6	202702	202707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4048	NC_010645	GCA	2	6	202768	202773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4049	NC_010645	CAT	2	6	202792	202797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476710
4050	NC_010645	ATG	2	6	202818	202823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476710
4051	NC_010645	AAG	2	6	202844	202849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476710
4052	NC_010645	CCA	2	6	202884	202889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476710
4053	NC_010645	GCA	2	6	202897	202902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4054	NC_010645	CGAA	2	8	202911	202918	50 %	0 %	25 %	25 %	187476710
4055	NC_010645	GCTG	2	8	202924	202931	0 %	25 %	50 %	25 %	187476710
4056	NC_010645	GC	4	8	202937	202944	0 %	0 %	50 %	50 %	187476710
4057	NC_010645	AAT	2	6	202946	202951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187476710
4058	NC_010645	GTC	2	6	202991	202996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4059	NC_010645	TGC	2	6	203005	203010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4060	NC_010645	CGA	2	6	203149	203154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4061	NC_010645	CGA	2	6	203233	203238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476710
4062	NC_010645	CGC	2	6	203267	203272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476710
4063	NC_010645	GTG	2	6	203282	203287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476710
4064	NC_010645	GATC	2	8	203404	203411	25 %	25 %	25 %	25 %	187476710
4065	NC_010645	GGC	2	6	203438	203443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476710
4066	NC_010645	T	6	6	203581	203586	0 %	100 %	0 %	0 %	187476711
4067	NC_010645	GCCC	2	8	203631	203638	0 %	0 %	25 %	75 %	187476711
4068	NC_010645	TGA	3	9	203647	203655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476711
4069	NC_010645	GC	3	6	203687	203692	0 %	0 %	50 %	50 %	187476711
4070	NC_010645	TCA	2	6	203754	203759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476711
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4074	NC_010645	GAGTGG	2	12	203948	203959	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	187476711
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4078	NC_010645	CCAT	2	8	204083	204090	25 %	25 %	0 %	50 %	187476712
4079	NC_010645	CCA	2	6	204101	204106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476712
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4083	NC_010645	CGG	2	6	204341	204346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476712
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4086	NC_010645	TGC	2	6	204500	204505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476712
4087	NC_010645	CGCAGG	2	12	204508	204519	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187476712
4088	NC_010645	CG	3	6	204525	204530	0 %	0 %	50 %	50 %	187476712
4089	NC_010645	GGC	2	6	204531	204536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476712
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4091	NC_010645	CTCG	2	8	204606	204613	0 %	25 %	25 %	50 %	187476712
4092	NC_010645	TCG	2	6	204634	204639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476712
4093	NC_010645	GCG	2	6	204646	204651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476712
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4098	NC_010645	G	6	6	204881	204886	0 %	0 %	100 %	0 %	187476712
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4103	NC_010645	TGC	2	6	205090	205095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476713
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4105	NC_010645	CGG	2	6	205161	205166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476713
4106	NC_010645	CG	3	6	205262	205267	0 %	0 %	50 %	50 %	187476713
4107	NC_010645	ATGG	2	8	205278	205285	25 %	25 %	50 %	0 %	187476713
4108	NC_010645	GAGC	2	8	205341	205348	25 %	0 %	50 %	25 %	187476713
4109	NC_010645	CGA	2	6	205367	205372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476713
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4111	NC_010645	GC	3	6	205383	205388	0 %	0 %	50 %	50 %	187476713
4112	NC_010645	CCA	2	6	205397	205402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476713
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4118	NC_010645	GGCG	2	8	205655	205662	0 %	0 %	75 %	25 %	187476713
4119	NC_010645	GC	3	6	205679	205684	0 %	0 %	50 %	50 %	187476713
4120	NC_010645	TGCG	2	8	205700	205707	0 %	25 %	50 %	25 %	187476713
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4122	NC_010645	CAG	2	6	205824	205829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476713
4123	NC_010645	GTG	2	6	205830	205835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476713
4124	NC_010645	GC	5	10	205859	205868	0 %	0 %	50 %	50 %	187476713
4125	NC_010645	TGG	2	6	205887	205892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476713
4126	NC_010645	GCG	2	6	205900	205905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476713
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4128	NC_010645	GC	3	6	205987	205992	0 %	0 %	50 %	50 %	187476713
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4135	NC_010645	GCA	2	6	206407	206412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476714
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4153	NC_010645	TCAA	2	8	207635	207642	50 %	25 %	0 %	25 %	187476599
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4244	NC_010645	ATG	2	6	211613	211618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476719
4245	NC_010645	GAA	2	6	211698	211703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476719
4246	NC_010645	TCCA	2	8	211709	211716	25 %	25 %	0 %	50 %	187476719
4247	NC_010645	TCGAAA	2	12	211742	211753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187476719
4248	NC_010645	GCAGG	2	10	211893	211902	20 %	0 %	60 %	20 %	187476720
4249	NC_010645	TGC	2	6	211931	211936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476720
4250	NC_010645	TCG	2	6	211952	211957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476720
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4266	NC_010645	TCG	2	6	212824	212829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476721
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4271	NC_010645	CGG	2	6	212972	212977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476721
4272	NC_010645	GCCG	2	8	213003	213010	0 %	0 %	50 %	50 %	187476721
4273	NC_010645	GCG	2	6	213031	213036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476721
4274	NC_010645	CGGC	2	8	213058	213065	0 %	0 %	50 %	50 %	187476721
4275	NC_010645	GGC	2	6	213152	213157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476721
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4355	NC_010645	TGGCC	2	10	217775	217784	0 %	20 %	40 %	40 %	187476725
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4487	NC_010645	CCAG	2	8	224017	224024	25 %	0 %	25 %	50 %	187476731
4488	NC_010645	GCG	2	6	224083	224088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476731
4489	NC_010645	GTG	2	6	224100	224105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476731
4490	NC_010645	GCC	3	9	224148	224156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476731
4491	NC_010645	CGA	2	6	224161	224166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476731
4492	NC_010645	GAAGA	2	10	224256	224265	60 %	0 %	40 %	0 %	187476731
4493	NC_010645	CAC	2	6	224387	224392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476731
4494	NC_010645	CCG	2	6	224407	224412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476731
4495	NC_010645	CAG	2	6	224414	224419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476731
4496	NC_010645	CGC	2	6	224498	224503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476731
4497	NC_010645	TGGT	2	8	224544	224551	0 %	50 %	50 %	0 %	187476731
4498	NC_010645	TTG	2	6	224577	224582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187476731
4499	NC_010645	GGC	2	6	224621	224626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476731
4500	NC_010645	GAT	2	6	224675	224680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476731

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