MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella avium 197N chromosome

Total Repeats: 74910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010645	CTT	2	6	28187	28192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187476536
502	NC_010645	AGC	2	6	28204	28209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
503	NC_010645	GC	3	6	28223	28228	0 %	0 %	50 %	50 %	187476536
504	NC_010645	TCCCG	2	10	28232	28241	0 %	20 %	20 %	60 %	187476536
505	NC_010645	TGAT	2	8	28282	28289	25 %	50 %	25 %	0 %	187476536
506	NC_010645	CAT	2	6	28307	28312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476536
507	NC_010645	AGCC	2	8	28322	28329	25 %	0 %	25 %	50 %	187476536
508	NC_010645	GAA	2	6	28383	28388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
509	NC_010645	GCC	3	9	28410	28418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
510	NC_010645	GTC	2	6	28421	28426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
511	NC_010645	TGA	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
512	NC_010645	GAA	2	6	28467	28472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
513	NC_010645	ATCC	2	8	28518	28525	25 %	25 %	0 %	50 %	187476536
514	NC_010645	CGAT	2	8	28603	28610	25 %	25 %	25 %	25 %	187476536
515	NC_010645	CCG	2	6	28614	28619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
516	NC_010645	CGT	2	6	28656	28661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
517	NC_010645	GAC	2	6	28665	28670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
518	NC_010645	TGA	2	6	28702	28707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
519	NC_010645	AAGA	2	8	28797	28804	75 %	0 %	25 %	0 %	187476536
520	NC_010645	AAC	2	6	28836	28841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187476536
521	NC_010645	GAA	2	6	28845	28850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476536
522	NC_010645	CGC	2	6	28877	28882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
523	NC_010645	GTG	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
524	NC_010645	ACC	2	6	28905	28910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187476536
525	NC_010645	TCACG	2	10	28937	28946	20 %	20 %	20 %	40 %	187476536
526	NC_010645	CGT	2	6	29059	29064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
527	NC_010645	ATT	2	6	29100	29105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187476536
528	NC_010645	TCG	2	6	29137	29142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
529	NC_010645	CGA	2	6	29225	29230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
530	NC_010645	GTG	2	6	29283	29288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
531	NC_010645	TCG	2	6	29329	29334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
532	NC_010645	CCG	2	6	29374	29379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
533	NC_010645	CTG	2	6	29407	29412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
534	NC_010645	CTGG	2	8	29418	29425	0 %	25 %	50 %	25 %	187476536
535	NC_010645	CGT	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476536
536	NC_010645	TTC	2	6	29457	29462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187476536
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538	NC_010645	AAGG	2	8	29526	29533	50 %	0 %	50 %	0 %	187476536
539	NC_010645	GAT	2	6	29567	29572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
540	NC_010645	GTTGAA	2	12	29577	29588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187476536
541	NC_010645	TGG	2	6	29606	29611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476536
542	NC_010645	TCGCG	2	10	29631	29640	0 %	20 %	40 %	40 %	187476536
543	NC_010645	GAC	2	6	29658	29663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476536
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545	NC_010645	ATC	2	6	29682	29687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476536
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547	NC_010645	CGC	2	6	29822	29827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476536
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549	NC_010645	CGG	2	6	30002	30007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476537
550	NC_010645	ACG	2	6	30013	30018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476537
551	NC_010645	CGA	2	6	30026	30031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476537
552	NC_010645	CGG	2	6	30036	30041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476537
553	NC_010645	GAA	2	6	30183	30188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476537
554	NC_010645	GCG	2	6	30202	30207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187476537
555	NC_010645	TGG	2	6	30227	30232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476537
556	NC_010645	GCT	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
557	NC_010645	CTG	2	6	30277	30282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
558	NC_010645	GCC	2	6	30284	30289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476537
559	NC_010645	CAT	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187476537
560	NC_010645	GAC	2	6	30340	30345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187476537
561	NC_010645	GCT	2	6	30351	30356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
562	NC_010645	TGG	2	6	30362	30367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187476537
563	NC_010645	CTG	2	6	30385	30390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476537
564	NC_010645	GCTG	2	8	30495	30502	0 %	25 %	50 %	25 %	187476537
565	NC_010645	GTTC	2	8	30548	30555	0 %	50 %	25 %	25 %	187476537
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591	NC_010645	CG	3	6	32167	32172	0 %	0 %	50 %	50 %	187476539
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621	NC_010645	CGC	2	6	33656	33661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187476542
622	NC_010645	AGA	2	6	33673	33678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187476542
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626	NC_010645	CTG	2	6	33843	33848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187476542
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751	NC_010645	TGCG	2	8	41479	41486	0 %	25 %	50 %	25 %	187476553
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753	NC_010645	TGATT	2	10	41648	41657	20 %	60 %	20 %	0 %	187476554
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