MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010581	CTATGG	2	12	850720	850731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182677750
15002	NC_010581	CGA	2	6	850741	850746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677750
15003	NC_010581	GC	4	8	850750	850757	0 %	0 %	50 %	50 %	182677750
15004	NC_010581	TCA	2	6	850788	850793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677750
15005	NC_010581	TCG	2	6	850866	850871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677750
15006	NC_010581	CG	3	6	850887	850892	0 %	0 %	50 %	50 %	182677750
15007	NC_010581	GCT	2	6	850951	850956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677750
15008	NC_010581	CTT	2	6	850975	850980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677750
15009	NC_010581	CTC	2	6	850988	850993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677750
15010	NC_010581	CGG	2	6	851005	851010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677750
15011	NC_010581	CG	3	6	851025	851030	0 %	0 %	50 %	50 %	182677750
15012	NC_010581	TGA	2	6	851036	851041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677750
15013	NC_010581	CTG	2	6	851074	851079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15014	NC_010581	CTG	2	6	851092	851097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15015	NC_010581	GCG	2	6	851102	851107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677751
15016	NC_010581	CGT	2	6	851142	851147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15017	NC_010581	TTA	2	6	851181	851186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677751
15018	NC_010581	TGC	2	6	851208	851213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15019	NC_010581	T	6	6	851218	851223	0 %	100 %	0 %	0 %	182677751
15020	NC_010581	ATT	2	6	851275	851280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677751
15021	NC_010581	TCG	2	6	851282	851287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15022	NC_010581	GCA	2	6	851397	851402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677751
15023	NC_010581	GCG	2	6	851437	851442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677751
15024	NC_010581	GC	3	6	851571	851576	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15025	NC_010581	GGC	2	6	851609	851614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677752
15026	NC_010581	CG	3	6	851629	851634	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15027	NC_010581	GC	3	6	851719	851724	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15028	NC_010581	CG	3	6	851791	851796	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15029	NC_010581	TTG	2	6	851916	851921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677752
15030	NC_010581	TCG	2	6	851946	851951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677752
15031	NC_010581	TGC	2	6	851980	851985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677752
15032	NC_010581	GCCG	2	8	852023	852030	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15033	NC_010581	AG	3	6	852118	852123	50 %	0 %	50 %	0 %	182677752
15034	NC_010581	GCCCAT	2	12	852128	852139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182677752
15035	NC_010581	AGA	2	6	852180	852185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677752
15036	NC_010581	CGG	2	6	852194	852199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677752
15037	NC_010581	CG	3	6	852231	852236	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15038	NC_010581	ACG	2	6	852237	852242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677752
15039	NC_010581	CG	3	6	852261	852266	0 %	0 %	50 %	50 %	182677752
15040	NC_010581	CCGCG	2	10	852391	852400	0 %	0 %	40 %	60 %	182677752
15041	NC_010581	CGG	2	6	852416	852421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677752
15042	NC_010581	GAC	2	6	852470	852475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677752
15043	NC_010581	AAT	2	6	852493	852498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677752
15044	NC_010581	CTC	2	6	852650	852655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677752
15045	NC_010581	AGGG	2	8	852672	852679	25 %	0 %	75 %	0 %	182677752
15046	NC_010581	TCG	2	6	852691	852696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677752
15047	NC_010581	CGGGGG	2	12	852700	852711	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	182677752
15048	NC_010581	A	6	6	853030	853035	100 %	0 %	0 %	0 %	182677753
15049	NC_010581	CCTTT	2	10	853046	853055	0 %	60 %	0 %	40 %	182677753
15050	NC_010581	GCA	2	6	853092	853097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677753
15051	NC_010581	CAGGC	2	10	853159	853168	20 %	0 %	40 %	40 %	182677753
15052	NC_010581	CGG	2	6	853369	853374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677753
15053	NC_010581	A	6	6	853383	853388	100 %	0 %	0 %	0 %	182677753
15054	NC_010581	GGC	2	6	853559	853564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677753
15055	NC_010581	GCCGC	2	10	853596	853605	0 %	0 %	40 %	60 %	182677753
15056	NC_010581	CCGG	2	8	853618	853625	0 %	0 %	50 %	50 %	182677753
15057	NC_010581	TCCCAT	2	12	853661	853672	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	182677753
15058	NC_010581	ATC	2	6	853708	853713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677753
15059	NC_010581	TGC	2	6	853720	853725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677753
15060	NC_010581	CG	3	6	854063	854068	0 %	0 %	50 %	50 %	182677754
15061	NC_010581	GTTA	2	8	854075	854082	25 %	50 %	25 %	0 %	182677754
15062	NC_010581	TATTC	2	10	854202	854211	20 %	60 %	0 %	20 %	182677754
15063	NC_010581	AGC	2	6	854260	854265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677754
15064	NC_010581	CGG	2	6	854328	854333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677754
15065	NC_010581	TTG	2	6	854406	854411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677754
15066	NC_010581	GTCA	2	8	854488	854495	25 %	25 %	25 %	25 %	182677755
15067	NC_010581	CCG	2	6	854616	854621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677755
15068	NC_010581	CGA	2	6	854836	854841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677756
15069	NC_010581	TCA	2	6	854940	854945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677756
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15072	NC_010581	GCG	2	6	855499	855504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677756
15073	NC_010581	CAAGGA	2	12	855590	855601	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	182677756
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15075	NC_010581	CGA	2	6	855722	855727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677756
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15079	NC_010581	GA	3	6	855887	855892	50 %	0 %	50 %	0 %	182677757
15080	NC_010581	A	6	6	855892	855897	100 %	0 %	0 %	0 %	182677757
15081	NC_010581	CGA	2	6	855912	855917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677757
15082	NC_010581	CGC	2	6	855995	856000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677757
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15088	NC_010581	TCTCC	2	10	856352	856361	0 %	40 %	0 %	60 %	182677757
15089	NC_010581	CGT	2	6	856446	856451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677757
15090	NC_010581	GTC	2	6	856524	856529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677757
15091	NC_010581	CCG	2	6	856574	856579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677757
15092	NC_010581	GCAA	2	8	856801	856808	50 %	0 %	25 %	25 %	182677757
15093	NC_010581	TCG	2	6	856837	856842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677757
15094	NC_010581	ATC	2	6	856876	856881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677757
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15098	NC_010581	ACT	2	6	857039	857044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677758
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15100	NC_010581	TTG	2	6	857096	857101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677758
15101	NC_010581	GGC	2	6	857109	857114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677758
15102	NC_010581	CAT	2	6	857145	857150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677758
15103	NC_010581	ATC	2	6	857335	857340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677758
15104	NC_010581	TCCG	2	8	857362	857369	0 %	25 %	25 %	50 %	182677758
15105	NC_010581	CTCG	2	8	857417	857424	0 %	25 %	25 %	50 %	182677758
15106	NC_010581	GCG	2	6	857454	857459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677758
15107	NC_010581	CG	3	6	857486	857491	0 %	0 %	50 %	50 %	182677758
15108	NC_010581	ATATT	2	10	857495	857504	40 %	60 %	0 %	0 %	182677758
15109	NC_010581	TTTC	2	8	857596	857603	0 %	75 %	0 %	25 %	182677758
15110	NC_010581	CAT	2	6	857604	857609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677758
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15112	NC_010581	TCAA	2	8	857783	857790	50 %	25 %	0 %	25 %	182677758
15113	NC_010581	CTGG	2	8	857838	857845	0 %	25 %	50 %	25 %	182677758
15114	NC_010581	GATC	2	8	857847	857854	25 %	25 %	25 %	25 %	182677758
15115	NC_010581	AGA	3	9	857876	857884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677758
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15117	NC_010581	TCT	2	6	857943	857948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677758
15118	NC_010581	GGC	2	6	858086	858091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677758
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15120	NC_010581	CTA	2	6	858126	858131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677758
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15231	NC_010581	TTCA	2	8	863503	863510	25 %	50 %	0 %	25 %	182677762
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15233	NC_010581	CCTG	2	8	863607	863614	0 %	25 %	25 %	50 %	182677762
15234	NC_010581	GCG	2	6	863630	863635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677762
15235	NC_010581	GGCC	2	8	863640	863647	0 %	0 %	50 %	50 %	182677762
15236	NC_010581	TTCA	2	8	863695	863702	25 %	50 %	0 %	25 %	182677762
15237	NC_010581	CG	3	6	863732	863737	0 %	0 %	50 %	50 %	182677762
15238	NC_010581	CGT	2	6	863788	863793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677762
15239	NC_010581	ATGGCG	2	12	863794	863805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182677762
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