MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010581	GCGG	2	8	620984	620991	0 %	0 %	75 %	25 %	182677555
11002	NC_010581	CG	3	6	621002	621007	0 %	0 %	50 %	50 %	182677555
11003	NC_010581	TTG	2	6	621008	621013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677555
11004	NC_010581	GGA	2	6	621039	621044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677555
11005	NC_010581	ACG	2	6	621081	621086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677555
11006	NC_010581	GC	3	6	621130	621135	0 %	0 %	50 %	50 %	182677555
11007	NC_010581	TCA	2	6	621147	621152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677555
11008	NC_010581	GGC	2	6	621236	621241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677555
11009	NC_010581	GGC	2	6	621341	621346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677555
11010	NC_010581	AATG	2	8	621553	621560	50 %	25 %	25 %	0 %	182677556
11011	NC_010581	GCA	2	6	621592	621597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11012	NC_010581	TGA	2	6	621598	621603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677556
11013	NC_010581	CGA	2	6	621610	621615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11014	NC_010581	ACCAA	2	10	621671	621680	60 %	0 %	0 %	40 %	182677556
11015	NC_010581	TGG	2	6	621682	621687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677556
11016	NC_010581	CGA	3	9	621697	621705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11017	NC_010581	GGA	2	6	621743	621748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677556
11018	NC_010581	GGC	3	9	621752	621760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11019	NC_010581	CCG	2	6	621810	621815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11020	NC_010581	AGCC	2	8	621861	621868	25 %	0 %	25 %	50 %	182677556
11021	NC_010581	GAA	2	6	621881	621886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677556
11022	NC_010581	GGC	2	6	621974	621979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11023	NC_010581	CCG	2	6	622129	622134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11024	NC_010581	CCG	2	6	622141	622146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11025	NC_010581	GGC	2	6	622161	622166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11026	NC_010581	CCG	2	6	622339	622344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11027	NC_010581	GCG	2	6	622353	622358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11028	NC_010581	AGGC	2	8	622455	622462	25 %	0 %	50 %	25 %	182677556
11029	NC_010581	GCG	2	6	622476	622481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11030	NC_010581	CGA	2	6	622489	622494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11031	NC_010581	AAGGC	2	10	622539	622548	40 %	0 %	40 %	20 %	182677556
11032	NC_010581	CCG	2	6	622561	622566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11033	NC_010581	GGC	2	6	622601	622606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11034	NC_010581	GGC	2	6	622648	622653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11035	NC_010581	TGACC	2	10	622666	622675	20 %	20 %	20 %	40 %	182677556
11036	NC_010581	CGG	2	6	622693	622698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11037	NC_010581	ACG	2	6	622707	622712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11038	NC_010581	GC	3	6	622714	622719	0 %	0 %	50 %	50 %	182677556
11039	NC_010581	CGG	2	6	622840	622845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677556
11040	NC_010581	AAG	2	6	622854	622859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677556
11041	NC_010581	AGC	2	6	622881	622886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11042	NC_010581	GCC	2	6	622894	622899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11043	NC_010581	TGA	3	9	622984	622992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677556
11044	NC_010581	GCC	2	6	623043	623048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677556
11045	NC_010581	CAC	2	6	623078	623083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677556
11046	NC_010581	AGCA	2	8	623154	623161	50 %	0 %	25 %	25 %	182677556
11047	NC_010581	GAT	2	6	623162	623167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677556
11048	NC_010581	CTG	2	6	623182	623187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677556
11049	NC_010581	ATTG	2	8	623197	623204	25 %	50 %	25 %	0 %	182677556
11050	NC_010581	TTG	2	6	623222	623227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677556
11051	NC_010581	ATA	2	6	623232	623237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677556
11052	NC_010581	GCC	2	6	623511	623516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677557
11053	NC_010581	GCT	2	6	623522	623527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677557
11054	NC_010581	TGA	2	6	623543	623548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677557
11055	NC_010581	AGGCCG	2	12	623635	623646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182677557
11056	NC_010581	GC	3	6	623655	623660	0 %	0 %	50 %	50 %	182677557
11057	NC_010581	TCG	2	6	623680	623685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677557
11058	NC_010581	CG	3	6	623717	623722	0 %	0 %	50 %	50 %	182677557
11059	NC_010581	GCG	2	6	623749	623754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677557
11060	NC_010581	GCCCGC	2	12	623767	623778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677557
11061	NC_010581	GC	3	6	623777	623782	0 %	0 %	50 %	50 %	182677557
11062	NC_010581	GCA	2	6	623801	623806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677557
11063	NC_010581	GGC	2	6	623809	623814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677557
11064	NC_010581	TCG	2	6	623827	623832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677557
11065	NC_010581	CCGTCG	2	12	623872	623883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182677557
11066	NC_010581	GCAG	2	8	623890	623897	25 %	0 %	50 %	25 %	182677557
11067	NC_010581	AG	3	6	624141	624146	50 %	0 %	50 %	0 %	182677558
11068	NC_010581	CCAT	2	8	624205	624212	25 %	25 %	0 %	50 %	182677558
11069	NC_010581	GC	3	6	624360	624365	0 %	0 %	50 %	50 %	182677558
11070	NC_010581	CG	3	6	624388	624393	0 %	0 %	50 %	50 %	182677558
11071	NC_010581	GAAGG	2	10	624478	624487	40 %	0 %	60 %	0 %	182677558
11072	NC_010581	TTC	2	6	624675	624680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677559
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11075	NC_010581	CGG	2	6	624888	624893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677559
11076	NC_010581	GCC	2	6	624946	624951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677559
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11078	NC_010581	TTG	2	6	625104	625109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677559
11079	NC_010581	CAGC	2	8	625128	625135	25 %	0 %	25 %	50 %	182677559
11080	NC_010581	TGA	2	6	625254	625259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677559
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11082	NC_010581	GAA	2	6	625303	625308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677559
11083	NC_010581	GGA	2	6	625362	625367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677559
11084	NC_010581	TGA	2	6	625488	625493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677559
11085	NC_010581	AG	3	6	625502	625507	50 %	0 %	50 %	0 %	182677559
11086	NC_010581	GGC	2	6	625528	625533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677559
11087	NC_010581	GAA	2	6	625549	625554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677559
11088	NC_010581	GAT	2	6	625564	625569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677559
11089	NC_010581	GCG	2	6	625581	625586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677559
11090	NC_010581	CATC	2	8	625599	625606	25 %	25 %	0 %	50 %	182677559
11091	NC_010581	ACG	2	6	625709	625714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677559
11092	NC_010581	CGC	2	6	625725	625730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677559
11093	NC_010581	GGCA	2	8	625930	625937	25 %	0 %	50 %	25 %	182677559
11094	NC_010581	ACG	2	6	625958	625963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677559
11095	NC_010581	ATC	2	6	625967	625972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677559
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11098	NC_010581	CGT	2	6	626791	626796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677560
11099	NC_010581	GC	3	6	626839	626844	0 %	0 %	50 %	50 %	182677560
11100	NC_010581	CCG	2	6	626904	626909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677560
11101	NC_010581	AAGG	2	8	626918	626925	50 %	0 %	50 %	0 %	182677560
11102	NC_010581	GGC	2	6	626962	626967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677560
11103	NC_010581	GCG	2	6	627065	627070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677560
11104	NC_010581	GCC	2	6	627074	627079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677560
11105	NC_010581	GGC	2	6	627136	627141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677560
11106	NC_010581	ATC	2	6	627155	627160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677560
11107	NC_010581	GC	4	8	627295	627302	0 %	0 %	50 %	50 %	182677560
11108	NC_010581	GCC	3	9	627311	627319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677560
11109	NC_010581	GGT	2	6	627320	627325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677560
11110	NC_010581	C	6	6	627347	627352	0 %	0 %	0 %	100 %	182677560
11111	NC_010581	GGC	2	6	627373	627378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677560
11112	NC_010581	GCC	2	6	627397	627402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677560
11113	NC_010581	ATT	2	6	627418	627423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677560
11114	NC_010581	TCAT	2	8	627435	627442	25 %	50 %	0 %	25 %	182677560
11115	NC_010581	GGCG	2	8	627448	627455	0 %	0 %	75 %	25 %	182677560
11116	NC_010581	CAT	2	6	627503	627508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677560
11117	NC_010581	TGG	2	6	627532	627537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677560
11118	NC_010581	TCGCTC	2	12	627564	627575	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182677560
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11120	NC_010581	GC	3	6	627701	627706	0 %	0 %	50 %	50 %	182677560
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11480	NC_010581	ATG	2	6	646591	646596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677577
11481	NC_010581	GGCC	2	8	646622	646629	0 %	0 %	50 %	50 %	182677577
11482	NC_010581	CGC	2	6	646634	646639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677577
11483	NC_010581	GCG	3	9	646699	646707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677577
11484	NC_010581	GCG	3	9	646732	646740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677577
11485	NC_010581	ATG	2	6	646768	646773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677577
11486	NC_010581	GGC	2	6	646783	646788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677577
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11491	NC_010581	GCG	2	6	647015	647020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677577
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11499	NC_010581	CGA	2	6	647650	647655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677578
11500	NC_010581	ATG	2	6	647682	647687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677578

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