MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_010581	CAC	2	6	3552418	3552423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680008
61002	NC_010581	TGC	2	6	3552441	3552446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680008
61003	NC_010581	CGG	2	6	3552479	3552484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680008
61004	NC_010581	GGC	3	9	3552511	3552519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680008
61005	NC_010581	GCC	2	6	3552523	3552528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680008
61006	NC_010581	TGA	2	6	3553435	3553440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680009
61007	NC_010581	TTC	2	6	3553554	3553559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680009
61008	NC_010581	CCA	2	6	3553569	3553574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680009
61009	NC_010581	CTG	2	6	3553666	3553671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680009
61010	NC_010581	GCG	2	6	3553685	3553690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680009
61011	NC_010581	GCC	2	6	3553754	3553759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680010
61012	NC_010581	CGGG	2	8	3553820	3553827	0 %	0 %	75 %	25 %	182680010
61013	NC_010581	TCT	2	6	3553832	3553837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680010
61014	NC_010581	TGG	2	6	3553925	3553930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680010
61015	NC_010581	GCC	2	6	3554022	3554027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680010
61016	NC_010581	TTGGCT	2	12	3554068	3554079	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	182680010
61017	NC_010581	T	6	6	3554138	3554143	0 %	100 %	0 %	0 %	182680010
61018	NC_010581	TCG	2	6	3554174	3554179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680010
61019	NC_010581	ACG	2	6	3554218	3554223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680010
61020	NC_010581	CGG	2	6	3554282	3554287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680010
61021	NC_010581	TCGCCT	2	12	3554333	3554344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182680010
61022	NC_010581	CGG	2	6	3554418	3554423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680010
61023	NC_010581	ATC	2	6	3554677	3554682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680011
61024	NC_010581	AAT	2	6	3554688	3554693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182680011
61025	NC_010581	TCGC	2	8	3554771	3554778	0 %	25 %	25 %	50 %	182680011
61026	NC_010581	TTCT	2	8	3554904	3554911	0 %	75 %	0 %	25 %	182680011
61027	NC_010581	CG	4	8	3554936	3554943	0 %	0 %	50 %	50 %	182680011
61028	NC_010581	GAG	2	6	3555054	3555059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680011
61029	NC_010581	GCCG	2	8	3555156	3555163	0 %	0 %	50 %	50 %	182680011
61030	NC_010581	CG	4	8	3555169	3555176	0 %	0 %	50 %	50 %	182680011
61031	NC_010581	CCGAT	2	10	3555309	3555318	20 %	20 %	20 %	40 %	182680012
61032	NC_010581	CG	3	6	3555380	3555385	0 %	0 %	50 %	50 %	182680012
61033	NC_010581	GA	3	6	3555500	3555505	50 %	0 %	50 %	0 %	182680012
61034	NC_010581	GCC	2	6	3555526	3555531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680012
61035	NC_010581	ACG	2	6	3555535	3555540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680012
61036	NC_010581	GCG	2	6	3555800	3555805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680013
61037	NC_010581	TCG	2	6	3555870	3555875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680013
61038	NC_010581	CAC	2	6	3555910	3555915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680013
61039	NC_010581	CCA	2	6	3556072	3556077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680013
61040	NC_010581	TGA	2	6	3556078	3556083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680013
61041	NC_010581	GAT	2	6	3556157	3556162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680013
61042	NC_010581	GGC	2	6	3556201	3556206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680013
61043	NC_010581	ATT	2	6	3556268	3556273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680013
61044	NC_010581	CGC	2	6	3556286	3556291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680013
61045	NC_010581	GCGA	2	8	3556299	3556306	25 %	0 %	50 %	25 %	182680013
61046	NC_010581	GC	3	6	3556325	3556330	0 %	0 %	50 %	50 %	182680013
61047	NC_010581	GTC	2	6	3556373	3556378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680013
61048	NC_010581	GAT	2	6	3556429	3556434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680013
61049	NC_010581	GCG	2	6	3556605	3556610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680013
61050	NC_010581	A	6	6	3556710	3556715	100 %	0 %	0 %	0 %	182680013
61051	NC_010581	GAC	2	6	3556784	3556789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680013
61052	NC_010581	CGA	2	6	3556837	3556842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680013
61053	NC_010581	GGC	2	6	3556844	3556849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680013
61054	NC_010581	GCGCCC	2	12	3556869	3556880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680013
61055	NC_010581	TCG	2	6	3557191	3557196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680014
61056	NC_010581	CAAGG	2	10	3557204	3557213	40 %	0 %	40 %	20 %	182680014
61057	NC_010581	CGA	2	6	3557215	3557220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680014
61058	NC_010581	CAGC	2	8	3557266	3557273	25 %	0 %	25 %	50 %	182680014
61059	NC_010581	CG	3	6	3557293	3557298	0 %	0 %	50 %	50 %	182680014
61060	NC_010581	CG	3	6	3557310	3557315	0 %	0 %	50 %	50 %	182680014
61061	NC_010581	ACC	2	6	3557367	3557372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680014
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61067	NC_010581	CG	3	6	3557931	3557936	0 %	0 %	50 %	50 %	182680015
61068	NC_010581	T	6	6	3557967	3557972	0 %	100 %	0 %	0 %	182680015
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61074	NC_010581	CAGCG	2	10	3558236	3558245	20 %	0 %	40 %	40 %	182680015
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61085	NC_010581	GGA	2	6	3558949	3558954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680016
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61096	NC_010581	GCCG	2	8	3559373	3559380	0 %	0 %	50 %	50 %	182680016
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61100	NC_010581	CGCT	2	8	3559634	3559641	0 %	25 %	25 %	50 %	182680016
61101	NC_010581	CGCC	2	8	3559672	3559679	0 %	0 %	25 %	75 %	182680016
61102	NC_010581	TGA	2	6	3559719	3559724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680016
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61110	NC_010581	AGC	2	6	3559997	3560002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680017
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61114	NC_010581	CCCTG	2	10	3560082	3560091	0 %	20 %	20 %	60 %	182680017
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61116	NC_010581	TCG	2	6	3560189	3560194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680017
61117	NC_010581	TCTCGT	2	12	3560238	3560249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182680017
61118	NC_010581	CAA	2	6	3560271	3560276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680017
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61219	NC_010581	GCG	2	6	3566397	3566402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680024
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61224	NC_010581	GC	3	6	3566924	3566929	0 %	0 %	50 %	50 %	182680026
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61233	NC_010581	TCG	2	6	3567249	3567254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680026
61234	NC_010581	GTA	2	6	3567260	3567265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680026
61235	NC_010581	GAT	2	6	3567272	3567277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680026
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61465	NC_010581	AGCG	2	8	3578098	3578105	25 %	0 %	50 %	25 %	182680035
61466	NC_010581	GCAT	2	8	3578343	3578350	25 %	25 %	25 %	25 %	182680036
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