MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 71622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_010581	CTG	2	6	3203687	3203692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55003	NC_010581	GC	4	8	3203693	3203700	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55004	NC_010581	CG	3	6	3203729	3203734	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55005	NC_010581	CAA	2	6	3203795	3203800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182679724
55006	NC_010581	CGAG	2	8	3203815	3203822	25 %	0 %	50 %	25 %	182679724
55007	NC_010581	CTT	2	6	3203839	3203844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679724
55008	NC_010581	GCA	2	6	3203908	3203913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55009	NC_010581	GTG	2	6	3203928	3203933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182679724
55010	NC_010581	GC	3	6	3203939	3203944	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55011	NC_010581	GC	3	6	3204015	3204020	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55012	NC_010581	ATA	2	6	3204056	3204061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182679724
55013	NC_010581	CAG	2	6	3204076	3204081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55014	NC_010581	GC	4	8	3204083	3204090	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55015	NC_010581	CG	3	6	3204203	3204208	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55016	NC_010581	GC	3	6	3204209	3204214	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55017	NC_010581	TCG	3	9	3204226	3204234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55018	NC_010581	GCC	2	6	3204241	3204246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679724
55019	NC_010581	CGA	2	6	3204259	3204264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55020	NC_010581	ATCG	2	8	3204273	3204280	25 %	25 %	25 %	25 %	182679724
55021	NC_010581	GCA	2	6	3204430	3204435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55022	NC_010581	ATC	2	6	3204500	3204505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679724
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55025	NC_010581	GC	5	10	3204525	3204534	0 %	0 %	50 %	50 %	182679724
55026	NC_010581	CTTG	2	8	3204573	3204580	0 %	50 %	25 %	25 %	182679724
55027	NC_010581	CAG	2	6	3204608	3204613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55028	NC_010581	TCG	2	6	3204630	3204635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679724
55029	NC_010581	AGGA	2	8	3204659	3204666	50 %	0 %	50 %	0 %	182679724
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55033	NC_010581	GGC	2	6	3204877	3204882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679725
55034	NC_010581	TCG	2	6	3204932	3204937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679725
55035	NC_010581	AG	3	6	3205001	3205006	50 %	0 %	50 %	0 %	182679725
55036	NC_010581	GC	3	6	3205043	3205048	0 %	0 %	50 %	50 %	182679725
55037	NC_010581	AAT	2	6	3205102	3205107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182679725
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55039	NC_010581	ATG	2	6	3205171	3205176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679725
55040	NC_010581	AG	3	6	3205223	3205228	50 %	0 %	50 %	0 %	182679725
55041	NC_010581	GCC	2	6	3205242	3205247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679725
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55051	NC_010581	CG	3	6	3205766	3205771	0 %	0 %	50 %	50 %	182679726
55052	NC_010581	TGA	2	6	3205807	3205812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679726
55053	NC_010581	GCG	3	9	3205816	3205824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679726
55054	NC_010581	TCG	3	9	3205834	3205842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679726
55055	NC_010581	CAT	2	6	3205874	3205879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679726
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55117	NC_010581	ATC	2	6	3209745	3209750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679730
55118	NC_010581	CTT	2	6	3209768	3209773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182679730
55119	NC_010581	GACC	2	8	3209810	3209817	25 %	0 %	25 %	50 %	182679730
55120	NC_010581	TGC	2	6	3209945	3209950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679730
55121	NC_010581	TC	3	6	3210005	3210010	0 %	50 %	0 %	50 %	182679730
55122	NC_010581	CGA	2	6	3210029	3210034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679730
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55125	NC_010581	CGGCCT	2	12	3210131	3210142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182679730
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55143	NC_010581	TCC	2	6	3211029	3211034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679732
55144	NC_010581	ATCC	2	8	3211077	3211084	25 %	25 %	0 %	50 %	182679732
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55214	NC_010581	GA	3	6	3214407	3214412	50 %	0 %	50 %	0 %	182679733
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55224	NC_010581	CATCGC	2	12	3214619	3214630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182679733
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55229	NC_010581	CGC	2	6	3214710	3214715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679733
55230	NC_010581	GCC	2	6	3214719	3214724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679733
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55347	NC_010581	ATC	2	6	3220194	3220199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679737
55348	NC_010581	CCG	2	6	3220324	3220329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679737
55349	NC_010581	CCAC	2	8	3220348	3220355	25 %	0 %	0 %	75 %	182679737
55350	NC_010581	GCG	2	6	3220374	3220379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679737
55351	NC_010581	ATC	2	6	3220386	3220391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679737
55352	NC_010581	GGC	2	6	3220442	3220447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679738
55353	NC_010581	ATC	2	6	3220472	3220477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679738
55354	NC_010581	GAT	2	6	3220499	3220504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679738
55355	NC_010581	TGA	2	6	3220513	3220518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679738
55356	NC_010581	GCG	2	6	3220521	3220526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679738
55357	NC_010581	CCG	2	6	3220531	3220536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679738
55358	NC_010581	GCA	2	6	3220559	3220564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679738
55359	NC_010581	A	6	6	3220615	3220620	100 %	0 %	0 %	0 %	182679738
55360	NC_010581	CG	3	6	3220667	3220672	0 %	0 %	50 %	50 %	182679738
55361	NC_010581	GCC	2	6	3220691	3220696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679738
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55365	NC_010581	TCGG	2	8	3220899	3220906	0 %	25 %	50 %	25 %	182679738
55366	NC_010581	GCC	2	6	3220960	3220965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679738
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55369	NC_010581	GCC	2	6	3221100	3221105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679738
55370	NC_010581	CGA	2	6	3221209	3221214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679738
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55374	NC_010581	CCG	2	6	3221305	3221310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679738
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55378	NC_010581	CCA	2	6	3221490	3221495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679738
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55380	NC_010581	CCT	2	6	3221544	3221549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679739
55381	NC_010581	CGA	2	6	3221586	3221591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679739
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55383	NC_010581	CGC	2	6	3221630	3221635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679739
55384	NC_010581	TGC	2	6	3221741	3221746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182679739
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55389	NC_010581	CAC	2	6	3222016	3222021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182679739
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55452	NC_010581	GCGCC	2	10	3225026	3225035	0 %	0 %	40 %	60 %	182679742
55453	NC_010581	AGCA	2	8	3225036	3225043	50 %	0 %	25 %	25 %	182679742
55454	NC_010581	GGC	2	6	3225096	3225101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679742
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55460	NC_010581	CA	3	6	3225438	3225443	50 %	0 %	0 %	50 %	182679742
55461	NC_010581	CGA	2	6	3225617	3225622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679742
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55463	NC_010581	CCAT	2	8	3225705	3225712	25 %	25 %	0 %	50 %	182679742
55464	NC_010581	TGA	2	6	3225713	3225718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679742
55465	NC_010581	CGG	2	6	3225728	3225733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679742
55466	NC_010581	GCC	2	6	3225863	3225868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679743
55467	NC_010581	CG	3	6	3225961	3225966	0 %	0 %	50 %	50 %	182679743
55468	NC_010581	GGC	2	6	3225977	3225982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679743
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55479	NC_010581	ATC	2	6	3226506	3226511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182679743
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55482	NC_010581	GCG	2	6	3226573	3226578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679743
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55490	NC_010581	GC	3	6	3226825	3226830	0 %	0 %	50 %	50 %	182679743
55491	NC_010581	CGA	2	6	3226837	3226842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182679743
55492	NC_010581	GATC	2	8	3226888	3226895	25 %	25 %	25 %	25 %	182679743
55493	NC_010581	ATTCC	2	10	3226901	3226910	20 %	40 %	0 %	40 %	182679743
55494	NC_010581	CGC	2	6	3226911	3226916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182679743
55495	NC_010581	ATG	2	6	3226950	3226955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182679743
55496	NC_010581	CCT	2	6	3226963	3226968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182679743
55497	NC_010581	GC	3	6	3227034	3227039	0 %	0 %	50 %	50 %	182679743
55498	NC_010581	CGG	2	6	3227095	3227100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679743
55499	NC_010581	TC	3	6	3227566	3227571	0 %	50 %	0 %	50 %	182679744
55500	NC_010581	GCG	2	6	3227579	3227584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182679744

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