MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND02

Total Repeats: 950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010578	TC	3	6	614	619	0 %	50 %	0 %	50 %	182676786
2	NC_010578	CGT	2	6	654	659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676786
3	NC_010578	CGA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676786
4	NC_010578	CAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676786
5	NC_010578	TCA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676786
6	NC_010578	TCG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676786
7	NC_010578	AC	3	6	899	904	50 %	0 %	0 %	50 %	182676786
8	NC_010578	GCCA	2	8	916	923	25 %	0 %	25 %	50 %	182676786
9	NC_010578	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676786
10	NC_010578	G	6	6	1021	1026	0 %	0 %	100 %	0 %	182676786
11	NC_010578	TGG	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676786
12	NC_010578	CAAC	2	8	1074	1081	50 %	0 %	0 %	50 %	182676786
13	NC_010578	GTCTT	2	10	1106	1115	0 %	60 %	20 %	20 %	182676786
14	NC_010578	GGC	2	6	1153	1158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676786
15	NC_010578	CGGT	2	8	1222	1229	0 %	25 %	50 %	25 %	182676786
16	NC_010578	TCC	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676786
17	NC_010578	GAA	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676786
18	NC_010578	TGT	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676786
19	NC_010578	CGA	2	6	1738	1743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676787
20	NC_010578	TGG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676787
21	NC_010578	GGC	2	6	1784	1789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676787
22	NC_010578	G	6	6	1810	1815	0 %	0 %	100 %	0 %	182676787
23	NC_010578	GGACA	2	10	1994	2003	40 %	0 %	40 %	20 %	182676787
24	NC_010578	GGC	2	6	2055	2060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676787
25	NC_010578	GCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676787
26	NC_010578	GGAT	2	8	2208	2215	25 %	25 %	50 %	0 %	182676787
27	NC_010578	GAA	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676787
28	NC_010578	CGC	2	6	2271	2276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676787
29	NC_010578	TTC	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676787
30	NC_010578	TGTCC	2	10	2322	2331	0 %	40 %	20 %	40 %	182676787
31	NC_010578	TG	3	6	2394	2399	0 %	50 %	50 %	0 %	182676787
32	NC_010578	AGCC	2	8	2403	2410	25 %	0 %	25 %	50 %	182676787
33	NC_010578	GAT	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676787
34	NC_010578	GCA	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676787
35	NC_010578	GCA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676787
36	NC_010578	GGC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676787
37	NC_010578	GCG	2	6	2655	2660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676787
38	NC_010578	GCC	2	6	2668	2673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676787
39	NC_010578	TCA	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676787
40	NC_010578	TCC	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676788
41	NC_010578	CGG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676788
42	NC_010578	TA	3	6	2803	2808	50 %	50 %	0 %	0 %	182676788
43	NC_010578	CGA	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676788
44	NC_010578	CCG	2	6	2930	2935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676788
45	NC_010578	TCG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676788
46	NC_010578	AC	3	6	3041	3046	50 %	0 %	0 %	50 %	182676788
47	NC_010578	AAG	2	6	3076	3081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676788
48	NC_010578	GCA	2	6	3233	3238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676788
49	NC_010578	GCC	2	6	3275	3280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676788
50	NC_010578	GCG	3	9	3332	3340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676788
51	NC_010578	CG	3	6	3399	3404	0 %	0 %	50 %	50 %	182676788
52	NC_010578	GGA	3	9	3457	3465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676788
53	NC_010578	AAT	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676788
54	NC_010578	GCC	2	6	3503	3508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676788
55	NC_010578	GAT	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676788
56	NC_010578	CGT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676788
57	NC_010578	CGCAAG	2	12	3571	3582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676788
58	NC_010578	AGA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676788
59	NC_010578	CGA	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676788
60	NC_010578	CCA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676788
61	NC_010578	GAT	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676788
62	NC_010578	GCGCG	2	10	3822	3831	0 %	0 %	60 %	40 %	182676788
63	NC_010578	TGA	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676788
64	NC_010578	AAAT	2	8	3959	3966	75 %	25 %	0 %	0 %	182676788
65	NC_010578	GCTCTC	2	12	4216	4227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182676789
66	NC_010578	CG	3	6	4308	4313	0 %	0 %	50 %	50 %	182676789
67	NC_010578	CGA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676789
68	NC_010578	ACC	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182676789
69	NC_010578	CGG	2	6	4669	4674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676789
70	NC_010578	AGA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676789
71	NC_010578	GAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676789
72	NC_010578	GC	3	6	4807	4812	0 %	0 %	50 %	50 %	182676789
73	NC_010578	GTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676789
74	NC_010578	CGA	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676789
75	NC_010578	AGA	2	6	4963	4968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676789
76	NC_010578	GGCC	4	16	5048	5063	0 %	0 %	50 %	50 %	182676789
77	NC_010578	GTT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182676789
78	NC_010578	CTG	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676789
79	NC_010578	AAC	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182676789
80	NC_010578	TCAG	2	8	5229	5236	25 %	25 %	25 %	25 %	182676789
81	NC_010578	GAA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182676789
82	NC_010578	TGGCC	2	10	5332	5341	0 %	20 %	40 %	40 %	182676789
83	NC_010578	CG	3	6	5377	5382	0 %	0 %	50 %	50 %	182676789
84	NC_010578	GC	3	6	5424	5429	0 %	0 %	50 %	50 %	182676789
85	NC_010578	ATG	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676789
86	NC_010578	CAG	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676789
87	NC_010578	ATG	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676790
88	NC_010578	GC	3	6	6173	6178	0 %	0 %	50 %	50 %	182676790
89	NC_010578	TGA	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676790
90	NC_010578	CGC	2	6	6452	6457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676791
91	NC_010578	GCC	2	6	6494	6499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676791
92	NC_010578	TCA	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676791
93	NC_010578	TAT	2	6	6607	6612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676791
94	NC_010578	CAG	2	6	6643	6648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676791
95	NC_010578	ATT	2	6	6687	6692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182676791
96	NC_010578	CGG	2	6	6711	6716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676791
97	NC_010578	TCG	2	6	6792	6797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676791
98	NC_010578	ACT	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676791
99	NC_010578	T	7	7	6872	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	182676791
100	NC_010578	TGC	2	6	6900	6905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676791
101	NC_010578	GAC	2	6	6922	6927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676791
102	NC_010578	ATC	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676791
103	NC_010578	TCT	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676791
104	NC_010578	CG	3	6	7005	7010	0 %	0 %	50 %	50 %	182676791
105	NC_010578	CAT	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676791
106	NC_010578	TCT	2	6	7116	7121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676791
107	NC_010578	GAT	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676791
108	NC_010578	GCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676791
109	NC_010578	TCT	2	6	7173	7178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676791
110	NC_010578	GAC	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676791
111	NC_010578	ATCT	2	8	7286	7293	25 %	50 %	0 %	25 %	182676791
112	NC_010578	CGG	3	9	7395	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676791
113	NC_010578	GGTC	2	8	7451	7458	0 %	25 %	50 %	25 %	182676791
114	NC_010578	CG	3	6	7490	7495	0 %	0 %	50 %	50 %	182676791
115	NC_010578	TAA	2	6	8083	8088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182676792
116	NC_010578	TCA	2	6	8120	8125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676792
117	NC_010578	ACG	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676792
118	NC_010578	TTC	2	6	8182	8187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182676792
119	NC_010578	TCG	2	6	8213	8218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676792
120	NC_010578	CG	3	6	8268	8273	0 %	0 %	50 %	50 %	182676792
121	NC_010578	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676792
122	NC_010578	CGA	2	6	8306	8311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676792
123	NC_010578	AT	3	6	8314	8319	50 %	50 %	0 %	0 %	182676792
124	NC_010578	CT	3	6	8328	8333	0 %	50 %	0 %	50 %	182676792
125	NC_010578	CTG	2	6	8397	8402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676792
126	NC_010578	CCG	2	6	8405	8410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676792
127	NC_010578	GGA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182676792
128	NC_010578	ACG	2	6	8465	8470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676792
129	NC_010578	CCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676792
130	NC_010578	CTC	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676792
131	NC_010578	GAT	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182676792
132	NC_010578	GC	3	6	9021	9026	0 %	0 %	50 %	50 %	182676792
133	NC_010578	TGC	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676792
134	NC_010578	CTG	2	6	9048	9053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676792
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261	NC_010578	GAAT	2	8	18763	18770	50 %	25 %	25 %	0 %	182676796
262	NC_010578	CGG	2	6	18795	18800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676796
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380	NC_010578	TC	3	6	26421	26426	0 %	50 %	0 %	50 %	182676802
381	NC_010578	GCA	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676802
382	NC_010578	GTG	2	6	26444	26449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182676802
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386	NC_010578	GA	4	8	26639	26646	50 %	0 %	50 %	0 %	182676803
387	NC_010578	AGC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
388	NC_010578	C	7	7	26682	26688	0 %	0 %	0 %	100 %	182676803
389	NC_010578	GCTT	2	8	26707	26714	0 %	50 %	25 %	25 %	182676803
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393	NC_010578	GCA	2	6	26927	26932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676803
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421	NC_010578	TGC	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676804
422	NC_010578	AATG	2	8	28548	28555	50 %	25 %	25 %	0 %	182676804
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