MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 plasmid pBMC401

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010553	GAGG	2	8	137816	137823	25 %	0 %	75 %	0 %	172064657
2502	NC_010553	GCC	2	6	137871	137876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064657
2503	NC_010553	GCA	2	6	137877	137882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2504	NC_010553	GAC	2	6	137886	137891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2505	NC_010553	CGT	2	6	138017	138022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2506	NC_010553	GAC	2	6	138051	138056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2507	NC_010553	CAG	2	6	138102	138107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2508	NC_010553	G	6	6	138161	138166	0 %	0 %	100 %	0 %	172064657
2509	NC_010553	CAG	2	6	138180	138185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064657
2510	NC_010553	CAAC	2	8	138268	138275	50 %	0 %	0 %	50 %	172064657
2511	NC_010553	GATGTC	2	12	138326	138337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	172064658
2512	NC_010553	CGG	2	6	138403	138408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064658
2513	NC_010553	GATGCA	2	12	138431	138442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172064658
2514	NC_010553	CGG	2	6	138469	138474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064658
2515	NC_010553	ACGA	2	8	138495	138502	50 %	0 %	25 %	25 %	172064658
2516	NC_010553	CGAC	2	8	138532	138539	25 %	0 %	25 %	50 %	172064658
2517	NC_010553	GAA	2	6	138548	138553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064658
2518	NC_010553	ACC	2	6	138615	138620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064658
2519	NC_010553	CCA	2	6	138625	138630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172064658
2520	NC_010553	TGC	2	6	138682	138687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064658
2521	NC_010553	AGA	2	6	138703	138708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064658
2522	NC_010553	CAT	2	6	138755	138760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064658
2523	NC_010553	AAG	2	6	138888	138893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064659
2524	NC_010553	CCG	2	6	138940	138945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
2525	NC_010553	GCC	2	6	138965	138970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
2526	NC_010553	CAT	2	6	138983	138988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
2527	NC_010553	ACG	2	6	138997	139002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2528	NC_010553	GAG	2	6	139080	139085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064659
2529	NC_010553	CGG	3	9	139126	139134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2530	NC_010553	GC	3	6	139173	139178	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2531	NC_010553	ACG	2	6	139258	139263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2532	NC_010553	CG	3	6	139294	139299	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2533	NC_010553	GAG	2	6	139314	139319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172064659
2534	NC_010553	TCA	2	6	139370	139375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
2535	NC_010553	GGC	2	6	139467	139472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2536	NC_010553	GCC	2	6	139516	139521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
2537	NC_010553	CTA	2	6	139538	139543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064659
2538	NC_010553	CAG	2	6	139556	139561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2539	NC_010553	GGCC	2	8	139577	139584	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2540	NC_010553	CGG	2	6	139616	139621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2541	NC_010553	TGC	2	6	139639	139644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2542	NC_010553	GCGT	2	8	139663	139670	0 %	25 %	50 %	25 %	172064659
2543	NC_010553	ACG	2	6	139677	139682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2544	NC_010553	GCA	2	6	139709	139714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2545	NC_010553	GCT	3	9	139730	139738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2546	NC_010553	CG	3	6	139741	139746	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2547	NC_010553	GCT	2	6	139778	139783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2548	NC_010553	GCG	3	9	139921	139929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2549	NC_010553	GC	3	6	139935	139940	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2550	NC_010553	GC	3	6	139984	139989	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2551	NC_010553	CGGA	2	8	139990	139997	25 %	0 %	50 %	25 %	172064659
2552	NC_010553	GCC	3	9	140001	140009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
2553	NC_010553	CGGC	2	8	140069	140076	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2554	NC_010553	CCG	2	6	140134	140139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064659
2555	NC_010553	ACG	2	6	140161	140166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2556	NC_010553	CG	3	6	140170	140175	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2557	NC_010553	GCA	2	6	140183	140188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2558	NC_010553	TTCG	2	8	140192	140199	0 %	50 %	25 %	25 %	172064659
2559	NC_010553	GCG	2	6	140239	140244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2560	NC_010553	GCCG	2	8	140258	140265	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2561	NC_010553	GCT	2	6	140284	140289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
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2563	NC_010553	GTC	2	6	140424	140429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2564	NC_010553	CG	4	8	140449	140456	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2565	NC_010553	CGGT	2	8	140475	140482	0 %	25 %	50 %	25 %	172064659
2566	NC_010553	GCG	2	6	140539	140544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
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2568	NC_010553	CGG	2	6	140632	140637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
2569	NC_010553	ACG	2	6	140667	140672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2570	NC_010553	AACTGG	2	12	140694	140705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172064659
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2572	NC_010553	CAA	2	6	140852	140857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172064659
2573	NC_010553	TCG	3	9	140880	140888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
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2577	NC_010553	TGC	2	6	141058	141063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
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2579	NC_010553	ACG	2	6	141100	141105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2580	NC_010553	GGC	3	9	141116	141124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064659
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2585	NC_010553	GATGC	2	10	141377	141386	20 %	20 %	40 %	20 %	172064659
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2587	NC_010553	TGA	2	6	141418	141423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172064659
2588	NC_010553	TGC	2	6	141463	141468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2589	NC_010553	GCT	2	6	141503	141508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064659
2590	NC_010553	GC	3	6	141539	141544	0 %	0 %	50 %	50 %	172064659
2591	NC_010553	CG	3	6	141771	141776	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
2592	NC_010553	GC	3	6	141783	141788	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
2593	NC_010553	CGA	2	6	141811	141816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064660
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2596	NC_010553	G	8	8	141935	141942	0 %	0 %	100 %	0 %	172064660
2597	NC_010553	TCA	2	6	141951	141956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064660
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2599	NC_010553	CA	3	6	142062	142067	50 %	0 %	0 %	50 %	172064660
2600	NC_010553	CGA	2	6	142095	142100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064660
2601	NC_010553	GACGG	2	10	142136	142145	20 %	0 %	60 %	20 %	172064660
2602	NC_010553	CGC	2	6	142165	142170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064660
2603	NC_010553	AAG	2	6	142178	142183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064660
2604	NC_010553	CGG	2	6	142192	142197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
2605	NC_010553	GGC	2	6	142273	142278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
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2607	NC_010553	CGT	2	6	142348	142353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064660
2608	NC_010553	ACG	2	6	142425	142430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064660
2609	NC_010553	CGAC	2	8	142467	142474	25 %	0 %	25 %	50 %	172064660
2610	NC_010553	CCGA	2	8	142527	142534	25 %	0 %	25 %	50 %	172064660
2611	NC_010553	GCG	2	6	142536	142541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064660
2612	NC_010553	CG	3	6	142551	142556	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
2613	NC_010553	AAG	2	6	142589	142594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172064660
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2616	NC_010553	GCCG	2	8	142646	142653	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
2617	NC_010553	GTG	2	6	142685	142690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172064660
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2620	NC_010553	GC	3	6	142807	142812	0 %	0 %	50 %	50 %	172064660
2621	NC_010553	GAC	2	6	145790	145795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064661
2622	NC_010553	TCC	3	9	145843	145851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064661
2623	NC_010553	GCC	2	6	145878	145883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064661
2624	NC_010553	CG	3	6	145946	145951	0 %	0 %	50 %	50 %	172064661
2625	NC_010553	CGAC	2	8	146041	146048	25 %	0 %	25 %	50 %	172064661
2626	NC_010553	CAT	2	6	146051	146056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064661
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2631	NC_010553	CTG	2	6	146235	146240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064661
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2644	NC_010553	ACT	2	6	146653	146658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064661
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2730	NC_010553	CCTG	2	8	151901	151908	0 %	25 %	25 %	50 %	172064664
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2742	NC_010553	CGA	2	6	152387	152392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064664
2743	NC_010553	GC	3	6	152439	152444	0 %	0 %	50 %	50 %	172064664
2744	NC_010553	TCC	2	6	152533	152538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172064665
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2746	NC_010553	CGCC	2	8	152565	152572	0 %	0 %	25 %	75 %	172064665
2747	NC_010553	CCAT	2	8	152608	152615	25 %	25 %	0 %	50 %	172064665
2748	NC_010553	CG	3	6	152681	152686	0 %	0 %	50 %	50 %	172064665
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2750	NC_010553	ATC	2	6	152716	152721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064665
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2752	NC_010553	CCG	3	9	152815	152823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172064665
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2755	NC_010553	TCG	2	6	152890	152895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064665
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2773	NC_010553	CTG	2	6	153573	153578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064665
2774	NC_010553	CGA	2	6	153612	153617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064665
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2843	NC_010553	AAAG	2	8	162657	162664	75 %	0 %	25 %	0 %	172064670
2844	NC_010553	TGC	2	6	162681	162686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064670
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2850	NC_010553	GCAAG	2	10	162813	162822	40 %	0 %	40 %	20 %	172064670
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2860	NC_010553	CGGGCA	2	12	163157	163168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	172064670
2861	NC_010553	GCGCG	2	10	163173	163182	0 %	0 %	60 %	40 %	172064670
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2863	NC_010553	TAC	2	6	163204	163209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172064670
2864	NC_010553	TCGC	2	8	163247	163254	0 %	25 %	25 %	50 %	172064670
2865	NC_010553	TGCG	2	8	163363	163370	0 %	25 %	50 %	25 %	172064671
2866	NC_010553	CGG	2	6	163397	163402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064671
2867	NC_010553	TGTGT	2	10	163407	163416	0 %	60 %	40 %	0 %	172064671
2868	NC_010553	TGTCGG	2	12	163421	163432	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	172064671
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2895	NC_010553	TGC	2	6	165136	165141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064672
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2897	NC_010553	TGT	2	6	165200	165205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064672
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2971	NC_010553	TCG	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2972	NC_010553	TCGTTG	2	12	168418	168429	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	172064675
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2974	NC_010553	GGAC	2	8	168465	168472	25 %	0 %	50 %	25 %	172064675
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2982	NC_010553	TG	3	6	168684	168689	0 %	50 %	50 %	0 %	172064675
2983	NC_010553	TTGCC	2	10	168690	168699	0 %	40 %	20 %	40 %	172064675
2984	NC_010553	AAGAT	2	10	168733	168742	60 %	20 %	20 %	0 %	172064675
2985	NC_010553	CGT	2	6	168834	168839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2986	NC_010553	GC	3	6	168880	168885	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
2987	NC_010553	CGA	2	6	168911	168916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2988	NC_010553	TTG	2	6	168924	168929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172064675
2989	NC_010553	GCG	2	6	168954	168959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064675
2990	NC_010553	GCG	2	6	168973	168978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172064675
2991	NC_010553	GCTG	2	8	168983	168990	0 %	25 %	50 %	25 %	172064675
2992	NC_010553	CCGG	2	8	169010	169017	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
2993	NC_010553	CGTT	2	8	169099	169106	0 %	50 %	25 %	25 %	172064675
2994	NC_010553	CG	3	6	169130	169135	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
2995	NC_010553	CTG	2	6	169146	169151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2996	NC_010553	CTG	2	6	169188	169193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2997	NC_010553	TCG	2	6	169252	169257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172064675
2998	NC_010553	GC	3	6	169340	169345	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675
2999	NC_010553	CGA	2	6	169352	169357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172064675
3000	NC_010553	GC	3	6	169362	169367	0 %	0 %	50 %	50 %	172064675

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