MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 127658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010170	ACG	2	6	20420	20425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854322
502	NC_010170	TGC	2	6	20632	20637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854323
503	NC_010170	CTGG	2	8	20639	20646	0 %	25 %	50 %	25 %	163854323
504	NC_010170	CG	3	6	20730	20735	0 %	0 %	50 %	50 %	163854323
505	NC_010170	GCGCAT	2	12	20768	20779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163854323
506	NC_010170	GGCGC	2	10	20828	20837	0 %	0 %	60 %	40 %	163854323
507	NC_010170	CGGCG	2	10	20876	20885	0 %	0 %	60 %	40 %	163854323
508	NC_010170	GCC	2	6	20894	20899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854323
509	NC_010170	GC	3	6	20916	20921	0 %	0 %	50 %	50 %	163854323
510	NC_010170	GCC	2	6	21060	21065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854323
511	NC_010170	TAC	2	6	21108	21113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854323
512	NC_010170	GAC	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854323
513	NC_010170	CCG	2	6	21133	21138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854323
514	NC_010170	CG	3	6	21151	21156	0 %	0 %	50 %	50 %	163854323
515	NC_010170	GCCG	2	8	21215	21222	0 %	0 %	50 %	50 %	163854323
516	NC_010170	CG	3	6	21221	21226	0 %	0 %	50 %	50 %	163854323
517	NC_010170	GCC	2	6	21270	21275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854323
518	NC_010170	GAA	2	6	21342	21347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854323
519	NC_010170	GCG	2	6	21471	21476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854324
520	NC_010170	CCG	2	6	21551	21556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854324
521	NC_010170	GTC	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854324
522	NC_010170	TGG	2	6	21681	21686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854324
523	NC_010170	GAC	2	6	21712	21717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854324
524	NC_010170	GGC	2	6	21847	21852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854324
525	NC_010170	CG	3	6	21905	21910	0 %	0 %	50 %	50 %	163854324
526	NC_010170	GCC	2	6	21979	21984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854324
527	NC_010170	GCC	2	6	22015	22020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854324
528	NC_010170	GCT	2	6	22083	22088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854324
529	NC_010170	CGA	2	6	22099	22104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854324
530	NC_010170	CG	5	10	22144	22153	0 %	0 %	50 %	50 %	163854324
531	NC_010170	GCA	2	6	22215	22220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854324
532	NC_010170	CGC	2	6	22272	22277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854324
533	NC_010170	CG	3	6	22308	22313	0 %	0 %	50 %	50 %	163854324
534	NC_010170	GACCG	2	10	22360	22369	20 %	0 %	40 %	40 %	163854324
535	NC_010170	CGC	2	6	22393	22398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854324
536	NC_010170	GCCCC	2	10	22410	22419	0 %	0 %	20 %	80 %	163854324
537	NC_010170	TGC	2	6	22434	22439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854324
538	NC_010170	CGG	2	6	22452	22457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854324
539	NC_010170	CGG	2	6	22678	22683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854325
540	NC_010170	GGC	2	6	22688	22693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854325
541	NC_010170	GGC	2	6	22708	22713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854325
542	NC_010170	GGCG	2	8	22717	22724	0 %	0 %	75 %	25 %	163854325
543	NC_010170	GC	4	8	22768	22775	0 %	0 %	50 %	50 %	163854325
544	NC_010170	CG	3	6	22797	22802	0 %	0 %	50 %	50 %	163854325
545	NC_010170	GGT	2	6	22810	22815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854325
546	NC_010170	GCC	2	6	22817	22822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854325
547	NC_010170	GGT	2	6	22825	22830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854325
548	NC_010170	ACG	2	6	22857	22862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854325
549	NC_010170	TGG	2	6	22863	22868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854325
550	NC_010170	CAT	2	6	22951	22956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854325
551	NC_010170	TGC	2	6	22965	22970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854325
552	NC_010170	GGGC	2	8	23014	23021	0 %	0 %	75 %	25 %	163854325
553	NC_010170	AGC	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854325
554	NC_010170	CAG	2	6	23192	23197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854325
555	NC_010170	GCC	2	6	23234	23239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854325
556	NC_010170	CCTG	2	8	23244	23251	0 %	25 %	25 %	50 %	163854325
557	NC_010170	CGA	2	6	23284	23289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854325
558	NC_010170	CTG	2	6	23312	23317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854325
559	NC_010170	CAG	2	6	23327	23332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854325
560	NC_010170	GGC	3	9	23335	23343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854325
561	NC_010170	GACC	2	8	23395	23402	25 %	0 %	25 %	50 %	163854325
562	NC_010170	GC	3	6	23448	23453	0 %	0 %	50 %	50 %	163854325
563	NC_010170	GC	3	6	23566	23571	0 %	0 %	50 %	50 %	163854325
564	NC_010170	ATG	2	6	23581	23586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163854325
565	NC_010170	CG	3	6	23703	23708	0 %	0 %	50 %	50 %	163854326
566	NC_010170	CGA	2	6	23723	23728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854326
567	NC_010170	TTG	2	6	23730	23735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163854326
568	NC_010170	CGC	2	6	23736	23741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854326
569	NC_010170	GGT	2	6	23780	23785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854326
570	NC_010170	CGGCC	2	10	23790	23799	0 %	0 %	40 %	60 %	163854326
571	NC_010170	CGC	2	6	23831	23836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854326
572	NC_010170	GGCC	2	8	23852	23859	0 %	0 %	50 %	50 %	163854326
573	NC_010170	ACG	2	6	23860	23865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854326
574	NC_010170	GCT	2	6	23909	23914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854326
575	NC_010170	CGCAG	2	10	23925	23934	20 %	0 %	40 %	40 %	163854326
576	NC_010170	GCT	2	6	23945	23950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854326
577	NC_010170	GGT	2	6	23951	23956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854326
578	NC_010170	GCG	2	6	23959	23964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854326
579	NC_010170	CCG	2	6	24007	24012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854326
580	NC_010170	GTG	2	6	24051	24056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854326
581	NC_010170	CTGGA	2	10	24087	24096	20 %	20 %	40 %	20 %	163854326
582	NC_010170	GCT	2	6	24167	24172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854326
583	NC_010170	CGA	3	9	24176	24184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854326
584	NC_010170	CGC	2	6	24244	24249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854326
585	NC_010170	CGG	2	6	24258	24263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854326
586	NC_010170	CTGG	2	8	24316	24323	0 %	25 %	50 %	25 %	163854327
587	NC_010170	CG	3	6	24337	24342	0 %	0 %	50 %	50 %	163854327
588	NC_010170	CGA	2	6	24654	24659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854327
589	NC_010170	CGC	2	6	24662	24667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854327
590	NC_010170	CA	3	6	24776	24781	50 %	0 %	0 %	50 %	163854327
591	NC_010170	GC	4	8	24812	24819	0 %	0 %	50 %	50 %	163854327
592	NC_010170	GCTG	2	8	25515	25522	0 %	25 %	50 %	25 %	163854328
593	NC_010170	GGC	2	6	25535	25540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
594	NC_010170	CCA	2	6	25582	25587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854328
595	NC_010170	CGG	2	6	25597	25602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
596	NC_010170	CG	3	6	25624	25629	0 %	0 %	50 %	50 %	163854328
597	NC_010170	TCA	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163854328
598	NC_010170	CGG	2	6	25666	25671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
599	NC_010170	GGCC	2	8	25681	25688	0 %	0 %	50 %	50 %	163854328
600	NC_010170	GCCGC	2	10	25721	25730	0 %	0 %	40 %	60 %	163854328
601	NC_010170	CGC	2	6	25738	25743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854328
602	NC_010170	CGG	2	6	25789	25794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
603	NC_010170	GC	3	6	25798	25803	0 %	0 %	50 %	50 %	163854328
604	NC_010170	CG	3	6	25817	25822	0 %	0 %	50 %	50 %	163854328
605	NC_010170	TGG	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163854328
606	NC_010170	CCA	2	6	25924	25929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163854328
607	NC_010170	GGC	2	6	25932	25937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
608	NC_010170	GTC	2	6	25958	25963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854328
609	NC_010170	CAGGCA	2	12	25967	25978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854328
610	NC_010170	CGG	2	6	26035	26040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
611	NC_010170	CGA	2	6	26041	26046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854328
612	NC_010170	GTC	2	6	26075	26080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854328
613	NC_010170	GGC	2	6	26095	26100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854328
614	NC_010170	GC	5	10	26119	26128	0 %	0 %	50 %	50 %	163854328
615	NC_010170	G	6	6	26162	26167	0 %	0 %	100 %	0 %	163854328
616	NC_010170	AGA	2	6	26180	26185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854328
617	NC_010170	GGA	2	6	26192	26197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163854328
618	NC_010170	TCT	2	6	26548	26553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854329
619	NC_010170	TTC	2	6	26556	26561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854329
620	NC_010170	CTT	2	6	26624	26629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854329
621	NC_010170	AGA	2	6	26665	26670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854329
622	NC_010170	TTC	2	6	26672	26677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163854329
623	NC_010170	GGC	2	6	26725	26730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163854329
624	NC_010170	GC	3	6	26774	26779	0 %	0 %	50 %	50 %	163854329
625	NC_010170	CGT	2	6	26788	26793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854329
626	NC_010170	CGC	2	6	26794	26799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854329
627	NC_010170	GAA	3	9	26828	26836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163854329
628	NC_010170	TCG	2	6	26850	26855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163854329
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750	NC_010170	GC	4	8	31516	31523	0 %	0 %	50 %	50 %	163854333
751	NC_010170	CTCAA	2	10	31593	31602	40 %	20 %	0 %	40 %	163854333
752	NC_010170	GGCA	2	8	31633	31640	25 %	0 %	50 %	25 %	163854333
753	NC_010170	GCC	2	6	31706	31711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163854333
754	NC_010170	CG	3	6	31749	31754	0 %	0 %	50 %	50 %	163854333
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756	NC_010170	GAC	2	6	31890	31895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854334
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758	NC_010170	CGA	2	6	31997	32002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163854334
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