MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM200

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010009	TTA	2	6	118	123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672656
2	NC_010009	TGAT	2	8	128	135	25 %	50 %	25 %	0 %	294672656
3	NC_010009	ACT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672656
4	NC_010009	AGT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672656
5	NC_010009	ACTA	2	8	637	644	50 %	25 %	0 %	25 %	294672657
6	NC_010009	AT	4	8	648	655	50 %	50 %	0 %	0 %	294672657
7	NC_010009	A	7	7	667	673	100 %	0 %	0 %	0 %	294672657
8	NC_010009	GGC	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672657
9	NC_010009	T	6	6	708	713	0 %	100 %	0 %	0 %	294672657
10	NC_010009	AAC	2	6	714	719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672657
11	NC_010009	GCGGTT	2	12	923	934	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	161376709
12	NC_010009	CGG	2	6	951	956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
13	NC_010009	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
14	NC_010009	ATT	2	6	991	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161376709
15	NC_010009	ATTA	2	8	1011	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	161376709
16	NC_010009	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161376709
17	NC_010009	CGG	2	6	1038	1043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161376709
18	NC_010009	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161376709
19	NC_010009	TGCC	2	8	1926	1933	0 %	25 %	25 %	50 %	161376710
20	NC_010009	GA	3	6	2099	2104	50 %	0 %	50 %	0 %	161376710
21	NC_010009	CGA	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
22	NC_010009	GCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161376710
23	NC_010009	CAA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161376710
24	NC_010009	ACG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
25	NC_010009	GC	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	294672658
26	NC_010009	CGG	2	6	2298	2303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
27	NC_010009	CAT	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672658
28	NC_010009	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672658
29	NC_010009	TGA	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
30	NC_010009	AGA	2	6	2580	2585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
31	NC_010009	CGG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294672658
32	NC_010009	AAGAGA	2	12	2871	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
33	NC_010009	CAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
34	NC_010009	CAG	2	6	2903	2908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
35	NC_010009	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
36	NC_010009	CAG	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
37	NC_010009	GAT	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
38	NC_010009	TC	3	6	2980	2985	0 %	50 %	0 %	50 %	294672658
39	NC_010009	GAAA	2	8	2995	3002	75 %	0 %	25 %	0 %	294672658
40	NC_010009	GAT	3	9	3016	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672658
41	NC_010009	GCA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672658
42	NC_010009	AC	3	6	3128	3133	50 %	0 %	0 %	50 %	294672658
43	NC_010009	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672658
44	NC_010009	CAA	3	9	3274	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672658
45	NC_010009	A	7	7	3342	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	294672658
46	NC_010009	ATA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672659
47	NC_010009	A	8	8	3760	3767	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
48	NC_010009	A	7	7	3781	3787	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
49	NC_010009	AAAT	2	8	3809	3816	75 %	25 %	0 %	0 %	294672660
50	NC_010009	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672660
51	NC_010009	GAA	2	6	3828	3833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
52	NC_010009	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
53	NC_010009	TTG	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
54	NC_010009	ATT	2	6	3979	3984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
55	NC_010009	AAC	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672660
56	NC_010009	TTA	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
57	NC_010009	AGA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672660
58	NC_010009	TAA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
59	NC_010009	TGT	2	6	4091	4096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672660
60	NC_010009	GAT	3	9	4098	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672660
61	NC_010009	GCA	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672660
62	NC_010009	A	6	6	4168	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
63	NC_010009	CTT	2	6	4174	4179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672660
64	NC_010009	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
65	NC_010009	TTA	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
66	NC_010009	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
67	NC_010009	AAGTT	2	10	4321	4330	40 %	40 %	20 %	0 %	294672660
68	NC_010009	ATT	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672660
69	NC_010009	A	6	6	4367	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
70	NC_010009	A	7	7	4391	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	294672660
71	NC_010009	T	7	7	4416	4422	0 %	100 %	0 %	0 %	294672660
72	NC_010009	AAT	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672660
73	NC_010009	CCA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672661
74	NC_010009	TAG	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
75	NC_010009	TGT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
76	NC_010009	GTT	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672661
77	NC_010009	TATG	2	8	4890	4897	25 %	50 %	25 %	0 %	294672661
78	NC_010009	T	6	6	4960	4965	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
79	NC_010009	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
80	NC_010009	T	6	6	5134	5139	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
81	NC_010009	TAAA	2	8	5156	5163	75 %	25 %	0 %	0 %	294672661
82	NC_010009	ATC	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672661
83	NC_010009	TTC	2	6	5226	5231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672661
84	NC_010009	ATA	2	6	5241	5246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672661
85	NC_010009	T	6	6	5247	5252	0 %	100 %	0 %	0 %	294672661
86	NC_010009	AGT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672661
87	NC_010009	ATTT	2	8	5339	5346	25 %	75 %	0 %	0 %	294672661
88	NC_010009	TA	3	6	6431	6436	50 %	50 %	0 %	0 %	294672662
89	NC_010009	ATC	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
90	NC_010009	TCA	2	6	6567	6572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672662
91	NC_010009	CTT	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672662
92	NC_010009	GAA	2	6	6604	6609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672662
93	NC_010009	ACC	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294672662
94	NC_010009	GAG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
95	NC_010009	TGA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672662
96	NC_010009	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
97	NC_010009	TGG	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672662
98	NC_010009	GGAGTT	2	12	6735	6746	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294672662
99	NC_010009	GGA	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
100	NC_010009	GGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294672662
101	NC_010009	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672662
102	NC_010009	A	6	6	6794	6799	100 %	0 %	0 %	0 %	294672662
103	NC_010009	TTA	2	6	6822	6827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672662
104	NC_010009	TTAG	2	8	6831	6838	25 %	50 %	25 %	0 %	294672662
105	NC_010009	TTG	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672662
106	NC_010009	T	6	6	6974	6979	0 %	100 %	0 %	0 %	294672662
107	NC_010009	GTT	2	6	7029	7034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161376717
108	NC_010009	T	6	6	7049	7054	0 %	100 %	0 %	0 %	161376717
109	NC_010009	TTAA	2	8	7106	7113	50 %	50 %	0 %	0 %	161376717
110	NC_010009	T	6	6	7144	7149	0 %	100 %	0 %	0 %	161376717
111	NC_010009	TAA	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
112	NC_010009	TA	3	6	7272	7277	50 %	50 %	0 %	0 %	294672663
113	NC_010009	TTA	2	6	7281	7286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
114	NC_010009	TAT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672663
115	NC_010009	ATA	2	6	7351	7356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672663
116	NC_010009	AGT	2	6	7580	7585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672664
117	NC_010009	T	6	6	7585	7590	0 %	100 %	0 %	0 %	294672664
118	NC_010009	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
119	NC_010009	AATCT	2	10	7671	7680	40 %	40 %	0 %	20 %	294672664
120	NC_010009	TTCAT	2	10	7722	7731	20 %	60 %	0 %	20 %	294672664
121	NC_010009	AGTTCC	2	12	7733	7744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294672664
122	NC_010009	CTT	2	6	7762	7767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
123	NC_010009	TGT	2	6	7783	7788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672664
124	NC_010009	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
125	NC_010009	T	7	7	7835	7841	0 %	100 %	0 %	0 %	294672664
126	NC_010009	AAC	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672664
127	NC_010009	AGA	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672664
128	NC_010009	TCT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
129	NC_010009	TTAT	2	8	7926	7933	25 %	75 %	0 %	0 %	294672664
130	NC_010009	TAAA	2	8	7949	7956	75 %	25 %	0 %	0 %	294672664
131	NC_010009	TTC	2	6	7991	7996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672664
132	NC_010009	CAT	3	9	8023	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672664
133	NC_010009	T	8	8	8062	8069	0 %	100 %	0 %	0 %	294672664
134	NC_010009	TCT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672665
135	NC_010009	TTTTA	2	10	8359	8368	20 %	80 %	0 %	0 %	294672665
136	NC_010009	T	7	7	8377	8383	0 %	100 %	0 %	0 %	294672665
137	NC_010009	GTT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672665
138	NC_010009	TAT	2	6	8413	8418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672665
139	NC_010009	TAAC	2	8	8421	8428	50 %	25 %	0 %	25 %	294672665
140	NC_010009	A	7	7	8449	8455	100 %	0 %	0 %	0 %	294672665
141	NC_010009	AACC	2	8	8461	8468	50 %	0 %	0 %	50 %	294672665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.