MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 3918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	TCGC	3	12	293	304	0 %	25 %	25 %	50 %	148240871
2	NC_009475	CAGC	2	8	325	332	25 %	0 %	25 %	50 %	148240871
3	NC_009475	TC	3	6	336	341	0 %	50 %	0 %	50 %	148240871
4	NC_009475	CTCG	2	8	407	414	0 %	25 %	25 %	50 %	148240871
5	NC_009475	GACC	2	8	424	431	25 %	0 %	25 %	50 %	148240871
6	NC_009475	GC	3	6	488	493	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
7	NC_009475	CGC	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
8	NC_009475	GAC	3	9	605	613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
9	NC_009475	CCTTGC	2	12	635	646	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240871
10	NC_009475	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	148240871
11	NC_009475	CCG	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
12	NC_009475	CAC	2	6	861	866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240871
13	NC_009475	GCG	2	6	887	892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
14	NC_009475	CGC	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240871
15	NC_009475	CGA	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
16	NC_009475	ACG	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
17	NC_009475	TCG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240871
18	NC_009475	GC	3	6	1009	1014	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
19	NC_009475	CCAT	2	8	1042	1049	25 %	25 %	0 %	50 %	148240871
20	NC_009475	CGG	2	6	1127	1132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240871
21	NC_009475	TCA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240871
22	NC_009475	ACG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240871
23	NC_009475	CCT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240871
24	NC_009475	GCGCG	2	10	1316	1325	0 %	0 %	60 %	40 %	148240871
25	NC_009475	GGGCG	2	10	1329	1338	0 %	0 %	80 %	20 %	148240871
26	NC_009475	CG	3	6	1347	1352	0 %	0 %	50 %	50 %	148240871
27	NC_009475	CTT	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240871
28	NC_009475	AAG	2	6	1398	1403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240871
29	NC_009475	TCG	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240872
30	NC_009475	GAG	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240872
31	NC_009475	GAT	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240872
32	NC_009475	CGC	2	6	1784	1789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240872
33	NC_009475	CG	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
34	NC_009475	CG	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
35	NC_009475	GC	3	6	1912	1917	0 %	0 %	50 %	50 %	148240872
36	NC_009475	TCGA	2	8	1979	1986	25 %	25 %	25 %	25 %	148240872
37	NC_009475	GCG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
38	NC_009475	GCA	2	6	2192	2197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
39	NC_009475	CAG	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240872
40	NC_009475	GGC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240872
41	NC_009475	ACG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
42	NC_009475	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
43	NC_009475	TCC	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240873
44	NC_009475	GCACG	2	10	2765	2774	20 %	0 %	40 %	40 %	148240873
45	NC_009475	GAT	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
46	NC_009475	ACTC	2	8	2892	2899	25 %	25 %	0 %	50 %	148240873
47	NC_009475	GGCG	2	8	2900	2907	0 %	0 %	75 %	25 %	148240873
48	NC_009475	TGCTG	2	10	2943	2952	0 %	40 %	40 %	20 %	148240873
49	NC_009475	CG	3	6	3003	3008	0 %	0 %	50 %	50 %	148240873
50	NC_009475	CGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
51	NC_009475	GGC	2	6	3093	3098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
52	NC_009475	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240873
53	NC_009475	GGAGG	2	10	3212	3221	20 %	0 %	80 %	0 %	148240873
54	NC_009475	CGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
55	NC_009475	CG	3	6	3262	3267	0 %	0 %	50 %	50 %	148240873
56	NC_009475	TCG	2	6	3269	3274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
57	NC_009475	CAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
58	NC_009475	GAC	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
59	NC_009475	TCT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240873
60	NC_009475	CA	3	6	3368	3373	50 %	0 %	0 %	50 %	148240873
61	NC_009475	GCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240873
62	NC_009475	TCG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
63	NC_009475	CGAT	2	8	3634	3641	25 %	25 %	25 %	25 %	148240873
64	NC_009475	GAG	2	6	3667	3672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240873
65	NC_009475	TCG	3	9	3707	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240873
66	NC_009475	CCG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240873
67	NC_009475	AGC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240873
68	NC_009475	GCT	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
69	NC_009475	GA	3	6	3956	3961	50 %	0 %	50 %	0 %	148240874
70	NC_009475	TTC	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240874
71	NC_009475	TGA	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
72	NC_009475	GC	3	6	4116	4121	0 %	0 %	50 %	50 %	148240874
73	NC_009475	AGC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240874
74	NC_009475	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240874
75	NC_009475	TCG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240874
76	NC_009475	ATG	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240874
77	NC_009475	CG	3	6	4368	4373	0 %	0 %	50 %	50 %	148240874
78	NC_009475	GCCGGA	2	12	4567	4578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148240875
79	NC_009475	CGG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
80	NC_009475	GC	3	6	4601	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	148240875
81	NC_009475	GGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240875
82	NC_009475	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240875
83	NC_009475	CG	3	6	4719	4724	0 %	0 %	50 %	50 %	148240875
84	NC_009475	TTC	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240875
85	NC_009475	TCG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240876
86	NC_009475	CGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
87	NC_009475	GGCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	50 %	25 %	148240876
88	NC_009475	CGA	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240876
89	NC_009475	CGGC	2	8	4987	4994	0 %	0 %	50 %	50 %	148240876
90	NC_009475	CGC	2	6	5041	5046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
91	NC_009475	CCG	2	6	5075	5080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240876
92	NC_009475	CGTC	2	8	5626	5633	0 %	25 %	25 %	50 %	148240877
93	NC_009475	TTC	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240877
94	NC_009475	GCCG	2	8	5690	5697	0 %	0 %	50 %	50 %	148240877
95	NC_009475	CATTT	2	10	5703	5712	20 %	60 %	0 %	20 %	148240877
96	NC_009475	CTCAAC	2	12	5866	5877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148240877
97	NC_009475	GCC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240877
98	NC_009475	AGA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240877
99	NC_009475	TCGAAG	2	12	6059	6070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148240877
100	NC_009475	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240878
101	NC_009475	GC	3	6	6207	6212	0 %	0 %	50 %	50 %	148240878
102	NC_009475	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240878
103	NC_009475	GAG	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240878
104	NC_009475	CGT	2	6	6354	6359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240879
105	NC_009475	TCC	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240879
106	NC_009475	GGCG	2	8	6400	6407	0 %	0 %	75 %	25 %	148240879
107	NC_009475	CCTTGA	2	12	6486	6497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148240879
108	NC_009475	GCA	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
109	NC_009475	CGA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240879
110	NC_009475	TCCG	2	8	6766	6773	0 %	25 %	25 %	50 %	148240880
111	NC_009475	CCG	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240880
112	NC_009475	TGCG	2	8	6960	6967	0 %	25 %	50 %	25 %	148240880
113	NC_009475	GCG	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
114	NC_009475	CGGTTC	2	12	6991	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240880
115	NC_009475	GCG	2	6	7040	7045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240880
116	NC_009475	CA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	0 %	50 %	148240881
117	NC_009475	GCC	2	6	7225	7230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240881
118	NC_009475	CGC	3	9	7320	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240881
119	NC_009475	TCG	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240881
120	NC_009475	CG	3	6	7430	7435	0 %	0 %	50 %	50 %	148240881
121	NC_009475	CCT	2	6	7476	7481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240881
122	NC_009475	GAG	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240881
123	NC_009475	AG	3	6	7495	7500	50 %	0 %	50 %	0 %	148240881
124	NC_009475	TGA	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240882
125	NC_009475	GC	3	6	7630	7635	0 %	0 %	50 %	50 %	148240882
126	NC_009475	GGC	2	6	7674	7679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
127	NC_009475	GCG	2	6	7682	7687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
128	NC_009475	GTG	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240882
129	NC_009475	CGA	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240882
130	NC_009475	CGG	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
131	NC_009475	TTCGTG	2	12	7981	7992	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148240882
132	NC_009475	TGCG	2	8	8024	8031	0 %	25 %	50 %	25 %	148240882
133	NC_009475	GCG	2	6	8093	8098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
134	NC_009475	GGA	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240882
135	NC_009475	CG	3	6	8128	8133	0 %	0 %	50 %	50 %	148240882
136	NC_009475	CGGT	2	8	8161	8168	0 %	25 %	50 %	25 %	148240882
137	NC_009475	CG	3	6	8221	8226	0 %	0 %	50 %	50 %	148240882
138	NC_009475	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	148240882
139	NC_009475	GC	3	6	8242	8247	0 %	0 %	50 %	50 %	148240882
140	NC_009475	GAA	3	9	8283	8291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240882
141	NC_009475	TTCC	2	8	8307	8314	0 %	50 %	0 %	50 %	148240882
142	NC_009475	ATC	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240882
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144	NC_009475	CGG	2	6	8448	8453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240882
145	NC_009475	CGT	2	6	8459	8464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240882
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148	NC_009475	TCG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240882
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151	NC_009475	GTT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240882
152	NC_009475	TGA	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240882
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154	NC_009475	AAG	2	6	8823	8828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240883
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156	NC_009475	CGA	2	6	8915	8920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240883
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158	NC_009475	GC	4	8	8925	8932	0 %	0 %	50 %	50 %	148240883
159	NC_009475	CG	3	6	8981	8986	0 %	0 %	50 %	50 %	148240883
160	NC_009475	ATC	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240883
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162	NC_009475	GA	3	6	9133	9138	50 %	0 %	50 %	0 %	148240883
163	NC_009475	GCC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240883
164	NC_009475	CAC	2	6	9233	9238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240883
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166	NC_009475	GCT	2	6	9323	9328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240883
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168	NC_009475	TTC	2	6	9381	9386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240883
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172	NC_009475	CCTC	2	8	9622	9629	0 %	25 %	0 %	75 %	148240883
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176	NC_009475	TCA	2	6	9942	9947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240884
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180	NC_009475	GCA	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240884
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251	NC_009475	AGC	2	6	14623	14628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240889
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254	NC_009475	GTC	2	6	14838	14843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240889
255	NC_009475	CATG	2	8	14845	14852	25 %	25 %	25 %	25 %	148240889
256	NC_009475	GCTT	2	8	14884	14891	0 %	50 %	25 %	25 %	148240889
257	NC_009475	TCGG	2	8	14929	14936	0 %	25 %	50 %	25 %	148240889
258	NC_009475	CCG	2	6	14998	15003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240889
259	NC_009475	GCC	2	6	15012	15017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240889
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261	NC_009475	CGA	2	6	15030	15035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240889
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263	NC_009475	GCC	3	9	15087	15095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240889
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