MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 chromosome 1

Total Repeats: 93792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009256	TGA	2	6	292	297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134294129
2	NC_009256	CTG	2	6	324	329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
3	NC_009256	CAG	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
4	NC_009256	ACGTG	2	10	355	364	20 %	20 %	40 %	20 %	134294129
5	NC_009256	CGC	2	6	419	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
6	NC_009256	GCGCG	2	10	548	557	0 %	0 %	60 %	40 %	134294129
7	NC_009256	GCCGC	2	10	576	585	0 %	0 %	40 %	60 %	134294129
8	NC_009256	CGC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
9	NC_009256	CGC	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
10	NC_009256	GC	3	6	670	675	0 %	0 %	50 %	50 %	134294129
11	NC_009256	CGG	2	6	700	705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294129
12	NC_009256	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
13	NC_009256	CAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134294129
14	NC_009256	CGA	2	6	728	733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
15	NC_009256	GCG	2	6	771	776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294129
16	NC_009256	GCCG	2	8	777	784	0 %	0 %	50 %	50 %	134294129
17	NC_009256	GCGCC	2	10	808	817	0 %	0 %	40 %	60 %	134294129
18	NC_009256	CG	4	8	914	921	0 %	0 %	50 %	50 %	134294129
19	NC_009256	CCG	2	6	922	927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
20	NC_009256	CGG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294129
21	NC_009256	GCT	3	9	1031	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
22	NC_009256	GC	3	6	1051	1056	0 %	0 %	50 %	50 %	134294129
23	NC_009256	CGT	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
24	NC_009256	CGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
25	NC_009256	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294129
26	NC_009256	CTCG	2	8	1148	1155	0 %	25 %	25 %	50 %	134294129
27	NC_009256	CTG	3	9	1158	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
28	NC_009256	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
29	NC_009256	TTC	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294129
30	NC_009256	CGCA	2	8	1200	1207	25 %	0 %	25 %	50 %	134294129
31	NC_009256	GGA	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134294129
32	NC_009256	TTC	2	6	1215	1220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294129
33	NC_009256	ATC	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294129
34	NC_009256	CGA	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
35	NC_009256	GCC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294129
36	NC_009256	GGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134294129
37	NC_009256	TTC	2	6	1434	1439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294129
38	NC_009256	TCGA	2	8	1530	1537	25 %	25 %	25 %	25 %	134294129
39	NC_009256	CTG	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
40	NC_009256	AGA	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294129
41	NC_009256	ACA	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134294129
42	NC_009256	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294129
43	NC_009256	CG	3	6	1676	1681	0 %	0 %	50 %	50 %	134294129
44	NC_009256	AGA	2	6	1723	1728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294129
45	NC_009256	CGG	2	6	1754	1759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294129
46	NC_009256	CAC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134294129
47	NC_009256	TGC	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294129
48	NC_009256	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294129
49	NC_009256	CTC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134294130
50	NC_009256	TCG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
51	NC_009256	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294130
52	NC_009256	CTG	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
53	NC_009256	TTTC	2	8	2167	2174	0 %	75 %	0 %	25 %	134294130
54	NC_009256	CGAC	2	8	2179	2186	25 %	0 %	25 %	50 %	134294130
55	NC_009256	CAC	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134294130
56	NC_009256	GC	3	6	2207	2212	0 %	0 %	50 %	50 %	134294130
57	NC_009256	TCGGCG	2	12	2218	2229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134294130
58	NC_009256	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
59	NC_009256	GC	3	6	2279	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	134294130
60	NC_009256	TCGC	2	8	2310	2317	0 %	25 %	25 %	50 %	134294130
61	NC_009256	CGC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294130
62	NC_009256	CGC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294130
63	NC_009256	GCT	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
64	NC_009256	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294130
65	NC_009256	CTA	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294130
66	NC_009256	TGC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
67	NC_009256	TCG	3	9	2521	2529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
68	NC_009256	TCG	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294130
69	NC_009256	GGC	2	6	2598	2603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294130
70	NC_009256	GCC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294130
71	NC_009256	CGA	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294130
72	NC_009256	CGG	2	6	2726	2731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294130
73	NC_009256	CG	3	6	2850	2855	0 %	0 %	50 %	50 %	134294130
74	NC_009256	CAT	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294130
75	NC_009256	GAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294130
76	NC_009256	GC	3	6	3082	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	134294130
77	NC_009256	ACG	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294130
78	NC_009256	CAG	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
79	NC_009256	TCG	2	6	3388	3393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
80	NC_009256	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134294131
81	NC_009256	TCGA	2	8	3505	3512	25 %	25 %	25 %	25 %	134294131
82	NC_009256	CCGA	2	8	3601	3608	25 %	0 %	25 %	50 %	134294131
83	NC_009256	AGCGC	2	10	3638	3647	20 %	0 %	40 %	40 %	134294131
84	NC_009256	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134294131
85	NC_009256	GCGG	2	8	3676	3683	0 %	0 %	75 %	25 %	134294131
86	NC_009256	CGGG	2	8	3713	3720	0 %	0 %	75 %	25 %	134294131
87	NC_009256	GGCGTG	2	12	3727	3738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	134294131
88	NC_009256	CGTG	2	8	3740	3747	0 %	25 %	50 %	25 %	134294131
89	NC_009256	AAG	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294131
90	NC_009256	CGA	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
91	NC_009256	AAC	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134294131
92	NC_009256	CGG	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
93	NC_009256	TCG	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
94	NC_009256	CAA	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134294131
95	NC_009256	TTC	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294131
96	NC_009256	GTGCT	2	10	4207	4216	0 %	40 %	40 %	20 %	134294131
97	NC_009256	AAC	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134294131
98	NC_009256	CGG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
99	NC_009256	GC	3	6	4266	4271	0 %	0 %	50 %	50 %	134294131
100	NC_009256	CG	3	6	4280	4285	0 %	0 %	50 %	50 %	134294131
101	NC_009256	TCA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294131
102	NC_009256	GAA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294131
103	NC_009256	GAC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
104	NC_009256	CGA	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
105	NC_009256	GTC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
106	NC_009256	GTC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
107	NC_009256	GAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134294131
108	NC_009256	CCGA	2	8	4504	4511	25 %	0 %	25 %	50 %	134294131
109	NC_009256	ATC	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294131
110	NC_009256	TCG	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
111	NC_009256	TGCGCG	2	12	4545	4556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	134294131
112	NC_009256	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
113	NC_009256	GC	3	6	4573	4578	0 %	0 %	50 %	50 %	134294131
114	NC_009256	GACGC	2	10	4584	4593	20 %	0 %	40 %	40 %	134294131
115	NC_009256	TCG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
116	NC_009256	GGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
117	NC_009256	CAAG	2	8	4707	4714	50 %	0 %	25 %	25 %	134294131
118	NC_009256	GC	3	6	4777	4782	0 %	0 %	50 %	50 %	134294131
119	NC_009256	GCT	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
120	NC_009256	GTC	2	6	4797	4802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
121	NC_009256	CAT	4	12	4887	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294131
122	NC_009256	GCT	3	9	4935	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
123	NC_009256	TTC	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294131
124	NC_009256	GCC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134294131
125	NC_009256	GAC	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
126	NC_009256	TGC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
127	NC_009256	CGGCG	2	10	5124	5133	0 %	0 %	60 %	40 %	134294131
128	NC_009256	CTG	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
129	NC_009256	TCGA	2	8	5251	5258	25 %	25 %	25 %	25 %	134294131
130	NC_009256	GCG	2	6	5305	5310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
131	NC_009256	GTG	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134294131
132	NC_009256	CGG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
133	NC_009256	CAG	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
134	NC_009256	ACT	2	6	5473	5478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294131
135	NC_009256	CGGTG	2	10	5508	5517	0 %	20 %	60 %	20 %	134294131
136	NC_009256	GCA	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
137	NC_009256	GCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
138	NC_009256	AGC	2	6	5606	5611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
139	NC_009256	AGC	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294131
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141	NC_009256	CTG	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294131
142	NC_009256	CGG	2	6	5714	5719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294131
143	NC_009256	TAC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294131
144	NC_009256	GCGG	2	8	5790	5797	0 %	0 %	75 %	25 %	134294131
145	NC_009256	CT	3	6	6153	6158	0 %	50 %	0 %	50 %	134294132
146	NC_009256	GACAG	2	10	6197	6206	40 %	0 %	40 %	20 %	134294132
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148	NC_009256	CCGGT	2	10	6226	6235	0 %	20 %	40 %	40 %	134294132
149	NC_009256	AGC	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294132
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151	NC_009256	CAT	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294132
152	NC_009256	TCG	2	6	6431	6436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294132
153	NC_009256	CTT	2	6	6481	6486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294132
154	NC_009256	CACGG	2	10	6526	6535	20 %	0 %	40 %	40 %	134294132
155	NC_009256	CAG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294132
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157	NC_009256	TAA	2	6	6780	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134294132
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164	NC_009256	TGT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134294132
165	NC_009256	GCA	2	6	7071	7076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294132
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167	NC_009256	GGTC	2	8	7123	7130	0 %	25 %	50 %	25 %	134294132
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169	NC_009256	CTT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294132
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175	NC_009256	CGG	2	6	7645	7650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294132
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189	NC_009256	CGTC	2	8	8106	8113	0 %	25 %	25 %	50 %	134294132
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218	NC_009256	ATT	3	9	10006	10014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134294133
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243	NC_009256	CG	3	6	12320	12325	0 %	0 %	50 %	50 %	134294134
244	NC_009256	ATGGA	2	10	12329	12338	40 %	20 %	40 %	0 %	134294134
245	NC_009256	CTG	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294134
246	NC_009256	CAA	2	6	12412	12417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134294134
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248	NC_009256	CTCG	2	8	12460	12467	0 %	25 %	25 %	50 %	134294134
249	NC_009256	CG	3	6	12466	12471	0 %	0 %	50 %	50 %	134294134
250	NC_009256	CGCC	2	8	12597	12604	0 %	0 %	25 %	75 %	134294134
251	NC_009256	ACT	2	6	12645	12650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134294134
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254	NC_009256	GAG	2	6	12741	12746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134294135
255	NC_009256	CTGGC	2	10	12816	12825	0 %	20 %	40 %	40 %	134294135
256	NC_009256	CGA	2	6	12834	12839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294135
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258	NC_009256	GC	3	6	12854	12859	0 %	0 %	50 %	50 %	134294135
259	NC_009256	TCG	2	6	12934	12939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294135
260	NC_009256	CAG	2	6	13038	13043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294135
261	NC_009256	CG	3	6	13082	13087	0 %	0 %	50 %	50 %	134294135
262	NC_009256	CGA	2	6	13175	13180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294135
263	NC_009256	GGC	2	6	13205	13210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294135
264	NC_009256	GC	3	6	13209	13214	0 %	0 %	50 %	50 %	134294135
265	NC_009256	TGA	2	6	13235	13240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134294135
266	NC_009256	CCAG	2	8	13270	13277	25 %	0 %	25 %	50 %	134294135
267	NC_009256	GAAA	2	8	13390	13397	75 %	0 %	25 %	0 %	134294135
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288	NC_009256	CGG	2	6	15249	15254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134294136
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382	NC_009256	TCG	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134294142
383	NC_009256	CCATC	2	10	21524	21533	20 %	20 %	0 %	60 %	134294142
384	NC_009256	GATA	2	8	21553	21560	50 %	25 %	25 %	0 %	134294142
385	NC_009256	TGA	2	6	21641	21646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134294142
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390	NC_009256	ACG	2	6	21846	21851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294142
391	NC_009256	GAT	2	6	21890	21895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134294142
392	NC_009256	GC	3	6	21909	21914	0 %	0 %	50 %	50 %	134294142
393	NC_009256	AGC	2	6	21931	21936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134294142
394	NC_009256	TTC	2	6	21951	21956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294142
395	NC_009256	TC	3	6	21955	21960	0 %	50 %	0 %	50 %	134294142
396	NC_009256	TCT	2	6	21980	21985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294142
397	NC_009256	T	7	7	22023	22029	0 %	100 %	0 %	0 %	134294142
398	NC_009256	CTT	2	6	22044	22049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294142
399	NC_009256	TTC	2	6	22192	22197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294142
400	NC_009256	CTTC	2	8	22252	22259	0 %	50 %	0 %	50 %	134294142
401	NC_009256	GCCT	2	8	22317	22324	0 %	25 %	25 %	50 %	134294142
402	NC_009256	TGAAGC	2	12	22415	22426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134294142
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404	NC_009256	TTC	2	6	22470	22475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134294142
405	NC_009256	CAC	2	6	22540	22545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134294142
406	NC_009256	GA	3	6	22551	22556	50 %	0 %	50 %	0 %	134294142
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