MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE01

Total Repeats: 6980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009230	CAT	2	6	63	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288153
2	NC_009230	CGT	2	6	75	80	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
3	NC_009230	GTT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134288153
4	NC_009230	CGCC	2	8	113	120	0 %	0 %	25 %	75 %	134288153
5	NC_009230	GTC	2	6	188	193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
6	NC_009230	GAA	2	6	207	212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
7	NC_009230	GAA	2	6	222	227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
8	NC_009230	AGC	2	6	251	256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288153
9	NC_009230	ACGTAC	2	12	334	345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134288153
10	NC_009230	CCG	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288153
11	NC_009230	CGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288153
12	NC_009230	GAA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
13	NC_009230	TCG	2	6	521	526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288153
14	NC_009230	CG	3	6	550	555	0 %	0 %	50 %	50 %	134288153
15	NC_009230	CCA	2	6	597	602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288153
16	NC_009230	GCCG	2	8	621	628	0 %	0 %	50 %	50 %	134288153
17	NC_009230	GAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288153
18	NC_009230	GAA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288153
19	NC_009230	TTC	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288154
20	NC_009230	CGA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
21	NC_009230	CTG	2	6	788	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
22	NC_009230	GCA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
23	NC_009230	AGG	2	6	850	855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288154
24	NC_009230	TTCTGC	2	12	882	893	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	134288154
25	NC_009230	CGT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
26	NC_009230	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
27	NC_009230	GCT	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288154
28	NC_009230	CGG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
29	NC_009230	CGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288154
30	NC_009230	CATG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	134288154
31	NC_009230	CAT	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
32	NC_009230	G	6	6	1251	1256	0 %	0 %	100 %	0 %	134288154
33	NC_009230	GGC	2	6	1292	1297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
34	NC_009230	CCG	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288154
35	NC_009230	TCT	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288154
36	NC_009230	GGCA	2	8	1334	1341	25 %	0 %	50 %	25 %	134288154
37	NC_009230	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134288154
38	NC_009230	GC	3	6	1402	1407	0 %	0 %	50 %	50 %	134288154
39	NC_009230	ACC	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288154
40	NC_009230	CGGC	2	8	1444	1451	0 %	0 %	50 %	50 %	134288154
41	NC_009230	TGA	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
42	NC_009230	CTA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
43	NC_009230	ATC	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288154
44	NC_009230	CGATC	2	10	1583	1592	20 %	20 %	20 %	40 %	134288154
45	NC_009230	CCA	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288154
46	NC_009230	TTG	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134288154
47	NC_009230	CGG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288154
48	NC_009230	AGT	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288154
49	NC_009230	GC	3	6	1733	1738	0 %	0 %	50 %	50 %	134288155
50	NC_009230	CG	3	6	1771	1776	0 %	0 %	50 %	50 %	134288155
51	NC_009230	AGC	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
52	NC_009230	CCG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288155
53	NC_009230	CCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288155
54	NC_009230	CGA	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
55	NC_009230	GCA	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
56	NC_009230	GCGA	2	8	1963	1970	25 %	0 %	50 %	25 %	134288155
57	NC_009230	TCA	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288155
58	NC_009230	CG	3	6	2022	2027	0 %	0 %	50 %	50 %	134288155
59	NC_009230	TGG	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288155
60	NC_009230	TGC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288155
61	NC_009230	TGG	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288155
62	NC_009230	CGA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
63	NC_009230	GCT	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288155
64	NC_009230	GAT	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288155
65	NC_009230	GC	3	6	2362	2367	0 %	0 %	50 %	50 %	134288155
66	NC_009230	CAG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288155
67	NC_009230	A	6	6	2498	2503	100 %	0 %	0 %	0 %	134288156
68	NC_009230	ACG	2	6	2558	2563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
69	NC_009230	CAG	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
70	NC_009230	GAC	2	6	2713	2718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
71	NC_009230	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288156
72	NC_009230	CTCGT	2	10	2811	2820	0 %	40 %	20 %	40 %	134288156
73	NC_009230	GACC	2	8	2854	2861	25 %	0 %	25 %	50 %	134288156
74	NC_009230	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288156
75	NC_009230	TTC	2	6	2894	2899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288156
76	NC_009230	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288156
77	NC_009230	ACG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288156
78	NC_009230	GGC	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288156
79	NC_009230	CG	3	6	3134	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	134288156
80	NC_009230	TCA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288156
81	NC_009230	CCG	2	6	3925	3930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288157
82	NC_009230	TGC	2	6	3935	3940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288157
83	NC_009230	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134288157
84	NC_009230	GAT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288158
85	NC_009230	CCG	2	6	4483	4488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288158
86	NC_009230	CGT	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288158
87	NC_009230	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288158
88	NC_009230	TAG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134288158
89	NC_009230	GGA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134288158
90	NC_009230	CG	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	134288158
91	NC_009230	GCGT	2	8	4828	4835	0 %	25 %	50 %	25 %	134288158
92	NC_009230	CGA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288158
93	NC_009230	GCG	2	6	4969	4974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288158
94	NC_009230	TGG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134288158
95	NC_009230	ACT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288158
96	NC_009230	TCG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288158
97	NC_009230	ATAA	2	8	5112	5119	75 %	25 %	0 %	0 %	134288158
98	NC_009230	ATT	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134288159
99	NC_009230	CCG	3	9	5310	5318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
100	NC_009230	GCC	2	6	5333	5338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
101	NC_009230	CCA	2	6	5364	5369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
102	NC_009230	CAC	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
103	NC_009230	CAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
104	NC_009230	ACC	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288159
105	NC_009230	GCATCT	2	12	5452	5463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134288159
106	NC_009230	CGA	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
107	NC_009230	AGAC	2	8	5545	5552	50 %	0 %	25 %	25 %	134288159
108	NC_009230	CTT	2	6	5558	5563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288159
109	NC_009230	GAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
110	NC_009230	ATCG	2	8	5659	5666	25 %	25 %	25 %	25 %	134288159
111	NC_009230	CGC	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288159
112	NC_009230	CGA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288159
113	NC_009230	TGAC	2	8	5761	5768	25 %	25 %	25 %	25 %	134288159
114	NC_009230	ATC	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288160
115	NC_009230	TCG	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288160
116	NC_009230	ACGC	2	8	6191	6198	25 %	0 %	25 %	50 %	134288160
117	NC_009230	ATC	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134288160
118	NC_009230	ACG	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
119	NC_009230	TGC	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288160
120	NC_009230	CGG	2	6	6553	6558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288160
121	NC_009230	GCA	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
122	NC_009230	CCG	2	6	6637	6642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288160
123	NC_009230	CGA	2	6	6655	6660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288160
124	NC_009230	CCA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
125	NC_009230	ACC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
126	NC_009230	CGCGGC	2	12	6817	6828	0 %	0 %	50 %	50 %	134288161
127	NC_009230	CG	3	6	6921	6926	0 %	0 %	50 %	50 %	134288161
128	NC_009230	CTC	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134288161
129	NC_009230	GTC	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288161
130	NC_009230	CGGCC	2	10	7009	7018	0 %	0 %	40 %	60 %	134288161
131	NC_009230	GCG	2	6	7057	7062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
132	NC_009230	CG	3	6	7092	7097	0 %	0 %	50 %	50 %	134288161
133	NC_009230	GTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288161
134	NC_009230	ACC	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288161
135	NC_009230	AGC	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
136	NC_009230	GCG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
137	NC_009230	GCAAG	2	10	7335	7344	40 %	0 %	40 %	20 %	134288161
138	NC_009230	GCG	2	6	7425	7430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
139	NC_009230	GCA	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
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141	NC_009230	GCC	2	6	7630	7635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288161
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143	NC_009230	GACC	2	8	7695	7702	25 %	0 %	25 %	50 %	134288161
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145	NC_009230	CAG	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288161
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147	NC_009230	CG	3	6	7884	7889	0 %	0 %	50 %	50 %	134288161
148	NC_009230	TGAA	2	8	7946	7953	50 %	25 %	25 %	0 %	134288161
149	NC_009230	AACC	2	8	7959	7966	50 %	0 %	0 %	50 %	134288161
150	NC_009230	GCG	2	6	7968	7973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288161
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156	NC_009230	ATT	2	6	8924	8929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134288162
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166	NC_009230	TGC	2	6	9305	9310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288162
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178	NC_009230	CGCTG	2	10	9771	9780	0 %	20 %	40 %	40 %	134288162
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248	NC_009230	GCCG	2	8	12594	12601	0 %	0 %	50 %	50 %	134288166
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254	NC_009230	GGGA	2	8	12824	12831	25 %	0 %	75 %	0 %	134288166
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261	NC_009230	CGA	2	6	13583	13588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
262	NC_009230	CTT	2	6	13632	13637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134288168
263	NC_009230	AGC	2	6	13648	13653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
264	NC_009230	CGA	2	6	13691	13696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
265	NC_009230	CGC	3	9	13743	13751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288168
266	NC_009230	CGA	2	6	13763	13768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134288168
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269	NC_009230	CCGGG	2	10	13922	13931	0 %	0 %	60 %	40 %	134288168
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354	NC_009230	TTTGT	2	10	17603	17612	0 %	80 %	20 %	0 %	134288172
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384	NC_009230	CAATC	2	10	18838	18847	40 %	20 %	0 %	40 %	134288173
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387	NC_009230	TCG	2	6	19089	19094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288173
388	NC_009230	CG	3	6	19261	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	134288173
389	NC_009230	CGGC	2	8	19290	19297	0 %	0 %	50 %	50 %	134288173
390	NC_009230	GCGA	2	8	19328	19335	25 %	0 %	50 %	25 %	134288173
391	NC_009230	GGC	2	6	19390	19395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288173
392	NC_009230	GCT	2	6	19869	19874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288174
393	NC_009230	CTG	2	6	19878	19883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288174
394	NC_009230	GCG	2	6	20079	20084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134288174
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396	NC_009230	ACGTG	2	10	20153	20162	20 %	20 %	40 %	20 %	134288174
397	NC_009230	GTT	2	6	20187	20192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134288174
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403	NC_009230	TGC	2	6	20411	20416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288174
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407	NC_009230	AC	3	6	20546	20551	50 %	0 %	0 %	50 %	134288174
408	NC_009230	CCGG	2	8	20578	20585	0 %	0 %	50 %	50 %	134288174
409	NC_009230	TCG	2	6	20597	20602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288174
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414	NC_009230	TCG	2	6	20800	20805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288175
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419	NC_009230	GCC	2	6	21011	21016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134288175
420	NC_009230	TGC	3	9	21031	21039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288175
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422	NC_009230	TCG	2	6	21130	21135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134288175
423	NC_009230	TCGA	2	8	21177	21184	25 %	25 %	25 %	25 %	134288175
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426	NC_009230	CG	3	6	21303	21308	0 %	0 %	50 %	50 %	134288175
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440	NC_009230	ACC	2	6	21886	21891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134288175
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500	NC_009230	GCAG	2	8	24896	24903	25 %	0 %	50 %	25 %	134288178

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