MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE02

Total Repeats: 5195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009227	ACGC	2	8	258171	258178	25 %	0 %	25 %	50 %	134287786
5002	NC_009227	GTG	2	6	258219	258224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134287786
5003	NC_009227	CG	3	6	258305	258310	0 %	0 %	50 %	50 %	134287786
5004	NC_009227	GCCG	2	8	258401	258408	0 %	0 %	50 %	50 %	134287786
5005	NC_009227	CGCAGC	2	12	258473	258484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	134287786
5006	NC_009227	CAT	2	6	258575	258580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287786
5007	NC_009227	TGC	2	6	258589	258594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287786
5008	NC_009227	AGC	2	6	258613	258618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287786
5009	NC_009227	GCTG	2	8	258623	258630	0 %	25 %	50 %	25 %	134287786
5010	NC_009227	GCA	2	6	258659	258664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287786
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5012	NC_009227	CT	3	6	258687	258692	0 %	50 %	0 %	50 %	134287786
5013	NC_009227	TCG	2	6	258720	258725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287786
5014	NC_009227	CG	3	6	258740	258745	0 %	0 %	50 %	50 %	134287786
5015	NC_009227	TCA	2	6	258763	258768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287786
5016	NC_009227	AATC	2	8	258782	258789	50 %	25 %	0 %	25 %	134287786
5017	NC_009227	AGCA	2	8	258915	258922	50 %	0 %	25 %	25 %	134287786
5018	NC_009227	AGA	2	6	258973	258978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134287786
5019	NC_009227	TGC	2	6	258979	258984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287786
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5021	NC_009227	GGC	2	6	259011	259016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287786
5022	NC_009227	GCA	2	6	259090	259095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287787
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5024	NC_009227	TGC	2	6	259174	259179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287787
5025	NC_009227	CTG	2	6	259296	259301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287787
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5029	NC_009227	CGC	3	9	259399	259407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287787
5030	NC_009227	TGG	2	6	259465	259470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134287787
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5032	NC_009227	CTA	2	6	259541	259546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287787
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5035	NC_009227	TTCT	2	8	259824	259831	0 %	75 %	0 %	25 %	134287787
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5052	NC_009227	GTCA	2	8	260404	260411	25 %	25 %	25 %	25 %	134287788
5053	NC_009227	TGA	2	6	260450	260455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287788
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5055	NC_009227	GCA	2	6	260472	260477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287788
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5059	NC_009227	GCA	2	6	260640	260645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287788
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5105	NC_009227	CG	3	6	262277	262282	0 %	0 %	50 %	50 %	134287791
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5108	NC_009227	CGA	2	6	262310	262315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287791
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5117	NC_009227	CTT	2	6	262681	262686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134287792
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.