MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia vietnamiensis G4 plasmid pBVIE05

Total Repeats: 1980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009226	CGT	2	6	20	25	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
2	NC_009226	CGT	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
3	NC_009226	ACG	2	6	151	156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287419
4	NC_009226	CTT	2	6	180	185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134287419
5	NC_009226	GTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134287419
6	NC_009226	CAT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287419
7	NC_009226	CAT	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287419
8	NC_009226	TCGG	2	8	325	332	0 %	25 %	50 %	25 %	134287419
9	NC_009226	TGA	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287419
10	NC_009226	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287419
11	NC_009226	CGT	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
12	NC_009226	TTG	2	6	448	453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134287419
13	NC_009226	CTC	2	6	483	488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134287419
14	NC_009226	GA	3	6	508	513	50 %	0 %	50 %	0 %	134287419
15	NC_009226	GCG	2	6	534	539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287419
16	NC_009226	CGG	2	6	569	574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287419
17	NC_009226	ACA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134287419
18	NC_009226	GCC	2	6	830	835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287419
19	NC_009226	GCT	2	6	836	841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
20	NC_009226	CCG	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287419
21	NC_009226	TGA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287419
22	NC_009226	CGT	2	6	1026	1031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
23	NC_009226	TTGACG	2	12	1039	1050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134287419
24	NC_009226	CGT	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
25	NC_009226	GTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134287419
26	NC_009226	GCG	2	6	1184	1189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287419
27	NC_009226	GC	3	6	1191	1196	0 %	0 %	50 %	50 %	134287419
28	NC_009226	TGA	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287419
29	NC_009226	CT	3	6	1270	1275	0 %	50 %	0 %	50 %	134287419
30	NC_009226	CTG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287419
31	NC_009226	GCG	2	6	1366	1371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287419
32	NC_009226	GGTT	2	8	1375	1382	0 %	50 %	50 %	0 %	134287419
33	NC_009226	CG	3	6	1418	1423	0 %	0 %	50 %	50 %	134287419
34	NC_009226	CG	3	6	1528	1533	0 %	0 %	50 %	50 %	134287420
35	NC_009226	CGC	2	6	1588	1593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287420
36	NC_009226	GCG	2	6	1603	1608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287420
37	NC_009226	GCA	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287420
38	NC_009226	CCGAG	2	10	1642	1651	20 %	0 %	40 %	40 %	134287420
39	NC_009226	CGG	2	6	1702	1707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287420
40	NC_009226	CG	3	6	1746	1751	0 %	0 %	50 %	50 %	134287420
41	NC_009226	GCG	2	6	1899	1904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287421
42	NC_009226	AGC	2	6	2198	2203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287422
43	NC_009226	ACG	2	6	2224	2229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287422
44	NC_009226	ACG	3	9	2234	2242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287422
45	NC_009226	AGC	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287422
46	NC_009226	GC	3	6	2288	2293	0 %	0 %	50 %	50 %	134287422
47	NC_009226	GAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287422
48	NC_009226	CTA	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287422
49	NC_009226	GAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287422
50	NC_009226	ATGA	2	8	2441	2448	50 %	25 %	25 %	0 %	134287422
51	NC_009226	CAAA	2	8	2452	2459	75 %	0 %	0 %	25 %	134287423
52	NC_009226	CGG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287423
53	NC_009226	GCGA	2	8	2558	2565	25 %	0 %	50 %	25 %	134287423
54	NC_009226	TTGG	2	8	2574	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	134287423
55	NC_009226	CCCGG	2	10	2627	2636	0 %	0 %	40 %	60 %	134287423
56	NC_009226	CGG	2	6	2659	2664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287423
57	NC_009226	CG	3	6	2709	2714	0 %	0 %	50 %	50 %	134287423
58	NC_009226	CAC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287423
59	NC_009226	ACG	3	9	2724	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287423
60	NC_009226	CGA	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287423
61	NC_009226	GC	3	6	2755	2760	0 %	0 %	50 %	50 %	134287423
62	NC_009226	GCGG	2	8	2769	2776	0 %	0 %	75 %	25 %	134287423
63	NC_009226	ACG	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287423
64	NC_009226	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287423
65	NC_009226	GCC	3	9	2834	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287423
66	NC_009226	TCG	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287423
67	NC_009226	ACCG	2	8	2926	2933	25 %	0 %	25 %	50 %	134287423
68	NC_009226	ATCT	2	8	3058	3065	25 %	50 %	0 %	25 %	134287423
69	NC_009226	CAT	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287424
70	NC_009226	TCG	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287424
71	NC_009226	GACA	2	8	3205	3212	50 %	0 %	25 %	25 %	134287424
72	NC_009226	GGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287424
73	NC_009226	TGGCT	2	10	3231	3240	0 %	40 %	40 %	20 %	134287424
74	NC_009226	CCCG	2	8	3249	3256	0 %	0 %	25 %	75 %	134287424
75	NC_009226	TGA	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287424
76	NC_009226	CAT	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287424
77	NC_009226	TGCGC	2	10	3366	3375	0 %	20 %	40 %	40 %	134287424
78	NC_009226	CGT	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287424
79	NC_009226	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134287424
80	NC_009226	CGAGG	2	10	3487	3496	20 %	0 %	60 %	20 %	134287424
81	NC_009226	GC	3	6	3521	3526	0 %	0 %	50 %	50 %	134287424
82	NC_009226	CCG	2	6	3530	3535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287424
83	NC_009226	CGG	2	6	3539	3544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287424
84	NC_009226	CGA	3	9	3579	3587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287424
85	NC_009226	GC	3	6	3599	3604	0 %	0 %	50 %	50 %	134287424
86	NC_009226	TCG	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287424
87	NC_009226	CGC	2	6	3690	3695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287424
88	NC_009226	ACG	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287424
89	NC_009226	CTCG	2	8	3744	3751	0 %	25 %	25 %	50 %	134287424
90	NC_009226	GCT	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287424
91	NC_009226	GC	3	6	3820	3825	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
92	NC_009226	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287425
93	NC_009226	CGC	2	6	3871	3876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287425
94	NC_009226	GC	4	8	3882	3889	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
95	NC_009226	CTTG	2	8	3958	3965	0 %	50 %	25 %	25 %	134287425
96	NC_009226	CGT	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287425
97	NC_009226	CG	3	6	4033	4038	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
98	NC_009226	CG	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	134287425
99	NC_009226	ACC	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287426
100	NC_009226	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287426
101	NC_009226	GAG	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134287426
102	NC_009226	GAG	2	6	4311	4316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134287426
103	NC_009226	GCC	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287426
104	NC_009226	GCG	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287426
105	NC_009226	GGC	2	6	4478	4483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287426
106	NC_009226	AAGC	2	8	4533	4540	50 %	0 %	25 %	25 %	134287426
107	NC_009226	CGAAGC	2	12	4543	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287426
108	NC_009226	GCAG	2	8	4568	4575	25 %	0 %	50 %	25 %	134287426
109	NC_009226	CG	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
110	NC_009226	CGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287426
111	NC_009226	GC	3	6	4688	4693	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
112	NC_009226	GC	3	6	4752	4757	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
113	NC_009226	GAG	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134287426
114	NC_009226	TCG	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287426
115	NC_009226	GGCAAG	2	12	4983	4994	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134287426
116	NC_009226	AGC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287426
117	NC_009226	GC	3	6	5015	5020	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
118	NC_009226	CAC	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287426
119	NC_009226	CTG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287426
120	NC_009226	CGA	2	6	5126	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287426
121	NC_009226	GCT	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287426
122	NC_009226	GGGCC	2	10	5154	5163	0 %	0 %	60 %	40 %	134287426
123	NC_009226	GC	3	6	5202	5207	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
124	NC_009226	CGCGC	2	10	5213	5222	0 %	0 %	40 %	60 %	134287426
125	NC_009226	GC	3	6	5248	5253	0 %	0 %	50 %	50 %	134287426
126	NC_009226	TGC	2	6	5328	5333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287426
127	NC_009226	CAC	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287426
128	NC_009226	GAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134287426
129	NC_009226	CATT	2	8	5494	5501	25 %	50 %	0 %	25 %	134287426
130	NC_009226	GCCGC	3	15	5514	5528	0 %	0 %	40 %	60 %	134287426
131	NC_009226	CCG	2	6	5536	5541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287426
132	NC_009226	CGC	2	6	5915	5920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287427
133	NC_009226	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	134287427
134	NC_009226	GCG	2	6	5973	5978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287427
135	NC_009226	CG	3	6	5977	5982	0 %	0 %	50 %	50 %	134287427
136	NC_009226	TTG	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134287427
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139	NC_009226	CGC	2	6	6139	6144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287427
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141	NC_009226	CGA	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287427
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242	NC_009226	CG	3	6	11511	11516	0 %	0 %	50 %	50 %	134287434
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251	NC_009226	GC	4	8	11739	11746	0 %	0 %	50 %	50 %	134287435
252	NC_009226	GCG	2	6	11768	11773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287435
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255	NC_009226	CGCGG	2	10	11853	11862	0 %	0 %	60 %	40 %	134287435
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257	NC_009226	CGG	2	6	12387	12392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287436
258	NC_009226	GCG	2	6	12427	12432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287436
259	NC_009226	GAC	2	6	12459	12464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287436
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261	NC_009226	CG	3	6	12593	12598	0 %	0 %	50 %	50 %	134287436
262	NC_009226	GAA	2	6	12647	12652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134287436
263	NC_009226	CGC	3	9	12691	12699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287437
264	NC_009226	GGC	2	6	12746	12751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287437
265	NC_009226	GATG	2	8	12804	12811	25 %	25 %	50 %	0 %	134287437
266	NC_009226	TGA	2	6	12894	12899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134287437
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271	NC_009226	TCGA	2	8	13031	13038	25 %	25 %	25 %	25 %	134287438
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389	NC_009226	GCA	2	6	18863	18868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287450
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392	NC_009226	GCG	2	6	18904	18909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287450
393	NC_009226	CCA	2	6	18935	18940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287450
394	NC_009226	GCC	2	6	18985	18990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287450
395	NC_009226	GTC	3	9	18991	18999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287450
396	NC_009226	GCC	2	6	19217	19222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287450
397	NC_009226	GC	3	6	19225	19230	0 %	0 %	50 %	50 %	134287450
398	NC_009226	GGC	2	6	19238	19243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287450
399	NC_009226	CGA	2	6	19275	19280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134287450
400	NC_009226	GCT	2	6	19291	19296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287450
401	NC_009226	CAC	2	6	19325	19330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134287450
402	NC_009226	ATCC	2	8	19343	19350	25 %	25 %	0 %	50 %	134287450
403	NC_009226	GCC	2	6	19378	19383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134287450
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405	NC_009226	CAT	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134287450
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426	NC_009226	CAGT	2	8	20359	20366	25 %	25 %	25 %	25 %	134287452
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453	NC_009226	CCGC	2	8	21407	21414	0 %	0 %	25 %	75 %	134287454
454	NC_009226	TGC	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287454
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496	NC_009226	CGG	2	6	23105	23110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287455
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498	NC_009226	GCG	2	6	23219	23224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134287455
499	NC_009226	GTC	2	6	23320	23325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134287455
500	NC_009226	GC	3	6	23332	23337	0 %	0 %	50 %	50 %	134287455

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