MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp25

Total Repeats: 524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008569	ACT	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621835
2	NC_008569	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
3	NC_008569	ATT	3	9	770	778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621835
4	NC_008569	ATA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
5	NC_008569	TTC	2	6	941	946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621835
6	NC_008569	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	117621835
7	NC_008569	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621835
8	NC_008569	GTT	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621835
9	NC_008569	TA	3	6	1209	1214	50 %	50 %	0 %	0 %	117621835
10	NC_008569	TGT	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621835
11	NC_008569	CCAACA	2	12	1355	1366	50 %	0 %	0 %	50 %	117621836
12	NC_008569	CTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621836
13	NC_008569	TTG	4	12	1477	1488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
14	NC_008569	TCA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
15	NC_008569	TTG	2	6	1501	1506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
16	NC_008569	TTC	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621836
17	NC_008569	CAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
18	NC_008569	TC	3	6	1566	1571	0 %	50 %	0 %	50 %	117621836
19	NC_008569	CT	3	6	1591	1596	0 %	50 %	0 %	50 %	117621836
20	NC_008569	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
21	NC_008569	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
22	NC_008569	AAT	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
23	NC_008569	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
24	NC_008569	TCAT	2	8	1892	1899	25 %	50 %	0 %	25 %	117621836
25	NC_008569	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621836
26	NC_008569	GTA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621836
27	NC_008569	AATT	2	8	1938	1945	50 %	50 %	0 %	0 %	117621836
28	NC_008569	A	7	7	1989	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	117621836
29	NC_008569	TTG	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621836
30	NC_008569	AAG	2	6	2046	2051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621836
31	NC_008569	T	6	6	2095	2100	0 %	100 %	0 %	0 %	117621836
32	NC_008569	CAA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
33	NC_008569	CTA	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
34	NC_008569	CAAA	2	8	2280	2287	75 %	0 %	0 %	25 %	117621836
35	NC_008569	ATC	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
36	NC_008569	ATG	2	6	2375	2380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621836
37	NC_008569	CTA	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621836
38	NC_008569	GCAA	2	8	2551	2558	50 %	0 %	25 %	25 %	117621836
39	NC_008569	ACA	2	6	2654	2659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621836
40	NC_008569	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621836
41	NC_008569	TGGGG	2	10	2781	2790	0 %	20 %	80 %	0 %	117621837
42	NC_008569	TCTT	2	8	2819	2826	0 %	75 %	0 %	25 %	117621837
43	NC_008569	T	6	6	2830	2835	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
44	NC_008569	TA	3	6	2932	2937	50 %	50 %	0 %	0 %	117621837
45	NC_008569	AC	3	6	3001	3006	50 %	0 %	0 %	50 %	117621837
46	NC_008569	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
47	NC_008569	T	9	9	3059	3067	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
48	NC_008569	TTG	2	6	3163	3168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621837
49	NC_008569	T	6	6	3185	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
50	NC_008569	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	117621837
51	NC_008569	T	8	8	3227	3234	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
52	NC_008569	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621837
53	NC_008569	T	6	6	3308	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
54	NC_008569	A	6	6	3315	3320	100 %	0 %	0 %	0 %	117621837
55	NC_008569	T	6	6	3327	3332	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
56	NC_008569	T	6	6	3377	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	117621837
57	NC_008569	TCC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621838
58	NC_008569	GCCACT	2	12	3511	3522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117621838
59	NC_008569	T	8	8	3715	3722	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
60	NC_008569	CAATC	2	10	3723	3732	40 %	20 %	0 %	40 %	117621838
61	NC_008569	AAT	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621838
62	NC_008569	TCT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621838
63	NC_008569	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
64	NC_008569	T	8	8	3806	3813	0 %	100 %	0 %	0 %	117621838
65	NC_008569	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	117621838
66	NC_008569	TCT	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621838
67	NC_008569	T	6	6	3937	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
68	NC_008569	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621839
69	NC_008569	T	6	6	4023	4028	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
70	NC_008569	T	6	6	4035	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
71	NC_008569	G	7	7	4041	4047	0 %	0 %	100 %	0 %	117621839
72	NC_008569	TTG	2	6	4099	4104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
73	NC_008569	T	6	6	4113	4118	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
74	NC_008569	TAC	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
75	NC_008569	CT	3	6	4147	4152	0 %	50 %	0 %	50 %	117621839
76	NC_008569	CTA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
77	NC_008569	CT	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	117621839
78	NC_008569	TTC	2	6	4183	4188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621839
79	NC_008569	AGCA	2	8	4207	4214	50 %	0 %	25 %	25 %	117621839
80	NC_008569	CAT	2	6	4284	4289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
81	NC_008569	TAA	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
82	NC_008569	TCA	3	9	4317	4325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
83	NC_008569	TTA	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
84	NC_008569	ATT	2	6	4456	4461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
85	NC_008569	TATT	2	8	4506	4513	25 %	75 %	0 %	0 %	117621839
86	NC_008569	T	7	7	4553	4559	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
87	NC_008569	TA	4	8	4572	4579	50 %	50 %	0 %	0 %	117621839
88	NC_008569	TAA	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
89	NC_008569	GGC	3	9	4634	4642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621839
90	NC_008569	T	7	7	4729	4735	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
91	NC_008569	TCA	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621839
92	NC_008569	CAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621839
93	NC_008569	TGTGG	2	10	4842	4851	0 %	40 %	60 %	0 %	117621839
94	NC_008569	TGT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
95	NC_008569	GTACG	2	10	4971	4980	20 %	20 %	40 %	20 %	117621839
96	NC_008569	T	7	7	4992	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
97	NC_008569	TTG	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621839
98	NC_008569	T	7	7	5145	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
99	NC_008569	T	6	6	5198	5203	0 %	100 %	0 %	0 %	117621839
100	NC_008569	TAA	2	6	5244	5249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621839
101	NC_008569	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621839
102	NC_008569	AT	3	6	5291	5296	50 %	50 %	0 %	0 %	117621839
103	NC_008569	A	8	8	5661	5668	100 %	0 %	0 %	0 %	117621840
104	NC_008569	ATT	2	6	5694	5699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621840
105	NC_008569	TAC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621840
106	NC_008569	GAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
107	NC_008569	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
108	NC_008569	AAAG	2	8	5952	5959	75 %	0 %	25 %	0 %	117621840
109	NC_008569	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621840
110	NC_008569	A	6	6	6006	6011	100 %	0 %	0 %	0 %	117621840
111	NC_008569	T	6	6	6057	6062	0 %	100 %	0 %	0 %	117621841
112	NC_008569	A	7	7	6090	6096	100 %	0 %	0 %	0 %	117621841
113	NC_008569	CAAAT	2	10	6193	6202	60 %	20 %	0 %	20 %	117621841
114	NC_008569	GTA	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
115	NC_008569	TGA	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
116	NC_008569	TGA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621841
117	NC_008569	AACA	2	8	6547	6554	75 %	0 %	0 %	25 %	117621842
118	NC_008569	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621842
119	NC_008569	TGA	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621842
120	NC_008569	GCAA	2	8	6647	6654	50 %	0 %	25 %	25 %	117621842
121	NC_008569	TAC	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621842
122	NC_008569	A	6	6	6742	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	117621842
123	NC_008569	A	6	6	6809	6814	100 %	0 %	0 %	0 %	117621842
124	NC_008569	CAG	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621842
125	NC_008569	TCAAG	2	10	6860	6869	40 %	20 %	20 %	20 %	117621843
126	NC_008569	ACT	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621843
127	NC_008569	A	7	7	6921	6927	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
128	NC_008569	GAA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
129	NC_008569	AGA	2	6	6997	7002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
130	NC_008569	ACA	2	6	7004	7009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621843
131	NC_008569	CTT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621843
132	NC_008569	AGA	2	6	7108	7113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
133	NC_008569	A	6	6	7113	7118	100 %	0 %	0 %	0 %	117621843
134	NC_008569	CAG	2	6	7140	7145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621843
135	NC_008569	AGA	2	6	7180	7185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621843
136	NC_008569	TTC	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621843
137	NC_008569	ATA	2	6	7236	7241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621843
138	NC_008569	T	6	6	7277	7282	0 %	100 %	0 %	0 %	117621843
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