MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	ATATA	2	10	926	935	60 %	40 %	0 %	0 %	117621707
2	NC_008566	TTGT	2	8	945	952	0 %	75 %	25 %	0 %	117621707
3	NC_008566	T	6	6	959	964	0 %	100 %	0 %	0 %	117621707
4	NC_008566	A	7	7	1020	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
5	NC_008566	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
6	NC_008566	AGA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
7	NC_008566	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
8	NC_008566	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
9	NC_008566	AGA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
10	NC_008566	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
11	NC_008566	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621707
12	NC_008566	A	7	7	1199	1205	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
13	NC_008566	A	8	8	1210	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
14	NC_008566	AGA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
15	NC_008566	TTGGG	2	10	1266	1275	0 %	40 %	60 %	0 %	117621707
16	NC_008566	A	6	6	1291	1296	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
17	NC_008566	ATA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
18	NC_008566	AG	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621707
19	NC_008566	TGT	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
20	NC_008566	CTT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621707
21	NC_008566	GAC	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621707
22	NC_008566	A	6	6	1485	1490	100 %	0 %	0 %	0 %	117621707
23	NC_008566	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621707
24	NC_008566	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
25	NC_008566	TTA	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621707
26	NC_008566	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621707
27	NC_008566	AGA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
28	NC_008566	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621707
29	NC_008566	TACAA	2	10	1727	1736	60 %	20 %	0 %	20 %	117621707
30	NC_008566	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621708
31	NC_008566	ATTT	2	8	2514	2521	25 %	75 %	0 %	0 %	117621708
32	NC_008566	AT	3	6	2536	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
33	NC_008566	AC	3	6	2565	2570	50 %	0 %	0 %	50 %	117621708
34	NC_008566	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
35	NC_008566	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621709
36	NC_008566	A	6	6	3170	3175	100 %	0 %	0 %	0 %	117621709
37	NC_008566	TAT	2	6	3178	3183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621709
38	NC_008566	T	7	7	3195	3201	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
39	NC_008566	TTTA	2	8	3203	3210	25 %	75 %	0 %	0 %	117621709
40	NC_008566	TAA	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621709
41	NC_008566	AT	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	117621709
42	NC_008566	CTG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621709
43	NC_008566	T	6	6	3315	3320	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
44	NC_008566	T	7	7	3325	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	117621709
45	NC_008566	TTTAA	2	10	3400	3409	40 %	60 %	0 %	0 %	117621710
46	NC_008566	CAT	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
47	NC_008566	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621710
48	NC_008566	AAC	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
49	NC_008566	ACC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621710
50	NC_008566	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	117621710
51	NC_008566	CAA	2	6	3680	3685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621710
52	NC_008566	TTA	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
53	NC_008566	TTA	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621710
54	NC_008566	TTAT	2	8	3778	3785	25 %	75 %	0 %	0 %	117621710
55	NC_008566	TATT	2	8	3816	3823	25 %	75 %	0 %	0 %	117621711
56	NC_008566	A	7	7	3824	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
57	NC_008566	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
58	NC_008566	A	7	7	3878	3884	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
59	NC_008566	A	6	6	3886	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
60	NC_008566	A	6	6	3899	3904	100 %	0 %	0 %	0 %	117621711
61	NC_008566	AATTTT	2	12	4284	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
62	NC_008566	TTG	2	6	4319	4324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621712
63	NC_008566	TCA	4	12	4362	4373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
64	NC_008566	A	6	6	4378	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	117621712
65	NC_008566	ATTA	2	8	4385	4392	50 %	50 %	0 %	0 %	117621712
66	NC_008566	A	7	7	4422	4428	100 %	0 %	0 %	0 %	117621712
67	NC_008566	TTAC	2	8	4449	4456	25 %	50 %	0 %	25 %	117621712
68	NC_008566	TTA	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
69	NC_008566	A	6	6	4569	4574	100 %	0 %	0 %	0 %	117621712
70	NC_008566	A	6	6	4599	4604	100 %	0 %	0 %	0 %	117621712
71	NC_008566	TTA	2	6	4665	4670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621712
72	NC_008566	A	7	7	4763	4769	100 %	0 %	0 %	0 %	117621712
73	NC_008566	TCA	2	6	4770	4775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621712
74	NC_008566	T	8	8	5155	5162	0 %	100 %	0 %	0 %	117621713
75	NC_008566	GCTT	2	8	5193	5200	0 %	50 %	25 %	25 %	117621713
76	NC_008566	TAA	2	6	5220	5225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621713
77	NC_008566	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621713
78	NC_008566	GTG	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621713
79	NC_008566	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
80	NC_008566	AGA	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621714
81	NC_008566	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
82	NC_008566	T	6	6	5691	5696	0 %	100 %	0 %	0 %	117621714
83	NC_008566	GTA	3	9	5717	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
84	NC_008566	TTA	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621714
85	NC_008566	TAG	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
86	NC_008566	ATG	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621714
87	NC_008566	AAT	2	6	5907	5912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621714
88	NC_008566	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
89	NC_008566	T	7	7	7000	7006	0 %	100 %	0 %	0 %	117621715
90	NC_008566	A	6	6	7007	7012	100 %	0 %	0 %	0 %	117621715
91	NC_008566	CT	3	6	7037	7042	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
92	NC_008566	CT	3	6	7097	7102	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
93	NC_008566	TAA	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
94	NC_008566	CT	3	6	7118	7123	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
95	NC_008566	A	6	6	7147	7152	100 %	0 %	0 %	0 %	117621715
96	NC_008566	TTAT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	117621715
97	NC_008566	TCA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
98	NC_008566	CTTAT	2	10	7256	7265	20 %	60 %	0 %	20 %	117621715
99	NC_008566	T	6	6	7300	7305	0 %	100 %	0 %	0 %	117621715
100	NC_008566	TCA	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
101	NC_008566	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
102	NC_008566	ATC	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
103	NC_008566	AT	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
104	NC_008566	AC	4	8	7370	7377	50 %	0 %	0 %	50 %	117621715
105	NC_008566	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
106	NC_008566	T	7	7	7483	7489	0 %	100 %	0 %	0 %	117621715
107	NC_008566	T	9	9	7495	7503	0 %	100 %	0 %	0 %	117621715
108	NC_008566	TTA	2	6	7538	7543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
109	NC_008566	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
110	NC_008566	CTT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
111	NC_008566	ACT	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621715
112	NC_008566	CTT	2	6	7689	7694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621715
113	NC_008566	CATTAT	2	12	7698	7709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	117621715
114	NC_008566	TTA	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621715
115	NC_008566	AAT	2	6	7730	7735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621715
116	NC_008566	AT	4	8	7776	7783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
117	NC_008566	T	6	6	7793	7798	0 %	100 %	0 %	0 %	117621715
118	NC_008566	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621716
119	NC_008566	TATT	2	8	8643	8650	25 %	75 %	0 %	0 %	117621716
120	NC_008566	AGA	2	6	8698	8703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621716
121	NC_008566	ATG	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621717
122	NC_008566	GAA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621717
123	NC_008566	A	6	6	8933	8938	100 %	0 %	0 %	0 %	117621717
124	NC_008566	TCC	2	6	8941	8946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621717
125	NC_008566	AGA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621717
126	NC_008566	AAT	2	6	9048	9053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621717
127	NC_008566	A	6	6	9124	9129	100 %	0 %	0 %	0 %	117621717
128	NC_008566	A	6	6	9185	9190	100 %	0 %	0 %	0 %	117621717
129	NC_008566	TAT	2	6	9191	9196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621717
130	NC_008566	AAC	2	6	9227	9232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621717
131	NC_008566	TTA	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621717
132	NC_008566	AC	3	6	9302	9307	50 %	0 %	0 %	50 %	117621717
133	NC_008566	ACA	2	6	9351	9356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621717
134	NC_008566	CAT	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621718
135	NC_008566	TGAT	2	8	9834	9841	25 %	50 %	25 %	0 %	117621718
136	NC_008566	ATCT	2	8	9849	9856	25 %	50 %	0 %	25 %	117621718
137	NC_008566	ATT	2	6	9928	9933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621718
138	NC_008566	TAT	2	6	9985	9990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621718
139	NC_008566	TCTTT	2	10	10040	10049	0 %	80 %	0 %	20 %	117621718
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