MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 2

Total Repeats: 77169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008543	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691274
2	NC_008543	GAC	2	6	265	270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
3	NC_008543	TCG	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691274
4	NC_008543	CAG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691274
5	NC_008543	TGA	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691274
6	NC_008543	CGGG	2	8	747	754	0 %	0 %	75 %	25 %	162228942
7	NC_008543	GC	3	6	782	787	0 %	0 %	50 %	50 %	162228942
8	NC_008543	CGG	3	9	801	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
9	NC_008543	GCA	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
10	NC_008543	CGA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
11	NC_008543	TCT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
12	NC_008543	GCG	2	6	979	984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
13	NC_008543	TGC	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
14	NC_008543	GCGAC	2	10	1034	1043	20 %	0 %	40 %	40 %	162228942
15	NC_008543	CGC	2	6	1067	1072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
16	NC_008543	TGA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
17	NC_008543	GGCC	2	8	1109	1116	0 %	0 %	50 %	50 %	162228942
18	NC_008543	CTTC	2	8	1133	1140	0 %	50 %	0 %	50 %	162228942
19	NC_008543	GTC	3	9	1179	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
20	NC_008543	TCG	2	6	1231	1236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
21	NC_008543	CAT	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
22	NC_008543	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
23	NC_008543	GAT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
24	NC_008543	CTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
25	NC_008543	CGG	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
26	NC_008543	CCGA	2	8	1411	1418	25 %	0 %	25 %	50 %	162228942
27	NC_008543	TGC	2	6	1444	1449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
28	NC_008543	GCC	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
29	NC_008543	GCA	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
30	NC_008543	CCG	2	6	1555	1560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
31	NC_008543	GCG	2	6	1598	1603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
32	NC_008543	TCG	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
33	NC_008543	CGACAG	2	12	1680	1691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
34	NC_008543	CGA	2	6	1721	1726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
35	NC_008543	CAT	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162228942
36	NC_008543	CTT	2	6	1905	1910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
37	NC_008543	GTC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162228942
38	NC_008543	GCG	2	6	1952	1957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
39	NC_008543	TGA	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
40	NC_008543	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
41	NC_008543	CTTG	2	8	1994	2001	0 %	50 %	25 %	25 %	162228942
42	NC_008543	ATG	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162228942
43	NC_008543	CCG	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162228942
44	NC_008543	CAG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
45	NC_008543	TTC	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162228942
46	NC_008543	CGG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162228942
47	NC_008543	CGA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
48	NC_008543	CAG	2	6	2360	2365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162228942
49	NC_008543	TCACT	2	10	2893	2902	20 %	40 %	0 %	40 %	116691276
50	NC_008543	CCG	2	6	2908	2913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
51	NC_008543	C	6	6	2954	2959	0 %	0 %	0 %	100 %	116691276
52	NC_008543	CTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691276
53	NC_008543	CAC	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691276
54	NC_008543	GCCG	2	8	3018	3025	0 %	0 %	50 %	50 %	116691276
55	NC_008543	CGC	2	6	3053	3058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691276
56	NC_008543	GCG	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
57	NC_008543	AGC	3	9	3105	3113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
58	NC_008543	AATGCG	2	12	3145	3156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116691276
59	NC_008543	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691276
60	NC_008543	ACG	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691276
61	NC_008543	CG	3	6	3587	3592	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
62	NC_008543	CG	3	6	3600	3605	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
63	NC_008543	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
64	NC_008543	GC	3	6	3653	3658	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
65	NC_008543	GC	3	6	3690	3695	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
66	NC_008543	GTC	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
67	NC_008543	CATCAC	2	12	3777	3788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116691277
68	NC_008543	GCA	2	6	3806	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
69	NC_008543	CGGCCA	2	12	3821	3832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116691277
70	NC_008543	GCAGC	2	10	3839	3848	20 %	0 %	40 %	40 %	116691277
71	NC_008543	GC	3	6	3851	3856	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
72	NC_008543	TCG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
73	NC_008543	GGC	2	6	3899	3904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
74	NC_008543	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
75	NC_008543	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691277
76	NC_008543	GCA	3	9	4076	4084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
77	NC_008543	ATG	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691277
78	NC_008543	CGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
79	NC_008543	GC	3	6	4202	4207	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
80	NC_008543	CGA	2	6	4208	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
81	NC_008543	CGA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
82	NC_008543	GTC	2	6	4269	4274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691277
83	NC_008543	AGC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
84	NC_008543	CCA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691277
85	NC_008543	CGA	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691277
86	NC_008543	GCG	2	6	4360	4365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691277
87	NC_008543	GCGCG	2	10	4471	4480	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
88	NC_008543	CG	3	6	4484	4489	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
89	NC_008543	CGGCG	2	10	4511	4520	0 %	0 %	60 %	40 %	116691277
90	NC_008543	CG	3	6	4526	4531	0 %	0 %	50 %	50 %	116691277
91	NC_008543	TCG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
92	NC_008543	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
93	NC_008543	CGTG	2	8	4835	4842	0 %	25 %	50 %	25 %	116691278
94	NC_008543	ACG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
95	NC_008543	GCCG	2	8	4887	4894	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
96	NC_008543	CGG	2	6	4904	4909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
97	NC_008543	ACC	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116691278
98	NC_008543	TTC	2	6	4936	4941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691278
99	NC_008543	CG	3	6	4947	4952	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
100	NC_008543	ACG	2	6	4954	4959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
101	NC_008543	GGC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
102	NC_008543	CCG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
103	NC_008543	CGC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
104	NC_008543	GGCA	2	8	5031	5038	25 %	0 %	50 %	25 %	116691278
105	NC_008543	CGA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
106	NC_008543	GGT	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691278
107	NC_008543	CG	4	8	5103	5110	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
108	NC_008543	GCG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
109	NC_008543	CGGTC	2	10	5199	5208	0 %	20 %	40 %	40 %	116691278
110	NC_008543	CCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
111	NC_008543	CG	3	6	5258	5263	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
112	NC_008543	TCG	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
113	NC_008543	GC	4	8	5299	5306	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
114	NC_008543	GCCG	2	8	5313	5320	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
115	NC_008543	CGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
116	NC_008543	GCGCG	2	10	5373	5382	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
117	NC_008543	GGCCG	2	10	5432	5441	0 %	0 %	60 %	40 %	116691278
118	NC_008543	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
119	NC_008543	CGC	2	6	5583	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691278
120	NC_008543	GC	4	8	5612	5619	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
121	NC_008543	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
122	NC_008543	GCG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
123	NC_008543	CG	3	6	5735	5740	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
124	NC_008543	GTG	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691278
125	NC_008543	CGG	2	6	5772	5777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
126	NC_008543	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
127	NC_008543	GC	4	8	5831	5838	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
128	NC_008543	CG	3	6	5843	5848	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
129	NC_008543	GCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691278
130	NC_008543	GC	3	6	5923	5928	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
131	NC_008543	TCG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691278
132	NC_008543	GCG	2	6	5965	5970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691278
133	NC_008543	GC	3	6	6019	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	116691278
134	NC_008543	GCAC	2	8	6430	6437	25 %	0 %	25 %	50 %	116691279
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157	NC_008543	CGA	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691279
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259	NC_008543	ACG	2	6	11565	11570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
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262	NC_008543	TGC	2	6	11688	11693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691281
263	NC_008543	GTTC	2	8	11694	11701	0 %	50 %	25 %	25 %	116691281
264	NC_008543	GAC	2	6	11716	11721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
265	NC_008543	CGG	2	6	11725	11730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691281
266	NC_008543	CGA	3	9	11733	11741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691281
267	NC_008543	TCG	2	6	11787	11792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691281
268	NC_008543	GTG	2	6	11899	11904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116691281
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272	NC_008543	TCT	2	6	12149	12154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691282
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280	NC_008543	TCG	2	6	12620	12625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691282
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284	NC_008543	CGT	2	6	12737	12742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116691282
285	NC_008543	GCA	2	6	12755	12760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691282
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292	NC_008543	TACGCG	2	12	13110	13121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116691283
293	NC_008543	CGGC	2	8	13190	13197	0 %	0 %	50 %	50 %	116691283
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295	NC_008543	CGC	2	6	13239	13244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691283
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356	NC_008543	CGC	2	6	16701	16706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691285
357	NC_008543	CG	3	6	16730	16735	0 %	0 %	50 %	50 %	116691285
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359	NC_008543	GAC	2	6	16834	16839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691285
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362	NC_008543	CTT	2	6	16912	16917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116691285
363	NC_008543	CGG	2	6	16929	16934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691285
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371	NC_008543	TGCG	2	8	17260	17267	0 %	25 %	50 %	25 %	116691286
372	NC_008543	GC	3	6	17294	17299	0 %	0 %	50 %	50 %	116691286
373	NC_008543	GCG	2	6	17325	17330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691286
374	NC_008543	GCC	2	6	17380	17385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691286
375	NC_008543	CGC	2	6	17416	17421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116691286
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377	NC_008543	GGCT	2	8	17480	17487	0 %	25 %	50 %	25 %	116691286
378	NC_008543	TGA	2	6	17499	17504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691286
379	NC_008543	GATC	2	8	17508	17515	25 %	25 %	25 %	25 %	116691286
380	NC_008543	GAT	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116691286
381	NC_008543	CGA	2	6	17568	17573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116691286
382	NC_008543	CGGGC	2	10	17583	17592	0 %	0 %	60 %	40 %	116691286
383	NC_008543	GCG	2	6	17605	17610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691286
384	NC_008543	GCG	2	6	17651	17656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691286
385	NC_008543	CGG	2	6	17662	17667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116691286
386	NC_008543	GC	3	6	17688	17693	0 %	0 %	50 %	50 %	116691286
387	NC_008543	CTC	2	6	17957	17962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116691287
388	NC_008543	GC	4	8	17963	17970	0 %	0 %	50 %	50 %	116691287
389	NC_008543	GC	4	8	17975	17982	0 %	0 %	50 %	50 %	116691287
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