MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 14308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008513	TTC	2	6	360288	360293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515240
12502	NC_008513	TA	3	6	360294	360299	50 %	50 %	0 %	0 %	116515240
12503	NC_008513	CCT	2	6	360311	360316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515240
12504	NC_008513	TCC	2	6	360373	360378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515240
12505	NC_008513	T	6	6	360418	360423	0 %	100 %	0 %	0 %	116515240
12506	NC_008513	T	7	7	360429	360435	0 %	100 %	0 %	0 %	116515240
12507	NC_008513	ATATA	2	10	360496	360505	60 %	40 %	0 %	0 %	116515241
12508	NC_008513	GCT	2	6	360529	360534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515241
12509	NC_008513	TCTTT	2	10	360538	360547	0 %	80 %	0 %	20 %	116515241
12510	NC_008513	TTA	2	6	360635	360640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515241
12511	NC_008513	ATA	2	6	360652	360657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515241
12512	NC_008513	ATT	2	6	360682	360687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515242
12513	NC_008513	TAA	2	6	360689	360694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515242
12514	NC_008513	T	7	7	360704	360710	0 %	100 %	0 %	0 %	116515242
12515	NC_008513	T	8	8	360734	360741	0 %	100 %	0 %	0 %	116515242
12516	NC_008513	ACA	2	6	360763	360768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515242
12517	NC_008513	TAG	2	6	360779	360784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515242
12518	NC_008513	AT	3	6	360789	360794	50 %	50 %	0 %	0 %	116515242
12519	NC_008513	CCA	2	6	360847	360852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515242
12520	NC_008513	AAT	2	6	360855	360860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515242
12521	NC_008513	TGTA	2	8	360903	360910	25 %	50 %	25 %	0 %	116515242
12522	NC_008513	TAAA	2	8	360941	360948	75 %	25 %	0 %	0 %	116515242
12523	NC_008513	T	6	6	360964	360969	0 %	100 %	0 %	0 %	116515242
12524	NC_008513	ATT	2	6	361047	361052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515242
12525	NC_008513	CAA	2	6	361055	361060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515242
12526	NC_008513	A	6	6	361079	361084	100 %	0 %	0 %	0 %	116515242
12527	NC_008513	TTC	2	6	361085	361090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515242
12528	NC_008513	AATT	2	8	361125	361132	50 %	50 %	0 %	0 %	116515242
12529	NC_008513	T	7	7	361156	361162	0 %	100 %	0 %	0 %	116515242
12530	NC_008513	TTC	2	6	361230	361235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515243
12531	NC_008513	A	6	6	361269	361274	100 %	0 %	0 %	0 %	116515243
12532	NC_008513	T	6	6	361278	361283	0 %	100 %	0 %	0 %	116515243
12533	NC_008513	GCTC	2	8	361300	361307	0 %	25 %	25 %	50 %	116515243
12534	NC_008513	AATT	2	8	361311	361318	50 %	50 %	0 %	0 %	116515243
12535	NC_008513	ATT	2	6	361324	361329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515243
12536	NC_008513	ATT	2	6	361359	361364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515243
12537	NC_008513	AAG	2	6	361412	361417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515243
12538	NC_008513	AAT	2	6	361428	361433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515243
12539	NC_008513	CTT	2	6	361489	361494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515243
12540	NC_008513	T	7	7	361496	361502	0 %	100 %	0 %	0 %	116515243
12541	NC_008513	T	10	10	361532	361541	0 %	100 %	0 %	0 %	116515243
12542	NC_008513	T	9	9	361565	361573	0 %	100 %	0 %	0 %	116515244
12543	NC_008513	TAT	2	6	361588	361593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515244
12544	NC_008513	TACCTT	2	12	361611	361622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116515244
12545	NC_008513	GCT	2	6	361658	361663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515244
12546	NC_008513	CTA	2	6	361671	361676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515244
12547	NC_008513	TTA	2	6	361682	361687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515244
12548	NC_008513	ATA	2	6	361695	361700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515244
12549	NC_008513	ATA	2	6	361716	361721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515244
12550	NC_008513	ATT	3	9	361792	361800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515244
12551	NC_008513	AATT	2	8	361834	361841	50 %	50 %	0 %	0 %	116515244
12552	NC_008513	AAT	2	6	361867	361872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515244
12553	NC_008513	TGA	2	6	361927	361932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515244
12554	NC_008513	A	7	7	361944	361950	100 %	0 %	0 %	0 %	116515244
12555	NC_008513	T	6	6	361964	361969	0 %	100 %	0 %	0 %	116515244
12556	NC_008513	T	9	9	361994	362002	0 %	100 %	0 %	0 %	116515244
12557	NC_008513	ATA	2	6	362220	362225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515245
12558	NC_008513	ATT	2	6	362237	362242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515245
12559	NC_008513	TTA	2	6	362265	362270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515245
12560	NC_008513	GAC	2	6	362290	362295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515245
12561	NC_008513	A	7	7	362343	362349	100 %	0 %	0 %	0 %	116515245
12562	NC_008513	TAT	3	9	362362	362370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515245
12563	NC_008513	T	9	9	362370	362378	0 %	100 %	0 %	0 %	116515245
12564	NC_008513	AT	3	6	362394	362399	50 %	50 %	0 %	0 %	116515245
12565	NC_008513	GCT	2	6	362627	362632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515246
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12569	NC_008513	TC	3	6	362814	362819	0 %	50 %	0 %	50 %	116515246
12570	NC_008513	A	6	6	362825	362830	100 %	0 %	0 %	0 %	116515246
12571	NC_008513	T	7	7	362845	362851	0 %	100 %	0 %	0 %	116515246
12572	NC_008513	ATTG	2	8	362873	362880	25 %	50 %	25 %	0 %	116515246
12573	NC_008513	ATTTT	2	10	362905	362914	20 %	80 %	0 %	0 %	116515247
12574	NC_008513	TAA	2	6	362938	362943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515247
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12577	NC_008513	TAAT	2	8	363020	363027	50 %	50 %	0 %	0 %	116515247
12578	NC_008513	AAT	2	6	363037	363042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515247
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12580	NC_008513	A	7	7	363148	363154	100 %	0 %	0 %	0 %	116515247
12581	NC_008513	TCT	2	6	363163	363168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515247
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12583	NC_008513	TAA	2	6	363246	363251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515247
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12586	NC_008513	AAT	2	6	363381	363386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515247
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12588	NC_008513	TATAA	2	10	363423	363432	60 %	40 %	0 %	0 %	116515247
12589	NC_008513	ATA	2	6	363446	363451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515247
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12591	NC_008513	A	7	7	363522	363528	100 %	0 %	0 %	0 %	116515248
12592	NC_008513	T	6	6	363544	363549	0 %	100 %	0 %	0 %	116515248
12593	NC_008513	T	6	6	363553	363558	0 %	100 %	0 %	0 %	116515248
12594	NC_008513	TCC	2	6	363610	363615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116515248
12595	NC_008513	T	7	7	363649	363655	0 %	100 %	0 %	0 %	116515248
12596	NC_008513	CAA	2	6	363672	363677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515248
12597	NC_008513	TAT	2	6	363684	363689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515248
12598	NC_008513	AT	3	6	363697	363702	50 %	50 %	0 %	0 %	116515248
12599	NC_008513	T	8	8	363702	363709	0 %	100 %	0 %	0 %	116515248
12600	NC_008513	GTA	2	6	363905	363910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515249
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12603	NC_008513	T	6	6	363976	363981	0 %	100 %	0 %	0 %	116515249
12604	NC_008513	GTAC	2	8	363983	363990	25 %	25 %	25 %	25 %	116515249
12605	NC_008513	TAC	3	9	363988	363996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515249
12606	NC_008513	TAC	2	6	364003	364008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515249
12607	NC_008513	CTTT	2	8	364014	364021	0 %	75 %	0 %	25 %	116515249
12608	NC_008513	CTT	2	6	364041	364046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515249
12609	NC_008513	TAT	2	6	364060	364065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515249
12610	NC_008513	ACC	2	6	364096	364101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515249
12611	NC_008513	AT	4	8	364175	364182	50 %	50 %	0 %	0 %	116515249
12612	NC_008513	T	7	7	364418	364424	0 %	100 %	0 %	0 %	116515250
12613	NC_008513	CAT	2	6	364425	364430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515250
12614	NC_008513	T	7	7	364449	364455	0 %	100 %	0 %	0 %	116515250
12615	NC_008513	T	6	6	364462	364467	0 %	100 %	0 %	0 %	116515250
12616	NC_008513	AT	3	6	364468	364473	50 %	50 %	0 %	0 %	116515250
12617	NC_008513	TTTTA	2	10	364480	364489	20 %	80 %	0 %	0 %	116515250
12618	NC_008513	TTA	2	6	364523	364528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515250
12619	NC_008513	T	10	10	364553	364562	0 %	100 %	0 %	0 %	116515250
12620	NC_008513	TTTA	2	8	364587	364594	25 %	75 %	0 %	0 %	116515251
12621	NC_008513	TCTT	2	8	364618	364625	0 %	75 %	0 %	25 %	116515251
12622	NC_008513	T	9	9	364627	364635	0 %	100 %	0 %	0 %	116515251
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12995	NC_008513	AAT	2	6	376969	376974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515269
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