MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 32209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_008392	GCT	2	6	1191389	1191394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30002	NC_008392	ACCG	2	8	1191399	1191406	25 %	0 %	25 %	50 %	115361247
30003	NC_008392	GAA	2	6	1191425	1191430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361247
30004	NC_008392	CATCGA	2	12	1191464	1191475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115361247
30005	NC_008392	TGC	2	6	1191529	1191534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30006	NC_008392	AGG	2	6	1191535	1191540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115361247
30007	NC_008392	ACG	2	6	1191615	1191620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30008	NC_008392	GTG	2	6	1191636	1191641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361247
30009	NC_008392	TGGT	2	8	1191746	1191753	0 %	50 %	50 %	0 %	115361247
30010	NC_008392	TGG	2	6	1191775	1191780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361247
30011	NC_008392	CGC	2	6	1191827	1191832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361247
30012	NC_008392	GTG	2	6	1191873	1191878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361247
30013	NC_008392	CGC	2	6	1191896	1191901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361247
30014	NC_008392	CGG	2	6	1191947	1191952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361247
30015	NC_008392	GCC	3	9	1191956	1191964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361247
30016	NC_008392	ACGC	2	8	1192008	1192015	25 %	0 %	25 %	50 %	115361247
30017	NC_008392	GCTCGA	2	12	1192079	1192090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30018	NC_008392	ATG	2	6	1192146	1192151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361247
30019	NC_008392	GCCC	2	8	1192155	1192162	0 %	0 %	25 %	75 %	115361247
30020	NC_008392	CAA	2	6	1192223	1192228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361247
30021	NC_008392	GAA	2	6	1192247	1192252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361247
30022	NC_008392	CGG	2	6	1192280	1192285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361247
30023	NC_008392	CAT	3	9	1192358	1192366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361247
30024	NC_008392	TCG	2	6	1192386	1192391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30025	NC_008392	ATCGAG	2	12	1192392	1192403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115361247
30026	NC_008392	GGC	2	6	1192436	1192441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361247
30027	NC_008392	TCG	2	6	1192444	1192449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30028	NC_008392	CG	3	6	1192448	1192453	0 %	0 %	50 %	50 %	115361247
30029	NC_008392	CGA	2	6	1192457	1192462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361247
30030	NC_008392	TCA	2	6	1192489	1192494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361247
30031	NC_008392	CAT	2	6	1192529	1192534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361247
30032	NC_008392	GC	3	6	1192647	1192652	0 %	0 %	50 %	50 %	115361247
30033	NC_008392	CCT	2	6	1192713	1192718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115361248
30034	NC_008392	TGT	2	6	1192719	1192724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361248
30035	NC_008392	TCT	2	6	1192758	1192763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361248
30036	NC_008392	TGA	2	6	1192773	1192778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361248
30037	NC_008392	ATG	2	6	1192856	1192861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361248
30038	NC_008392	CG	3	6	1192919	1192924	0 %	0 %	50 %	50 %	115361248
30039	NC_008392	TGC	2	6	1192971	1192976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361248
30040	NC_008392	CGG	2	6	1192980	1192985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361248
30041	NC_008392	CGT	2	6	1193049	1193054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361248
30042	NC_008392	CAG	2	6	1193062	1193067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361248
30043	NC_008392	GCG	2	6	1193169	1193174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361248
30044	NC_008392	GCC	2	6	1193278	1193283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361248
30045	NC_008392	CCA	2	6	1193317	1193322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361248
30046	NC_008392	GACC	2	8	1193344	1193351	25 %	0 %	25 %	50 %	115361248
30047	NC_008392	CGA	2	6	1193361	1193366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361248
30048	NC_008392	CGA	2	6	1193747	1193752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30049	NC_008392	CA	4	8	1193762	1193769	50 %	0 %	0 %	50 %	115361249
30050	NC_008392	CGT	2	6	1193780	1193785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30051	NC_008392	TCA	2	6	1193833	1193838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361249
30052	NC_008392	CAA	2	6	1193871	1193876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361249
30053	NC_008392	GA	3	6	1193911	1193916	50 %	0 %	50 %	0 %	115361249
30054	NC_008392	CGG	2	6	1193930	1193935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361249
30055	NC_008392	TGC	2	6	1194079	1194084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30056	NC_008392	CGT	2	6	1194095	1194100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30057	NC_008392	ATCA	2	8	1194135	1194142	50 %	25 %	0 %	25 %	115361249
30058	NC_008392	TTG	2	6	1194147	1194152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115361249
30059	NC_008392	CGG	2	6	1194178	1194183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361249
30060	NC_008392	CTG	2	6	1194186	1194191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30061	NC_008392	CG	3	6	1194203	1194208	0 %	0 %	50 %	50 %	115361249
30062	NC_008392	GCT	2	6	1194212	1194217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361249
30063	NC_008392	T	6	6	1194217	1194222	0 %	100 %	0 %	0 %	115361249
30064	NC_008392	CG	4	8	1194281	1194288	0 %	0 %	50 %	50 %	115361249
30065	NC_008392	CGC	2	6	1194353	1194358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361249
30066	NC_008392	ACG	2	6	1194394	1194399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361249
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30068	NC_008392	CAA	2	6	1194488	1194493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361249
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30070	NC_008392	GGC	2	6	1194565	1194570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361250
30071	NC_008392	TCA	2	6	1194597	1194602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361250
30072	NC_008392	GCG	2	6	1194609	1194614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361250
30073	NC_008392	AGC	2	6	1194621	1194626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361250
30074	NC_008392	CGA	2	6	1194720	1194725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361250
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30081	NC_008392	GGCGT	2	10	1195154	1195163	0 %	20 %	60 %	20 %	115361250
30082	NC_008392	GCCT	2	8	1195223	1195230	0 %	25 %	25 %	50 %	115361250
30083	NC_008392	TCG	2	6	1195274	1195279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361250
30084	NC_008392	GAAAA	2	10	1195567	1195576	80 %	0 %	20 %	0 %	115361251
30085	NC_008392	AGC	2	6	1195709	1195714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
30086	NC_008392	ATCA	2	8	1195828	1195835	50 %	25 %	0 %	25 %	115361251
30087	NC_008392	GGC	2	6	1195860	1195865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361251
30088	NC_008392	GC	3	6	1195908	1195913	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
30089	NC_008392	ACG	2	6	1195918	1195923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
30090	NC_008392	GC	3	6	1195932	1195937	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
30091	NC_008392	TAC	2	6	1196038	1196043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361251
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30094	NC_008392	TGA	2	6	1196159	1196164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361251
30095	NC_008392	CTG	2	6	1196203	1196208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361251
30096	NC_008392	GACCG	2	10	1196241	1196250	20 %	0 %	40 %	40 %	115361251
30097	NC_008392	GACC	2	8	1196298	1196305	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
30098	NC_008392	CG	3	6	1196329	1196334	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
30099	NC_008392	CG	3	6	1196346	1196351	0 %	0 %	50 %	50 %	115361251
30100	NC_008392	CGAC	2	8	1196357	1196364	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
30101	NC_008392	CCT	2	6	1196457	1196462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115361251
30102	NC_008392	CCA	2	6	1196474	1196479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361251
30103	NC_008392	CGA	2	6	1196541	1196546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
30104	NC_008392	TGC	3	9	1196549	1196557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361251
30105	NC_008392	TGG	2	6	1196603	1196608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115361251
30106	NC_008392	CAA	2	6	1196640	1196645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361251
30107	NC_008392	CGAC	2	8	1196657	1196664	25 %	0 %	25 %	50 %	115361251
30108	NC_008392	GCA	2	6	1196712	1196717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361251
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30110	NC_008392	TCG	2	6	1196872	1196877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361252
30111	NC_008392	GCCG	2	8	1196922	1196929	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
30112	NC_008392	CGG	2	6	1196942	1196947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
30113	NC_008392	TCGA	2	8	1196958	1196965	25 %	25 %	25 %	25 %	115361252
30114	NC_008392	CG	3	6	1196989	1196994	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
30115	NC_008392	TCGAGG	2	12	1197022	1197033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115361252
30116	NC_008392	GGC	2	6	1197044	1197049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
30117	NC_008392	CGG	2	6	1197170	1197175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
30118	NC_008392	CTT	2	6	1197192	1197197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361252
30119	NC_008392	TGA	2	6	1197226	1197231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361252
30120	NC_008392	GAT	2	6	1197272	1197277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361252
30121	NC_008392	CAA	2	6	1197278	1197283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361252
30122	NC_008392	GCT	2	6	1197302	1197307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361252
30123	NC_008392	GGC	2	6	1197311	1197316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361252
30124	NC_008392	CG	3	6	1197349	1197354	0 %	0 %	50 %	50 %	115361252
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30127	NC_008392	TCGC	2	8	1197426	1197433	0 %	25 %	25 %	50 %	115361252
30128	NC_008392	ACC	3	9	1197563	1197571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361253
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30131	NC_008392	CAC	2	6	1197655	1197660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115361253
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30138	NC_008392	GGA	2	6	1197859	1197864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115361253
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30143	NC_008392	CGA	2	6	1198042	1198047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361253
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30146	NC_008392	CG	3	6	1198258	1198263	0 %	0 %	50 %	50 %	115361253
30147	NC_008392	CGA	2	6	1198272	1198277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361253
30148	NC_008392	TCG	2	6	1198311	1198316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361253
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30186	NC_008392	CG	4	8	1201990	1201997	0 %	0 %	50 %	50 %	115361255
30187	NC_008392	AGA	2	6	1202023	1202028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115361255
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30200	NC_008392	GCC	2	6	1202340	1202345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361255
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30202	NC_008392	GAC	2	6	1202404	1202409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361255
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30204	NC_008392	TGA	2	6	1202430	1202435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361255
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30206	NC_008392	CTG	2	6	1202480	1202485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361255
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30210	NC_008392	CAT	2	6	1202557	1202562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361255
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30212	NC_008392	GCG	2	6	1202609	1202614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361255
30213	NC_008392	CGT	2	6	1202647	1202652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361255
30214	NC_008392	GCC	2	6	1202686	1202691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361255
30215	NC_008392	GCA	2	6	1202749	1202754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361255
30216	NC_008392	GTC	2	6	1202801	1202806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361255
30217	NC_008392	CGAT	2	8	1202841	1202848	25 %	25 %	25 %	25 %	115361255
30218	NC_008392	GC	4	8	1203138	1203145	0 %	0 %	50 %	50 %	115361256
30219	NC_008392	GCC	2	6	1203167	1203172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361256
30220	NC_008392	TCA	2	6	1203194	1203199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361256
30221	NC_008392	GCT	3	9	1203204	1203212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361256
30222	NC_008392	GCGG	2	8	1203216	1203223	0 %	0 %	75 %	25 %	115361256
30223	NC_008392	CGG	2	6	1203230	1203235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361256
30224	NC_008392	CGG	2	6	1203249	1203254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361256
30225	NC_008392	ACGATG	2	12	1203429	1203440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115361257
30226	NC_008392	GAC	2	6	1203524	1203529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361257
30227	NC_008392	GCC	2	6	1203633	1203638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361257
30228	NC_008392	ATC	2	6	1203654	1203659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361257
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30230	NC_008392	CCG	2	6	1203795	1203800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361257
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30232	NC_008392	GAG	2	6	1203879	1203884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115361257
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30259	NC_008392	ATC	2	6	1205555	1205560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361258
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30339	NC_008392	CG	3	6	1210178	1210183	0 %	0 %	50 %	50 %	115361264
30340	NC_008392	TACG	2	8	1210194	1210201	25 %	25 %	25 %	25 %	115361264
30341	NC_008392	GTCGC	2	10	1210212	1210221	0 %	20 %	40 %	40 %	115361264
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30343	NC_008392	TCG	2	6	1210267	1210272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361264
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30345	NC_008392	TGA	2	6	1210324	1210329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115361264
30346	NC_008392	CGT	3	9	1210364	1210372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361264
30347	NC_008392	GGC	2	6	1210387	1210392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361264
30348	NC_008392	CCGG	2	8	1210468	1210475	0 %	0 %	50 %	50 %	115361264
30349	NC_008392	GCT	2	6	1210484	1210489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361264
30350	NC_008392	GCT	2	6	1210526	1210531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361264
30351	NC_008392	GTC	2	6	1210566	1210571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361264
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30356	NC_008392	GC	3	6	1210768	1210773	0 %	0 %	50 %	50 %	115361265
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30459	NC_008392	GGC	2	6	1215580	1215585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361269
30460	NC_008392	CGA	2	6	1215654	1215659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30461	NC_008392	GCGTCC	2	12	1215677	1215688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115361269
30462	NC_008392	CGA	2	6	1215692	1215697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30463	NC_008392	GAC	2	6	1215706	1215711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30464	NC_008392	CCG	2	6	1215758	1215763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361269
30465	NC_008392	GCGCG	2	10	1215771	1215780	0 %	0 %	60 %	40 %	115361269
30466	NC_008392	CGT	2	6	1215855	1215860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30467	NC_008392	CGG	2	6	1215897	1215902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361269
30468	NC_008392	GCG	2	6	1215906	1215911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361269
30469	NC_008392	CGC	2	6	1215983	1215988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361269
30470	NC_008392	CGA	2	6	1216031	1216036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30471	NC_008392	ACA	2	6	1216046	1216051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115361269
30472	NC_008392	TCG	2	6	1216052	1216057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30473	NC_008392	GCT	2	6	1216074	1216079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30474	NC_008392	GC	3	6	1216097	1216102	0 %	0 %	50 %	50 %	115361269
30475	NC_008392	GCT	2	6	1216149	1216154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30476	NC_008392	CGGC	2	8	1216205	1216212	0 %	0 %	50 %	50 %	115361269
30477	NC_008392	CGC	2	6	1216254	1216259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361269
30478	NC_008392	TGC	2	6	1216292	1216297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361269
30479	NC_008392	GA	3	6	1216306	1216311	50 %	0 %	50 %	0 %	115361269
30480	NC_008392	TCA	2	6	1216334	1216339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115361269
30481	NC_008392	GCAT	2	8	1216405	1216412	25 %	25 %	25 %	25 %	115361269
30482	NC_008392	GC	3	6	1216425	1216430	0 %	0 %	50 %	50 %	115361269
30483	NC_008392	AGG	2	6	1216451	1216456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115361269
30484	NC_008392	CTT	2	6	1216532	1216537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115361270
30485	NC_008392	CGC	2	6	1216588	1216593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361270
30486	NC_008392	CGG	2	6	1216610	1216615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115361270
30487	NC_008392	GACC	2	8	1216730	1216737	25 %	0 %	25 %	50 %	115361270
30488	NC_008392	GTC	2	6	1216779	1216784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361270
30489	NC_008392	CGCC	2	8	1216801	1216808	0 %	0 %	25 %	75 %	115361270
30490	NC_008392	CGGA	2	8	1216842	1216849	25 %	0 %	50 %	25 %	115361270
30491	NC_008392	CATGAC	2	12	1216852	1216863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115361270
30492	NC_008392	TCG	2	6	1216866	1216871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30493	NC_008392	GC	3	6	1216937	1216942	0 %	0 %	50 %	50 %	115361271
30494	NC_008392	CGA	2	6	1216990	1216995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30495	NC_008392	CTG	2	6	1217132	1217137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30496	NC_008392	ACG	2	6	1217151	1217156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30497	NC_008392	TGC	2	6	1217157	1217162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30498	NC_008392	GCC	2	6	1217202	1217207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115361271
30499	NC_008392	TCG	2	6	1217220	1217225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361271
30500	NC_008392	TGC	2	6	1217226	1217231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115361271

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