MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 3

Total Repeats: 32209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008392	CGGC	2	8	206260	206267	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5502	NC_008392	CAGCC	2	10	206271	206280	20 %	0 %	20 %	60 %	115360494
5503	NC_008392	GCCC	2	8	206335	206342	0 %	0 %	25 %	75 %	115360494
5504	NC_008392	GC	3	6	206380	206385	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5505	NC_008392	AGC	2	6	206391	206396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5506	NC_008392	ACG	2	6	206397	206402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5507	NC_008392	CGGCG	2	10	206416	206425	0 %	0 %	60 %	40 %	115360494
5508	NC_008392	CGG	2	6	206475	206480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5509	NC_008392	CCG	2	6	206481	206486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360494
5510	NC_008392	CGG	2	6	206527	206532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5511	NC_008392	GCT	2	6	206575	206580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5512	NC_008392	CG	4	8	206590	206597	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5513	NC_008392	GCG	2	6	206616	206621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5514	NC_008392	GCC	2	6	206625	206630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360494
5515	NC_008392	CTG	2	6	206687	206692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5516	NC_008392	TGC	2	6	206700	206705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5517	NC_008392	CGT	2	6	206733	206738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5518	NC_008392	TCA	2	6	206739	206744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360494
5519	NC_008392	CGT	2	6	206776	206781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5520	NC_008392	GCC	2	6	206786	206791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360494
5521	NC_008392	ACGGC	2	10	206814	206823	20 %	0 %	40 %	40 %	115360494
5522	NC_008392	CGG	2	6	206845	206850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5523	NC_008392	CG	3	6	206863	206868	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5524	NC_008392	GGC	2	6	206887	206892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5525	NC_008392	CGG	2	6	206903	206908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360494
5526	NC_008392	CGA	2	6	206965	206970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5527	NC_008392	TCGCA	2	10	206987	206996	20 %	20 %	20 %	40 %	115360494
5528	NC_008392	CG	3	6	207004	207009	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5529	NC_008392	CG	3	6	207021	207026	0 %	0 %	50 %	50 %	115360494
5530	NC_008392	TGC	2	6	207035	207040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360494
5531	NC_008392	GAG	2	6	207044	207049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115360494
5532	NC_008392	GCA	2	6	207112	207117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5533	NC_008392	GC	3	6	207209	207214	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5534	NC_008392	AAGG	2	8	207237	207244	50 %	0 %	50 %	0 %	115360495
5535	NC_008392	GCC	2	6	207247	207252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
5536	NC_008392	TCG	2	6	207280	207285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5537	NC_008392	CG	3	6	207293	207298	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5538	NC_008392	GTC	2	6	207342	207347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
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5540	NC_008392	GCC	2	6	207385	207390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
5541	NC_008392	CGG	3	9	207460	207468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360495
5542	NC_008392	GC	3	6	207502	207507	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5543	NC_008392	GCC	2	6	207510	207515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
5544	NC_008392	AGA	2	6	207550	207555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115360495
5545	NC_008392	TCG	2	6	207556	207561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5546	NC_008392	GCG	2	6	207583	207588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360495
5547	NC_008392	CCG	2	6	207589	207594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
5548	NC_008392	CG	3	6	207593	207598	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5549	NC_008392	CCT	2	6	207609	207614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115360495
5550	NC_008392	CCGT	2	8	207627	207634	0 %	25 %	25 %	50 %	115360495
5551	NC_008392	GC	3	6	207728	207733	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5552	NC_008392	CAT	2	6	207747	207752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360495
5553	NC_008392	GC	3	6	207791	207796	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5554	NC_008392	GC	3	6	207903	207908	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5555	NC_008392	TGG	2	6	207931	207936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115360495
5556	NC_008392	CTCGAC	2	12	207963	207974	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115360495
5557	NC_008392	CGA	2	6	208034	208039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5558	NC_008392	GCT	2	6	208046	208051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5559	NC_008392	CG	3	6	208113	208118	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5560	NC_008392	CG	4	8	208125	208132	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5561	NC_008392	CGT	2	6	208136	208141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
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5563	NC_008392	CCGCAT	2	12	208251	208262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115360495
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5570	NC_008392	GCC	2	6	208485	208490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
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5587	NC_008392	ACG	2	6	209220	209225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5588	NC_008392	GCT	2	6	209237	209242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360495
5589	NC_008392	CG	3	6	209267	209272	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5590	NC_008392	GC	3	6	209286	209291	0 %	0 %	50 %	50 %	115360495
5591	NC_008392	AG	3	6	209369	209374	50 %	0 %	50 %	0 %	115360495
5592	NC_008392	CCG	2	6	209382	209387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
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5594	NC_008392	CCGCGT	2	12	209483	209494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115360495
5595	NC_008392	ACG	2	6	209515	209520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360495
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5600	NC_008392	CGC	2	6	209871	209876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360495
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5602	NC_008392	CCG	2	6	209983	209988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360496
5603	NC_008392	GC	3	6	209993	209998	0 %	0 %	50 %	50 %	115360496
5604	NC_008392	CGT	2	6	210007	210012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360496
5605	NC_008392	GGCC	2	8	210104	210111	0 %	0 %	50 %	50 %	115360496
5606	NC_008392	TCG	2	6	210138	210143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360496
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5608	NC_008392	CG	3	6	210279	210284	0 %	0 %	50 %	50 %	115360496
5609	NC_008392	CGG	2	6	210302	210307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360496
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5612	NC_008392	TGGCG	2	10	210460	210469	0 %	20 %	60 %	20 %	115360496
5613	NC_008392	GCCC	2	8	210494	210501	0 %	0 %	25 %	75 %	115360496
5614	NC_008392	AGCC	2	8	210582	210589	25 %	0 %	25 %	50 %	115360496
5615	NC_008392	TCT	2	6	210604	210609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115360496
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5622	NC_008392	GCG	2	6	210952	210957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360496
5623	NC_008392	CG	3	6	210996	211001	0 %	0 %	50 %	50 %	115360496
5624	NC_008392	GC	3	6	211042	211047	0 %	0 %	50 %	50 %	115360496
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5627	NC_008392	CGT	2	6	211130	211135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360496
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5651	NC_008392	TCGA	2	8	211946	211953	25 %	25 %	25 %	25 %	115360497
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5734	NC_008392	CG	5	10	214635	214644	0 %	0 %	50 %	50 %	115360498
5735	NC_008392	GC	3	6	214649	214654	0 %	0 %	50 %	50 %	115360498
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5740	NC_008392	TGCG	2	8	214839	214846	0 %	25 %	50 %	25 %	115360498
5741	NC_008392	CG	3	6	214857	214862	0 %	0 %	50 %	50 %	115360498
5742	NC_008392	GTGC	2	8	214889	214896	0 %	25 %	50 %	25 %	115360498
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5744	NC_008392	CCGTG	2	10	214991	215000	0 %	20 %	40 %	40 %	115360498
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5866	NC_008392	CCA	2	6	220222	220227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115360501
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5868	NC_008392	GCA	2	6	220302	220307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360502
5869	NC_008392	GC	3	6	220353	220358	0 %	0 %	50 %	50 %	115360502
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5973	NC_008392	CGT	2	6	224166	224171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360505
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5985	NC_008392	ACGGC	2	10	224531	224540	20 %	0 %	40 %	40 %	115360505
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5987	NC_008392	CCG	2	6	224582	224587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360505
5988	NC_008392	CAGAAA	2	12	224616	224627	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115360505
5989	NC_008392	GAC	2	6	224631	224636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360505
5990	NC_008392	TGC	2	6	224672	224677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360505
5991	NC_008392	CAT	2	6	224687	224692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360506
5992	NC_008392	ACG	2	6	224718	224723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360506
5993	NC_008392	CGC	2	6	224738	224743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360506
5994	NC_008392	CGT	2	6	224758	224763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360506
5995	NC_008392	ATCG	2	8	224807	224814	25 %	25 %	25 %	25 %	115360506
5996	NC_008392	GGCG	2	8	224879	224886	0 %	0 %	75 %	25 %	115360506
5997	NC_008392	GGCC	2	8	224905	224912	0 %	0 %	50 %	50 %	115360506
5998	NC_008392	TCG	2	6	224913	224918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360506
5999	NC_008392	CGC	2	6	224938	224943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360506
6000	NC_008392	GCC	2	6	224979	224984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360506

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