MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 2

Total Repeats: 70954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008061	GCTT	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	107025344
2	NC_008061	CTG	2	6	52	57	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025344
3	NC_008061	TCG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025344
4	NC_008061	CGG	2	6	143	148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
5	NC_008061	CG	4	8	165	172	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
6	NC_008061	CG	3	6	183	188	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
7	NC_008061	GGC	2	6	189	194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
8	NC_008061	GGC	2	6	223	228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
9	NC_008061	GCGG	2	8	238	245	0 %	0 %	75 %	25 %	107025344
10	NC_008061	CG	3	6	247	252	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
11	NC_008061	CCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107025344
12	NC_008061	GACTG	2	10	319	328	20 %	20 %	40 %	20 %	107025344
13	NC_008061	ACG	2	6	329	334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
14	NC_008061	GTCG	2	8	361	368	0 %	25 %	50 %	25 %	107025344
15	NC_008061	TCT	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025344
16	NC_008061	AGC	2	6	557	562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
17	NC_008061	GCG	2	6	635	640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
18	NC_008061	CG	3	6	682	687	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
19	NC_008061	ACG	2	6	730	735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
20	NC_008061	CTAT	2	8	786	793	25 %	50 %	0 %	25 %	107025344
21	NC_008061	GC	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
22	NC_008061	CGG	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
23	NC_008061	GTC	2	6	844	849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025344
24	NC_008061	GCCG	2	8	957	964	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
25	NC_008061	GC	4	8	967	974	0 %	0 %	50 %	50 %	107025344
26	NC_008061	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
27	NC_008061	TGGTCG	2	12	1017	1028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	107025344
28	NC_008061	GAC	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
29	NC_008061	TCG	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025344
30	NC_008061	TGC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025344
31	NC_008061	ATG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025344
32	NC_008061	GT	3	6	1217	1222	0 %	50 %	50 %	0 %	107025344
33	NC_008061	GGC	2	6	1239	1244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025344
34	NC_008061	CAG	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025344
35	NC_008061	CTT	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025345
36	NC_008061	ACT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025345
37	NC_008061	CGG	2	6	1714	1719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025345
38	NC_008061	CGA	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025345
39	NC_008061	GCC	2	6	1846	1851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025345
40	NC_008061	CGA	3	9	1880	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025345
41	NC_008061	GAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107025345
42	NC_008061	CGA	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025345
43	NC_008061	CGA	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025345
44	NC_008061	TCGA	2	8	2176	2183	25 %	25 %	25 %	25 %	107025345
45	NC_008061	GGGC	2	8	2216	2223	0 %	0 %	75 %	25 %	107025345
46	NC_008061	GATGA	2	10	2226	2235	40 %	20 %	40 %	0 %	107025345
47	NC_008061	GCG	2	6	2249	2254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025345
48	NC_008061	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025345
49	NC_008061	GCGT	2	8	2339	2346	0 %	25 %	50 %	25 %	107025345
50	NC_008061	CGC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025345
51	NC_008061	CG	3	6	2508	2513	0 %	0 %	50 %	50 %	107025345
52	NC_008061	GTCC	2	8	2709	2716	0 %	25 %	25 %	50 %	107025346
53	NC_008061	CGG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025346
54	NC_008061	GGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107025346
55	NC_008061	CCGG	2	8	2871	2878	0 %	0 %	50 %	50 %	107025346
56	NC_008061	GGCA	2	8	2949	2956	25 %	0 %	50 %	25 %	107025346
57	NC_008061	GCG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025346
58	NC_008061	CGA	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025346
59	NC_008061	GCC	2	6	3013	3018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025346
60	NC_008061	GC	4	8	3030	3037	0 %	0 %	50 %	50 %	107025346
61	NC_008061	GGC	2	6	3051	3056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025346
62	NC_008061	CCGA	2	8	3092	3099	25 %	0 %	25 %	50 %	107025346
63	NC_008061	CAC	2	6	3213	3218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107025346
64	NC_008061	GCTC	2	8	3231	3238	0 %	25 %	25 %	50 %	107025346
65	NC_008061	CCG	2	6	3311	3316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025346
66	NC_008061	AAG	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107025346
67	NC_008061	GTG	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107025346
68	NC_008061	CGG	2	6	3387	3392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025346
69	NC_008061	CG	3	6	3553	3558	0 %	0 %	50 %	50 %	107025347
70	NC_008061	ACCG	2	8	3566	3573	25 %	0 %	25 %	50 %	107025347
71	NC_008061	GAT	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025347
72	NC_008061	ATC	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025347
73	NC_008061	GCGG	2	8	3735	3742	0 %	0 %	75 %	25 %	107025347
74	NC_008061	CAT	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025347
75	NC_008061	GAC	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025347
76	NC_008061	AGC	2	6	3865	3870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025347
77	NC_008061	ATC	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025347
78	NC_008061	CGC	3	9	3929	3937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025347
79	NC_008061	GGCT	2	8	3956	3963	0 %	25 %	50 %	25 %	107025347
80	NC_008061	GATC	2	8	4001	4008	25 %	25 %	25 %	25 %	107025347
81	NC_008061	GATC	2	8	4054	4061	25 %	25 %	25 %	25 %	107025347
82	NC_008061	GCT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025347
83	NC_008061	GTT	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	107025347
84	NC_008061	GCC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025347
85	NC_008061	GAC	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025347
86	NC_008061	TCAT	2	8	4712	4719	25 %	50 %	0 %	25 %	107025348
87	NC_008061	CTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025348
88	NC_008061	TCG	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025348
89	NC_008061	TCG	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025348
90	NC_008061	CGG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025348
91	NC_008061	GC	3	6	5018	5023	0 %	0 %	50 %	50 %	107025348
92	NC_008061	CGC	2	6	5088	5093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025348
93	NC_008061	CG	3	6	5174	5179	0 %	0 %	50 %	50 %	107025348
94	NC_008061	TTC	2	6	5183	5188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025348
95	NC_008061	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025348
96	NC_008061	TGG	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107025348
97	NC_008061	ATG	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025348
98	NC_008061	GC	3	6	5289	5294	0 %	0 %	50 %	50 %	107025348
99	NC_008061	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107025348
100	NC_008061	CTG	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025348
101	NC_008061	CGA	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025349
102	NC_008061	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025349
103	NC_008061	CGTTC	2	10	5729	5738	0 %	40 %	20 %	40 %	107025349
104	NC_008061	ACG	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025349
105	NC_008061	CGC	2	6	5831	5836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025349
106	NC_008061	CGT	2	6	5846	5851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025349
107	NC_008061	TCG	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025349
108	NC_008061	ACT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025349
109	NC_008061	AAG	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107025349
110	NC_008061	TGA	2	6	6208	6213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025350
111	NC_008061	CGC	2	6	6263	6268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025350
112	NC_008061	CGG	2	6	6269	6274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
113	NC_008061	CCA	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107025350
114	NC_008061	CCA	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107025350
115	NC_008061	TCG	2	6	6346	6351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
116	NC_008061	CG	3	6	6385	6390	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
117	NC_008061	GCA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025350
118	NC_008061	TCG	2	6	6481	6486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
119	NC_008061	GCAC	2	8	6514	6521	25 %	0 %	25 %	50 %	107025350
120	NC_008061	ACG	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025350
121	NC_008061	TGC	2	6	6562	6567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
122	NC_008061	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025350
123	NC_008061	CGG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
124	NC_008061	GCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
125	NC_008061	GAA	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107025350
126	NC_008061	GAT	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107025350
127	NC_008061	CGA	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025350
128	NC_008061	GCG	2	6	6741	6746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
129	NC_008061	CGCGG	2	10	6763	6772	0 %	0 %	60 %	40 %	107025350
130	NC_008061	CGGC	2	8	6784	6791	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
131	NC_008061	ATC	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025350
132	NC_008061	CGG	2	6	6821	6826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
133	NC_008061	GTC	3	9	6861	6869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
134	NC_008061	GCG	2	6	6870	6875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
135	NC_008061	TCG	2	6	6901	6906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
136	NC_008061	CG	3	6	6905	6910	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
137	NC_008061	CGG	2	6	6931	6936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025350
138	NC_008061	AAC	2	6	6972	6977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	107025350
139	NC_008061	GC	4	8	6991	6998	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
140	NC_008061	GC	4	8	7034	7041	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
141	NC_008061	GCGCGA	2	12	7093	7104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	107025350
142	NC_008061	GTC	3	9	7131	7139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
143	NC_008061	CGC	2	6	7163	7168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025350
144	NC_008061	CG	4	8	7175	7182	0 %	0 %	50 %	50 %	107025350
145	NC_008061	TCG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025350
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149	NC_008061	TCGT	2	8	7272	7279	0 %	50 %	25 %	25 %	107025350
150	NC_008061	CGGCG	2	10	7361	7370	0 %	0 %	60 %	40 %	107025350
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152	NC_008061	ATC	2	6	7476	7481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025351
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155	NC_008061	GC	3	6	7521	7526	0 %	0 %	50 %	50 %	107025351
156	NC_008061	GC	3	6	7530	7535	0 %	0 %	50 %	50 %	107025351
157	NC_008061	CGCGG	2	10	7545	7554	0 %	0 %	60 %	40 %	107025351
158	NC_008061	CGC	2	6	7561	7566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025351
159	NC_008061	CTGG	2	8	7582	7589	0 %	25 %	50 %	25 %	107025351
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161	NC_008061	CTT	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025351
162	NC_008061	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107025351
163	NC_008061	CGACC	2	10	7657	7666	20 %	0 %	20 %	60 %	107025351
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169	NC_008061	CGT	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025351
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172	NC_008061	GCT	2	6	7861	7866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025351
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175	NC_008061	TGC	2	6	7884	7889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025351
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213	NC_008061	GCA	2	6	8902	8907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025352
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243	NC_008061	ACGGC	2	10	10246	10255	20 %	0 %	40 %	40 %	107025353
244	NC_008061	GCCG	2	8	10331	10338	0 %	0 %	50 %	50 %	107025353
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246	NC_008061	GAC	2	6	10368	10373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025353
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250	NC_008061	TCG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025353
251	NC_008061	GC	3	6	10483	10488	0 %	0 %	50 %	50 %	107025353
252	NC_008061	TCGGCA	2	12	10513	10524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	107025353
253	NC_008061	TCGA	2	8	10554	10561	25 %	25 %	25 %	25 %	107025353
254	NC_008061	GTAC	2	8	10591	10598	25 %	25 %	25 %	25 %	107025353
255	NC_008061	CAC	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107025354
256	NC_008061	GCCG	2	8	10776	10783	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
257	NC_008061	AGC	2	6	10862	10867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025354
258	NC_008061	TCGTGC	2	12	10910	10921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025354
259	NC_008061	ATC	3	9	10946	10954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107025354
260	NC_008061	CGC	2	6	11034	11039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107025354
261	NC_008061	GC	3	6	11044	11049	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
262	NC_008061	CGA	2	6	11061	11066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025354
263	NC_008061	CG	3	6	11080	11085	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
264	NC_008061	CGTG	2	8	11088	11095	0 %	25 %	50 %	25 %	107025354
265	NC_008061	CGGCG	2	10	11103	11112	0 %	0 %	60 %	40 %	107025354
266	NC_008061	CGCGC	2	10	11124	11133	0 %	0 %	40 %	60 %	107025354
267	NC_008061	GCT	2	6	11160	11165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025354
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269	NC_008061	GCTC	2	8	11207	11214	0 %	25 %	25 %	50 %	107025354
270	NC_008061	CG	3	6	11271	11276	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
271	NC_008061	GCT	2	6	11298	11303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107025354
272	NC_008061	GGC	2	6	11317	11322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025354
273	NC_008061	CGA	2	6	11331	11336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107025354
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289	NC_008061	CGGC	2	8	11747	11754	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
290	NC_008061	GC	3	6	11753	11758	0 %	0 %	50 %	50 %	107025354
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388	NC_008061	GCG	2	6	15535	15540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025359
389	NC_008061	CGG	2	6	15589	15594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107025359
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