MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia xenovorans LB400 chromosome 1

Total Repeats: 106957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007951	CAG	2	6	246	251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
2	NC_007951	ACGTG	2	10	253	262	20 %	20 %	40 %	20 %	91781385
3	NC_007951	CGC	2	6	293	298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
4	NC_007951	GC	3	6	446	451	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
5	NC_007951	CG	3	6	482	487	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
6	NC_007951	CG	4	8	578	585	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
7	NC_007951	AAC	2	6	606	611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91781385
8	NC_007951	CG	3	6	639	644	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
9	NC_007951	AACGCA	2	12	657	668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91781385
10	NC_007951	CGC	2	6	671	676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
11	NC_007951	CCG	2	6	688	693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
12	NC_007951	CGAA	2	8	718	725	50 %	0 %	25 %	25 %	91781385
13	NC_007951	GCC	2	6	732	737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
14	NC_007951	CGC	2	6	738	743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
15	NC_007951	AACGGC	2	12	774	785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
16	NC_007951	GC	4	8	870	877	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
17	NC_007951	GGC	2	6	936	941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781385
18	NC_007951	GGCG	2	8	1001	1008	0 %	0 %	75 %	25 %	91781385
19	NC_007951	CTA	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781385
20	NC_007951	CTCG	2	8	1103	1110	0 %	25 %	25 %	50 %	91781385
21	NC_007951	CTG	3	9	1113	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781385
22	NC_007951	CGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
23	NC_007951	CA	3	6	1157	1162	50 %	0 %	0 %	50 %	91781385
24	NC_007951	TTC	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781385
25	NC_007951	CAA	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91781385
26	NC_007951	ATC	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781385
27	NC_007951	CGA	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
28	NC_007951	GCC	2	6	1307	1312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781385
29	NC_007951	TGAA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	91781385
30	NC_007951	TTC	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781385
31	NC_007951	CGTG	2	8	1418	1425	0 %	25 %	50 %	25 %	91781385
32	NC_007951	GC	3	6	1435	1440	0 %	0 %	50 %	50 %	91781385
33	NC_007951	AAG	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781385
34	NC_007951	CTG	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781385
35	NC_007951	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781385
36	NC_007951	GAA	2	6	1610	1615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781385
37	NC_007951	AGA	2	6	1678	1683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781385
38	NC_007951	CGG	2	6	1709	1714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781385
39	NC_007951	ACCAC	2	10	1720	1729	40 %	0 %	0 %	60 %	91781385
40	NC_007951	TGC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781385
41	NC_007951	CGA	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
42	NC_007951	GCA	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781385
43	NC_007951	CCT	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91781386
44	NC_007951	TCG	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781386
45	NC_007951	CGC	2	6	2116	2121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781386
46	NC_007951	CAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91781386
47	NC_007951	GCG	2	6	2234	2239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781386
48	NC_007951	CTC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91781386
49	NC_007951	GC	3	6	2286	2291	0 %	0 %	50 %	50 %	91781386
50	NC_007951	TCACGC	2	12	2309	2320	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	91781386
51	NC_007951	CGC	2	6	2379	2384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781386
52	NC_007951	AGA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781386
53	NC_007951	CAG	2	6	2491	2496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781386
54	NC_007951	CTA	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781386
55	NC_007951	TGC	2	6	2522	2527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781386
56	NC_007951	CGAC	2	8	2561	2568	25 %	0 %	25 %	50 %	91781386
57	NC_007951	GTTC	2	8	2606	2613	0 %	50 %	25 %	25 %	91781386
58	NC_007951	CTG	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781386
59	NC_007951	CGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781386
60	NC_007951	TGG	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91781386
61	NC_007951	GAA	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781386
62	NC_007951	CGC	2	6	2856	2861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781386
63	NC_007951	CAT	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781386
64	NC_007951	GAA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781386
65	NC_007951	ACG	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781386
66	NC_007951	ACG	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781386
67	NC_007951	CGT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781386
68	NC_007951	ACA	2	6	3294	3299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91781387
69	NC_007951	CGA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
70	NC_007951	GAC	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
71	NC_007951	AGCGC	2	10	3561	3570	20 %	0 %	40 %	40 %	91781387
72	NC_007951	TGA	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91781387
73	NC_007951	CGG	2	6	3601	3606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781387
74	NC_007951	CGG	2	6	3637	3642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781387
75	NC_007951	GGCGTG	2	12	3650	3661	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91781387
76	NC_007951	CGTG	2	8	3663	3670	0 %	25 %	50 %	25 %	91781387
77	NC_007951	CGC	2	6	3704	3709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781387
78	NC_007951	AAG	2	6	3716	3721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781387
79	NC_007951	CGA	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
80	NC_007951	GAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781387
81	NC_007951	GGC	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781387
82	NC_007951	CAA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91781387
83	NC_007951	TGC	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
84	NC_007951	GCG	2	6	4065	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781387
85	NC_007951	GGCGTG	2	12	4079	4090	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91781387
86	NC_007951	GTGCT	2	10	4130	4139	0 %	40 %	40 %	20 %	91781387
87	NC_007951	AAC	2	6	4145	4150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91781387
88	NC_007951	TGG	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91781387
89	NC_007951	TGCG	2	8	4188	4195	0 %	25 %	50 %	25 %	91781387
90	NC_007951	CG	3	6	4203	4208	0 %	0 %	50 %	50 %	91781387
91	NC_007951	GAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781387
92	NC_007951	CGA	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
93	NC_007951	CGTG	2	8	4293	4300	0 %	25 %	50 %	25 %	91781387
94	NC_007951	GC	3	6	4332	4337	0 %	0 %	50 %	50 %	91781387
95	NC_007951	GTC	2	6	4357	4362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
96	NC_007951	GC	4	8	4369	4376	0 %	0 %	50 %	50 %	91781387
97	NC_007951	GGA	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91781387
98	NC_007951	ATT	2	6	4442	4447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91781387
99	NC_007951	GCA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
100	NC_007951	CG	6	12	4468	4479	0 %	0 %	50 %	50 %	91781387
101	NC_007951	TCG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
102	NC_007951	GCT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
103	NC_007951	TTC	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781387
104	NC_007951	CAT	4	12	4810	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781387
105	NC_007951	GTT	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91781387
106	NC_007951	TTC	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781387
107	NC_007951	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91781387
108	NC_007951	TATATC	2	12	4910	4921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91781387
109	NC_007951	GCC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91781387
110	NC_007951	GATG	2	8	5161	5168	25 %	25 %	50 %	0 %	91781387
111	NC_007951	CGG	3	9	5211	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781387
112	NC_007951	GAT	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91781387
113	NC_007951	ACG	2	6	5270	5275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
114	NC_007951	AGA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781387
115	NC_007951	CTG	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
116	NC_007951	CAG	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
117	NC_007951	TCA	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91781387
118	NC_007951	GTT	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91781387
119	NC_007951	AGC	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781387
120	NC_007951	CGT	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781387
121	NC_007951	CTT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781387
122	NC_007951	CAC	2	6	5653	5658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91781387
123	NC_007951	GAT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91781387
124	NC_007951	GCGG	2	8	5713	5720	0 %	0 %	75 %	25 %	91781387
125	NC_007951	CAGGC	2	10	5933	5942	20 %	0 %	40 %	40 %	91781388
126	NC_007951	CCA	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91781388
127	NC_007951	TCT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91781388
128	NC_007951	CAG	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781388
129	NC_007951	GC	3	6	6139	6144	0 %	0 %	50 %	50 %	91781388
130	NC_007951	GC	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	91781388
131	NC_007951	CAC	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91781388
132	NC_007951	TCG	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781388
133	NC_007951	TTG	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91781388
134	NC_007951	TCG	2	6	6387	6392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781388
135	NC_007951	GCA	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781388
136	NC_007951	AGA	2	6	6468	6473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781388
137	NC_007951	TCC	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91781388
138	NC_007951	GGCT	2	8	6635	6642	0 %	25 %	50 %	25 %	91781388
139	NC_007951	TGA	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91781388
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141	NC_007951	AGA	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91781388
142	NC_007951	GTC	2	6	6739	6744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91781388
143	NC_007951	CGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781388
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145	NC_007951	GTGC	2	8	7000	7007	0 %	25 %	50 %	25 %	91781388
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149	NC_007951	GTCA	2	8	7150	7157	25 %	25 %	25 %	25 %	91781388
150	NC_007951	GC	3	6	7165	7170	0 %	0 %	50 %	50 %	91781388
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153	NC_007951	CAG	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781388
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163	NC_007951	CTTT	2	8	8192	8199	0 %	75 %	0 %	25 %	91781389
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169	NC_007951	CGA	2	6	8809	8814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781390
170	NC_007951	GGT	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91781390
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172	NC_007951	T	7	7	8866	8872	0 %	100 %	0 %	0 %	91781390
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262	NC_007951	CGTC	2	8	14449	14456	0 %	25 %	25 %	50 %	91781394
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264	NC_007951	GCG	2	6	14498	14503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91781394
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266	NC_007951	AT	4	8	14643	14650	50 %	50 %	0 %	0 %	91781394
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395	NC_007951	CGGCG	2	10	20420	20429	0 %	0 %	60 %	40 %	91781399
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498	NC_007951	GAC	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91781403
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