MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei K96243 chromosome 2

Total Repeats: 85733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006351	CGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721040
2	NC_006351	ATCC	2	8	24	31	25 %	25 %	0 %	50 %	53721040
3	NC_006351	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53721040
4	NC_006351	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	53721040
5	NC_006351	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53721040
6	NC_006351	GCGA	2	8	169	176	25 %	0 %	50 %	25 %	53721040
7	NC_006351	GGC	2	6	243	248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721040
8	NC_006351	GAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53721040
9	NC_006351	GC	3	6	278	283	0 %	0 %	50 %	50 %	53721040
10	NC_006351	GC	3	6	290	295	0 %	0 %	50 %	50 %	53721040
11	NC_006351	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53721040
12	NC_006351	GCA	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721040
13	NC_006351	AGCA	3	12	347	358	50 %	0 %	25 %	25 %	53721040
14	NC_006351	GGC	3	9	366	374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721040
15	NC_006351	CG	4	8	441	448	0 %	0 %	50 %	50 %	53721040
16	NC_006351	GCC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721040
17	NC_006351	GAAAAT	2	12	556	567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	53721040
18	NC_006351	GCT	2	6	570	575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721040
19	NC_006351	CGC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721040
20	NC_006351	GCA	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721040
21	NC_006351	GCG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721040
22	NC_006351	TCG	2	6	728	733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721040
23	NC_006351	GCA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721040
24	NC_006351	CAA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53721040
25	NC_006351	GC	4	8	835	842	0 %	0 %	50 %	50 %	53721040
26	NC_006351	AGCC	2	8	918	925	25 %	0 %	25 %	50 %	53721040
27	NC_006351	CGC	2	6	945	950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721040
28	NC_006351	CGC	3	9	987	995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721040
29	NC_006351	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721040
30	NC_006351	ACG	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721040
31	NC_006351	GCAT	2	8	1125	1132	25 %	25 %	25 %	25 %	53721040
32	NC_006351	GCC	4	12	1156	1167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721040
33	NC_006351	ACA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53721040
34	NC_006351	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	53721041
35	NC_006351	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53721041
36	NC_006351	CGA	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
37	NC_006351	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	53721041
38	NC_006351	CGA	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
39	NC_006351	CG	3	6	1549	1554	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
40	NC_006351	TCG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721041
41	NC_006351	GCC	2	6	1578	1583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721041
42	NC_006351	ACG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
43	NC_006351	CG	3	6	1689	1694	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
44	NC_006351	GCC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721041
45	NC_006351	CCG	3	9	1787	1795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721041
46	NC_006351	GC	3	6	1812	1817	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
47	NC_006351	TTCC	2	8	1828	1835	0 %	50 %	0 %	50 %	53721041
48	NC_006351	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	53721041
49	NC_006351	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
50	NC_006351	GCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721041
51	NC_006351	TCG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721041
52	NC_006351	CG	4	8	1929	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
53	NC_006351	GC	3	6	1937	1942	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
54	NC_006351	TCG	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721041
55	NC_006351	TCT	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53721041
56	NC_006351	CGA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
57	NC_006351	AGCC	2	8	2138	2145	25 %	0 %	25 %	50 %	53721041
58	NC_006351	GC	3	6	2163	2168	0 %	0 %	50 %	50 %	53721041
59	NC_006351	GAC	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721041
60	NC_006351	GCCA	2	8	2207	2214	25 %	0 %	25 %	50 %	53721041
61	NC_006351	GCG	2	6	2289	2294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721041
62	NC_006351	GCG	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721042
63	NC_006351	CGGCA	2	10	2525	2534	20 %	0 %	40 %	40 %	53721042
64	NC_006351	GC	4	8	2544	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	53721042
65	NC_006351	CGA	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721042
66	NC_006351	TCG	2	6	2631	2636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721042
67	NC_006351	GCCTCG	2	12	2724	2735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	53721042
68	NC_006351	GCA	2	6	2743	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721042
69	NC_006351	GCC	2	6	2749	2754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721042
70	NC_006351	GC	3	6	3027	3032	0 %	0 %	50 %	50 %	53721043
71	NC_006351	CGCC	2	8	3038	3045	0 %	0 %	25 %	75 %	53721043
72	NC_006351	GCC	2	6	3050	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721043
73	NC_006351	CGC	2	6	3066	3071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721043
74	NC_006351	GC	3	6	3143	3148	0 %	0 %	50 %	50 %	53721043
75	NC_006351	TCG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721043
76	NC_006351	GCC	2	6	3341	3346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721043
77	NC_006351	TCG	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721043
78	NC_006351	CGG	2	6	3413	3418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721043
79	NC_006351	CG	3	6	3419	3424	0 %	0 %	50 %	50 %	53721043
80	NC_006351	TCG	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721043
81	NC_006351	CGG	2	6	3486	3491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721043
82	NC_006351	GGT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53721043
83	NC_006351	CG	3	6	3532	3537	0 %	0 %	50 %	50 %	53721043
84	NC_006351	CG	3	6	3770	3775	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
85	NC_006351	GGC	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
86	NC_006351	CGG	2	6	3838	3843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
87	NC_006351	CACG	2	8	3844	3851	25 %	0 %	25 %	50 %	53721044
88	NC_006351	AAC	2	6	3869	3874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53721044
89	NC_006351	CGC	3	9	3907	3915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721044
90	NC_006351	GGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
91	NC_006351	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
92	NC_006351	CGA	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
93	NC_006351	GCT	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721044
94	NC_006351	CGG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
95	NC_006351	GCT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721044
96	NC_006351	CGA	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
97	NC_006351	ACG	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
98	NC_006351	ATC	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721044
99	NC_006351	CGA	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
100	NC_006351	CAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721044
101	NC_006351	AAC	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53721044
102	NC_006351	CGG	2	6	4230	4235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
103	NC_006351	GC	4	8	4236	4243	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
104	NC_006351	CGAC	2	8	4257	4264	25 %	0 %	25 %	50 %	53721044
105	NC_006351	CAT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721044
106	NC_006351	GC	3	6	4332	4337	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
107	NC_006351	CGA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
108	NC_006351	GCG	2	6	4407	4412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
109	NC_006351	GCG	2	6	4461	4466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
110	NC_006351	CG	3	6	4486	4491	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
111	NC_006351	TCG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721044
112	NC_006351	GCT	2	6	4507	4512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721044
113	NC_006351	CGA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721044
114	NC_006351	GC	4	8	4611	4618	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
115	NC_006351	GC	3	6	4633	4638	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
116	NC_006351	GC	3	6	4644	4649	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
117	NC_006351	AGA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53721044
118	NC_006351	GCG	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721044
119	NC_006351	GCT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721044
120	NC_006351	CG	3	6	4809	4814	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
121	NC_006351	CG	4	8	4817	4824	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
122	NC_006351	CGCA	2	8	4829	4836	25 %	0 %	25 %	50 %	53721044
123	NC_006351	CG	3	6	4854	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	53721044
124	NC_006351	GATC	2	8	4864	4871	25 %	25 %	25 %	25 %	53721044
125	NC_006351	CGGGC	2	10	4960	4969	0 %	0 %	60 %	40 %	53721045
126	NC_006351	ACG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721045
127	NC_006351	TCA	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721045
128	NC_006351	CCG	2	6	5029	5034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721045
129	NC_006351	GAC	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721045
130	NC_006351	AGA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53721045
131	NC_006351	TCG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721045
132	NC_006351	CG	3	6	5231	5236	0 %	0 %	50 %	50 %	53721045
133	NC_006351	GCG	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721045
134	NC_006351	CGA	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721045
135	NC_006351	CGC	2	6	5362	5367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721045
136	NC_006351	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721045
137	NC_006351	GC	4	8	5493	5500	0 %	0 %	50 %	50 %	53721045
138	NC_006351	CGT	2	6	5503	5508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721045
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140	NC_006351	CG	3	6	5564	5569	0 %	0 %	50 %	50 %	53721045
141	NC_006351	CG	3	6	5580	5585	0 %	0 %	50 %	50 %	53721045
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262	NC_006351	GCACG	2	10	10506	10515	20 %	0 %	40 %	40 %	53721050
263	NC_006351	GC	3	6	10527	10532	0 %	0 %	50 %	50 %	53721050
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265	NC_006351	CAG	2	6	10638	10643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721050
266	NC_006351	GTC	2	6	10674	10679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721050
267	NC_006351	CAT	2	6	10683	10688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721050
268	NC_006351	GCG	2	6	10758	10763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53721050
269	NC_006351	GC	4	8	10778	10785	0 %	0 %	50 %	50 %	53721050
270	NC_006351	CGA	2	6	11048	11053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721051
271	NC_006351	CGT	3	9	11069	11077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721051
272	NC_006351	GCC	2	6	11100	11105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721051
273	NC_006351	GCT	2	6	11150	11155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53721051
274	NC_006351	CGC	2	6	11196	11201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721051
275	NC_006351	CGA	2	6	11255	11260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721051
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290	NC_006351	GC	3	6	11590	11595	0 %	0 %	50 %	50 %	53721051
291	NC_006351	ATC	2	6	11623	11628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53721051
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380	NC_006351	GAC	2	6	16309	16314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53721056
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388	NC_006351	CCTT	2	8	16550	16557	0 %	50 %	0 %	50 %	53721056
389	NC_006351	CG	3	6	16566	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	53721056
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395	NC_006351	TCT	2	6	16743	16748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53721056
396	NC_006351	TCGT	2	8	16871	16878	0 %	50 %	25 %	25 %	53721056
397	NC_006351	GCC	2	6	16906	16911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721056
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399	NC_006351	CG	5	10	16984	16993	0 %	0 %	50 %	50 %	53721056
400	NC_006351	CGC	2	6	17026	17031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53721056
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